BioLiP

>protein
GDQRFGDLVFRQLAPNVWQHTSFEEVNGWGVVPSNGLIVRDGGRVLVVDTAWTDDQTAQILNWIKQEINLPVALAVVTHA
HQDKMGGMDALHAAGIATYANALSNQLAPQEGMVAAQHSLTFAANGWVEPATAPNFGPLKVFYPGPGHTSDNITVGIDGT
DIAFGGCLIKDSKAKSLGNLGDADTEHYAASARAFGAAFPKASMIVMSHSAPDSRAAITHTARMADKL

The query sequence (length=228) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6jkb:A	244	228	0.9649	0.9016	0.9649	5.67e-155	5a5z:A, 5a5z:C, 8a76:A, 8a76:B, 7aez:A, 8b1w:A, 8b1w:B, 8b1z:A, 8b1z:B, 8b20:A, 8b20:B, 6c6i:A, 6c6i:B, 6c89:A, 6c89:B, 6c89:C, 6c89:D, 6cac:A, 6cac:B, 6cac:C, 6cac:D, 6d1a:A, 6d1b:A, 6d1c:A, 6d1d:A, 6d1e:A, 6d1f:A, 6d1g:A, 6d1h:A, 6d1i:A, 6d1j:A, 6d1k:A, 6efj:A, 4exs:B, 4exs:A, 4exy:A, 4exy:B, 4ey2:A, 4ey2:B, 4eyb:A, 4eyb:B, 4eyf:A, 4eyf:B, 4eyl:A, 4eyl:B, 8gpc:A, 8gpc:B, 8gpd:A, 8gpd:B, 8gpe:A, 8gpe:B, 4h0d:A, 4h0d:B, 4hky:A, 4hky:B, 4hl1:A, 4hl1:B, 4hl2:A, 4hl2:B, 8hy6:A, 8hy6:B, 8hyc:A, 8hyc:B, 8i8f:A, 8i8f:B, 6ibs:A, 6ibs:B, 6ibv:A, 6ibv:B, 6jkb:B, 5jqj:A, 5k4m:A, 6kxi:A, 6kxi:B, 6kzl:A, 6kzl:B, 6lip:A, 6liz:A, 6lj0:A, 6lj1:A, 6lj2:A, 6lj4:A, 6lj5:A, 6lj6:A, 6lj7:A, 6lj8:A, 6mdu:A, 6mgx:A, 6mgx:B, 6mgy:A, 6mgy:B, 6mgy:C, 6mgy:D, 6mgz:A, 6mgz:B, 6mh0:A, 6mh0:B, 5n0h:A, 5n0h:B, 5n0i:A, 5n0i:B, 5nbk:A, 5nbk:C, 6ny7:A, 5o2e:A, 5o2e:B, 5o2f:A, 5o2f:B, 6o3r:A, 6ogo:A, 6ogo:B, 6ogo:C, 6ol8:A, 6ol8:B, 6ovz:A, 6ovz:B, 6q2y:A, 6q2y:B, 6q30:A, 6q30:B, 8r5t:A, 8r5t:B, 4ram:A, 4ram:B, 4raw:A, 4raw:B, 4rbs:A, 4rbs:B, 4rl0:A, 4rl0:B, 4rl2:A, 4rl2:B, 4rm5:A, 4rm5:B, 4rm5:C, 4rm5:D, 6rmf:A, 6rmf:B, 3s0z:A, 3s0z:B, 3sfp:A, 3sfp:B, 3sfp:C, 3sfp:D, 8sk2:A, 8sko:A, 8sko:B, 8skp:A, 3spu:A, 3spu:B, 3spu:C, 3spu:D, 3spu:E, 6tgd:A, 6tgd:B, 6tt8:A, 6tta:A, 6ttc:A, 6twt:A, 6twt:B, 4tyf:A, 4tz9:A, 4tzb:A, 4tze:A, 4tze:B, 4tzf:A, 4u4l:A, 4u4l:B, 4u4l:C, 4u4l:D, 7uox:A, 7uox:B, 7uoy:A, 7uoy:B, 7up1:A, 7up1:B, 7up3:A, 7up3:B, 6v1m:A, 7vqj:A, 7vqj:B, 5wig:A, 5wig:B, 5wih:A, 6xbe:A, 6xbe:B, 6xbe:C, 6xbe:D, 6xbf:A, 6xbf:B, 6xbf:C, 6xbf:D, 