Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
FYEESKPFTCLDGTATIPFDQVNDDYCDCKDGSDEPGTAACPNGSFHCTNTGYKPLYILSSRVNDGVCDCCDGTDEYNSG
TVCENTCR

The query sequence (length=88) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8d43:B 100 88 0.9205 0.8100 0.9205 9.54e-57 8emr:B, 5f0e:B, 5h9o:B, 5h9o:D, 5hjo:B, 5hjo:D, 5hjr:B, 5hjr:D, 5ied:B, 5iee:B, 5ief:B, 5ieg:B, 7jty:B, 7jty:D, 7k9n:B, 7k9n:D, 7k9o:B, 7k9o:D, 7k9q:B, 7k9q:D, 7k9t:B, 7k9t:D, 7kad:B, 7kad:D, 7kb6:B, 7kb6:D, 7kb8:B, 7kb8:D, 7kbj:B, 7kbj:D, 7kbr:B, 7kbr:D, 7kry:B, 7kry:D, 7l9e:B, 7l9e:D
2 5jqp:B 131 118 0.5568 0.3740 0.4153 9.36e-16
3 8em7:A 4378 80 0.3523 0.0071 0.3875 7.90e-04 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
4 8em7:A 4378 53 0.2614 0.0053 0.4340 0.019 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
5 8em7:A 4378 72 0.2955 0.0059 0.3611 0.020 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
6 8em7:A 4378 79 0.3295 0.0066 0.3671 0.020 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
7 8em7:A 4378 78 0.3409 0.0069 0.3846 0.024 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
8 8em7:A 4378 73 0.3295 0.0066 0.3973 0.038 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
9 8em7:A 4378 76 0.3068 0.0062 0.3553 0.12 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
10 8em7:A 4378 75 0.3182 0.0064 0.3733 0.16 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
11 8em7:A 4378 57 0.2500 0.0050 0.3860 0.71 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
12 8em7:A 4378 86 0.3295 0.0066 0.3372 0.88 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
13 8em7:A 4378 78 0.2955 0.0059 0.3333 2.0 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
14 8em7:A 4378 77 0.3409 0.0069 0.3896 2.1 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
15 8em7:A 4378 79 0.3068 0.0062 0.3418 3.4 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
16 8em7:A 4378 71 0.2955 0.0059 0.3662 3.7 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
17 8em7:A 4378 78 0.2955 0.0059 0.3333 3.9 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
18 8em7:A 4378 73 0.3068 0.0062 0.3699 4.9 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
19 8em4:A 3818 80 0.3523 0.0081 0.3875 8.87e-04 8em4:B
20 8em4:A 3818 72 0.2955 0.0068 0.3611 0.024 8em4:B
21 8em4:A 3818 79 0.3295 0.0076 0.3671 0.024 8em4:B
22 8em4:A 3818 74 0.3182 0.0073 0.3784 0.034 8em4:B
23 8em4:A 3818 73 0.3295 0.0076 0.3973 0.037 8em4:B
24 8em4:A 3818 76 0.3068 0.0071 0.3553 0.11 8em4:B
25 8em4:A 3818 57 0.2500 0.0058 0.3860 0.83 8em4:B
26 8em4:A 3818 78 0.2955 0.0068 0.3333 2.4 8em4:B
27 8em4:A 3818 51 0.2386 0.0055 0.4118 3.3 8em4:B
28 8em4:A 3818 73 0.3068 0.0071 0.3699 6.6 8em4:B
29 8jxc:A 1337 76 0.3523 0.0232 0.4079 0.007 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
30 8jxc:A 1337 77 0.3295 0.0217 0.3766 0.011 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
31 8jxc:A 1337 78 0.3068 0.0202 0.3462 0.24 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
32 8jxc:A 1337 57 0.2614 0.0172 0.4035 0.58 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
33 8jxc:A 1337 35 0.1818 0.0120 0.4571 1.1 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
34 8jxc:A 1337 71 0.2955 0.0194 0.3662 2.7 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
35 1f5y:A 85 77 0.3068 0.3176 0.3506 0.087
36 8jxj:A 570 76 0.3409 0.0526 0.3947 0.32 8jxj:B
37 8jxd:B 156 78 0.2841 0.1603 0.3205 0.51
38 7qbg:D 81 75 0.3068 0.3333 0.3600 0.53 7qbd:C, 7qbd:D, 7qbf:C, 4zrp:C, 4zrp:D, 4zrq:C, 4zrq:D
39 7oik:A 4426 55 0.1932 0.0038 0.3091 0.74 7oim:A, 6tax:A, 6tay:A
40 1jrf:A 47 46 0.1932 0.3617 0.3696 0.80
41 3hhs:A 669 18 0.1023 0.0135 0.5000 1.6
42 2xrc:C 454 69 0.2727 0.0529 0.3478 2.7
43 2xrc:B 485 69 0.2727 0.0495 0.3478 2.9 5o32:D, 5o32:H, 2xrc:A, 2xrc:D
44 8xi4:M 79 75 0.2955 0.3291 0.3467 8.8 8ua4:R, 8ufb:V, 8ufb:W, 8ufb:X, 8ufb:Y, 8ufc:V, 8ufc:W, 8ufc:X, 8ufc:Y, 8xi4:N, 8xi4:O, 8xi4:P, 8ys2:M, 8ys2:N, 8ys2:O, 8ys2:P

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218