BioLiP

>protein
GAMLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRI
QDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNK

The query sequence (length=133) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4gt8:A	133	133	1.0000	1.0000	1.0000	3.61e-95
2	8sbm:B	126	98	0.2632	0.2778	0.3571	1.81e-12	8sbm:A, 3zxo:A, 3zxo:B
3	7ssj:A	219	104	0.1880	0.1142	0.2404	0.005	3ehf:A, 3ehf:D, 3ehg:A, 3ehh:A, 3ehh:B, 3ehj:A, 3ehj:B, 3gie:A, 3gie:B, 3gif:A, 3gig:A, 3gig:B, 5iuj:A, 5iuj:B, 5iuj:D, 5iuj:E, 5iuk:A, 5iuk:B, 5iuk:D, 5iuk:E, 5iul:A, 5iul:B, 5iul:D, 5iul:E, 5ium:A, 5ium:B, 7ssi:A, 7ssi:B, 7ssi:D, 7ssi:E, 7ssj:C, 7ssj:D
4	8g3b:E	334	90	0.1353	0.0539	0.2000	1.1	8g3f:E
5	8f5f:A	326	118	0.2105	0.0859	0.2373	3.5	4dzy:A, 4e00:A, 4e01:A, 4e02:A, 8egd:A, 8egf:A, 8egq:A, 8egu:A, 8f4q:A, 8f5f:B, 8f5j:A, 8f5s:A, 8f5s:B, 1gjv:A, 1gkz:A, 4h7q:A, 4h81:A, 4h85:A, 3tz0:A, 3tz2:A, 3tz4:A, 3tz5:A, 3vad:A
6	6bxj:A	619	25	0.0902	0.0194	0.4800	3.9	3bn3:A, 3bqm:B, 3bqm:C, 3bqn:B, 3bqn:C, 6bxb:A, 6bxb:B, 6bxf:A, 6bxf:B, 6ckb:A, 6ckb:B, 1cqp:A, 1cqp:B, 3e2m:A, 3e2m:B, 3eob:I, 3eob:J, 3f74:C, 3f78:A, 3f78:B, 3f78:C, 3hi6:A, 3hi6:B, 2ica:A, 4ixd:A, 7kc3:C, 7kc5:A, 7kc5:C, 7kc6:C, 7kc6:A, 1lfa:A, 1lfa:B, 3m6f:A, 1mjn:A, 1mq8:B, 1mq8:D, 1mq9:A, 2o7n:A, 1rd4:A, 1rd4:B, 1rd4:C, 1rd4:D, 1t0p:A, 3tcx:B, 3tcx:D, 3tcx:F, 3tcx:H, 3tcx:J, 3tcx:L, 3tcx:N, 3tcx:P, 3tcx:R, 3tcx:T, 3tcx:V, 3tcx:X, 3tcx:Z, 3tcx:b, 1xdd:A, 1xdd:B, 1xdg:A, 1xdg:B, 1xuo:A, 1xuo:B, 1zoo:A, 1zoo:B, 1zop:A, 1zop:B
7	4ew2:A	205	30	0.0977	0.0634	0.4333	4.6	4ew3:A, 8fdx:A, 8fdy:A, 8fdz:A, 8fe0:A, 8fjv:A, 8fjw:A, 8fjx:A, 8fjy:A, 5j9f:A, 7jg0:A, 7jg3:A, 7jg4:A, 1men:A, 1men:B, 1men:C, 1njs:A, 1njs:B, 1rbm:A, 1rbm:B, 1rbq:A, 1rbq:B, 1rbq:C, 1rbq:D, 1rby:A, 1rby:B, 1rby:C, 1rby:D, 1rbz:A, 1rbz:B, 1rc0:A, 1rc0:B, 1rc1:A, 1rc1:B, 1zly:A, 4zyt:A, 4zyu:A, 4zyv:A, 4zyw:A, 4zyx:A, 4zyy:A, 4zyz:A, 4zz0:A, 4zz1:A, 4zz2:A, 4zz3:A
8	7jps:E	386	32	0.0902	0.0311	0.3750	4.7	7cte:E, 7ctf:E, 7ctg:E
9	1gdi:A	153	33	0.0977	0.0850	0.3939	5.4	1gdj:A, 1gdk:A, 1gdl:A, 2gdm:A, 1lh1:A, 1lh2:A, 1lh3:A, 1lh5:A, 1lh6:A, 1lh7:A, 2lh1:A, 2lh2:A, 2lh3:A, 2lh5:A, 2lh6:A, 2lh7:A
10	7jpp:E	406	71	0.1654	0.0542	0.3099	7.1	7jpo:E, 7jpq:E, 7jpr:E, 5uj7:E, 5uj7:F
11	6lzj:A	245	39	0.1128	0.0612	0.3846	8.8	6lzi:A
12	7obq:u	441	61	0.1429	0.0431	0.3115	9.3	6frk:u, 3jaj:6, 3jan:6, 5m73:C, 5m73:G, 7nfx:u, 7obr:u, 4p3e:C, 7qwq:v, 6r6g:AI, 4ue5:C
13	1ijt:A	128	23	0.0677	0.0703	0.3913	9.5
14	2d3m:A	405	87	0.1579	0.0519	0.2414	9.7	2d3m:B, 2d52:A, 2d52:B

[Back]