Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GAMGWCIFIYNLGQDADEGILWQMFGPFGAVTNVKVIRDFNTNKCKGFGFVTMTNYEEAAMAIASLNGYRLGDKILQVSF
KTNK

The query sequence (length=84) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6gd2:A 84 84 1.0000 1.0000 1.0000 3.73e-59 6g2k:A, 6g2k:B, 6gc5:A, 6gc5:B, 6gc5:C, 6gc5:D, 6gd2:B, 6gd3:B, 6gd3:C
2 2rqc:A 115 84 0.4524 0.3304 0.4524 1.48e-16
3 5m8i:A 114 84 0.4286 0.3158 0.4286 1.29e-15
4 8xxm:3G 84 73 0.3095 0.3095 0.3562 2.52e-12 5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
5 7q33:A 93 78 0.2738 0.2473 0.2949 8.84e-11 6pai:D, 6q0r:D, 6q0v:D, 6q0w:D, 6sj7:C, 6ud7:C, 6ue5:C
6 7zew:A 117 75 0.2738 0.1966 0.3067 1.45e-10 7zex:A
7 8i0v:4 161 83 0.3214 0.1677 0.3253 1.82e-10
8 8i0v:4 161 74 0.2619 0.1366 0.2973 6.75e-07
9 2x1f:A 94 78 0.2619 0.2340 0.2821 6.86e-10 2km8:B, 2x1a:A
10 6r5k:H 394 81 0.3690 0.0787 0.3827 1.22e-09 6r5k:D, 6r5k:F
11 6r5k:H 394 73 0.3452 0.0736 0.3973 2.87e-07 6r5k:D, 6r5k:F
12 6r5k:H 394 61 0.2143 0.0457 0.2951 8.08e-06 6r5k:D, 6r5k:F
13 6r5k:H 394 72 0.2381 0.0508 0.2778 2.28e-05 6r5k:D, 6r5k:F
14 2mb0:B 95 76 0.3095 0.2737 0.3421 1.54e-09
15 5mqf:o 223 74 0.2738 0.1031 0.3108 1.63e-09 6id1:y, 7w59:y, 7w5a:y, 7w5b:y
16 8h6e:4R 106 77 0.2976 0.2358 0.3247 2.24e-09 8h6j:4R, 8qp8:R, 8qp9:R, 8qpk:R, 6qw6:R, 6qx9:R, 8qxd:R, 8r08:R, 8r0a:R
17 6m75:A 167 68 0.2857 0.1437 0.3529 2.38e-09
18 6m75:A 167 62 0.2500 0.1257 0.3387 1.62e-06
19 2mkc:A 118 86 0.2976 0.2119 0.2907 3.00e-09 2my3:A
20 2fy1:A 108 72 0.2976 0.2315 0.3472 3.47e-09
21 7dco:X 128 74 0.2500 0.1641 0.2838 7.85e-09 5gm6:V, 5zwm:X
22 5ith:A 80 74 0.2619 0.2750 0.2973 1.01e-08 5o3j:A
23 4f02:A 175 79 0.3690 0.1771 0.3924 1.55e-08 1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
24 4f02:A 175 61 0.1905 0.0914 0.2623 2.07e-06 1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
25 4ed5:B 169 78 0.3333 0.1657 0.3590 2.00e-08 4ed5:A
26 4ed5:B 169 64 0.2262 0.1124 0.2969 7.14e-05 4ed5:A
27 2mgz:A 94 78 0.3214 0.2872 0.3462 2.28e-08
28 1rk8:A 87 79 0.2381 0.2299 0.2532 5.78e-08
29 2xb2:D 89 77 0.2619 0.2472 0.2857 1.05e-07 2xb2:Z
30 2rra:A 99 79 0.2500 0.2121 0.2658 1.20e-07 2kxn:B
31 1fnx:H 174 69 0.2738 0.1322 0.3333 1.31e-07 1fxl:A, 1g2e:A
32 1fnx:H 174 64 0.1905 0.0920 0.2500 0.003 1fxl:A, 1g2e:A
