Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GAMGSMERASLIQKAKLAEQAERYEDMAAFMKGAVEKGEELSCEERNLLSVAYKNVVGGQRAAWRVLSSIEQKSNEGSEE
GPEVREYREKVETELQGVCDTVLGLLDSHLIKEAGDAESRVFYLKMKGDYYRYLAEVATDKKRIIDSARSAYQEAMDISK
KEMPPTNPIRLGLALNFSVFHYEIANSPEEAISLAKTTFDEAMADLHTLSEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWT

The query sequence (length=232) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8a62:A 236 236 1.0000 0.9831 0.9831 2.67e-168 8a65:A, 8a68:A, 8a6f:A, 8a6h:A, 8adm:A, 7aew:AAA, 8afn:A, 8ai0:A, 8alr:A, 8alt:A, 8alv:A, 8alw:A, 8am7:A, 8anb:A, 8anc:A, 8anf:A, 7aog:A, 8aoy:A, 8aps:A, 8aq1:A, 8aqc:A, 8aqe:A, 8aqz:A, 8ar4:A, 8ar5:A, 8arg:A, 8aro:A, 8arq:A, 8arr:A, 8arw:A, 8arx:A, 8ary:A, 8arz:A, 8as1:A, 8at9:A, 8atp:A, 8atr:A, 8ats:A, 8au2:A, 8aus:A, 8auy:A, 8av0:A, 8av3:A, 8av4:A, 8av7:A, 8av8:A, 8awg:A, 7axn:A, 8axe:A, 8axu:A, 7ayf:A, 7az1:A, 7az2:A, 8aze:A, 7b13:A, 7b15:A, 8b2i:A, 8b2k:A, 8b39:A, 8b4q:A, 8b5p:A, 7b9m:A, 7b9r:A, 7b9t:A, 7ba3:A, 7ba5:A, 7ba6:A, 7ba7:A, 7ba8:A, 7ba9:A, 7baa:A, 7bab:A, 7bdp:A, 7bdt:A, 7bdy:A, 7bfw:A, 8bfc:A, 7bg3:A, 7bgq:A, 7bgr:A, 7bgv:A, 7bgw:A, 7bi3:A, 7biq:A, 7biw:A, 7biy:A, 8bi7:A, 7bjb:A, 7bjf:A, 7bjl:A, 7bjw:A, 8bjg:A, 8bjn:A, 7bkh:A, 7bm9:A, 7bmc:A, 8bm5:A, 5btv:A, 8btq:A, 8bwe:A, 8bwh:A, 8bwj:A, 8bwx:A, 8bwz:A, 8bx0:A, 8bx3:A, 8bx4:A, 8bxi:A, 8bxm:A, 8bxn:A, 8bxo:A, 8bxq:A, 8bxs:A, 8by9:A, 8byb:A, 8byc:A, 8byd:A, 8bye:A, 8byf:A, 8byg:A, 8byo:A, 8byy:A, 8byz:A, 8bz0:A, 8bz9:A, 8bza:A, 8bzb:A, 8bzc:A, 8bzd:A, 8bze:A, 8bzf:A, 8bzg:A, 8bzh:A, 8bzt:A, 8bzw:A, 8c04:A, 8c0k:A, 8c0l:A, 8c1y:A, 8c28:BBB, 8c28:AAA, 8c2d:AAA, 8c2e:A, 8c2f:A, 8c2g:A, 8c2y:A, 8c30:AAA, 8c3c:A, 8c3z:A, 8c40:A, 8c42:A, 8c43:A, 8c4f:A, 8c4g:A, 4dat:A, 4dau:A, 4dhm:A, 4dhn:A, 4dho:A, 4dhp:A, 4dhq:A, 4dhr:A, 4dhs:A, 4dht:A, 4dhu:A, 6fau:A, 6fau:C, 6fav:A, 6fav:C, 6faw:A, 6faw:C, 6fbb:A, 6fbw:A, 6fbw:C, 6fby:A, 6fby:C, 6fcp:A, 6fi4:A, 6fi5:A, 4fl5:A, 4fl5:B, 4fr3:A, 6g6x:A, 6g8i:A, 6g8j:A, 6g8k:A, 6g8l:A, 6g8p:A, 6g8q:A, 6ghp:A, 5hf3:A, 6hhp:A, 6hkb:A, 6hkf:A, 6hmt:A, 6hmu:A, 6hn2:A, 