BioLiP

>protein
FSCNVDGGSSIGAGTTSVYVNLDPVIQPGQNLVVDLSQHISCWNDYGGWYDTDHINLVQGSAFAGSLQSYKGSLYWNNVT
YPFPLTTNTNVLDIGDKTPMPLPLKLYITPVGVVIKAGEVIARIHMYKIATLGSGNPRNFTWNIISNNSVVM

The query sequence (length=152) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5lne:B	162	155	0.9934	0.9321	0.9742	2.79e-105	6aox:A, 6aox:B, 6aoy:B, 6arm:A, 6arm:B, 6arn:A, 6arn:B, 6aro:A, 6aro:B, 6as8:A, 6as8:B, 5lne:A, 6map:B, 6maq:B, 6maw:A, 8usm:A, 8usm:B
2	9at9:B	163	158	0.4474	0.4172	0.4304	4.66e-33
3	6gtv:A	279	158	0.4474	0.2437	0.4304	2.98e-32	5aal:A, 5aal:B, 5aap:A, 5abz:A, 5abz:B, 4att:A, 4auj:A, 4auy:A, 4auy:B, 4av0:A, 4av0:B, 4av4:A, 4av5:A, 4av5:B, 4av5:C, 4av5:D, 4avh:A, 4avh:B, 4avi:A, 4avi:B, 4avj:A, 4avj:B, 4avk:A, 4avk:B, 7ayn:A, 7ayn:B, 7ayn:C, 7ayn:D, 7bhd:A, 7bhd:B, 4buq:A, 4buq:B, 8bvd:A, 8bvd:B, 8bvd:C, 8bvd:D, 8bxy:A, 8bxy:B, 8by3:A, 8by3:C, 8by3:B, 8by3:D, 4ca4:A, 4ca4:B, 5cgb:A, 5cgb:B, 4css:A, 4cst:A, 5f2f:A, 5f3f:A, 5fs5:A, 5fwr:A, 5fwr:B, 5fwr:C, 5fwr:D, 5fwr:E, 5fwr:F, 5fwr:G, 5fwr:H, 6g2r:A, 6g2r:B, 6g2s:A, 6g2s:B, 6g2s:C, 6g2s:D, 6g2s:E, 6g2s:F, 6g2s:G, 6g2s:H, 6g2s:I, 6gtv:C, 6gtw:C, 6gtw:B, 6gtw:A, 6gtw:D, 6gtx:A, 6gtx:B, 6gtx:C, 6gtx:D, 6gty:A, 6gty:B, 6gty:C, 6gty:D, 6gty:E, 6gtz:A, 6gtz:C, 6gu0:A, 5jcq:A, 5jcq:B, 5jcr:A, 5jcr:B, 5jqi:H, 5jqi:B, 5jqi:D, 5jqi:F, 5jr4:A, 1kiu:B, 1kiu:D, 1kiu:F, 1kiu:H, 1kiu:J, 1kiu:L, 1kiu:N, 1kiu:P, 1klf:B, 1klf:D, 1klf:F, 1klf:H, 1klf:J, 1klf:L, 1klf:N, 1klf:P, 5l4t:A, 5l4t:B, 5l4u:A, 5l4u:B, 5l4v:A, 5l4v:B, 5l4v:C, 5l4w:A, 5l4w:B, 5l4w:C, 5l4x:A, 5l4x:B, 5l4y:A, 5l4y:B, 4lov:A, 3mcy:A, 3mcy:D, 3mcy:B, 3mcy:C, 5mts:A, 5mts:B, 5muc:A, 5muc:B, 7q3n:F, 7quo:A, 7quo:C, 7quo:B, 7quo:D, 1tr7:B, 1tr7:A, 1uwf:A, 2vco:A, 2vco:B, 4x50:A, 4x50:B, 4x5p:A, 4x5q:A, 4x5r:A, 4x5r:B, 4x5r:C, 4xo8:A, 4xo8:B, 4xo9:A, 4xoa:A, 4xoa:G, 4xoa:C, 4xoa:E, 4xob:A, 4xob:C, 4xob:E, 4xob:G, 4xoc:A, 4xoc:B, 4xod:A, 4xoe:A, 6yhw:A, 6yhw:B, 3zl1:A, 3zl1:B, 3zl2:A
4	4qpe:A	867	101	0.2105	0.0369	0.3168	1.8	5dyf:A, 2gtq:A, 4pu2:A, 4pvb:A, 4pw4:A, 4qhp:A, 4qir:A, 4qme:A, 4quo:A
5	8isz:B	450	98	0.1513	0.0511	0.2347	2.2	8ifk:A, 8ifl:A, 8ifl:F, 8ifl:J, 8ifl:N, 8ifm:A, 8ifm:F, 8ifm:J, 8ifm:N, 8it0:B, 8it0:F, 8it1:J, 8it1:N, 8it1:B, 8it1:F, 8j8h:B, 8j9g:B, 8j9p:B, 8j9p:D, 8jay:B, 8jay:D, 8jay:J, 8jay:N, 8k9g:B, 8k9g:F, 8u72:B, 8u72:D, 8u72:H, 8u72:F, 8u7b:B
6	5wru:B	308	75	0.1382	0.0682	0.2800	2.6
7	7ape:A	435	60	0.1184	0.0414	0.3000	4.4	7ape:B
8	8ja7:E	443	49	0.1053	0.0361	0.3265	4.9	8ja8:A, 8ja9:A, 8jaa:A, 8jab:A, 8jac:A, 8jad:A, 7wda:A, 7wda:B, 7wda:C, 7wda:D
9	8the:A	712	33	0.0789	0.0169	0.3636	5.7
10	7mit:E	1438	18	0.0592	0.0063	0.5000	5.8	7mjo:E, 7mjp:E, 7mjq:E, 7y1l:A
11	7xuh:A	707	42	0.0789	0.0170	0.2857	7.0	7xuh:B, 7xuj:A, 7xuj:B, 7xul:A, 7xul:B
12	5tp4:B	409	51	0.0855	0.0318	0.2549	7.5	5tp4:A
13	5clt:A	646	79	0.1382	0.0325	0.2658	9.7	5clt:B, 5clt:C, 5clw:A, 5clw:C, 5clw:B

[Back]