>protein
GADDVVDSSKSFVMENFSSYHGTKPGYVDSIQKGIQKPKSGNYDDDWKEFYSTDNKYDAAGYSVDNENPLSGKAGGVVKV
TYPGLTKVLALKVDNAETIKKELGLSLTEPLMEQVGTEEFIKRFGDGASRVVLSLPFAEGSSSVEYINNWEQAKALSVEL
EINFETRGKRGQDAMYEYMAQACLSCINLDWDVIRDKTKTKIESLKEHGPIKNKMSESPNKTVSEEKAKQYLEEFHQTAL
EHPELSELKTVTGTNPVFAGANYAAWAVNVAQVIDSETADNLEKTTAALSILPGIGSVMGIADGAVHHNTEEIVAQSIAL
SSLMVAQAIPLVGELVDIGFAAYNFVESIINLFQVVHNSYNRPAYSPGHKTQPFLHDGYAVSWNTVEDSIIRTGFQGESG
HDIKITAENTPLPIAGVLLPTIPGKLDVNKSKTHISVNGRKIRMRCRAIDGDVTFCRPKSPVYVGNGVHANLHVAFHRSS
SEKIHSNEISSDSIGVLGYQKTVDHTKVNSKLSLFFEIKS
The query sequence (length=520) is searched through a non-redundant set of database sequences
protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.
| # |
Hit |
Hit
length |
Aligned
length |
Identity
(normalized by query) |
Identity
(normalized by hit) |
Identity (normalized
by aligned length) |
E-value |
Homologs
to hit |
| 1 |
1ddt:A |
523 |
523 |
0.9962 |
0.9904 |
0.9904 |
0.0 |
4ae1:A, 4ae1:B, 1dtp:A, 1f0l:A, 1f0l:B, 8g0g:A, 8g0g:B, 1mdt:A, 1mdt:B, 7o4w:A, 1tox:A, 1tox:B |
| 2 |
9biw:B |
528 |
531 |
0.3904 |
0.3845 |
0.3823 |
3.68e-121 |
9biw:A |
| 3 |
7ri3:C |
583 |
272 |
0.1327 |
0.1184 |
0.2537 |
2.59e-13 |
7ri3:A, 7ri3:B, 7ri3:D |
| 4 |
7ri3:C |
583 |
56 |
0.0385 |
0.0343 |
0.3571 |
0.25 |
7ri3:A, 7ri3:B, 7ri3:D |
| 5 |
6edg:A |
213 |
69 |
0.0423 |
0.1033 |
0.3188 |
0.093 |
1aer:A, 1aer:B, 3b78:B, 3b78:D, 3b78:F, 3b82:B, 3b82:D, 3b82:F, 3b8h:B, 3b8h:D, 3b8h:F, 1dma:A, 1dma:B, 1xk9:A, 1xk9:B, 2zit:B, 2zit:D, 2zit:F, 1zm4:B, 1zm4:D, 1zm4:F, 1zm9:B, 1zm9:D, 1zm9:F |
| 6 |
3v0a:A |
1280 |
95 |
0.0500 |
0.0203 |
0.2737 |
2.6 |
8agk:AAA, 3bon:A, 3boo:A, 3bta:A, 3bwi:A, 3c88:A, 3c89:A, 3c8a:A, 3c8b:A, 3dda:A, 3ddb:A, 3ds9:A, 1e1h:A, 1e1h:C, 4ej5:A, 4el4:A, 4elc:A, 2g7n:A, 2g7p:A, 2g7p:B, 2g7q:A, 2g7q:B, 8hkh:A, 8hkh:B, 2ilp:A, 2ilp:B, 2ise:A, 2ise:B, 2isg:A, 2isg:B, 2ish:A, 2ish:B, 3k3q:B, 4ks6:A, 4ktx:A, 4kuf:A, 7kyf:C, 7l6v:A, 7lzp:A, 7lzp:D, 7m1h:A, 2nyy:A, 2nz9:A, 2nz9:B, 7qpt:A, 7qpu:A, 3qw5:A, 3qw6:A, 3qw7:A, 3qw8:A, 5tpb:B, 5tpc:A, 3v0b:A, 3v0c:A, 5vgv:A, 2vu9:A, 2w2d:A, 2w2d:C, 6xcb:A, 6xcc:A, 6xcd:A, 6xce:A, 6xcf:A, 1xtf:A, 1xtf:B, 1xtg:A, 4zjx:A, 3zus:A, 3zus:B, 3zus:C, 3zus:D |
| 7 |
7d69:B |
78 |
68 |
0.0404 |
0.2692 |
0.3088 |
6.1 |
7d69:F |
| 8 |
3csk:A |
710 |
178 |
0.0942 |
0.0690 |
0.2753 |
6.8 |
|
| 9 |
1woo:A |
362 |
26 |
0.0212 |
0.0304 |
0.4231 |
9.7 |
1wop:A, 1wor:A |
[Back]
umich.edu