Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GAYTYKELEREQYWPSENLKISITGAGGFIASHIARRLKHEGHYVIASDWKKNEHMTEDMFCDEFHLVDLRVMENCLKVT
EGVDHVFNLAADMGGMGFIQSNHSVIMYNNTMISFNMIEAARINGIKRFFYASSACIYPEFKQLETTNVSLKESDAWPAE
PQDAYGLEKLATEELCKHYNKDFGIECRIGRFHNIYGPFGTWKGGREKAPAAFCRKAQTSTDRFEMWGDGLQTRSFTFID
ECVEGVLRLTKSDFREPVNIGSDEMVSMNEMAEMVLSFEEKKLPIHHIPGPEGVRGRNSDNNLIKEKLGWAPNMRLKEGL
RITYFWIKEQIEKEKAKGSDVSLYGSSKVVGTQAPVQLGSLR

The query sequence (length=362) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2c59:A 364 360 0.9945 0.9890 1.0000 0.0 2c54:A, 2c54:B, 2c59:B, 2c5a:A, 2c5a:B, 2c5e:A, 2c5e:B, 8sg0:A, 8sg0:B, 8skb:A, 8skb:B, 8skb:C, 8skb:D
2 6zll:A 321 336 0.2569 0.2897 0.2768 1.85e-29 6zl6:A, 6zl6:B, 6zla:A, 6zla:B, 6zla:C, 6zla:D, 6zld:A, 6zld:B, 6zlj:A, 6zlj:B, 6zlk:A, 6zlk:B, 6zlk:C, 6zlk:D, 6zll:B, 6zll:C, 6zll:D
3 2b69:A 312 323 0.2376 0.2756 0.2663 1.40e-26 4gll:A, 4gll:B
4 4zrn:A 309 319 0.2238 0.2621 0.2539 2.75e-26 4zrm:A, 4zrm:B, 4zrn:B
5 3aw9:A 304 319 0.2320 0.2763 0.2633 4.59e-25 3aw9:B, 3aw9:C, 3icp:A, 3ko8:A
6 3ehe:A 290 319 0.2265 0.2828 0.2571 1.90e-24 3ehe:B
7 1bsv:A 317 330 0.2238 0.2555 0.2455 2.36e-24 1bws:A, 1e6u:A, 1e7q:A, 1e7r:A, 1e7s:A, 1fxs:A
8 4lk3:B 274 319 0.2293 0.3029 0.2602 7.95e-22 4lk3:A, 4lk3:C, 4lk3:D, 4lk3:E, 4lk3:F, 4m55:A, 4m55:B, 4m55:C, 4m55:D
9 8du0:A 286 316 0.2403 0.3042 0.2753 8.94e-21 7ll6:A
10 5u4q:A 321 347 0.2541 0.2866 0.2651 1.72e-19
11 6wj9:B 308 311 0.2099 0.2468 0.2444 8.81e-19 6wj9:A, 6wja:A, 6wja:B, 6wjb:A, 6wjb:B
12 3lu1:A 336 330 0.2514 0.2708 0.2758 2.03e-18 3lu1:B, 3lu1:C, 3lu1:D, 3ru7:A, 3ru7:B, 3ru7:C, 3ru7:D, 3ru9:A, 3ru9:B, 3ru9:C, 3ru9:D, 3rua:A, 3rua:B, 3rua:C, 3rua:D, 3ruc:A, 3ruc:B, 3ruc:C, 3ruc:D, 3rud:A, 3rud:B, 3rud:C, 3rud:D, 3rue:A, 3rue:B, 3rue:S, 3rue:b, 3ruf:A, 3ruf:B, 3ruf:S, 3ruf:b, 3ruh:A, 3ruh:B, 3ruh:C, 3ruh:D
13 6bwl:A 313 321 0.2127 0.2460 0.2399 3.42e-18
14 6dnt:A 310 324 0.2238 0.2613 0.2500 1.40e-17
15 6kv9:A 299 326 0.2459 0.2977 0.2730 2.39e-17 6kvc:A
16 5u4q:B 304 342 0.2376 0.2829 0.2515 4.38e-17
17 6pnl:A 336 326 0.2099 0.2262 0.2331 2.83e-15 6pmh:A
18 3vps:A 303 310 0.2044 0.2442 0.2387 7.23e-15 3vps:B
19 8vr2:B 321 325 0.2182 0.2461 0.2431 1.40e-13 8vr2:A, 8vr2:C, 8vr2:D
