Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GDIFEVELAKNDNSLGISVTGGVNTSVRHGGIYVKAVIPQGAAESDGRIHKGDRVLAVNGVSLEGATHKQAVETLRNTGQ
VVHLLLEKG

The query sequence (length=89) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2m0z:A 97 89 0.9775 0.8969 0.9775 9.24e-58 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
2 8bq8:C 93 90 0.4270 0.4086 0.4222 1.44e-16 8bq8:A, 8bq8:B
3 7pc3:A 405 88 0.4382 0.0963 0.4432 1.12e-15 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
4 2ka9:A 189 88 0.4382 0.2063 0.4432 1.22e-15 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
5 2ka9:A 189 88 0.3596 0.1693 0.3636 1.67e-11 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
6 4xhv:A 94 85 0.3820 0.3617 0.4000 8.62e-14
7 7p73:A 420 85 0.3483 0.0738 0.3647 1.37e-12 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
8 2exg:A 101 87 0.3820 0.3366 0.3908 2.34e-12 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
9 2r4h:C 98 88 0.3146 0.2857 0.3182 6.46e-12
10 8cn1:H 101 88 0.3483 0.3069 0.3523 1.74e-11 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
11 2qt5:A 194 84 0.3483 0.1598 0.3690 1.85e-11 2qt5:B
12 2qt5:A 194 90 0.3483 0.1598 0.3444 9.95e-06 2qt5:B
13 6xa7:B 96 84 0.3820 0.3542 0.4048 2.10e-11 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
14 5heb:A 119 73 0.3034 0.2269 0.3699 3.70e-11 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
15 2koh:A 111 78 0.3820 0.3063 0.4359 3.75e-11 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
16 7weg:B 96 77 0.3258 0.3021 0.3766 3.81e-11 7weg:A
17 1n7f:A 86 86 0.3483 0.3605 0.3605 1.10e-10 1n7f:B
18 8b82:A 108 78 0.3483 0.2870 0.3974 1.36e-10 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
19 4wyu:A 201 89 0.3483 0.1542 0.3483 1.73e-10 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
20 4wyu:A 201 81 0.3708 0.1642 0.4074 2.41e-09 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
21 8c1t:A 90 87 0.3146 0.3111 0.3218 2.75e-10 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
22 3jxt:A 96 75 0.3146 0.2917 0.3733 2.98e-10 3jxt:B
23 6zbq:A 89 71 0.3146 0.3146 0.3944 5.26e-10 6zc4:A
24 7pc5:A 405 71 0.3146 0.0691 0.3944 6.51e-10
25 6gbe:A 119 87 0.3933 0.2941 0.4023 7.74e-10
26 8bp4:A 93 80 0.2809 0.2688 0.3125 8.77e-10 8bp4:C, 8bp4:B
27 1l6o:A 95 65 0.3034 0.2842 0.4154 8.97e-10 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
28 2kaw:A 90 62 0.3034 0.3000 0.4355 2.85e-09 6lcb:A, 2mx6:A
29 7pcb:A 415 80 0.3820 0.0819 0.4250 4.21e-09 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
30 4e34:A 87 76 0.3708 0.3793 0.4342 4.88e-09 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
31 5wou:A 95 88 0.3146 0.2947 0.3182 9.85e-09
32 5zys:A 90 85 0.2809 0.2778 0.2941 2.10e-08
33 8bv7:A 95 58 0.2247 0.2105 0.3448 2.63e-08 8buw:A, 8buw:B
34 7qct:A 90 89 0.3146 0.3111 0.3146 1.05e-07 7qct:B
35 2i0i:A 81 81 0.3146 0.3457 0.3457 4.10e-07 2i0i:B, 2i0i:C
36 6x23:A 89 81 0.2472 0.2472 0.2716 1.49e-06
37 2pdz:A 86 70 0.2921 0.3023 0.3714 1.55e-06
38 1ihj:B 95 78 0.2135 0.2000 0.2436 2.78e-06 1ihj:A
39 7p70:A 407 70 0.2809 0.0614 0.3571 4.24e-06 7pc4:A, 7qql:A