33 7ohx:o 112 73 0.2738 0.2054 0.3151 1.92e-07
34 8fkp:SH 150 75 0.2381 0.1333 0.2667 2.37e-07 8fkq:SH, 8fkr:SH, 8fks:SH, 8fkt:SH, 8fku:SH, 8fkv:SH, 8fkw:SH, 8fkx:SH, 8fky:SH, 8fkz:SH, 8fl2:SH, 8fl6:SH, 8fla:SH, 8fld:SH, 8ine:t, 8inf:t, 8ipx:t, 8ipy:t, 8ir3:t
35 5kw6:A 201 72 0.2500 0.1045 0.2917 2.57e-07 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
36 5kw6:A 201 74 0.2976 0.1244 0.3378 5.85e-07 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
37 7dvq:Y 140 77 0.2500 0.1500 0.2727 2.79e-07 8i0p:Y, 8i0r:Y
38 2n82:B 104 66 0.3095 0.2500 0.3939 2.80e-07 2err:A, 7vrl:B
39 6c0f:o 133 73 0.2738 0.1729 0.3151 2.98e-07 7btb:o, 6cb1:o, 8e5t:o, 6elz:o, 6em1:o, 6em3:o, 6em4:o, 6em5:o, 3jct:o, 6m62:o, 7nac:o, 7ohp:o, 7ohq:o, 7ohr:o, 7ohs:o, 7ohv:o, 7ohw:o, 7r6q:o, 7r7a:o, 7u0h:o, 7uoo:o, 7uqb:o, 7uqz:o, 7v08:o, 8v83:o, 8v84:o, 8v87:o, 6ylx:o, 6yly:o, 5z3g:E
40 7csz:A 175 55 0.2262 0.1086 0.3455 3.09e-07
41 7csz:A 175 46 0.1667 0.0800 0.3043 1.6
42 4qqb:A 169 69 0.2619 0.1302 0.3188 4.28e-07 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
43 4qqb:A 169 61 0.2262 0.1124 0.3115 6.75e-06 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
44 7qde:B 169 74 0.2738 0.1361 0.3108 6.27e-07 7qdd:B
45 5x8p:v 190 72 0.3214 0.1421 0.3750 8.78e-07 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
46 5x8p:v 190 80 0.2381 0.1053 0.2500 2.66e-04 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
47 2mgz:B 105 61 0.2619 0.2095 0.3607 3.13e-06 4ch1:A, 4cio:A, 2ru3:A
48 6g90:B 193 65 0.2381 0.1036 0.3077 4.83e-06
49 6n7p:A 186 73 0.2619 0.1183 0.3014 5.45e-06 6n7r:A, 6n7x:A, 7oqc:B, 7oqe:B, 8w2o:A, 5zwn:Q
50 7s7b:C 79 76 0.2619 0.2785 0.2895 7.90e-06 7s7b:G, 7s7c:C
51 7b9v:Y 88 60 0.2738 0.2614 0.3833 1.56e-05 6bk8:r, 7dco:p, 6exn:Y, 6g90:Y, 5gmk:a, 6j6g:a, 6j6h:a, 6j6n:a, 6j6q:a, 5lj3:Y, 5lj5:Y, 5mq0:Y, 5nrl:Y, 7oqb:Y, 7oqe:Y, 5wsg:X, 5y88:p, 5ylz:p, 5zwm:p, 5zwo:p
52 1wtb:A 79 66 0.2619 0.2785 0.3333 2.02e-05 1x0f:A
53 9gpj:A 184 57 0.2500 0.1141 0.3684 2.86e-05 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
54 9gpj:A 184 51 0.1667 0.0761 0.2745 0.002 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
55 2cjk:A 167 46 0.2143 0.1078 0.3913 3.71e-05 2km8:C