20 8ewu:B 354 367 0.2210 0.2260 0.2180 1.46e-13 8ewu:A
21 1r66:A 322 327 0.2044 0.2298 0.2263 5.50e-13 1r6d:A
22 1sb8:A 341 353 0.2376 0.2522 0.2436 1.64e-12 1sb9:A
23 2c20:A 329 332 0.2155 0.2371 0.2349 6.13e-12 2c20:B, 2c20:C, 2c20:D, 2c20:E, 2c20:F
24 7yst:A 312 345 0.2348 0.2724 0.2464 4.16e-11 7ys8:A, 7ys8:B, 7ys9:A, 7ys9:B, 7ysa:A, 7ysa:B, 7ysm:A, 7ysm:B, 7yst:B, 7ysy:A, 7ysy:B, 7yt0:A, 7yt0:B
25 7cxt:A 348 274 0.1713 0.1782 0.2263 5.13e-11 7anc:A, 7cxt:B, 7m13:A, 7m13:B
26 3sxp:D 314 277 0.1934 0.2229 0.2527 6.09e-11 3sxp:A, 3sxp:B, 3sxp:C, 3sxp:E
27 2q1s:A 336 338 0.1989 0.2143 0.2130 9.17e-11 2pzj:A, 2q1t:A, 2q1u:A, 2q1u:B
28 1ker:B 347 354 0.2348 0.2450 0.2401 1.18e-10 1kep:A, 1kep:B, 1ker:A, 1ket:A, 1ket:B, 1oc2:A, 1oc2:B
29 2p5u:A 311 323 0.2099 0.2444 0.2353 4.33e-10 2p5u:B, 2p5u:C, 2p5u:D, 2p5y:A
30 8sk0:B 330 323 0.1823 0.2000 0.2043 1.86e-09 8shh:A, 8shh:B, 8sk0:A
31 4ej0:A 330 359 0.2403 0.2636 0.2423 2.04e-09 4ej0:B, 4ej0:C, 4ej0:D, 4ej0:E, 4ej0:F, 4ej0:G, 4ej0:H, 4ej0:I, 4ej0:J
32 7anc:B 314 254 0.1713 0.1975 0.2441 2.26e-09
33 7xpo:A 344 299 0.1878 0.1977 0.2274 4.22e-09 7xpo:B, 7xpp:B, 7xpp:A, 7xpq:A, 7xpq:B
34 3m2p:B 255 180 0.1354 0.1922 0.2722 4.51e-09
35 2hun:A 329 323 0.2127 0.2340 0.2384 7.75e-09 2hun:B
36 7cgv:A 310 309 0.1823 0.2129 0.2136 1.27e-08 7cgv:B, 7cgv:C, 7cgv:D
37 7k3p:A 329 318 0.2127 0.2340 0.2421 1.32e-08 7k3p:B
38 4id9:B 328 172 0.1215 0.1341 0.2558 2.48e-08 4id9:A, 4idg:A, 4idg:B
39 6x3b:A 300 219 0.1492 0.1800 0.2466 3.30e-08 6x3b:B, 6x3b:C, 6x3b:D
40 5z75:A 306 181 0.1298 0.1536 0.2597 1.66e-07 5z75:B, 5z75:D
41 3rfv:A 265 173 0.1133 0.1547 0.2370 2.60e-07 3rfv:B, 3rfv:C, 3rfx:A, 3rfx:B, 3rfx:C
42 6h0n:A 377 359 0.2210 0.2122 0.2228 2.90e-07 6h0n:B, 6h0p:A, 6h0p:B
43 7epr:B 310 313 0.1934 0.2258 0.2236 3.27e-07 7epr:A, 7epr:C, 7epr:D
44 5y1f:A 311 238 0.1713 0.1994 0.2605 3.59e-07 5y1e:A, 5y1g:A
45 8du1:A 361 355 0.2238 0.2244 0.2282 9.05e-07 8du1:B, 8du1:C, 8du1:D
46 7eps:A 310 185 0.1409 0.1645 0.2757 9.30e-07 7eps:B, 7eps:C, 7eps:D, 3wmx:A, 3wmx:B, 3wmx:C, 3wmx:D
47 3a1n:A 315 180 0.1160 0.1333 0.2333 1.57e-06 3a1n:B, 3a4v:A, 3a4v:B, 3a9w:A, 3a9w:B, 3ajr:A, 3ajr:B
48 6jyg:D 307 188 0.1215 0.1433 0.2340 2.14e-06 6jyg:A, 6jyg:B, 6jyg:C, 6jyg:E, 6jyg:F
