Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
FRIRKCPKCGRYTLKEVCPVCGEKTKVAHPPRFSPEDPYGEYRRRWKREVLGI

The query sequence (length=53) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2aus:D 53 52 0.9245 0.9245 0.9423 7.42e-31 2aus:B, 2ey4:E, 2ey4:F, 3hax:C, 3hay:C, 3hjw:B, 2hvy:C, 3lwo:B, 3lwp:B, 3lwq:B, 3lwr:B, 3lwv:B, 2rfk:B
2 2aqc:A 63 50 0.5849 0.4921 0.6200 7.42e-18 2apo:B
3 8oue:J 64 32 0.3208 0.2656 0.5312 7.45e-05 8ouf:J, 7v9a:J
4 1s0u:A 391 24 0.2642 0.0358 0.5833 1.97e-04
5 2dcu:A 407 24 0.2264 0.0295 0.5000 0.002 2d74:A, 1kjz:A, 1kk0:A, 1kk1:A, 1kk2:A, 1kk3:A
6 6knb:B 1120 23 0.2075 0.0098 0.4783 0.089 6knc:B
7 5kl1:B 70 44 0.2830 0.2143 0.3409 0.19 5kl8:B
8 8k3f:A 190 24 0.1509 0.0421 0.3333 0.23 8k3f:B, 8k3f:C, 8k3f:D
9 5zvq:A 194 25 0.1698 0.0464 0.3600 0.29 8ab0:F, 8ab0:E, 8bpr:E, 8bpr:F
10 1kb6:B 101 35 0.2264 0.1188 0.3429 0.45 1kb2:A, 1kb2:B, 1kb4:A, 1kb4:B, 1kb6:A, 1ynw:A
11 8ppt:B 1191 23 0.1887 0.0084 0.4348 0.63 8ppu:B, 8ppv:B, 6t8h:B
12 5ijl:A 943 23 0.1887 0.0106 0.4348 0.64
13 4qsz:A 686 25 0.2264 0.0175 0.4800 0.66 8j25:A, 8j2p:E, 8j2p:A, 4kyc:A, 4qsz:B, 4qu2:A, 4qu2:B
14 2ff0:A 102 29 0.2075 0.1078 0.3793 1.5 2a66:A, 5l0m:A, 8pki:K
15 4zn3:B 67 22 0.1887 0.1493 0.4545 1.6 3lpe:B, 3lpe:D, 3lpe:F, 3lpe:H, 4zn1:B
16 6lz3:A 486 14 0.1698 0.0185 0.6429 2.1 6lz3:B, 6lz3:C, 6lz3:D
17 6lz7:A 492 14 0.1698 0.0183 0.6429 2.3
18 8ab0:D 157 43 0.2453 0.0828 0.3023 2.3 8bpr:D
19 8hbm:B 73 36 0.1887 0.1370 0.2778 2.5 8hbm:F
20 1gy8:C 370 47 0.2642 0.0378 0.2979 2.8 2cnb:A, 2cnb:B, 2cnb:C, 2cnb:D, 1gy8:A, 1gy8:B, 1gy8:D
21 2r6f:A 899 29 0.1887 0.0111 0.3448 2.9
22 3uwx:A 945 29 0.1887 0.0106 0.3448 2.9
23 2han:A 78 36 0.1698 0.1154 0.2500 3.0 1r0o:A, 4umm:A
24 4v6x:CG 246 31 0.2264 0.0488 0.3871 3.1 7a01:V2, 8a3d:n, 5aj0:AG, 8b5l:G, 8b6c:G, 9bdl:AL08, 9bdn:AL08, 9bdp:AL08, 7bhp:LG, 8bhf:p3, 8bpo:G2, 8btk:BG, 7cpu:LG, 7cpv:LG, 4d5y:G, 4d67:G, 6d90:G, 6d9j:G, 9f1b:BG, 9f1c:BG, 9f1d:BG, 7f5s:LG, 8fkp:SE, 8fkq:SE, 8fkr:SE, 8fks:SE, 8fkt:SE, 8fku:SE, 8fkv:SE, 8fkw:SE, 8fkx:SE, 8fky:SE, 8fkz:SE, 8fl2:SE, 8fl3:SE, 8fl4:SE, 8fl6:SE, 8fl7:SE, 8fl9:SE, 8fla:SE, 8flb:SE, 8flc:SE, 8fld:SE, 8fle:SE, 8flf:SE, 6frk:G, 6ftg:G, 6fti:G, 6ftj:G, 8g5y:LG, 8g5z:LG, 8g60:LG, 8g61:LG, 8g6j:LG, 8glp:LG, 6gz3:AG, 6gz4:AG, 6gz5:AG, 6hcf:G3, 6hcj:G3, 6hcm:G3, 6hcq:G3, 