56 2cjk:A 167 46 0.1667 0.0838 0.3043 0.020 2km8:C
57 5en1:A 184 51 0.1786 0.0815 0.2941 4.42e-05 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
58 5en1:A 184 59 0.2262 0.1033 0.3220 8.21e-04 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
59 6jvx:A 87 61 0.2500 0.2414 0.3443 9.88e-05 6jvy:A
60 4bs2:A 174 50 0.2262 0.1092 0.3800 1.23e-04 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
61 6xlv:A 203 73 0.2619 0.1084 0.3014 5.44e-04 5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
62 2rs2:A 84 50 0.2619 0.2619 0.4400 5.46e-04
63 7uj1:B 270 77 0.2738 0.0852 0.2987 0.002 7pu5:B, 7pu5:D, 7pu5:H, 7pu5:J, 7pu5:L, 7sp0:B, 7uj1:A
64 2i2y:A 150 65 0.2381 0.1333 0.3077 0.003 9asq:H, 5bmg:A, 5bmg:B, 5bmg:H, 5bmg:D, 5bmg:E, 5bmg:F, 5bmg:G, 5bmh:A, 3v3x:C, 3v3x:D
65 4lmz:A 176 66 0.2381 0.1136 0.3030 0.004 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
66 4lmz:A 176 61 0.1905 0.0909 0.2623 0.19 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
67 2xs2:A 87 63 0.2262 0.2184 0.3016 0.007 2xs5:A, 2xs5:B, 2xs7:A
68 7dco:4 174 74 0.2500 0.1207 0.2838 0.007 6g90:R, 5gm6:e, 5nrl:R, 7oqb:R, 7oqe:R, 5zwm:4
69 8pv1:CI 152 71 0.2262 0.1250 0.2676 0.008 8i9p:CI, 8i9r:CI, 8i9t:CI, 8i9v:CI, 8i9w:CI, 8i9x:CI, 8i9y:CI, 8i9z:CI, 8ia0:CI, 8pv3:CI, 8pv4:CI, 8pv7:CI, 8pvk:CI
70 5x3z:A 96 71 0.2143 0.1875 0.2535 0.011
71 3lqv:B 115 78 0.2024 0.1478 0.2179 0.012 2f9j:B, 3lqv:A, 7q4o:F, 8qo9:B6, 8qxd:B6, 8qzs:B6, 8r08:B6, 8r09:B6, 8r0a:B6, 8r0b:B6, 8rm5:B6
72 8y6o:W 167 68 0.2143 0.1078 0.2647 0.012
73 5ifm:C 256 74 0.2619 0.0859 0.2973 0.013 5ifm:A
74 8ch6:V 285 66 0.2024 0.0596 0.2576 0.013 7qtt:V
75 8i0s:Y 320 66 0.2024 0.0531 0.2576 0.013 8i0t:Y, 8i0u:Y, 8i0v:Y
76 3smz:A 280 58 0.2024 0.0607 0.2931 0.017
77 3smz:A 280 61 0.2500 0.0750 0.3443 0.040
78 2n3o:A 123 60 0.2619 0.1789 0.3667 0.043 2ad9:A, 8bwf:A, 8bwf:D, 8bwf:B, 8bwf:C, 8bwf:E, 8bwf:J, 8bwf:F, 8bwf:G, 8bwf:H, 8bwf:I, 8bwf:K, 8bwf:L, 8bwf:N, 8bwf:O, 8bwf:P
79 8by6:B 152 73 0.2143 0.1184 0.2466 0.100 7abg:A1, 6d0y:A, 1h2t:Z, 1h2u:X, 1h2u:Y, 1n52:B, 5oo6:B, 5oo6:E, 5oo6:H, 5oo6:K, 5oo6:N, 5oo6:Q, 5oo6:T, 5oo6:W, 5oob:D, 5oob:J, 5oob:B, 5oob:G, 8pmp:B, 8pnt:B, 8srr:B, 8suy:B
80 7slp:B 321 60 0.2024 0.0530 0.2833 0.12 6d12:A, 6d12:B, 7slq:B, 4wkr:A, 4wkr:B