49 2yy7:A 312 276 0.1685 0.1955 0.2210 4.09e-06 2yy7:B
50 4twr:A 325 322 0.1906 0.2123 0.2143 4.47e-06 4wok:A
51 1a9y:A 338 337 0.2017 0.2160 0.2166 5.97e-06 1a9z:A, 5gy7:A, 5gy7:B, 1kvq:A, 1kvr:A, 1kvs:A, 1kvt:A, 1kvu:A, 1lrj:A, 1lrk:A, 1lrl:A, 1nah:A, 1nai:A, 1uda:A, 1udb:A, 1udc:A, 2udp:A, 2udp:B, 1xel:A
52 8v4h:B 342 328 0.1934 0.2047 0.2134 7.96e-06 8v4g:A, 8v4g:B, 8v4h:A
53 8wov:B 341 310 0.1961 0.2082 0.2290 1.40e-05 8wop:A, 8wop:B, 8wov:A, 8wow:A, 8wow:B
54 1keu:A 361 355 0.1989 0.1994 0.2028 1.74e-05 1g1a:A, 1g1a:B, 1g1a:C, 1g1a:D, 1keu:B, 1kew:A, 1kew:B
55 2x6t:G 308 292 0.1796 0.2110 0.2226 3.04e-05 1eq2:B, 1eq2:D, 1eq2:E, 1eq2:F, 1eq2:G, 1eq2:H, 1eq2:I, 1eq2:J, 2x6t:A, 2x6t:B, 2x6t:C, 2x6t:D, 2x6t:E, 2x6t:F, 2x6t:H, 2x6t:I, 2x6t:J, 2x86:A, 2x86:B, 2x86:C, 2x86:D, 2x86:E, 2x86:F, 2x86:G, 2x86:H, 2x86:I, 2x86:J, 2x86:K, 2x86:L, 2x86:M, 2x86:N, 2x86:O, 2x86:P, 2x86:Q, 2x86:R, 2x86:S, 2x86:T
56 1bxk:B 344 346 0.2044 0.2151 0.2139 3.80e-05 1bxk:A
57 6bi4:C 311 172 0.1160 0.1350 0.2442 7.11e-05 6bi4:B, 6bi4:D, 6bi4:A
58 1z7e:D 644 301 0.1768 0.0994 0.2126 9.00e-05 2bln:A, 2bln:B, 5j63:A, 5j63:B, 5j63:C, 5j63:D, 1z7e:A, 1z7e:B, 1z7e:C, 1z7e:E, 1z7e:F
59 3wmw:B 278 90 0.0746 0.0971 0.3000 1.36e-04 3wmw:A
60 6aqz:A 334 190 0.1326 0.1437 0.2526 1.94e-04 6aqz:B, 6aqz:C, 6aqz:E, 6aqz:F
61 6vlo:A 319 220 0.1436 0.1630 0.2364 2.38e-04 6vlo:B, 6vlo:C, 6vlo:D
62 2q1w:A 300 332 0.2017 0.2433 0.2199 2.98e-04 2q1w:B, 2q1w:C
63 1orr:A 338 339 0.2155 0.2308 0.2301 6.28e-04 1orr:B, 1orr:C, 1orr:D
64 8gjh:A 639 335 0.1851 0.1049 0.2000 6.64e-04 8gjh:B, 8gjh:C, 8gjh:D, 8gjh:E, 8gjh:F
65 2pk3:A 309 313 0.1713 0.2006 0.1981 0.005 2pk3:B
66 4m55:E 164 247 0.1436 0.3171 0.2105 0.005
67 1z45:A 674 175 0.1133 0.0608 0.2343 0.007
68 7kn1:A 336 340 0.1906 0.2054 0.2029 0.009 7kn1:B
69 1gy8:C 370 371 0.2127 0.2081 0.2075 0.013 2cnb:A, 2cnb:B, 2cnb:C, 2cnb:D, 1gy8:A, 1gy8:B, 1gy8:D
70 4r1s:A 319 121 0.0884 0.1003 0.2645 0.024 4r1s:B
71 6bwc:C 327 127 0.0912 0.1009 0.2598 0.025 6bwc:A, 6bwc:B, 6bwc:D, 6bwc:E, 6bwc:F
72 6jkh:A 212 127 0.0829 0.1415 0.2362 0.036 6jkh:B
73 6k0g:A 335 343 0.1934 0.2090 0.2041 0.089 6k0h:A, 6k0i:A
74 6nbr:A 316 125 0.0884 0.1013 0.2560 0.13 6nbr:B, 6nbr:C, 6nbr:D