8idt:G, 8idy:G, 8ie3:G, 8ifd:2B, 8ife:2B, 8ine:G, 8inf:G, 8ink:G, 6ip5:2B, 6ip6:2B, 6ip8:2B, 8ipd:G, 8ipx:G, 8ipy:G, 8ir1:G, 8ir3:G, 3j7o:G, 3j7p:G, 3j7q:G, 3j7r:G, 3j92:G, 3jag:G, 3jah:G, 3jai:G, 3jaj:G, 3jan:G, 8jdj:M, 8jdk:M, 8jdl:M, 8jdm:M, 8k2c:LG, 5lks:LG, 6lqm:G, 6lsr:G, 6lss:G, 7ls1:B1, 7ls2:B1, 6lu8:G, 5lzs:G, 5lzt:G, 5lzu:G, 5lzv:G, 5lzw:G, 5lzx:G, 5lzy:G, 5lzz:G, 7mdz:G, 6mtb:G, 6mtc:G, 6mtd:G, 6mte:G, 7nfx:G, 7nwg:G3, 7nwh:G, 7nwi:G, 7o7y:BG, 7o7z:BG, 7o80:BG, 7o81:BG, 7obr:G, 8ohd:LG, 8oj0:LG, 8oj5:LG, 8oj8:LG, 6ole:I, 6olf:I, 6olg:AG, 6oli:I, 6olz:AG, 6om0:I, 6om7:I, 7ow7:n, 7oya:G1, 7oyb:G1, 7oyc:G1, 7oyd:G, 8p2k:BG, 6p5i:AG, 6p5j:AG, 6p5k:AG, 6p5n:AG, 8q7z:BG, 8q87:BG, 8qfd:G, 7qgg:I, 8qoi:LG, 7qvp:MG, 7qvp:LG, 7qwq:G, 7qwr:G, 7qws:G, 6qzp:LG, 6r5q:G, 6r6g:G, 6r6p:G, 6r7q:G, 8rjb:G, 8rjc:G, 8rjd:G, 8scb:G, 6sgc:G2, 6swa:G, 5t2c:n, 6t59:G3, 7tm3:G, 7toq:AL08, 7tor:AL08, 7tut:G, 7ucj:G, 7uck:G, 4ug0:LG, 4ujc:BG, 4ujd:AG, 4uje:CG, 4v5z:Bf, 6w6l:I, 6xa1:LG, 7xnx:LG, 7xny:LG, 8xsx:LG, 8xsy:LG, 8xsz:LG, 6y0g:LG, 8y0w:LG, 8y0x:LG, 6y2l:LG, 6y57:LG, 6y6x:LG, 8yoo:LG, 8yop:LG, 6z6l:LG, 6z6m:LG, 6z6n:LG, 7zjw:LJ, 7zjx:LJ, 6zm7:LG, 6zme:LG, 6zmi:LG, 6zmo:LG, 6zvk:V2
25 8oki:B 1101 29 0.1887 0.0091 0.3448 3.6 8cro:B, 8orq:B, 8p2i:B, 8rbo:B
26 3dzu:A 289 36 0.1698 0.0311 0.2500 3.6 3e00:A, 5uan:A
27 5nfn:B 318 25 0.2264 0.0377 0.4800 3.8 5nfn:A, 5nfn:C, 5nfn:D, 5nfo:A, 5nfo:B
28 4qiw:B 1069 29 0.1887 0.0094 0.3448 4.4 4qiw:J
29 6kf3:B 1114 29 0.1887 0.0090 0.3448 4.5 9bct:B, 9bcu:B, 6kf4:B, 6kf9:B
30 2r6f:B 879 26 0.1887 0.0114 0.3846 4.8
31 8ey3:A 60 22 0.1887 0.1667 0.4545 5.0 8ey4:I
32 3alr:C 67 18 0.1698 0.1343 0.5000 5.1 3alr:A, 3alr:B, 3alr:D
33 3qqc:A 381 29 0.1887 0.0262 0.3448 5.4
34 2ebl:A 89 33 0.1887 0.1124 0.3030 5.5
35 1u3c:A 485 14 0.1698 0.0186 0.6429 5.6 1u3d:A
36 4nqa:H 319 36 0.1698 0.0282 0.2500 5.7 6a5y:D, 6a5z:D, 6a5z:L, 6a60:D, 7a77:A, 7a78:A, 7a79:A, 7a79:B, 3a9e:A, 2acl:A, 2acl:C, 2acl:E, 2acl:G, 7aos:A, 7b88:A, 7b9o:A, 7bk4:A, 7bk4:C, 1by4:A, 1by4:B, 1by4:C, 1by4:D, 7cfo:A, 7cfo:B, 7cfo:D, 7cfo:C, 4cn2:C, 4cn2:D, 4cn3:A, 4cn3:D, 4cn3:B, 4cn3:C, 4cn5:A, 4cn5:B, 4cn7:A, 4cn7:B, 4cn7:E, 4cn7:F, 1dsz:B, 3dzy:A, 3e94:A, 5ec9:A, 3fal:A, 3fal:C, 1fby:A, 1fby:B, 6fbq:A, 6fbq:B, 6fbr:A, 6fbr:B, 3fc6:A, 3fc6:C, 1fm6:A, 1fm6:U, 1fm9:A, 3fug:A, 1g5y:B, 