4iea:A, 3iqj:A, 3iqu:A, 3iqv:A, 4jc3:A, 4jdd:A, 5lu1:A, 5lu1:B, 5lu1:E, 5lu1:F, 5lu2:B, 5lu2:A, 3lw1:A, 3mhr:A, 5mhc:A, 5moc:A, 5mxo:A, 5my9:A, 5myc:A, 5n5r:A, 5n5t:A, 5n5w:A, 5n75:A, 7nfw:A, 7nif:A, 7nig:A, 7nix:A, 7niz:A, 7nj6:A, 7nj8:A, 7nj9:A, 7nja:A, 7njb:A, 7nk3:A, 7nk5:A, 7nla:A, 7nle:A, 7nm1:A, 7nm3:A, 7nm9:A, 7nma:A, 7nmh:A, 7nmw:A, 7nmx:A, 7nn2:A, 7nnd:A, 7nne:A, 7np2:A, 7npb:A, 7npg:A, 7nqp:A, 7nr7:A, 7nrk:A, 7nrl:A, 7nsv:A, 6nv2:A, 7nv4:A, 7nvi:A, 7nws:A, 7nxs:A, 7nxt:A, 7nxw:A, 7nxy:A, 7ny4:A, 7nye:A, 7nyf:A, 7nyg:A, 7nz6:A, 7nzg:A, 7nzk:A, 7nzv:A, 7o07:A, 7o34:A, 7o3a:A, 7o3f:A, 7o3p:A, 7o3q:A, 7o3r:A, 7o3s:A, 7o57:A, 7o59:A, 7o5a:A, 7o5c:A, 7o5d:A, 7o5f:A, 7o5g:A, 7o5o:A, 7o5p:A, 7o5s:A, 7o5u:A, 7o5x:A, 7o6f:A, 7o6g:A, 7o6i:A, 7o6j:A, 7o6k:A, 7o6m:A, 7o6o:A, 3o8i:A, 7ob5:A, 7ob8:A, 7obc:A, 7obd:A, 7obg:A, 7obh:A, 7obk:A, 7obl:A, 7obs:A, 7obt:A, 7obx:A, 7oby:A, 5oeg:A, 5oeh:A, 7opw:A, 7oq7:A, 7oq8:A, 7oq9:A, 7oqa:A, 7oqg:A, 7oqj:A, 7oqs:A, 7oqu:A, 7oqw:A, 7or3:A, 7or5:A, 7or7:A, 7or8:A, 7org:A, 7orh:A, 7ors:A, 7ort:A, 8p0d:A, 3p1n:A, 3p1o:A, 3p1p:A, 3p1q:A, 3p1r:A, 3p1s:A, 7pwt:A, 7pwz:A, 6qdr:A, 6qds:A, 6qdt:A, 6qdu:A, 6qhl:A, 6qhm:A, 6qiu:A, 7qik:B, 7qik:A, 7qip:A, 7qip:B, 4qli:A, 6qzr:F, 6qzr:E, 6qzr:B, 6qzr:A, 6qzr:C, 6qzr:D, 6qzr:G, 6qzr:H, 6qzs:A, 6qzs:B, 8r0z:A, 6r5l:A, 6rhc:A, 6rjl:A, 6rjq:A, 6rjz:A, 6rk8:A, 6rki:A, 6rkk:A, 6rkm:A, 6rl3:A, 6rl4:A, 6rl6:A, 6rm5:A, 6rm7:A, 6rp6:A, 6rwh:A, 6rwi:A, 6rws:A, 6rwu:A, 6rx2:A, 6s39:A, 6s3c:A, 6s40:A, 6s9q:A, 6sin:A, 6sio:A, 6sip:A, 6siq:A, 6slv:A, 6slw:A, 6slx:A, 3smk:A, 3sml:A, 3smm:A, 3smn:A, 3smo:A, 3sp5:A, 3spr:A, 3t0l:A, 3t0m:A, 6t5f:C, 6t5f:D, 6t5f:A, 6t5f:B, 6t80:C, 6t80:D, 6t80:A, 6t80:B, 6tch:B, 6tjm:A, 6tl3:A, 6tlf:A, 6tm7:B, 6twz:B, 6twz:C, 6twz:D, 6twz:A, 3u9x:A, 3ux0:A, 6w0l:A, 6xwd:A, 6xxc:A, 6xy5:A, 6y18:A, 6y1d:A, 6y1j:A, 4y32:A, 4y32:B, 4y3b:A, 4y3b:B, 6y3m:A, 6y3o:A, 6y3r:A, 6y3s:A, 6y3v:A, 6y3w:A, 6y40:A, 6y44:A, 4y5i:A, 4y5i:B, 6y58:A, 6y7t:F, 6y7t:A, 6y8a:A, 6y8b:A, 6y8d:A, 6y8e:A, 6ye9:A, 6yia:A, 6yib:A, 6yic:A, 6ylu:A, 6yow:A, 6yox:A, 6yoy:A, 6yp2:A, 6yp3:A, 6yp8:A, 6ypl:A, 6ypy:A, 6yq2:A, 6yr5:A, 6yr5:B, 6yr5:C, 6yr5:D, 6yr6:A, 6yr6:C, 6yr6:E, 6yr6:G, 6yr7:B, 6yr7:A, 1ywt:A, 1ywt:B, 6zcj:A, 7zmu:A, 7zmw:A, 6zvb:A, 6zvc:A, 6zvd:A, 6zve:A
