BioLiP

>protein
GAMAMHPMLNIAVRAARKAGNLIAKNYETPDAVEASQKGSNDFVTNVDKAAEAVIIDTIRKSYPQHTIITEESGELEGTD
QDVQWVIDPLDGTTNFIKRLPHFAVSIAVRIKGRTEVAVVYDPMRNELFTATRGQGAQLNGYRLRGSTARDLDGTILATG
FPFKAKQYATTYINIVGKLFNECADFRRTGSAALDLAYVAAGRVDGFFEIGLRPWDFAAGELLVREAGGIVSDFTGGHNY
MLTGNIVAGNPRVVKAMLANMRDELSDALK

The query sequence (length=270) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6ib8:B	270	270	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	6ib7:A, 6ib8:A, 2qfl:A, 6tqn:T, 6tqn:S, 6tqo:T, 6tqo:S
2	8wdq:A	273	271	0.5481	0.5421	0.5461	3.13e-101	8wdq:B
3	3lv0:A	258	246	0.4000	0.4186	0.4390	4.59e-64	3luz:A, 3lv0:B
4	3luz:B	234	246	0.3741	0.4316	0.4106	1.33e-54
5	2p3n:A	256	246	0.3444	0.3633	0.3780	2.24e-48	2p3n:B, 2p3n:C, 2p3n:D
6	6giu:A	275	257	0.3111	0.3055	0.3268	4.47e-45	4as4:A, 4as4:B, 1awb:A, 1awb:B, 6giu:B, 6gj0:A, 6gj0:B, 2hhm:A, 2hhm:B, 1ima:A, 1ima:B, 1imb:A, 1imb:B, 1imc:A, 1imc:B, 1imd:A, 1imd:B, 1ime:A, 1ime:B, 6zk0:AAA, 6zk0:BBB
7	2czi:A	259	251	0.3148	0.3282	0.3386	9.94e-44	2czh:B
8	4as5:A	274	249	0.3000	0.2956	0.3253	1.53e-42	4as5:B, 4as5:C, 4as5:D
9	2bji:A	274	259	0.3111	0.3066	0.3243	1.71e-40	2bji:B
10	5dw8:A	260	217	0.2889	0.3000	0.3594	1.38e-36	5dw8:B, 5j16:A, 5j16:B, 5j16:C, 5j16:D
11	5eyg:B	265	183	0.1963	0.2000	0.2896	1.26e-23	5eyg:A, 5eyh:A, 5eyh:B, 5f24:A, 5f24:B, 4g61:A, 4g61:B, 4i3e:A, 4i3e:B, 4i3y:A, 4i3y:B, 4i40:A, 4i40:B, 4ptk:A, 4ptk:B, 3ryd:A, 3ryd:C
12	5eq9:B	260	233	0.2444	0.2538	0.2833	3.23e-21	5eq8:A, 5eq9:A, 5eq9:C, 5eq9:D, 5t3j:A
13	1dk4:A	252	194	0.2000	0.2143	0.2784	2.46e-17	1dk4:B, 1g0h:A, 1g0h:B, 1g0i:A, 1g0i:B
14	5zon:A	256	202	0.2222	0.2344	0.2970	1.54e-13	5yht:A, 5yht:B, 5zon:B, 5zon:C, 5zon:D
15	6b5z:A	252	229	0.2593	0.2778	0.3057	2.49e-13	6b5z:B, 6b60:A, 6b60:B, 6b61:A, 6b61:B, 6b62:A, 6b62:B, 6b63:A, 6b63:B, 6b64:A, 6b64:B, 6b65:A, 6b65:B, 6b66:A, 6b66:B, 1lbx:A, 1lbx:B, 1lby:A, 1lby:B, 1lbz:A, 1lbz:B
16	4hxv:A	317	206	0.2037	0.1735	0.2670	3.38e-09	4o7i:A
17	8f9y:A	352	288	0.2704	0.2074	0.2535	2.09e-08
18	2wef:A	303	264	0.2481	0.2211	0.2538	2.84e-08	1jp4:A
19	1k9y:A	354	357	0.2926	0.2232	0.2213	1.96e-06	1k9z:A, 1ka0:A, 1ka1:A, 1qgx:A
20	5djj:A	257	87	0.0926	0.0973	0.2874	0.015	5djg:A, 5djh:A, 5dji:A, 5djk:A
21	5q0c:A	328	86	0.0852	0.0701	0.2674	0.13	5et6:A, 5et6:C, 5et6:B, 5et6:D, 4he0:A, 4he1:A, 4he2:A, 3ifa:A, 3ifa:B, 3ifa:C, 3ifa:D, 3ifc:A, 3ifc:B, 3ifc:C, 3ifc:D, 5k56:A, 5l0a:A, 5q0c:B, 5q0c:C, 5q0c:D, 5q0c:E, 5q0c:F, 5q0c:G, 5q0c:H
22	8de5:A	338	126	0.1370	0.1095	0.2937	0.37
23	5o9z:L	459	41	0.0556	0.0327	0.3659	2.0
24	2wnb:A	273	126	0.1037	0.1026	0.2222	2.6	2wnf:A
25	1ee9:A	317	64	0.0704	0.0599	0.2969	2.8
26	4oal:A	444	67	0.0556	0.0338	0.2239	3.1	4oal:B
27	9enp:A	1072	135	0.1444	0.0364	0.2889	3.1	9enq:A, 8oja:A
28	8v1t:A	1064	147	0.1556	0.0395	0.2857	3.8
29	5k55:A	290	65	0.0556	0.0517	0.2308	4.3	5et8:A
30	5yjl:B	415	69	0.1000	0.0651	0.3913	5.1	5yjl:A
31	8av6:C	459	40	0.0556	0.0327	0.3750	5.5	8av6:A, 8av6:B, 6fhs:A, 6fhs:B, 6fhs:C, 6fml:A, 6fml:B, 6fml:C, 8oo7:A, 8oo7:B, 8oo7:C, 8ooc:A, 8ooc:B, 8ooc:C, 8oop:A, 8oop:B, 8oop:C, 8oor:A, 8oor:B, 8oor:C, 4wvy:A
32	5fm6:A	426	40	0.0556	0.0352	0.3750	5.6	5fm7:A, 4ww4:A
33	8v1q:A	1097	149	0.1556	0.0383	0.2819	6.0	8exx:A, 7luf:A, 7luf:B, 8oj6:A, 8oj7:A, 8ojb:A, 8ojd:A, 8v1r:A, 8v1s:A, 8vq2:A, 8vq2:B
34	3e4d:A	278	19	0.0370	0.0360	0.5263	7.1	3e4d:B, 3e4d:C, 3e4d:E, 3e4d:D, 3e4d:F
35	3ojl:A	418	84	0.0741	0.0478	0.2381	9.9	3ojl:B, 3ojo:A, 3ojo:B

[Back]