6xci:A, 6xci:B, 5xp6:A, 5xp9:A, 5ypi:A, 5ypi:E, 5ypi:B, 5ypi:C, 5ypi:D, 5ypi:F, 5ypi:G, 5ypi:H, 5ypk:A, 5ypk:H, 5ypk:B, 5ypk:C, 5ypk:D, 5ypk:E, 5ypk:F, 5ypk:G, 5ypl:A, 5ypl:B, 5ypm:A, 5ypm:B, 5ypm:C, 5ypm:D, 5ypm:E, 5ypm:F, 5ypm:G, 5ypm:H, 5ypn:A, 5ypn:B, 5zge:A, 5zge:B, 5zgf:A, 5zgi:A, 5zgp:A, 5zgp:B, 5zgq:A, 5zgq:B, 5zgr:A, 5zgr:B, 5zgt:A, 5zgt:B, 5zgu:A, 5zgu:B, 5zgv:A, 5zgv:B, 5zgw:A, 5zgx:A, 5zgy:A, 5zgz:A, 5zh1:A, 5zh1:B, 5zio:A, 5zj1:A, 5zj2:A, 5zj7:A, 5zj8:A, 5zjc:A, 3zr9:A, 5zr8:A, 5zr8:E, 6zyp:A, 6zyp:B, 6zyq:A, 6zyq:B
2	6v73:A	228	225	0.5482	0.5482	0.5556	3.46e-87	6v3u:A, 6v3u:B, 6v72:A
3	6v3q:A	226	220	0.4518	0.4558	0.4682	4.85e-62	6v3q:B
4	6v5m:A	221	215	0.3640	0.3756	0.3860	1.01e-52	6v54:A, 6v61:A, 6v71:A
5	5lsc:A	235	219	0.3728	0.3617	0.3881	6.20e-50	8a4m:A, 7a5z:A, 7a60:A, 7a60:B, 5a87:A, 5a87:B, 5acu:A, 5acv:A, 5acv:B, 5acw:A, 5acw:B, 5acx:A, 5acx:B, 7afx:A, 7afx:B, 7afy:A, 7ayj:A, 6bm9:A, 6bm9:B, 6bm9:C, 6bm9:D, 4bz3:A, 4bz3:B, 4c1d:A, 4c1d:B, 4c1e:A, 4c1e:B, 7chv:A, 7cjl:B, 7cjl:A, 6dd0:A, 6dd0:B, 6dd1:A, 6dd1:B, 7du1:A, 7du1:B, 7dub:A, 7dub:B, 7due:A, 7due:B, 7dux:A, 7duy:A, 7duz:A, 7duz:B, 7dv0:A, 7dv1:A, 7dv1:B, 7dyy:A, 7dyy:B, 7dyz:A, 7dz0:A, 7dz0:B, 7dz1:A, 7dz1:B, 6ew3:A, 6ew3:B, 5fqc:A, 5fqc:B, 4fr7:A, 4fsb:A, 4fsb:B, 6hf5:A, 8hx5:A, 8hx5:B, 8hxo:A, 8hxo:B, 8hxp:A, 8hxp:B, 8hxu:A, 8hxu:B, 8hxv:A, 8hxv:B, 8hxw:A, 8hxw:B, 8hy1:A, 8hy1:B, 8hy2:A, 8hyd:A, 8i52:A, 8i52:D, 6j8r:A, 6jn6:A, 6jn6:B, 5k48:A, 5k48:B, 1ko2:A, 1ko3:A, 6kw1:A, 6kw1:B, 6kxo:A, 6kxo:B, 6kzn:A, 6kzn:B, 5lca:A, 5lcf:A, 5lch:A, 5le1:A, 5lm6:B, 5lm6:A, 5lsc:B, 5mm9:A, 5mm9:B, 5mxq:A, 5mxr:A, 5n4s:A, 5n4s:B, 5n4t:A, 5n4t:B, 5n55:A, 5n55:B, 5n55:C, 5n58:A, 5n58:B, 5n5g:A, 5n5h:A, 5n5i:A, 5nai:A, 5nhz:A, 5nhz:B, 5ni0:A, 5ni0:E, 4nq2:A, 6o5t:A, 6o5t:B, 5o7n:A, 5o7n:B, 6op6:A, 6op7:A, 7ove:A, 7ovf:A, 7ovh:A, 8p8y:A, 8p8z:A, 8p92:A, 8p93:A, 8p95:A, 8p9p:A, 8p9q:A, 8p9s:A, 8p9t:A, 8pa3:A, 8pa4:A, 