Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
FRLPYGERVRLAKNPTGKKLFEIMIQKETNLCLAADVATAAELLDIADKVGPEICMLKTHVDILPDFTPDFGSKLRSIAE
KHNFLIFEDRKFADIGNTVTMQYEGGIFKILDWADIVNAHIVSGPGIVDGLKLKGLPRGRGLLLLAEMSSSGNFAKGDYT
AAAVKIAEGHSDFVIGFISVNPASWPSGPGNPALIHATPGVQLQYNTPFSVISERGSDIIIVGRGIIKAANPAEVAREYR
LQGWDAYLLHC

The query sequence (length=251) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8u0z:A 260 260 1.0000 0.9654 0.9654 0.0 8u0z:B
2 2v30:A 262 258 0.6016 0.5763 0.5853 6.09e-101 7am9:A, 7asq:A, 3bgg:A, 3bgj:A, 3bgj:B, 3bk0:A, 3bk0:B, 3bvj:A, 3bvj:B, 3dbp:A, 3dbp:B, 3ewu:A, 3ewu:B, 3eww:A, 3eww:B, 3ewx:A, 3ewy:A, 3ewz:A, 3ewz:B, 3ewz:C, 3ewz:D, 3ex1:A, 3ex1:B, 3ex2:A, 3ex2:B, 3ex3:A, 3ex3:B, 3ex4:A, 3ex6:A, 3ex6:B, 3g3d:A, 3g3d:B, 3g3m:A, 4hib:A, 4hib:B, 4hkp:A, 4hkp:B, 3l0k:A, 3l0k:B, 3l0n:A, 3l0n:B, 3mi2:A, 3mi2:B, 3mo7:A, 3mw7:A, 3mw7:B, 7oqf:A, 7oqf:B, 7oqi:A, 7oqi:B, 7oqk:A, 7oqk:B, 7oqm:A, 7oqm:B, 7oqn:A, 7oqn:B, 7otu:A, 7ouz:A, 7ov0:A, 7q1h:A, 2qcd:A, 2qcd:B, 2qcf:A, 2qcg:A, 2qcg:B, 2qch:A, 2qch:B, 2qcl:A, 2qcl:B, 2qcm:A, 2qcn:A, 2qcn:B, 2v30:B, 6yvk:A, 6yvl:A, 6yvm:A, 6yvn:A, 6yvo:A, 6ywt:A, 6ywu:A, 6zwy:A, 6zx0:A, 6zx1:A, 6zx2:A, 6zx3:A
3 1dqx:A 267 264 0.5139 0.4831 0.4886 2.93e-74 1dqx:B, 1dqx:C, 1dqx:D, 3gdl:A, 3gdl:B, 3gdt:A, 3gdt:B, 3gdt:C, 3gdt:D
4 3uwq:B 224 227 0.2311 0.2589 0.2555 4.34e-08 3uwq:A
5 1dbt:A 237 244 0.2351 0.2489 0.2418 2.31e-06 1dbt:B, 1dbt:C
6 8cso:C 231 236 0.2191 0.2381 0.2331 1.73e-05 8cso:A, 8cso:B, 8cso:D, 8cso:E, 8cso:F, 8ek7:C, 8ek7:E
7 1eix:C 232 235 0.2112 0.2284 0.2255 2.99e-04 1eix:A, 1eix:B, 1eix:D, 1jjk:A, 1jjk:B, 1jjk:C, 1jjk:D, 1jjk:E, 1jjk:F, 1jjk:G, 1jjk:H, 1jjk:I, 1jjk:J, 1jjk:K, 1jjk:L, 1jjk:M, 1jjk:N, 1jjk:O, 1jjk:P
8 2yyu:B 229 184 0.1833 0.2009 0.2500 0.005 2yyu:A
9 2cze:A 208 217 0.2311 0.2788 0.2673 0.009 2cze:B, 2czf:A, 2czf:B
10 5ifp:A 968 76 0.1036 0.0269 0.3421 0.020 5ift:A, 5ihr:A, 5juv:A, 5mgc:A, 5mgd:A
11 1tg7:A 971 56 0.0876 0.0227 0.3929 0.020 1xc6:A
12 4luj:A 214 219 0.2191 0.2570 0.2511 0.025 4luj:B