1g5y:C, 3h0a:A, 1h9u:A, 1h9u:B, 1h9u:C, 1h9u:D, 8hbm:A, 8hbm:E, 6hn6:A, 8j54:C, 8j54:D, 8j54:E, 8j54:F, 5ji0:A, 6jno:A, 6jno:D, 6jnr:A, 6jnr:B, 4k4j:A, 4k6i:A, 1k74:A, 3kwy:A, 6l6k:A, 6lb4:A, 6lb5:A, 6lb5:C, 6lb6:A, 5lyq:A, 4m8e:A, 4m8h:A, 5mj5:A, 5mk4:A, 5mk4:C, 5mkj:A, 5mku:A, 5mmw:A, 1mv9:A, 1mvc:A, 1mzn:A, 1mzn:C, 1mzn:E, 1mzn:G, 4n5g:A, 4n5g:D, 4n8r:A, 4n8r:D, 7nke:A, 7nke:C, 2nll:A, 4nqa:A, 3nsq:B, 3oap:A, 4oc7:A, 3ozj:A, 3ozj:C, 2p1t:A, 2p1u:A, 2p1v:A, 3pcu:A, 7pdq:A, 7pdt:A, 7pdt:B, 4poh:A, 4poj:A, 4pp3:A, 4pp5:A, 8pp0:A, 1r0n:A, 3r29:A, 3r29:B, 3r2a:B, 3r2a:D, 3r2a:A, 3r2a:C, 3r5m:A, 3r5m:C, 1rdt:A, 4rfw:A, 4rmc:A, 4rmd:A, 4rme:A, 1rxr:A, 6sjm:A, 6sti:A, 5tbp:A, 5tbp:C, 5tbp:B, 5tbp:D, 1uhl:A, 3uvv:B, 7uw2:A, 7uw4:A, 1xdk:A, 1xdk:E, 1xls:A, 1xls:B, 1xls:C, 1xls:D, 1xv9:A, 1xv9:C, 1xvp:A, 1xvp:C, 6xwg:C, 6xwh:C, 6xwh:D, 1ynw:B, 5z12:C, 5z12:B, 5zqu:A, 5zqu:C, 5zqu:B, 5zqu:D, 4zsh:A, 2zxz:A, 2zy0:A, 2zy0:C
37 3f8k:A 131 32 0.2264 0.0916 0.3750 6.1
38 6ql9:D 1765 20 0.1509 0.0045 0.4000 6.4 3hmj:A, 3hmj:B, 3hmj:C, 8prv:A, 8prv:B, 8prw:A, 8prw:B, 8prw:C, 8prw:D, 8prw:E, 8prw:F, 8ps1:A, 6ql6:F, 6ql6:E, 6ql6:D, 6ql6:C, 6ql6:B, 6ql6:A, 6ql9:F, 6ql9:A, 6ql9:E, 6ql9:B, 6ql9:C, 6ta1:A, 6ta1:B, 6ta1:D, 6ta1:K, 6ta1:F, 6ta1:I, 6u5u:A, 2vkz:A, 2vkz:B, 2vkz:C, 2wat:A, 2wat:B, 2wat:C, 2wat:D, 2wat:E, 2wat:F
39 2nll:B 103 35 0.2075 0.1068 0.3143 6.6 3m9e:A, 3m9e:B, 3m9e:E, 3m9e:F
40 3pih:A 836 24 0.2075 0.0132 0.4583 6.6
41 8t45:A 460 18 0.1132 0.0130 0.3333 6.7 8t3r:A, 8t3u:A, 8t3u:B, 8t44:A, 8t45:B
42 4yzf:A 475 18 0.1132 0.0126 0.3333 6.7 4yzf:B, 4yzf:C, 4yzf:D
43 8cs9:g 832 18 0.1132 0.0072 0.3333 6.8 8cs9:V, 8cs9:e, 8cs9:Y, 8cs9:f, 8cs9:Z, 8cte:P, 8cte:T, 7v0k:O, 7v0k:P
44 7tvz:A 850 18 0.1132 0.0071 0.3333 6.8 8crq:C, 8crq:E, 8crr:C, 8crr:E, 8crt:C, 8crt:E, 8ct3:C, 8ct3:E, 8t3r:B, 8t44:B, 8t47:B, 8t47:A, 8t6u:A, 8t6u:B, 8t6v:A, 8t6v:B, 7tvz:B, 7ty4:A, 7ty4:B, 7ty6:A, 7ty6:B, 7ty7:A, 7ty7:B, 7ty8:A, 7ty8:B, 7tya:A, 7tya:B, 7uz3:C, 7uz3:E, 7v07:C, 7v07:E, 7v19:C, 7v19:E
45 4o6o:D 199 49 0.2453 0.0653 0.2653 7.8 4o6o:A, 4o6o:B, 4o6o:C, 4o6p:B, 4o6p:C, 3vdp:A, 3vdp:B, 3vdp:C, 3vdp:D, 3vdu:A, 3ve5:D, 3ve5:A
46 2han:B 87 37 0.1887 0.1149 0.2703 7.9 1r0n:B, 1r0o:B, 4umm:E
47 9bct:I 65 21 0.1698 0.1385 0.4286 9.4

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218