8pa5:A, 8pa7:A, 8pa8:A, 8paa:A, 8pac:A, 8pad:A, 8pah:A, 8pal:A, 8pam:A, 8pan:A, 8pao:A, 8pb0:A, 8pb2:A, 8pg2:A, 8pg3:A, 8pg4:A, 8pg5:A, 8pg6:A, 8pg7:A, 8pg8:A, 8pg9:A, 8pga:A, 8pgb:A, 8pgc:A, 8pge:A, 8pgf:A, 8pgg:A, 8pgh:A, 8pgi:A, 8pgj:A, 8pgk:A, 8pgl:A, 8pgm:A, 8pgn:A, 8pgo:A, 8pgp:A, 8pgq:A, 8pgr:A, 8pgs:A, 8pgt:A, 8pgu:A, 8pgv:A, 8pgw:A, 8pgx:A, 8pgy:A, 8pgz:A, 8ph0:A, 8ph1:A, 8ph2:A, 8ph3:A, 8pjm:AAAA, 7pp0:A, 4pvo:A, 4pvo:B, 4pvt:A, 4pvt:B, 8r5u:A, 8r5u:B, 6rpn:A, 6rpn:B, 6sp7:A, 6sp7:E, 6tgi:A, 6tgi:B, 6tm9:A, 6tma:A, 6tma:B, 6tmb:A, 6tmb:B, 6tmc:A, 4ua4:A, 4ua4:B, 7up2:A, 4uwo:B, 4uwp:B, 4uwr:B, 4uws:B, 7uya:A, 7uyb:A, 7uyc:A, 7uyd:A, 7uyd:B, 6v1p:A, 6v1p:B, 2whg:A, 2whg:B, 2wrs:A, 2wrs:B, 5y6d:A, 5y6d:B, 5y6d:C, 5y6d:D, 5y6e:A, 5y6e:B, 6y6j:A, 5yd7:A, 5yd7:B, 7yhb:A, 7yhb:B, 7yhc:A, 7yhc:B, 7yhc:C, 7yhc:D, 7yhc:E, 7yhc:F, 7yhc:G, 7yhc:H, 7yhd:A, 6yrp:A, 7yrp:A, 7yrp:B, 2yz3:A, 2yz3:B, 6zgm:A, 6zyn:A, 6zyn:B, 6zyo:A, 6zyo:B
6	4d1t:A	229	224	0.3465	0.3450	0.3527	8.41e-46	4d1u:A, 4d1v:A, 4d1w:A, 2y87:A, 2y8a:A, 2y8b:A
7	6jka:C	228	225	0.3684	0.3684	0.3733	1.08e-45	4c1f:A, 4c1f:B, 4c1g:A, 4c1g:B, 1dd6:A, 1dd6:B, 1ddk:A, 2doo:A, 2doo:B, 7dtm:A, 7dtm:B, 7dtm:C, 7dtm:D, 7dtn:A, 7dtn:B, 7dtn:C, 7dtn:D, 5ev6:A, 5ev6:B, 5ev6:C, 5ev6:D, 5ev8:A, 5ev8:C, 5ev8:B, 5ev8:D, 5ewa:A, 5ewa:B, 5ewa:C, 5ewa:D, 4f6h:A, 4f6z:A, 5hh4:A, 5hh4:B, 5hh4:C, 5hh4:D, 8hyb:A, 8hyb:B, 8hyb:C, 8hyb:D, 8jao:A, 8jao:B, 6jed:A, 1jje:A, 1jje:B, 1jjt:A, 1jjt:B, 6jka:A, 6jka:B, 6jka:D, 6lbl:A, 4uam:A, 4uam:B, 4uam:C, 4uam:D, 1vgn:A, 1vgn:B, 1wuo:A, 1wuo:B, 1wuo:C, 1wuo:D, 1wup:A, 1wup:B, 1wup:C, 1wup:D, 3wxc:A, 3wxc:B, 7wzu:A, 7wzu:B, 7wzu:C, 7wzu:D, 7xhw:A, 7xhw:B, 7xhw:C, 7xhw:D, 7xhx:A, 7xhx:B, 7xhx:C, 7xhx:D, 8y0s:A, 8y0s:B, 8y0s:C, 8y0s:D, 5y5b:A, 7yh9:A, 7yh9:B, 7yh9:C, 7yh9:F, 7yh9:D, 7yh9:E, 7yha:A, 7yha:B, 7yha:C, 7yha:D, 8z5l:A, 8z5l:B, 8z5l:C, 8z5l:D, 6zyr:A, 6zyr:B, 6zyr:C, 6zyr:D, 6zys:A, 6zys:B, 6zys:C, 6zys:D
