Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GASKLRAVLEKLKLSRDDISTAAGMVKGVVDHLLLRLKCDSAFRGVGLLNTGSYYEHVKISAPNEFDVMFKLEVPRIQLE
EYSNTRAYYFVKFKNPLSQFLEGEILSASKMLSKFRKIIKEEGSPAVTLISVDITLALESKSSWPASTQEGLRIQNWLSA
KVRKQLRLKPFYLVPKHAGFQEETWRLSFSHIEKEILNNHGKSKTCCENKEEKCCRKDCLKLMKYLLEQLKERFKDEEHL
DKFSSYHVKTAFFHVCTQNPQDSQWDRKDLGLCFDNCVTYFLQCLRTEKLENYFIPEFNLFSSNLIDKRSKEFLTKQIEY
ERNNEFPVFDE

The query sequence (length=331) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4lev:A 369 361 0.9940 0.8916 0.9114 0.0 7c0m:K, 7c0m:k, 6ct9:A, 6cta:A, 6edb:A, 6edc:A, 7ftf:A, 7ftg:A, 7ftg:B, 7fth:A, 7fti:A, 7ftj:A, 7ftk:A, 7ftk:B, 7ftl:A, 7ftm:A, 7ftn:A, 7fto:A, 7ftp:A, 7ftq:A, 7ftr:A, 7fts:A, 7ftt:A, 7ftt:B, 7ftu:A, 7ftv:A, 7ftw:A, 7ftx:A, 7fty:A, 7ftz:A, 7ftz:B, 7fu0:A, 7fu1:A, 7fu2:A, 7fu3:A, 7fu4:A, 7fu5:A, 7fu5:B, 7fu6:A, 7fu7:A, 7fu8:A, 7fu9:A, 7fua:A, 7fub:A, 7fuc:A, 7fud:A, 7fud:B, 7fue:A, 7fuf:A, 7fug:A, 7fuh:A, 7fui:A, 7fuj:A, 7fuk:A, 7ful:A, 7fum:A, 7fun:A, 7fuo:A, 7fup:A, 7fuq:A, 7fur:A, 8imf:B, 8img:A, 8img:B, 4km5:A, 4lev:B, 4lew:B, 4lew:A, 6lrc:B, 6lrc:A, 6lre:B, 6lrk:A, 6lrk:B, 6nao:A, 6nao:B, 6nfg:A, 6nfg:B, 6nfo:A, 6nfo:B, 6o47:A, 4o67:A, 4o67:B, 4o68:A, 4o69:A, 8okx:A, 8ol1:K, 5v8o:A, 5v8o:B, 5vdo:A, 5vdo:B, 5vdp:A, 5vdp:B, 5vdq:A, 5vdq:B, 5vdr:A, 5vdr:B, 5vds:B, 5vdt:A, 5vdt:B, 5vdu:A, 5vdu:B, 5vdv:A, 5vdv:B, 5vdw:A, 5vdw:B, 6y5d:K, 6y5d:L, 6y5e:K
2 5vds:A 342 345 0.9728 0.9415 0.9333 0.0 7fug:B, 8ime:B, 8imf:A, 6lre:A, 6lri:A, 6lri:B, 6lrj:A, 6lrj:B, 6lrl:A, 6mju:A, 6mjw:A, 6mjx:A, 4mkp:A, 8shz:A, 8si0:A, 8sj8:A
3 6lrl:B 316 335 0.9215 0.9652 0.9104 0.0 8ime:A
4 4jlz:A 363 362 0.7644 0.6970 0.6989 1.09e-171 4jlx:A, 4jlz:B, 4kb6:A
5 7buj:B 362 360 0.7160 0.6547 0.6583 4.62e-160 7a08:a, 7buj:A, 7bum:A, 7bum:B, 7buq:A, 7buq:B, 8eae:A, 8eae:C, 8ecc:A, 8ecc:C, 8g10:A, 8g10:C, 8g1j:A, 8g1j:C, 8g23:A, 8g23:C, 8g2p:A, 8g2p:C, 8g2q:A, 8g2q:C, 8gim:A, 8gim:C, 8gin:A, 8gin:C, 8gio:A, 8gio:C, 8gip:A, 8gip:C, 8gir:A, 8gir:C, 8gis:A, 8gis:C, 8git:A, 8git:C, 7jo9:K, 7joa:K, 4k8v:C, 4k8v:A, 4k8v:B, 4k8v:D, 4k96:A, 4k96:B, 