75 1eq2:A 273 242 0.1492 0.1978 0.2231 0.16 1eq2:C
76 4qqr:A 274 238 0.1381 0.1825 0.2101 0.19 4qqr:B
77 6vsp:B 252 36 0.0414 0.0595 0.4167 0.20 6vsp:A, 6xew:A, 6xew:B, 6xex:A
78 7ymb:A 343 33 0.0387 0.0408 0.4242 0.22
79 3st7:A 369 64 0.0580 0.0569 0.3281 0.23 2zkl:A
80 4yr9:A 308 207 0.1050 0.1234 0.1836 0.31 4yr9:B, 4yr9:C, 4yr9:D, 4yr9:E, 4yr9:F
81 3enk:A 340 169 0.1077 0.1147 0.2308 0.58 3enk:B
82 4pvd:A 342 42 0.0470 0.0497 0.4048 0.65 4pvd:B
83 2xwg:B 185 95 0.0718 0.1405 0.2737 0.77 2xwg:A, 2xwg:C
84 4j2o:C 316 123 0.0829 0.0949 0.2439 0.83 4j2o:A, 4j2o:B, 4j2o:D, 4j2o:E, 4j2o:F
85 5l3z:A 280 97 0.0746 0.0964 0.2784 0.98 5l4l:A
86 3c1t:B 326 129 0.0967 0.1074 0.2713 1.1 3bxx:A, 3bxx:B, 3bxx:C, 3bxx:D, 3bxx:E, 3bxx:F, 3c1t:A, 3c1t:C, 3c1t:D, 2c29:D, 2c29:F, 2iod:A, 2iod:B, 2iod:C, 2iod:D, 2nnl:D, 2nnl:F
87 8gul:A 464 53 0.0414 0.0323 0.2830 1.2
88 3qtb:A 125 73 0.0691 0.2000 0.3425 1.3
89 7e1g:A 332 57 0.0497 0.0542 0.3158 1.5 7e1c:A, 7e1g:B
90 8gul:B 361 53 0.0414 0.0416 0.2830 1.6
91 7c1e:A 342 30 0.0331 0.0351 0.4000 2.0 7c1e:B, 7c3v:A, 5z2x:A, 5z2x:B, 8zav:A, 8zav:B, 5zec:A, 5zec:B, 5zed:A, 5zed:B
92 5xtg:B 233 45 0.0497 0.0773 0.4000 2.0
93 5tqm:A 315 82 0.0580 0.0667 0.2561 2.1 5tqm:B
94 2f6r:A 230 35 0.0414 0.0652 0.4286 2.3
95 1y1p:A 342 25 0.0304 0.0322 0.4400 2.7 1y1p:B
96 4yrb:C 249 86 0.0580 0.0843 0.2442 3.5 4yrb:A, 4yrb:D, 4yrb:E
97 1rpn:D 322 318 0.1657 0.1863 0.1887 4.6 1rpn:A, 1rpn:B, 1rpn:C
98 7csa:A 310 121 0.0801 0.0935 0.2397 4.7 7csa:B, 7csa:C, 7csa:D, 7csb:C, 7csb:D, 7csb:A, 7csb:B, 7csc:E, 7csc:F, 7csc:A, 7csc:B, 7csc:C, 7csc:D, 7csd:C, 7csd:D, 7csd:A, 7csd:B, 7cse:E, 7cse:F, 7cse:A, 7cse:B, 7cse:C, 7cse:D, 7csf:C, 7csf:D, 7csf:A, 7csf:B
99 4yrd:B 346 52 0.0470 0.0491 0.3269 4.9 3vhr:A, 4yrd:A
100 8r2j:B 275 118 0.0691 0.0909 0.2119 5.3 8r2j:A
101 6kwt:A 338 30 0.0276 0.0296 0.3333 6.2
102 6tnm:A 719 31 0.0304 0.0153 0.3548 7.7
103 5vt6:A 245 68 0.0552 0.0816 0.2941 8.1 5vt6:B, 5vt6:C, 5vt6:D
104 6els:A 459 36 0.0387 0.0305 0.3889 8.2 6elt:A, 6elv:A
105 3asv:A 248 54 0.0470 0.0685 0.3148 8.3 3asv:B, 3asv:C, 3asv:D, 3asv:E, 3asv:F
106 1fi6:A 92 24 0.0331 0.1304 0.5000 9.3
107 1um8:A 327 65 0.0497 0.0550 0.2769 9.5

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218