BioLiP

>protein
GCSTVDTVKDFNKDNFFTGSWYITHYKLGDSTLEVGDKNCTKFLHQKTADGKIKEVFSNYNPNAKTYSYDISFAKVSDFD
GNNGKYTAKNVIVEKDGRKIDERTLQVSYIDTDYSKYSVVHVCDPAAPDYYLYAVQSRTENVKEDVKSKVEAALGKVGLK
LSGLFDATTLGNKCQYDDETLQKLLKQSFPNYEK

The query sequence (length=194) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4ge1:A	195	194	1.0000	0.9949	1.0000	3.23e-143	4ge1:B, 4ge1:C, 4ge1:D
2	2a3f:X	180	185	0.3041	0.3278	0.3189	2.12e-15	2acp:X, 2ah7:X, 2al0:X, 2all:X, 2amm:X, 2asn:X, 1euo:A, 2eu7:X, 2gtf:X, 2hys:A, 1pee:A, 1pm1:X, 1t68:X
3	4xmh:A	185	178	0.2835	0.2973	0.3090	3.04e-12	5m6j:A, 5m6k:A, 4xmc:A, 4xmd:A, 4xme:A, 4xmf:A, 4xmg:A
4	1u17:A	185	184	0.3196	0.3351	0.3370	3.07e-12	1np1:A, 1np1:B, 2np1:A, 2np1:B, 3np1:A, 3np1:B, 4np1:A, 4np1:B, 1u17:B, 1u18:A, 1u18:B
5	2at0:X	184	189	0.2887	0.3043	0.2963	2.83e-11	2at3:X, 2at5:X, 2at6:X, 2at8:X, 3c76:X, 3c77:X, 3c78:X, 1d2u:A, 1d3s:A, 1eqd:A, 1erx:A, 3fll:A, 4gnw:A, 4gnw:B, 4grj:A, 4grj:B, 4hpa:A, 4hpb:A, 4hpc:A, 4hpd:A, 5hwz:A, 1ike:A, 1ikj:A, 1koi:A, 1ml7:A, 3mvf:A, 1np4:A, 2ofr:X, 1sxu:A, 1sxw:A, 1sxx:A, 1sxy:A, 1sy0:A, 1sy1:A, 1sy2:A, 1sy3:A, 3tga:A, 3tgb:A, 3tgc:A, 1u0x:A, 1x8n:A, 1x8o:A, 1x8p:A, 1x8q:A, 1ywa:A, 1ywb:A, 1ywc:A, 1ywd:A
6	5ha0:A	156	125	0.1701	0.2115	0.2640	0.016	5h9l:A, 5h9n:A, 5hae:A
7	1gka:B	174	162	0.2165	0.2414	0.2593	0.032
8	1bso:A	162	70	0.1031	0.1235	0.2857	0.31	1b0o:A, 7bf7:AAA, 7bf8:BBB, 7bf9:AAA, 4dq3:A, 4dq4:A, 7er3:A, 7er3:B, 7er3:C, 7er3:D, 6ge7:A, 6gf9:A, 6gfs:A, 6ghh:A, 2gj5:A, 4gny:A, 1gx8:A, 1gx9:A, 1gxa:A, 4ib6:A, 4ib7:A, 4ib8:A, 4ib9:A, 4iba:A, 4kii:A, 7kot:A, 7kp5:AA1, 7kp5:BA1, 5lke:A, 5lkf:A, 4lzu:A, 4lzv:A, 6nkq:B, 3nq9:A, 5nuj:A, 5nuk:A, 5num:A, 5nun:A, 4omw:C, 4omw:D, 4omx:A, 7q19:AAA, 7q2n:AAA, 7q2n:BBB, 7q2o:AAA, 7q2o:BBB, 7q2p:AAA, 7q2p:BBB, 6t42:AAA, 6t44:AAA, 6t44:BBB, 3uew:A, 7wql:A, 7wql:B, 4y0p:A, 4y0q:A, 4y0r:A, 4y0s:A, 5y5c:A, 5y5c:B, 7z9z:AAA, 7za0:AAA, 7zcd:AAA
9	1gka:A	180	72	0.1031	0.1111	0.2778	0.57
10	8yhe:H	524	78	0.1340	0.0496	0.3333	0.60	8yhd:H
11	4g10:A	263	107	0.1186	0.0875	0.2150	1.8	4yav:A
12	5cyv:B	143	50	0.0722	0.0979	0.2800	6.8	5cyv:A, 3fm5:C
13	3zwm:H	253	69	0.0825	0.0632	0.2319	7.4	3i9j:A, 3i9j:B, 3i9k:B, 3i9l:A, 3i9o:A, 3i9o:B, 1r15:A, 1r15:B, 1r15:C, 1r15:D, 1r15:E, 1r15:F, 1r15:G, 1r15:H, 1r16:A, 1r16:B, 3zwm:A, 3zwm:B, 3zwm:C, 3zwm:D, 3zwm:E, 3zwm:F, 3zwm:G, 3zwn:A, 3zwn:B, 3zwo:A, 3zwo:B, 3zwo:C, 3zwo:E, 3zwo:F, 3zwo:G, 3zwo:H, 3zwp:A, 3zwp:B, 3zwp:C, 3zwp:D, 3zwp:E, 3zwp:F, 3zwp:G, 3zwp:H, 3zwv:A, 3zwv:H, 3zwv:B, 3zwv:C, 3zwv:D, 3zwv:E, 3zwv:F, 3zwv:G, 3zww:A, 3zww:B, 3zww:C, 3zww:D, 3zww:E, 3zww:F, 3zww:G, 3zww:H, 3zwx:A, 3zwx:B, 3zwx:C, 3zwx:D, 3zwx:E, 3zwx:F, 3zwx:G, 3zwx:H, 3zwy:A, 3zwy:B, 3zwy:C, 3zwy:D, 3zwy:E, 3zwy:F, 3zwy:G, 3zwy:H
14	2a2g:A	158	62	0.0722	0.0886	0.2258	7.9	2a2g:B, 2a2g:C, 2a2g:D
15	1vzy:A	290	28	0.0619	0.0414	0.4286	8.5	1vzy:B

[Back]