Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSI
IAIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGFMTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDR
IAQPNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVNRMHESMK
LFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATD
TKNVQFVFDAVTDVIIKNNLK

The query sequence (length=341) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1agr:A 350 345 0.9883 0.9629 0.9768 0.0 1agr:D, 1as0:A, 1as2:A, 1as3:A, 1bh2:A, 1cip:A, 6crk:A, 3d7m:A, 3ffa:A, 4g5o:A, 4g5o:C, 4g5o:B, 4g5o:D, 4g5q:A, 4g5q:C, 4g5q:B, 4g5q:D, 4g5r:A, 4g5r:B, 4g5r:C, 4g5r:D, 4g5s:A, 4g5s:C, 4g5s:D, 4g5s:B, 2g83:A, 2g83:B, 1gfi:A, 1gg2:A, 1gia:A, 1gil:A, 1git:A, 1gp2:A, 2gtp:A, 2gtp:B, 8gvx:F, 8gvx:E, 8gvx:G, 8gvx:H, 2ihb:A, 2ik8:A, 2ik8:C, 5kdl:A, 5kdl:B, 5kdo:A, 1kjy:A, 1kjy:C, 6m8h:A, 6mhe:A, 6mhf:A, 4n0d:A, 4n0e:A, 2ode:A, 2ode:C, 2om2:A, 2om2:C, 3onw:A, 3onw:B, 8oy1:A, 4pam:A, 4pao:A, 4paq:A, 3qe0:B, 3qe0:A, 3qe0:C, 3qi2:A, 3qi2:B, 7rky:A, 1svk:A, 1svs:A, 5tdh:A, 5tdh:H, 3umr:A, 3ums:A, 2v4z:A, 7x6i:E, 7x6i:F, 7x6i:G, 7x6i:H, 2xns:A, 2xns:B, 1y3a:A, 1y3a:B, 1y3a:C, 1y3a:D, 2zjy:A, 2zjz:A, 2zjz:B
2 3ffb:A 327 337 0.9326 0.9725 0.9436 0.0 1bof:A, 1gdd:A, 4pan:A
3 3v00:C 353 348 0.7361 0.7110 0.7213 0.0 1fqj:A, 1fqj:D, 1fqk:A, 1fqk:C, 1got:A, 7jsn:E, 7jsn:F, 1tad:A, 1tad:B, 1tad:C, 1tag:A, 1tnd:A, 1tnd:B, 1tnd:C, 3v00:B, 3v00:A
4 3c7k:C 311 312 0.6598 0.7235 0.7212 7.51e-162 3c7k:A
5 1shz:D 327 328 0.6540 0.6820 0.6799 1.48e-161 1shz:A
6 8iys:A 355 355 0.5806 0.5577 0.5577 6.54e-128 3ah8:A, 2bcj:Q, 5do9:A, 5do9:C, 5do9:E, 4ekc:A, 4ekc:C, 4ekd:A, 4gnk:A, 4gnk:C, 8jpb:Q, 8jpc:Q, 8jpe:Q, 4qj3:A, 4qj4:A, 4qj5:A, 2rgn:A, 2rgn:D, 7sq2:A, 8uqn:A, 8uqo:A
7 7rkf:A 350 348 0.5572 0.5429 0.5460 6.08e-124
8 8pjk:A 222 170 0.4633 0.7117 0.9294 5.61e-115 7e2x:A, 7e2z:A
9 8pjk:A 222 58 0.1466 0.2252 0.8621 6.51e-24 7e2x:A, 7e2z:A
10 8fn0:B 212 161 0.3724 0.5991 0.7888 6.25e-88
11 8fn0:B 212 52 0.1261 0.2028 0.8269 2.04e-19
12 1zca:A 318 321 0.3930 0.4214 0.4174 9.67e-84 1zca:B
13 3ab3:A 322 327 0.3959 0.4193 0.4128 2.26e-83 3ab3:C, 3cx6:A, 3cx7:A, 3cx8:A, 1zcb:A
14 6eg8:I 372 361 0.4370 0.4005 0.4127 2.46e-81 6au6:A, 1azs:C, 1azt:A, 1azt:B, 7bph:A, 8buz:B, 8bv5:B, 3c14:C, 3c15:C, 3c16:C, 1cjk:C, 1cjt:C, 1cju:C, 1cjv:C, 1cs4:C, 1cul:C, 7e5e:A, 7e5e:B, 7e5e:C, 7e5e:D, 6eg8:J, 6eg8:K, 6eg8:L, 3g82:C, 8gge:A, 8ggf:A, 2gvd:C, 2gvz:C, 3maa:C, 7pde:B, 7pdf:B, 6r3q:B, 6r4o:B, 6r4p:B, 1tl7:C, 1u0h:C, 8uo3:A