13 1dvj:A 239 183 0.2151 0.2259 0.2951 0.14 1dvj:B, 1dvj:C, 1dvj:D, 2e6y:A, 2e6y:B, 4fx6:M, 4fx6:N, 4fx8:A, 4fx8:B, 4fxr:A, 4fxr:B, 3g1a:A, 3g1a:B, 3g1d:A, 3g1d:B, 3g1f:A, 3g1f:B, 3g1f:C, 3g1f:D, 3g1f:E, 3g1f:F, 3g1f:G, 3g1f:H, 3g1f:I, 3g1f:J, 3g1f:K, 3g1f:L, 3g1f:M, 3g1h:A, 3g1h:B, 3g1h:C, 3g1h:D, 3g1h:E, 3g1h:F, 3g1h:G, 3g1h:H, 3g1h:I, 3g1h:J, 3g1h:K, 3g1h:L, 3g1h:M, 3g1v:A, 3g1v:B, 3g1x:A, 3g1x:B, 3g22:A, 3g22:B, 3g24:A, 3g24:B, 4gc4:A, 4gc4:B, 1kly:A, 1klz:A, 1km0:A, 1km0:B, 1km0:C, 1km0:D, 1km1:A, 1km1:B, 1km2:A, 1km3:A, 1km4:A, 1km5:A, 1km6:A, 4lc6:A, 4lc6:B, 4lc8:A, 4lc8:B, 3lht:A, 3lht:B, 3lhu:A, 3lhu:B, 3lhv:A, 3lhv:B, 3lhv:C, 3lhv:D, 3lhw:A, 3lhw:B, 3lhy:A, 3lhy:B, 3lhz:A, 3lhz:B, 3li0:A, 3li0:B, 3li1:A, 3li1:B, 3lld:A, 3lld:B, 3llf:A, 3llf:B, 1lol:A, 1lol:B, 1loq:A, 1lor:A, 1los:A, 1los:B, 1los:C, 1los:D, 1lp6:A, 1lp6:B, 3ltp:A, 3ltp:B, 3lts:A, 3lts:B, 3lty:A, 3lty:B, 3lv5:A, 3lv5:B, 3lv6:A, 3lv6:B, 4lw7:A, 4lw7:B, 3m1z:A, 3m1z:B, 3nq6:A, 3nq6:B, 3nq7:A, 3nq7:B, 3nqa:A, 3nqa:B, 3nqc:A, 3nqc:B, 3nqd:A, 3nqd:B, 3nqe:A, 3nqe:B, 3nqf:A, 3nqf:B, 3nqg:A, 3nqg:B, 3nqm:A, 3nqm:B, 4nt0:A, 4nt0:B, 4nuw:A, 4nuw:B, 4nx5:A, 4nx5:B, 4o11:A, 4o11:B, 4o8r:A, 4o8r:B, 4o8r:C, 4o8r:D, 4o8r:E, 4o8r:F, 4o8r:G, 4o8r:H, 4o8r:I, 4o8r:J, 4o8r:K, 4o8r:L, 4o8r:M, 3p5y:A, 3p5y:B, 3p5z:A, 3p5z:B, 3p60:A, 3p60:B, 3p61:A, 3p61:B, 3pbu:A, 3pbu:B, 3pbv:A, 3pbv:B, 3pbw:A, 3pbw:B, 3pby:A, 3pby:B, 3pc0:A, 3pc0:B, 3qez:A, 3qez:B, 3qf0:A, 3qf0:B, 3qmr:A, 3qmr:B, 3qms:A, 3qms:B, 3qmt:A, 3qmt:B, 3rlu:A, 3rlu:B, 3rlv:A, 3rlv:B, 3sec:A, 3sgu:A, 3siz:A, 3siz:B, 3sj3:A, 3sj3:B, 3ssj:A, 3sw6:A, 3sy5:A, 3sy5:B, 3thq:A, 3thq:B, 3v1p:A, 3v1p:B, 3w07:A, 3wjw:A, 3wjx:A, 3wjy:A, 3wjz:A, 3wk0:A, 3wk1:A, 3wk2:A, 3wk3:A, 1x1z:A, 1x1z:B, 2zz1:A, 2zz1:B, 2zz2:A, 2zz2:B, 2zz3:A, 2zz3:B, 2zz4:A, 2zz4:B, 2zz5:A, 2zz5:B, 2zz6:A, 2zz6:B, 2zz7:A
14 4wz9:B 887 31 0.0598 0.0169 0.4839 0.18 4wz9:A
15 4muz:A 212 42 0.0757 0.0896 0.4524 0.18 4muz:B
16 4iug:A 957 68 0.0956 0.0251 0.3529 0.33
17 5uun:A 286 50 0.0677 0.0594 0.3400 0.36 5uun:B, 5uuo:B, 5uuo:A
18 3ve7:A 206 156 0.1793 0.2184 0.2885 0.42 3ve7:B
19 6gnf:B 492 77 0.0837 0.0427 0.2727 0.45
20 6gnf:A 522 77 0.0837 0.0402 0.2727 0.54 6gnf:C
21 6j18:A 272 119 0.1514 0.1397 0.3193 0.70
