BioLiP

>protein
FYEKIQTPAYILEEDKLRKNCELLASVGEKSGAKVLLALKGFAFSGAMKIVGEYLKGCTCSGLWEAKFAKEYMDKEIHTY
SPAFKEDEIGEIASLSHHIVFNSLAQFHKFQSKTQKNSLGLRCNVEFSGRYSRLGIRAKDFENVDLNAIEGLHFHALCEE
SADALEAVLKVFEEKFGKWIGQMKWVNFGGGHHITKKGYDVEKLIALCKNFSDKYGVQVYLEPGEAVGWQTGNLVASVVD
IIENEKQIAILDTSSEAHMPDTIIMPYTSEVLNARILATRENEKISDLKENEFAYLLTGNTCLAGDVMGEYAFDKKLKIG
DKIVFLDQIHYTIVKNTTFNGIRLPNLMLLDHKNELQMIREFSYKDYSLRN

The query sequence (length=371) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3n29:A	371	371	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3n29:B
2	7kh2:D	415	257	0.1456	0.1301	0.2101	1.71e-04	7kh2:A, 7kh2:B, 7kh2:C
3	2oo0:A	419	255	0.1644	0.1456	0.2392	2.05e-04	5bwa:A, 7odc:A, 2on3:A, 2on3:B, 2oo0:B, 7s3f:A, 7s3f:B, 7s3g:A, 7s3g:B, 7u6p:A, 7u6p:B, 7u6u:A, 7u6u:B, 4zgy:A
4	1tuf:A	434	420	0.2749	0.2350	0.2429	4.11e-04	1tuf:B, 1twi:A, 1twi:B, 1twi:C, 1twi:D
5	8d4i:A	462	77	0.0728	0.0584	0.3506	5.65e-04	8d2y:A, 8d4i:C, 8d5d:A, 8d5d:B, 8d5r:A, 8d5r:B, 8d88:A, 8d88:B
6	1f3t:B	381	287	0.1644	0.1601	0.2125	0.002	1f3t:A, 1f3t:C, 1f3t:D, 1njj:A, 1njj:B, 1njj:C, 1njj:D, 1qu4:A, 1qu4:B, 1qu4:C, 1qu4:D, 1szr:C, 1szr:D, 1szr:A, 1szr:B, 2tod:A, 2tod:B, 2tod:C, 2tod:D
7	2plj:A	376	290	0.1752	0.1729	0.2241	0.032	2plj:B, 2plk:A, 2plk:B
8	5gjo:A	385	67	0.0566	0.0545	0.3134	0.036	5gjn:A, 5gjo:B, 5gjp:A
9	1hkv:A	446	424	0.2453	0.2040	0.2146	0.069	1hkv:B
10	7v40:A	432	44	0.0404	0.0347	0.3409	0.78	7v41:A, 7v42:A, 7v43:A, 7v44:A, 7v45:A, 7v46:A
11	3kyf:A	231	43	0.0431	0.0693	0.3721	1.9
12	2nv9:B	372	46	0.0485	0.0484	0.3913	2.2	2nv9:A, 2nv9:C, 2nv9:D, 2nv9:E, 2nv9:F, 2nv9:G, 2nv9:H, 2nva:A, 2nva:B, 2nva:C, 2nva:D, 2nva:E, 2nva:F, 2nva:G, 2nva:H
13	6km8:A	345	81	0.0620	0.0667	0.2840	3.4
14	8a1l:A	354	54	0.0512	0.0537	0.3519	4.4	7a0z:A, 7a0z:B, 7a10:A, 7a10:B, 7a11:A, 7a1e:A, 8a1j:A, 8a1j:B, 8a1k:A, 8a1k:B, 8a1l:B, 8a1m:A, 8a1m:B, 8a1n:A, 8a1o:A, 8bk3:A, 6boi:A, 6boi:B, 5dc2:A, 5dc2:B, 5dcc:A, 5dcc:B, 5duj:A, 5duj:B, 5dvp:A, 5dvp:B, 5dzj:A, 5dzj:B, 5dzp:A, 5e1g:A, 5e1i:A, 7f71:A, 7f71:B, 7f8p:A, 4gsq:A, 4gsr:A, 4gsu:A, 4gsu:B, 6iyv:B, 6iyv:A, 6iyw:A, 6iyw:B, 6iyw:C, 6iyw:D, 6iyw:E, 6iyw:F, 5k69:A, 5k69:B, 7kem:A, 7kem:B, 5lb1:A, 5lb1:B, 5lbg:B, 6lqb:A, 6lqb:B, 8pxy:A, 8pxz:A, 4qr7:A, 4qrb:A, 4qtf:A, 6rrm:A, 6rrm:B, 3tur:A, 3tur:B, 3vyp:A, 3vyp:B
15	4kxf:P	866	39	0.0350	0.0150	0.3333	4.6
16	4kxf:K	904	39	0.0350	0.0144	0.3333	4.9	4kxf:B, 4kxf:D, 4kxf:F, 4kxf:H, 4kxf:L, 4kxf:N
17	2y53:A	529	25	0.0323	0.0227	0.4800	5.8	2vro:A, 2vro:B, 2y53:B, 2y5d:A, 2y5d:B
18	6ltb:A	928	64	0.0566	0.0226	0.3281	7.9	6ltc:A, 6ltd:A, 6ltd:B
19	4cu7:A	848	134	0.0943	0.0413	0.2612	8.9	4cu8:A, 4cuc:A

[Back]