8	6r79:A	220	221	0.3640	0.3773	0.3756	2.60e-45	6r73:A, 6r73:B, 6r78:A, 6r78:B, 6r79:D, 6r79:B, 6r79:C, 6rzr:A, 6rzr:B, 6rzs:A, 6rzs:B, 6s0h:A, 6s0h:B, 4ubq:A, 6yi4:AAA, 6yi4:BBB, 6yi4:CCC
9	5mmd:E	221	220	0.3377	0.3484	0.3500	2.98e-45	5mmd:F
10	1a8t:A	230	225	0.3246	0.3217	0.3289	9.93e-43	1a7t:A, 1a7t:B, 1a8t:B, 2bmi:A, 2bmi:B, 1hlk:A, 1hlk:B, 1kr3:A, 1kr3:B, 1znb:A, 1znb:B, 2znb:A, 2znb:B, 3znb:A, 3znb:B, 4znb:A, 4znb:B
11	6l3s:A	218	221	0.3509	0.3670	0.3620	1.62e-42	6l3s:B
12	5b3r:B	219	221	0.3465	0.3607	0.3575	5.80e-42	5b3r:A
13	6xfr:B	216	206	0.3333	0.3519	0.3689	7.65e-41	6xfr:A
14	4wd6:A	219	220	0.3070	0.3196	0.3182	1.28e-39	4wd6:B, 4zej:A, 4zej:B
15	6jv4:A	221	215	0.3158	0.3258	0.3349	2.81e-39	6jv4:B, 6jv4:C, 6jv4:D, 6lf4:A, 6lf4:B, 6lf4:C, 6lf4:D, 6lfd:A, 6lfd:B, 6lfd:C, 6lfd:D
16	2m5c:A	227	212	0.3158	0.3172	0.3396	1.23e-36	1bc2:A, 1bc2:B, 2bc2:A, 2bc2:B, 3bc2:A, 2bfk:A, 2bfk:B, 2bfl:A, 2bfl:B, 2bfz:A, 2bfz:B, 2bg2:A, 2bg2:B, 2bg6:A, 2bg6:B, 2bg7:A, 2bg7:B, 2bg8:A, 2bg8:B, 2bga:A, 2bga:B, 1bmc:A, 1bvt:A, 4c09:A, 4c1c:A, 4c1h:A, 6dja:A, 1dxk:A, 6eum:A, 6ewe:A, 6f2n:A, 3fcz:A, 3fcz:B, 5fqa:A, 5fqb:A, 3i11:A, 3i13:A, 3i14:A, 3i15:A, 5jmx:A, 3knr:A, 3knr:B, 3knr:C, 3knr:D, 3kns:A, 3kns:B, 3kns:C, 3kns:D, 2m5d:A, 4nq4:A, 4nq5:A, 4nq6:A, 2nxa:A, 2nyp:A, 2nze:A, 2nze:B, 2nzf:A, 4tyt:A, 2uyx:A, 5w8w:A
17	2ynt:A	221	215	0.2939	0.3032	0.3116	1.39e-35	5acp:A, 5acp:B, 5acq:A, 5acq:B, 5acr:A, 5acr:B, 5acs:A, 5acs:B, 5act:A, 5act:B, 2ynt:B, 2ynt:C, 2ynv:A, 2ynv:B, 2ynw:A, 2ynw:B
18	6t5k:C	224	219	0.3070	0.3125	0.3196	4.47e-31
19	9c3d:A	224	220	0.2719	0.2768	0.2818	1.13e-29
20	1m2x:A	219	222	0.2588	0.2694	0.2658	7.45e-28	1m2x:B, 1m2x:C, 1m2x:D
21	6t5l:A	224	205	0.2412	0.2455	0.2683	5.11e-25	6t5l:B
22	3l6n:A	218	191	0.2368	0.2477	0.2827	1.44e-22
23	5nde:B	247	205	0.2368	0.2186	0.2634	2.47e-16	4bp0:A, 4bp0:C, 4bp0:B, 4bp0:D, 2fhx:A, 2fhx:B, 5ls3:B, 5ls3:A, 5ndb:A, 5ndb:B, 5nde:A