40 1n7t:A 103 82 0.2921 0.2524 0.3171 5.84e-06 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
41 4xh7:A 110 67 0.2584 0.2091 0.3433 6.37e-06
42 5oak:A 90 49 0.2360 0.2333 0.4286 1.53e-05 5oak:C
43 2m0v:A 128 56 0.2247 0.1562 0.3571 2.19e-05
44 7qqm:A 413 93 0.3258 0.0702 0.3118 2.28e-05
45 1rzx:A 98 71 0.2360 0.2143 0.2958 2.59e-05 5i7z:A, 1x8s:A
46 7qqn:C 414 70 0.2360 0.0507 0.3000 3.44e-05 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
47 5n7d:A 423 91 0.2921 0.0615 0.2857 6.91e-05 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
48 3ch8:A 190 77 0.2921 0.1368 0.3377 1.18e-04 2qbw:A
49 2kpl:A 129 91 0.2921 0.2016 0.2857 1.19e-04
50 2m0u:A 117 56 0.2472 0.1880 0.3929 1.24e-04
51 3vqg:A 85 87 0.2809 0.2941 0.2874 1.24e-04
52 2l4t:A 124 84 0.3146 0.2258 0.3333 1.76e-04 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
53 6kz1:A 97 70 0.2472 0.2268 0.3143 2.93e-04 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
54 1b8q:A 127 64 0.2472 0.1732 0.3438 4.45e-04
55 4wsi:A 372 75 0.2360 0.0565 0.2800 4.54e-04 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
56 2os6:A 89 82 0.2697 0.2697 0.2927 0.001
57 7x2e:A 163 64 0.2247 0.1227 0.3125 0.001 2kbs:A
58 3r0h:D 199 84 0.2697 0.1206 0.2857 0.002 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
59 3r0h:D 199 63 0.2135 0.0955 0.3016 6.9 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
60 6q0m:B 94 82 0.2584 0.2447 0.2805 0.003
61 1u38:A 89 44 0.1685 0.1685 0.3409 0.004
62 1zub:A 109 56 0.2247 0.1835 0.3571 0.006
63 6ar4:B 87 73 0.2472 0.2529 0.3014 0.008 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
64 2egn:A 83 56 0.1910 0.2048 0.3036 0.018
65 7d6f:A 87 48 0.1798 0.1839 0.3333 0.027
66 4ydp:A 83 51 0.1573 0.1687 0.2745 0.057 4ydp:B
67 3qw4:C 447 48 0.1798 0.0358 0.3333 0.059 3qw4:B
68 6hks:B 94 66 0.1798 0.1702 0.2424 0.064 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
69 3cyy:B 81 36 0.1573 0.1728 0.3889 0.13 3cyy:A
70 5ez0:D 95 77 0.2135 0.2000 0.2468 0.44 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
71 6nid:B 88 78 0.2360 0.2386 0.2692 0.52 6nid:A, 6nid:C
72 3pep:A 326 31 0.1236 0.0337 0.3548 1.3 1psa:A, 1psa:B, 6xct:A, 6xcy:A, 6xcz:A, 6xd2:A
73 2kqf:A 96 42 0.1461 0.1354 0.3095 2.1 2kyl:A
74 1mkm:A 246 90 0.2247 0.0813 0.2222 2.5
75 2c1l:B 358 41 0.1685 0.0419 0.3659 3.2 3zi5:A, 3zi5:D
76 6gqi:A 529 27 0.1011 0.0170 0.3333 4.7 6gqi:B, 5m0z:A, 5m10:A, 7v8o:A, 7v8o:B, 7v8r:A, 7v8s:A, 7v8s:B
77 2b1g:A 590 34 0.1461 0.0220 0.3824 6.0 2b1g:D, 2b1i:A, 2b1i:B, 1g8m:A, 2iu0:B, 2iu3:B, 1m9n:A, 1m9n:B, 1oz0:A, 1oz0:B, 1thz:A, 1thz:B
78 5m7n:B 428 78 0.2584 0.0537 0.2949 6.4
79 1pso:E 326 40 0.1348 0.0368 0.3000 7.5 1qrp:E
80 7koe:C 438 64 0.2135 0.0434 0.2969 8.5 7koe:G
81 8w6z:A 396 44 0.1573 0.0354 0.3182 9.5 8w72:A
82 4bmv:C 258 23 0.1011 0.0349 0.3913 9.7 4bmv:A, 4bmv:B, 4bmv:D, 4bmv:E, 4bmv:F, 4bmv:G, 4bmv:H, 4bmv:I, 4bmv:J
83 5znq:A 183 36 0.1573 0.0765 0.3889 9.9 5b6h:A, 5y07:A, 5y07:B, 5zc7:A, 5zc7:B, 5zmi:A, 5znq:B, 5zoc:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218