2 4zdr:A 243 231 0.7112 0.6790 0.7143 2.83e-116 1a38:A, 1a38:B, 8a9g:A, 8a9g:B, 4bg6:A, 4bg6:B, 2c1j:A, 2c1j:B, 2c1n:A, 2c1n:B, 3cu8:A, 3cu8:B, 5d2d:A, 5d2d:B, 5d3f:A, 5d3f:B, 7d8h:A, 7d8p:A, 7d8p:B, 7d9v:A, 7d9v:B, 6ef5:D, 6ef5:C, 6ef5:A, 6ef5:B, 6ejl:A, 6ejl:B, 5ewz:A, 5ewz:B, 6eww:A, 6eww:B, 6eww:C, 6eww:D, 5exa:B, 5exa:A, 7exe:A, 7exe:B, 6f08:B, 6f08:I, 6f08:A, 6f08:J, 6f09:P, 6f09:Q, 6f09:R, 6f09:S, 4fj3:A, 4fj3:B, 6fn9:A, 6fn9:B, 6fna:A, 6fna:B, 6fnb:A, 6fnb:B, 6fnc:A, 6fnc:B, 4hkc:A, 4ihl:A, 4ihl:B, 5j31:A, 5j31:B, 5jm4:A, 5jm4:B, 5m35:A, 5m35:B, 5m36:B, 5m36:A, 5m37:B, 5m37:A, 4n7g:A, 4n7y:A, 4n7y:B, 4n84:A, 4n84:B, 5nas:A, 5nas:B, 3nkx:A, 3nkx:B, 2o02:A, 2o02:B, 8p1h:A, 8qdv:A, 8qdv:B, 8qdv:E, 8qdv:G, 1qja:B, 1qja:A, 1qjb:A, 1qjb:B, 3rdh:A, 3rdh:B, 3rdh:C, 3rdh:D, 6rlz:A, 6rlz:B, 5ulo:A, 5ulo:B, 2v7d:A, 2v7d:B, 2v7d:C, 2v7d:D, 8we2:B, 8we2:A, 8wf6:B, 8wf6:A, 8wf6:D, 8wf6:C, 2wh0:A, 2wh0:B, 2wh0:C, 2wh0:D, 4wrq:A, 4wrq:B, 5wxn:A, 5wxn:B, 5xy9:A, 5xy9:B, 6ymo:A, 6ymo:B, 6yo8:A, 6yo8:B, 6yo8:C, 6yo8:D, 6yos:A, 6yos:B, 6zfg:A, 6zfg:B, 7zit:A, 7zit:B
3 2btp:A 248 230 0.7026 0.6573 0.7087 5.55e-115 6bcr:A, 6bcr:B, 6bcr:E, 6bcr:F, 6bcy:A, 6bcy:B, 6bcy:E, 6bcy:F, 6bd1:A, 6bd1:B, 6bd1:E, 6bd1:F, 6bd2:A, 6bd2:B, 6bqt:A, 6bqt:B, 6bqt:D, 6bqt:E, 6bqt:G, 6bqt:H, 6bqt:J, 6bqt:K, 2btp:B, 6kzg:A, 6kzg:B, 6kzh:A, 6kzh:B
4 5n10:B 236 234 0.6767 0.6653 0.6709 1.70e-112 6a5q:C, 6a5q:B, 6a5q:A, 6byk:B, 6byk:D, 6byk:A, 6byk:C, 2c23:A, 8dp5:C, 5f74:A, 4gnt:A, 6hep:A, 6hep:B, 6hep:C, 6hep:D, 5n10:A, 7qi1:A, 7qi1:D, 7qi1:B, 7qi1:C, 6ygj:A, 6ygj:F