24	6cqs:A	242	217	0.2588	0.2438	0.2719	4.35e-13
25	3fai:A	227	195	0.2149	0.2159	0.2513	9.29e-12	3f9o:A, 2gkl:A, 3iof:A, 3iog:A, 2qds:A, 1x8g:A, 1x8h:A, 1x8i:A
26	7bj9:B	230	202	0.1711	0.1696	0.1931	3.80e-05	7bj9:A, 5ew0:A, 5ew0:B, 8hxn:A, 3q6v:A, 3q6v:B, 3sd9:A, 3sd9:B
27	8d2z:A	306	184	0.2018	0.1503	0.2500	0.008	8d2z:B
28	4ad9:A	288	146	0.1667	0.1319	0.2603	0.014	4ad9:B, 4ad9:C, 4ad9:D, 4ad9:E, 4ad9:F
29	7l0b:A	202	63	0.0746	0.0842	0.2698	0.019	7l0b:B, 7l0b:C, 7l0b:D
30	5ve5:A	350	146	0.1579	0.1029	0.2466	0.062	5ve3:B, 5ve3:A, 5ve4:A, 5ve4:B, 5ve4:C, 5ve5:B, 5ve5:C
31	3v17:A	276	119	0.1711	0.1413	0.3277	0.19	3v17:C, 3v17:B, 3v17:D
32	2yhe:A	639	134	0.1316	0.0469	0.2239	0.33	4av7:A, 4av7:B, 4av7:C, 4av7:D, 4av7:E, 4av7:F, 4axh:A, 4axh:B, 2yhe:B, 2yhe:C, 2yhe:D, 2yhe:E, 2yhe:F
33	7ev5:A	209	32	0.0570	0.0622	0.4062	0.36
34	2p4z:B	276	85	0.1009	0.0833	0.2706	0.51	2p4z:A
35	4lv8:A	360	88	0.0965	0.0611	0.2500	2.7	4lv5:A, 3q60:A
36	9cly:B	242	116	0.1140	0.1074	0.2241	6.3	9cly:A
37	1z11:A	467	42	0.0702	0.0343	0.3810	6.4	3ebs:A, 3ebs:B, 3ebs:C, 3ebs:D, 4ejg:A, 4ejg:B, 4ejg:C, 4ejg:D, 4ejg:E, 4ejg:F, 4ejg:G, 4ejg:H, 4ejh:A, 4ejh:B, 4ejh:C, 4ejh:D, 4ejh:E, 4ejh:F, 4ejh:G, 4ejh:H, 4eji:A, 4ejj:A, 4ejj:B, 4ejj:C, 4ejj:D, 2fdu:A, 2fdu:B, 2fdu:C, 2fdu:D, 2fdv:A, 2fdv:B, 2fdv:C, 2fdv:D, 2fdw:A, 2fdw:B, 2fdw:C, 2fdw:D, 2fdy:A, 2fdy:B, 2fdy:C, 2fdy:D, 2p85:A, 2p85:B, 2p85:C, 2p85:D, 2p85:E, 2p85:F, 2pg5:A, 2pg5:B, 2pg5:C, 2pg5:D, 2pg6:A, 2pg6:B, 2pg6:C, 2pg6:D, 2pg7:A, 2pg7:B, 2pg7:C, 2pg7:D, 4rui:D, 4rui:A, 4rui:B, 4rui:C, 4rui:E, 4rui:F, 3t3q:A, 3t3q:B, 3t3q:C, 3t3q:D, 3t3r:A, 3t3r:B, 3t3r:C, 3t3r:D, 3t3s:A, 3t3s:B, 3t3s:C, 3t3s:D, 3t3s:E, 3t3s:F, 3t3s:G, 3t3s:H, 1z10:A, 1z10:B, 1z10:C, 1z10:D, 1z11:B, 1z11:C, 1z11:D
38	6k4t:A	260	97	0.1184	0.1038	0.2784	6.7	5axo:A, 5axr:A, 5aya:A, 5b15:A, 5b1u:A, 6k4x:A, 3vpe:A, 3vqz:A
39	5a0t:A	454	74	0.0833	0.0419	0.2568	8.0	5a0t:B, 5a0v:A, 5a0v:B

[Back]