15 8htg:B 334 327 0.4164 0.4251 0.4343 1.08e-80 8htg:A, 8htg:C, 8htg:D
16 4fid:A 318 319 0.3578 0.3836 0.3824 3.94e-71 4fid:B
17 2xtz:A 343 332 0.3783 0.3761 0.3886 3.48e-70
18 8uo1:A 334 360 0.4076 0.4162 0.3861 1.37e-65 8gga:A
19 2xtz:B 291 325 0.3666 0.4296 0.3846 9.56e-64
20 8ggb:A 310 358 0.3959 0.4355 0.3771 3.77e-63 8gg9:A, 8ggc:A
21 2xtz:C 270 325 0.3372 0.4259 0.3538 1.87e-53
22 8uo4:A 292 357 0.3548 0.4144 0.3389 9.98e-48 8uo2:A
23 8xql:A 240 178 0.2522 0.3583 0.4831 8.95e-45
24 8xql:A 240 50 0.0762 0.1083 0.5200 4.12e-07
25 8unx:A 244 184 0.2287 0.3197 0.4239 6.36e-39 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
26 8unx:A 244 48 0.0792 0.1107 0.5625 1.78e-07 7f1o:A, 7f1z:A, 7f23:A, 7f24:A, 5g53:C, 8gfv:A, 8gfw:A, 8gfx:A, 8gfy:A, 8gfz:A, 8gg0:A, 8gg1:A, 8gg2:A, 8gg3:A, 8gg4:A, 8gg5:A, 8gg6:A, 8gg7:A, 8gg8:A, 8gw8:A, 8jr9:A, 8unl:A, 8unm:A, 8unn:A, 8uno:A, 8unp:A, 8unq:A, 8unr:A, 8uns:A, 8unt:A, 8unu:A, 8unv:A, 8unw:A, 8uny:A, 8unz:A, 8uo0:A, 7vui:A, 7vuj:A
27 3lvq:E 420 90 0.0909 0.0738 0.3444 9.15e-10 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
28 3lvq:E 420 99 0.0762 0.0619 0.2626 4.3 2b0o:E, 2b0o:F, 2b0o:G, 2b0o:H, 3lvr:E
29 6bbp:A 520 90 0.0880 0.0577 0.3333 1.76e-08 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
30 6bbp:A 520 91 0.0733 0.0481 0.2747 1.4 2a5d:A, 2a5f:A, 2a5g:A, 6bbq:A, 1e0s:A, 1fgy:A, 1fhw:A, 1fhw:B, 1fhx:A, 1fhx:B, 4fme:C, 4fme:F, 2j5x:A, 2j5x:B, 4kax:A, 4kax:B, 3n5c:A, 3n5c:B, 3pcr:B, 2r09:A, 2r09:B, 2r0d:A, 2r0d:B, 3vhx:A, 3vhx:C, 3vhx:E, 3vhx:G, 2w83:A, 2w83:B, 2w83:E, 7xrd:A, 7xrd:B, 7xrd:C, 7xrd:D
31 6a8d:A 181 103 0.0909 0.1713 0.3010 1.74e-07
32 6a8d:A 181 50 0.0469 0.0884 0.3200 1.6
33 7rll:B 177 88 0.0850 0.1638 0.3295 5.98e-07 7rll:A
34 7rll:B 177 43 0.0381 0.0734 0.3023 7.2 7rll:A
35 8d4c:C 180 90 0.0821 0.1556 0.3111 1.11e-06 8d4c:H, 8d4c:D, 8d4c:F, 8d4d:C, 8d4d:H, 8d4d:D, 8d4d:F, 8d4e:C, 8d4e:H, 8d4e:Z, 8d4f:C, 8d4f:H, 8d4f:Z, 8d4f:D, 8d4f:F, 8d4f:Q, 8d4g:C, 8d4g:H, 8d4g:Z, 8d4g:D, 8d4g:F, 8d4g:Q, 8d9r:C, 8d9r:H, 8d9r:Z, 8d9r:J, 8d9r:X, 8d9r:3, 8d9r:K, 8d9r:a, 8d9r:4, 8d9r:O, 8d9r:b, 8d9r:5, 8d9r:P, 8d9r:c, 8d9r:6, 8d9r:Q, 8d9r:d, 8d9r:7, 8d9s:C, 8d9s:H, 8d9s:Z, 8d9s:J, 8d9s:X, 8d9s:3, 8d9s:K, 8d9s:a, 8d9s:4, 8d9s:O, 8d9s:b, 8d9s:5, 8d9s:P, 8d9s:c, 8d9s:6, 8d9s:Q, 8d9s:d, 8d9s:7, 8d9t:C, 8d9t:H, 8d9t:J, 8d9t:X, 8d9t:K, 8d9t:Z, 8d9t:O, 8d9t:a, 8d9t:P, 8d9t:b, 8d9t:Q, 8d9t:c, 8d9u:C, 8d9u:H, 8d9u:J, 8d9u:X, 8d9u:K, 8d9u:Z, 8d9u:O, 8d9u:a, 8d9u:P, 8d9u:b, 8d9u:Q, 8d9u:c, 8d9v:C, 8d9v:H, 8d9v:D, 8d9v:F, 8d9w:F, 8d9w:I, 1hur:A, 1hur:B, 7ux3:C, 7ux3:H