4k97:A, 4k98:A, 4k99:A, 4k9a:A, 4k9b:A, 7kxs:A, 7kxs:B, 4ley:A, 4ley:C, 4ley:B, 4ley:D, 4lez:A, 4lez:C, 7lz3:A, 5n6i:A, 5n6i:B, 5n6i:C, 5n6i:D, 5n6i:E, 5n6i:F, 4o6a:A, 4o6a:B, 8shk:C, 8shu:C, 8shy:C, 8sj0:A, 8sj0:C, 8sj1:A, 8sj1:C, 8sj2:A, 8sj2:C, 8skt:A, 8skt:C, 7utt:A, 7utt:C, 7uux:A, 7uux:C, 7uxw:A, 7uxw:C, 7uyq:A, 7uyq:C, 7uyz:A, 7uyz:C, 7uzr:A, 7uzr:C, 7v0c:A, 7v0c:C, 7v0r:A, 7v0r:C, 7v0w:A, 7v0w:C, 6x59:K, 6xjd:K, 6xjd:L, 5xzb:A, 5xze:A, 5xzg:A
6 7lz3:B 339 350 0.6737 0.6578 0.6371 4.77e-145
7 5eom:C 353 289 0.1903 0.1785 0.2180 1.62e-10 5eom:A, 5eom:B, 5eom:D, 5eom:E, 5eom:F, 5eom:G, 5eom:H, 5eom:I
8 5eom:J 286 132 0.1027 0.1189 0.2576 8.90e-09
9 7lt2:A 387 319 0.2085 0.1783 0.2163 1.74e-04
10 8a22:AA 50 30 0.0363 0.2400 0.4000 0.45 8apn:AA, 8apo:AA
11 5fkv:A 1145 72 0.0634 0.0183 0.2917 1.4 5fkw:A, 4jom:A, 5m1s:A
12 4v6w:CE 228 58 0.0634 0.0921 0.3621 2.0 6xu6:CE, 6xu7:CE, 6xu8:CE
13 8ej3:D 1281 60 0.0544 0.0141 0.3000 2.5 6bzo:D, 6c04:D, 6c05:D, 6c06:D, 6dv9:D, 6dvb:D, 6dvc:D, 6dvd:D, 6dve:D, 8e74:D, 8e79:D, 8e82:D, 8e8m:D, 8e95:D, 6edt:D, 6ee8:D, 6eec:D, 8ehq:D, 8eoe:D, 8eof:D, 8eos:D, 8eot:D, 8exy:D, 6fbv:D, 8hih:D, 6jcx:D, 6jcy:D, 7kif:D, 7kim:D, 7kin:D, 6kon:D, 6koo:D, 6kop:D, 6koq:D, 6m7j:D, 7p5x:AD, 7pp4:d, 8q3i:D, 7q4u:D, 7q4u:J, 7q4u:P, 7q4u:W, 7q4u:CA, 7q4u:IA, 7q4u:OA, 7q4u:UA, 7q59:D, 7q59:d, 7rwi:D, 6tye:D, 6tyf:D, 6tyg:D, 7u22:D, 5uh5:D, 5uh6:D, 5uh8:D, 5uh9:D, 5uha:D, 5uhb:D, 5uhc:D, 5uhd:D, 5uhe:D, 5uhf:D, 5uhg:D, 6vvx:D, 6vvy:D, 6vvz:D, 6vw0:D, 6yxu:D, 6yys:D, 7z8q:d, 7zf2:D, 5zx2:D, 5zx3:D
14 7pkt:z 53 20 0.0272 0.1698 0.4500 3.0
15 8hvr:D 1259 60 0.0574 0.0151 0.3167 3.3 8dy7:D, 8dy9:D, 8jke:D, 8k60:D, 7vpd:D, 7vpz:D, 7x74:D, 7x75:D, 7x76:D
16 4cja:A 753 70 0.0816 0.0359 0.3857 4.7
17 1eyz:A 389 151 0.0967 0.0823 0.2119 7.0 1eyz:B, 1ez1:A, 1ez1:B, 1kj8:A, 1kj8:B, 1kj9:A, 1kj9:B, 1kji:A, 1kji:B, 1kjj:A, 1kjj:B, 1kjq:A, 1kjq:B
18 6aay:A 1199 103 0.0755 0.0209 0.2427 7.2
19 8im8:A 557 105 0.0695 0.0413 0.2190 9.7 8im8:B, 8im8:C, 8im8:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218