BioLiP

>protein
FYLRNFNNWMKSVLIGEFLEKVRQKKKRDITVLDLGCGKGGDLLKWKKGRINKLVCTDIADVSVKQCQQRYEDMKNRIFS
AEFITADSSKELLIDKFRDPQMCFDICSCQFVCHYSFESYEQADMMLRNACERLSPGGYFIGTTPNSFELIRRLEASETE
SFGNEIYTVKFQKKGDYPLFGCKYDFNLEGVVDVPEFLVYFPLLNEMAKKYNMKLVYKKTFLEFYEEKIKNNENKMLLKR
MGLGCLSKSEWEATSIYLVFAFEKQQ

The query sequence (length=266) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5e8j:A	310	307	0.9925	0.8516	0.8599	0.0	3bgv:A, 3bgv:B, 3bgv:C, 3bgv:D, 5e8j:B, 5e9j:A, 5e9j:B, 5e9w:A, 5e9w:B, 5e9w:C, 5e9w:D, 3epp:A, 3epp:B, 8q69:A, 8q69:B, 8q8g:A, 8q8g:B, 8q9w:A, 8q9w:B
2	1ri1:A	252	264	0.3759	0.3968	0.3788	3.36e-45	2hv9:A, 1ri2:A, 1ri3:A, 1ri4:A, 1z3c:A
3	6rie:O	822	143	0.1466	0.0474	0.2727	1.24e-07	4ckb:A, 4ckb:D, 4ckc:A, 4ckc:D, 4cke:A, 4cke:D, 2vdw:A, 2vdw:C, 2vdw:E, 2vdw:G
4	7d8u:A	284	271	0.2406	0.2254	0.2362	0.017	7d8u:B
5	1ve3:B	226	127	0.1466	0.1726	0.3071	0.031	1ve3:A
6	7ofl:A	335	69	0.0639	0.0507	0.2464	0.13	7ofl:B
7	5dpl:A	520	138	0.1466	0.0750	0.2826	0.66	5doo:A, 5dpl:B
8	7wzg:B	243	121	0.1053	0.1152	0.2314	0.74	7wzg:A, 7wzg:C, 7wzg:D, 7wzg:E, 7wzg:F
9	5egp:A	282	149	0.1203	0.1135	0.2148	0.83	5egp:B, 5jgk:A, 5jgk:B, 5jgl:A, 5jgl:B
10	3mb5:A	255	31	0.0414	0.0431	0.3548	0.90	3lga:A, 3lga:B, 3lga:C, 3lga:D, 3lhd:C, 3lhd:A, 3lhd:B, 3lhd:D
11	5igo:C	323	101	0.0902	0.0743	0.2376	1.2	5igo:A, 5igo:D, 5igo:B, 5kwn:A, 6qto:A, 6qtq:A, 6qtr:A, 6qts:A, 6qtt:A, 6qtu:A, 6qtv:A, 6qtw:A, 6qtx:A
12	3b6u:B	343	87	0.0752	0.0583	0.2299	2.2	3b6u:A
13	6cx6:B	333	53	0.0639	0.0511	0.3208	2.3	6cx6:A, 5eg5:A, 4fr0:A, 4fsd:A, 4kw7:A, 4rsr:A
14	6p3o:A	341	126	0.1128	0.0880	0.2381	2.4	6p3m:A, 6p3n:A
15	6gkv:A	351	147	0.1241	0.0940	0.2245	2.5	6gkv:B, 6gky:A, 6gky:B, 6gkz:A, 6gkz:B, 6gkz:C, 6gkz:D
16	6ecx:A	283	65	0.0865	0.0813	0.3538	2.9	6ect:A
17	7cnv:A	132	41	0.0489	0.0985	0.3171	3.1	7c8m:A, 7c8m:C, 7c8n:A, 7c8o:D, 7c8o:B, 7cnv:B, 7cnv:C, 7cnv:D, 7cnv:E, 7cnv:F
18	5dm0:B	272	51	0.0639	0.0625	0.3333	3.2	5dly:A, 5dm0:A, 4kvz:A
19	6cu5:A	314	120	0.1165	0.0987	0.2583	3.4	6cu5:B, 8ft7:A, 8ft7:B
20	2f8l:A	323	206	0.1729	0.1424	0.2233	6.0
21	7dmb:A	358	154	0.1203	0.0894	0.2078	6.2	7dmb:B
22	7r7e:A	567	82	0.0827	0.0388	0.2683	6.2	7r7e:B, 7r7f:A, 7r7f:B, 7r7g:A, 7r7g:B
23	7qd4:A	908	74	0.0752	0.0220	0.2703	6.2	7qd4:D, 7qd5:A, 7qd5:D, 7qd6:A, 7qd6:D
24	4rh7:A	3005	46	0.0677	0.0060	0.3913	6.3
25	2j3e:A	249	65	0.0752	0.0803	0.3077	7.1	3bb3:A, 3bb4:A, 3def:A
26	6sc2:B	3930	46	0.0677	0.0046	0.3913	7.5	6rla:A, 6rla:B, 6sc2:A
27	3ofk:A	204	109	0.0940	0.1225	0.2294	8.0	3ofk:B, 3ofk:C, 3ofk:D
28	4ax8:A	450	71	0.0865	0.0511	0.3239	8.7	4azs:A, 4azt:A, 4azv:A
29	3vc1:D	288	29	0.0414	0.0382	0.3793	9.7	4f86:D, 4f86:G, 3vc1:A, 3vc1:B, 3vc1:C, 3vc1:E, 3vc1:F, 3vc1:G, 3vc1:H, 3vc1:I, 3vc1:J, 3vc1:K, 3vc1:L, 3vc2:A, 3vc2:B, 3vc2:C, 3vc2:D, 3vc2:E, 3vc2:F, 3vc2:G, 3vc2:H, 3vc2:I, 3vc2:J, 3vc2:K, 3vc2:L
30	2zyo:A	385	31	0.0414	0.0286	0.3548	9.9	2zyk:A, 2zyk:B, 2zyk:C, 2zyk:D, 2zym:A, 2zyn:A

[Back]