36 3lrp:A 181 90 0.0762 0.1436 0.2889 3.36e-06
37 2k5u:A 181 92 0.0762 0.1436 0.2826 3.49e-06 2ksq:A, 1mr3:F, 4q66:F, 4q66:L, 3tjz:A, 3tjz:D
38 1z6x:A 175 93 0.0821 0.1600 0.3011 1.17e-05 1z6x:B
39 8e0c:A 185 107 0.0792 0.1459 0.2523 2.74e-05 8e0a:B, 8e0b:B, 8e0d:A, 1f6b:A, 1f6b:B, 2fa9:A, 2fa9:B, 2fmx:A, 2fmx:B
40 6pta:A 165 90 0.0762 0.1576 0.2889 3.65e-05 6pta:B, 6pta:C, 6pta:D, 5uf8:A, 5uf8:B, 5uf8:C
41 5di3:B 204 96 0.0821 0.1373 0.2917 4.03e-05 4m9q:A, 4m9q:B, 4m9q:C
42 2h57:B 167 138 0.1085 0.2216 0.2681 4.83e-05 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
43 2h57:B 167 44 0.0469 0.0958 0.3636 9.6 2h57:A, 2h57:C, 6vbv:3
44 5de3:A 166 72 0.0616 0.1265 0.2917 2.18e-04 5di3:A
45 5uf8:D 160 90 0.0762 0.1625 0.2889 2.49e-04
46 3doe:A 189 79 0.0704 0.1270 0.3038 3.90e-04 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
47 3doe:A 189 21 0.0323 0.0582 0.5238 7.7 3dof:A, 4gok:B, 4gok:A, 1ksg:A, 1ksh:A, 1ksj:A
48 6zga:C 168 108 0.0850 0.1726 0.2685 5.21e-04 8bsh:B, 4bzi:B, 4bzi:J, 4bzi:K, 6gni:B, 1m2o:B, 1m2o:D, 2qtv:B, 6zga:G
49 3o47:A 289 90 0.0762 0.0900 0.2889 8.47e-04 4c0a:C, 4c0a:D, 4c0a:G, 4c0a:H, 6cm9:C, 6cm9:H, 6cri:C, 6cri:H, 6cri:K, 6cri:U, 6cri:L, 6cri:V, 6d83:C, 6d83:H, 6d84:C, 6d84:H, 6d84:I, 6d84:N, 6dff:C, 6dff:H, 7dn8:D, 7dn8:B, 7dn8:F, 7dn8:H, 7dn9:B, 7dn9:D, 7dn9:F, 7dn9:H, 3dwd:A, 3dwd:B, 4hmy:C, 6ii6:C, 6ii6:D, 1j2j:A, 2j59:A, 2j59:B, 2j59:C, 2j59:D, 2j59:E, 2j59:F, 7mge:E, 1o3y:A, 1o3y:B, 3o47:B, 8p50:B, 7r4h:C, 7r4h:H, 1r8q:A, 1r8q:B, 1r8s:A, 1re0:A, 1rrf:A, 1rrg:A, 1rrg:B, 1s9d:A, 8sdw:A, 1u81:A, 7wqy:A, 7wqy:B
50 4y0v:A 165 90 0.0762 0.1576 0.2889 0.001 4y0v:B, 4ylg:A, 4ylg:B
51 2x77:A 181 82 0.0762 0.1436 0.3171 0.002 2x77:B
52 8oun:A 181 186 0.1056 0.1989 0.1935 0.003 8oum:A, 8oum:B, 8oum:C, 8oum:D, 8oum:E, 8oun:B
53 1upt:G 170 90 0.0704 0.1412 0.2667 0.003 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
54 1upt:G 170 29 0.0293 0.0588 0.3448 9.5 4dcn:A, 4dcn:B, 5ee5:B, 5j5c:A, 1r4a:A, 1r4a:B, 1r4a:C, 1r4a:D, 1upt:A, 1upt:C, 1upt:E
55 2b6h:A 171 90 0.0704 0.1404 0.2667 0.004