22 1cg0:A 431 153 0.1195 0.0696 0.1961 1.00 1cg1:A, 1cg3:A, 1cg4:A, 1ch8:A, 1cib:A, 2gcq:A, 1gim:A, 1gin:A, 1hon:A, 1hoo:A, 1juy:A, 1kjx:A, 1kkb:A, 1kkf:A, 1ksz:A, 1nht:A, 1qf4:A, 1qf5:A, 1son:A, 1soo:A
23 3ka7:A 422 55 0.0677 0.0403 0.3091 1.5
24 1l1c:A 55 37 0.0398 0.1818 0.2703 1.9 1l1c:B
25 3n6r:A 591 86 0.1036 0.0440 0.3023 2.1 3n6r:C, 3n6r:E
26 3n6r:G 646 86 0.1036 0.0402 0.3023 2.2 3n6r:I, 3n6r:K
27 2ffc:A 318 24 0.0478 0.0377 0.5000 2.3 2guu:A
28 4pak:A 304 85 0.0876 0.0724 0.2588 3.6 4p9k:A
29 6puu:A 1309 81 0.0797 0.0153 0.2469 4.8 8e6t:A, 8e6t:B, 8e6t:C, 8e6t:D, 6pur:A, 6pur:B, 6pur:C, 6pur:D, 6pus:A, 6pus:C, 6pus:D, 6pus:B, 6puu:B, 6puu:C, 6puu:D
30 8e6q:A 1348 81 0.0797 0.0148 0.2469 5.0 8e6q:B, 8e6q:C, 8e6q:D, 8e6r:A, 8e6r:B, 8e6r:C, 8e6r:D, 8e6s:A, 8e6s:B, 8e6s:C, 8e6s:D, 8e6u:A, 8e6u:B, 8e6u:C, 8e6u:D, 6mj2:A, 6mj2:B, 6mj2:C, 6mj2:D
31 8e6v:A 707 81 0.0797 0.0283 0.2469 5.3
32 8j6n:A 390 21 0.0438 0.0282 0.5238 6.1 8j6n:D, 8j6n:B, 8j6n:C, 8j6n:E, 8j6n:H, 8j6n:J, 8j6n:K, 8j6n:F, 8j6n:G, 8j6n:I, 8j6n:L
33 3cog:D 392 23 0.0478 0.0306 0.5217 6.6 3cog:A, 3cog:B, 3cog:C, 5eig:C, 5eig:D, 5eig:E, 5eig:F, 5eig:G, 6nba:A, 6nba:B, 6nba:C, 6nba:D, 2nmp:A, 2nmp:B, 2nmp:C, 2nmp:D, 5tsu:A, 5tsu:C, 5tsu:D, 5tsu:E, 5tsu:F, 5tsu:G, 5tsu:H
34 4m33:A 161 97 0.1076 0.1677 0.2784 7.6 4m32:A, 4m32:B, 4m32:C, 4m32:D, 4m33:B, 4m33:C, 4m33:D, 4m34:A, 4m34:B, 4m34:C, 4m34:D, 4m35:A, 4m35:B, 4m35:C, 4m35:D, 5ww3:A, 5ww3:B, 5ww3:C, 5ww3:D, 5ww4:A, 5ww4:B, 5ww4:C, 5ww4:D, 5ww5:A, 5ww5:C, 5ww5:B, 5ww6:A, 5ww6:B, 5ww6:C, 5ww6:D, 5ww7:A, 5ww7:C, 5ww7:B, 5ww7:D, 5ww8:A, 5ww8:B, 5ww8:C, 5ww8:D, 5ww9:A, 5ww9:B, 5ww9:C, 5ww9:D, 2z90:A, 2z90:B, 2z90:C, 2z90:D
35 6x80:A 574 85 0.1076 0.0470 0.3176 7.9 6x80:B, 6x80:C, 6x80:D, 6x80:E, 6x80:F, 6x80:G, 6x80:H, 6x80:I, 6x80:J, 6x80:K, 6x80:L, 6x80:M, 6x80:N, 6x80:O, 6x80:P, 6x80:Q, 6x80:R, 6x80:S, 6x80:T, 6x80:U, 6x80:V
36 6xwl:C 477 95 0.1036 0.0545 0.2737 9.6 6xwl:F, 6xwl:A, 6xwl:B, 6xwl:D, 6xwl:E, 6xyl:A, 6xyl:B, 6xyl:C, 6xyl:D, 6xyl:E, 6xyl:F, 6y21:D, 6y21:A, 6y21:B, 6z3s:D, 6z3s:A, 6z3s:B, 6zs7:D, 6zs7:A, 6zs7:B, 6zs7:C, 6zs7:E, 6zs7:F

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218