81 4pkd:B 240 72 0.1548 0.0542 0.1806 0.16 1aud:A, 7b0y:c, 3bo2:A, 3bo3:A, 3bo4:A, 4c4w:A, 4c4w:E, 3cul:A, 3cul:B, 3cun:A, 3cun:B, 7d7v:C, 5ddo:G, 5ddo:C, 5ddp:D, 5ddp:C, 5ddq:D, 5ddq:C, 5ddr:D, 5ddr:C, 7dlz:A, 7dlz:B, 1drz:A, 7dwh:A, 7dwh:B, 1dz5:A, 1dz5:B, 3egz:A, 5fj4:A, 5fj4:E, 3g8s:A, 3g8s:B, 3g8s:C, 3g8s:D, 3g8t:A, 3g8t:B, 3g8t:C, 3g8t:D, 3g96:A, 3g96:B, 3g96:C, 3g96:D, 3g9c:A, 3g9c:B, 3g9c:C, 3g9c:D, 8gxb:C, 8gxb:D, 8gxb:F, 8gxc:C, 8gxc:D, 8gxc:F, 3hhn:B, 3hhn:D, 3iin:A, 3irw:P, 3iwn:C, 3iwn:D, 8jy0:A, 8jy0:C, 8jy0:E, 3k0j:A, 3k0j:B, 3l3c:A, 3l3c:B, 3l3c:C, 3l3c:D, 6las:E, 6las:D, 6las:C, 6lau:E, 6lau:D, 6lau:C, 6lax:D, 6lax:E, 6lax:C, 6laz:D, 6laz:E, 6laz:C, 1m5k:C, 1m5k:F, 1m5o:C, 1m5o:F, 1m5p:C, 1m5p:F, 1m5v:C, 1m5v:F, 3mum:P, 3mur:P, 3mut:P, 3muv:P, 3mxh:P, 2nz4:A, 2nz4:B, 2nz4:C, 2nz4:D, 2oih:A, 2oj3:A, 3p49:B, 4pr6:A, 4prf:A, 7qr3:A, 7qr3:B, 7qr4:A, 6qx9:1A, 3r1h:A, 3r1h:D, 3r1l:A, 3r1l:D, 1sj3:P, 1sj4:P, 1sjf:A, 6sqn:A, 6sqn:B, 6sqn:C, 6sqq:AAA, 6sqq:BBB, 6sqq:CCC, 1u6b:A, 3ucu:P, 3ucz:P, 3ud3:P, 3ud4:P, 1urn:A, 1urn:B, 1urn:C, 1vbx:A, 1vby:A, 1vbz:A, 1vc0:A, 1vc5:A, 1vc6:A, 7vpx:M, 4w90:B, 4w92:B, 1zzn:A
82 8pj1:1 588 69 0.2500 0.0357 0.3043 0.20 6fec:w, 2krb:A, 8oz0:I, 8pj2:1, 8pj3:1, 8pj5:1, 8pj6:1
83 6qx9:1K 201 72 0.1548 0.0647 0.1806 0.22 7b0y:b, 4pjo:K, 4pjo:k, 4pjo:N, 4pjo:n, 8r08:1K, 7vpx:O
84 8xxn:3B 536 69 0.2500 0.0392 0.3043 0.23 6zon:B, 6zp4:B, 6zvj:B
85 8gap:H 384 47 0.1786 0.0391 0.3191 0.24
86 5det:B 94 77 0.2619 0.2340 0.2857 0.27 5det:A
87 4a8x:A 88 63 0.1429 0.1364 0.1905 0.37
88 2adc:A 208 64 0.2381 0.0962 0.3125 2.0
89 5ldr:A 731 19 0.1071 0.0123 0.4737 2.1 5ldr:B
90 3cb7:A 126 48 0.1310 0.0873 0.2292 2.8
91 7x2y:A 342 23 0.1190 0.0292 0.4348 3.4 7x1x:A, 7x1x:B, 7x2y:B
92 7vsj:A 160 47 0.1548 0.0813 0.2766 4.6 6fqr:A, 6gx6:A, 7yew:A, 7yew:C, 7yex:A
93 2mxy:A 105 35 0.1310 0.1048 0.3143 5.1 2mz1:A
94 3egw:A 1244 50 0.1429 0.0096 0.2400 6.3 3ir5:A, 3ir6:A, 3ir7:A, 1q16:A, 1r27:A, 1r27:C, 1siw:A, 1y4z:A, 1y5i:A, 1y5l:A, 1y5n:A
95 4xym:B 229 52 0.1905 0.0699 0.3077 6.3 4xym:D, 4xz3:B, 4xz3:D, 4y8v:B, 4y8v:D, 4yb8:B, 4yb8:D, 4ybz:D
96 8idf:A 459 70 0.2619 0.0479 0.3143 6.6
97 2bh4:X 121 19 0.1190 0.0826 0.5263 8.0 2bgv:X, 2bh5:X

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218