5 4j6s:B 243 238 0.6810 0.6502 0.6639 1.26e-108 6a5s:A, 6a5s:B, 6a5s:D, 6a5s:G, 7a6r:A, 7a6r:B, 7a6r:C, 7a6r:D, 7a6y:A, 7a6y:B, 7a6y:C, 7a6y:D, 2b05:A, 2b05:B, 2b05:C, 2b05:D, 2b05:E, 2b05:F, 6byj:A, 6byj:D, 6byj:C, 6byl:A, 6byl:D, 6byl:C, 6bzd:A, 6bzd:B, 5d3e:A, 5d3e:B, 5d3e:E, 5d3e:F, 5d3e:I, 5d3e:J, 6fel:A, 6fel:B, 6fel:C, 6fel:D, 6gkf:A, 6gkf:B, 6gkf:C, 6gkf:D, 6gkf:E, 6gkf:F, 6gkf:G, 6gkf:H, 6gkg:A, 6gkg:E, 6gkg:B, 6gkg:F, 6gkg:C, 6gkg:G, 4j6s:A, 4j6s:C, 4j6s:D, 4o46:A, 4o46:B, 4o46:C, 4o46:D, 4o46:E, 4o46:F, 6s9k:A, 6sad:A, 6sad:B, 3uzd:A, 6y4k:A, 6y4k:B, 6y6b:A, 6y6b:B, 6zbt:A, 6zbt:D, 6zbt:B, 6zbt:C, 6zc9:A, 6zc9:B, 6zc9:C, 6zc9:D
6 5yqg:C 237 232 0.6466 0.6329 0.6466 3.90e-103 2c63:A, 2c63:B, 2c63:C, 2c63:D, 2c74:A, 2c74:B, 7nmz:AA, 7nmz:BA, 5yqg:A, 5yqg:B, 5yqg:D
7 8qtc:A 238 231 0.6121 0.5966 0.6147 1.48e-96 8qtf:A, 8qtf:D, 8qtf:B, 8qtf:C, 8qtf:E, 8qtf:F, 8qtf:G, 8qtf:H, 8qtf:I, 8qtf:J, 8qtt:A, 8qtt:B, 8qtt:C, 8qtt:D, 8qtt:E, 8qtt:F, 8qtt:G, 8qtt:H, 8qtt:I, 8qtt:J
8 5lx2:A 235 223 0.5948 0.5872 0.6188 1.90e-96 6qk8:A, 6qk8:C, 6qk8:D, 6qk8:B
9 8dgp:A 236 230 0.6121 0.6017 0.6174 3.71e-96 2br9:A, 7c8e:A, 7c8e:B, 8dgm:A, 8dgn:A, 8dgp:B, 8dgp:C, 8dgp:D, 8dp5:D, 6eih:A, 8q1s:B, 8q1s:A, 3ual:A, 3ubw:A, 7v9b:A
10 5nwk:B 245 237 0.6121 0.5796 0.5992 2.20e-94 3e6y:A, 3e6y:B, 8hew:A, 3m50:A, 3m51:A, 5nwi:A, 5nwj:A, 5nwk:A, 5nwk:C, 5nwk:D, 5nwk:E, 5nwk:F, 5nwk:G, 1o9d:A, 1o9e:A, 1o9f:A, 2o98:A, 2o98:B
11 3axy:C 235 233 0.6034 0.5957 0.6009 3.83e-93 3axy:D, 3axy:I, 3axy:J
12 4dx0:A 229 224 0.5776 0.5852 0.5982 7.03e-87
13 1a37:A 195 228 0.6121 0.7282 0.6228 2.14e-86 1a37:B
14 2npm:A 237 230 0.5603 0.5485 0.5652 7.47e-86 2npm:B
15 4zq0:A 234 233 0.5302 0.5256 0.5279 6.59e-80 4zq0:B, 4zq0:C, 4zq0:D
16 5oql:V 121 54 0.0776 0.1488 0.3333 0.61 5oql:W, 6rxt:CE, 6rxt:CF, 6rxu:CE, 6rxu:CF, 6rxv:CE, 6rxv:CF, 6rxx:CE, 6rxx:CF, 6rxy:CE, 6rxy:CF, 6rxz:CE, 6rxz:CF
17 2zad:A 344 74 0.0948 0.0640 0.2973 1.8 3deq:A, 3deq:B, 3deq:C, 3deq:D, 3der:A, 3der:B, 3der:C, 3der:D, 3des:A, 3des:B, 3des:C, 3des:D, 3dfy:A, 3dfy:B, 3dfy:C, 3dfy:D, 3dfy:E, 3dfy:F, 3dfy:G, 3dfy:H, 3dfy:I, 3dfy:J, 3dfy:K, 3dfy:L, 3dfy:M, 3dfy:N, 3dfy:O, 3dfy:P, 2zad:B, 2zad:C, 2zad:D
18 6npl:A 861 14 0.0431 0.0116 0.7143 8.1 6nph:A, 6nph:B, 6npl:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218