56 8oul:A 185 93 0.0792 0.1459 0.2903 0.004 8ouk:A, 8oul:B, 8oul:C
57 3aq4:A 170 90 0.0733 0.1471 0.2778 0.006 3aq4:B
58 4ile:A 176 88 0.0616 0.1193 0.2386 0.007 2al7:A, 2h18:A, 8jc5:A, 8jc5:B, 8jca:A, 1zd9:A
59 4q66:C 134 87 0.0733 0.1866 0.2874 0.020
60 3p27:B 444 120 0.0968 0.0743 0.2750 0.085 3p27:A
61 1yzg:A 168 75 0.0616 0.1250 0.2800 0.090
62 4zi2:A 185 72 0.0528 0.0973 0.2500 0.20 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
63 4zi2:A 185 31 0.0381 0.0703 0.4194 2.1 3bh6:A, 3bh7:A, 1fzq:A, 4goj:A, 4goj:B, 7ok7:A, 7ok7:B, 7ok7:C, 7ok7:D, 7ok7:E, 7ok7:F, 4zi2:B, 4zi3:A, 4zi3:B
64 6mao:A 137 58 0.0528 0.1314 0.3103 0.28
65 3lkb:A 382 114 0.0938 0.0838 0.2807 0.54 3lkb:B
66 6i3p:C 630 87 0.0616 0.0333 0.2414 0.57 6i3p:A, 6i3p:B, 6i3p:D, 6qic:A, 6qic:B, 6qic:C, 6qic:D
67 4bas:A 172 35 0.0381 0.0756 0.3714 0.66
68 4wnr:A 323 29 0.0381 0.0402 0.4483 0.86
69 4v0l:A 168 86 0.0645 0.1310 0.2558 0.99 4v0k:A, 4v0k:B, 4v0l:B, 4v0m:A, 4v0m:C, 4v0m:E, 4v0m:G, 4v0n:A, 4v0n:C, 4v0n:E, 4v0n:G, 4v0o:A, 4v0o:C, 4v0o:E, 4v0o:G
70 6vs4:A 223 100 0.0674 0.1031 0.2300 1.3 6vs4:B
71 8dr5:A 646 38 0.0440 0.0232 0.3947 2.3 8dqx:A, 8dqz:A, 8dr0:A, 8dr1:A, 8dr3:A, 8dr4:A, 8dr6:A, 8dr7:A, 1sxj:A, 7tfh:A, 7tfi:A, 7tfj:A, 7thj:A, 7thv:A, 7ti8:A, 7tib:A, 7tic:A, 7tid:A, 7tku:A, 7u19:A, 7u1a:A, 7u1p:A
72 7tfk:A 360 38 0.0440 0.0417 0.3947 2.7 7tfl:A
73 4eyw:B 634 35 0.0293 0.0158 0.2857 4.0 2deb:A, 2deb:B, 4ep9:A, 4eph:A, 4eyw:A, 2fw3:A, 2rcu:A, 2rcu:B
74 5djs:A 520 98 0.0792 0.0519 0.2755 4.1 5djs:B, 5djs:C, 5djs:D
75 7q1c:A 427 76 0.0733 0.0585 0.3289 6.8 7q1b:A, 7q1c:B
76 5i8f:A 164 32 0.0411 0.0854 0.4375 7.2 4n3e:A, 4n3e:B, 4n3e:Z, 4n3e:b, 4n3e:C, 4n3e:D, 4n3e:E, 4n3e:F, 4n3e:G, 4n3e:H, 4n3e:I, 4n3e:J, 4n3e:K, 4n3e:L, 4n3e:P, 4n3e:M, 4n3e:N, 4n3e:O, 4n3e:Q, 4n3e:S, 4n3e:R, 4n3e:U, 4n3e:V, 4n3e:W, 4n3e:X, 4n3e:Y, 4n3e:a, 6sjj:B, 6sjj:j, 6sjj:A, 6sjj:R, 6sjj:Q, 6sjj:P, 6sjj:O, 6sjj:N, 6sjj:M, 6sjj:L, 6sjj:K, 6sjj:J, 6sjj:I, 6sjj:a, 6sjj:Y, 6sjj:H, 6sjj:G, 6sjj:F, 6sjj:D, 6sjj:f, 6sjj:E, 6sjj:C, 6sjj:e, 6sjj:d, 6sjj:c, 6sjj:b, 6sjj:Z, 6sjj:X, 6sjj:W, 6sjj:V, 6sjj:U, 6sjj:T, 6sjj:S, 6sjj:i, 6sjj:h, 6sjj:g
77 7am2:BU 463 94 0.0850 0.0626 0.3085 8.0
78 6rm8:A 655 74 0.0762 0.0397 0.3514 9.9 6fa5:A, 6faa:A, 6fac:A, 6rm9:A, 6rma:A, 6rmb:A, 6rmc:A, 6rmc:B, 6zm2:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218