BioLiP

>protein
FRIAQDVVARENDRRASALKEDYEALGANLARRGVDIEAVTAKVEKFFVAVPSWGVGTGGTRFARFPGTGEPRGIFDKLD
DCAVIQQLTRATPNVSLNIPWDKADPKELKARGDALGLGFDAMNSNTFSDAPGQAHSYKYGSLSHTNAATRAQAVEHNLE
CIEIGKAIGSKALTVWIGDGSNFPGQSNFTRAFERYLSAMAEIYKGLPDDWKLFSEHKMYEPAFYSTVVQDWGTNYLIAQ
TLGPKAQCLVDLGHHAPNTNIEMIVARLIQFGKLGGFHFNDSKYGDDDLDAGAIEPYRLFLVFNELVDAEARGVKGFHPA
HMIDQSHNVTDPIESLINSANEIRRAYAQALLVDRAALSGYQEDNDALMATETLKRAYRTDVEPILAEARRRTGGAVDPV
ATYRASGYRARVAAERPASVA

The query sequence (length=421) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3m0v:C	433	421	0.9952	0.9677	0.9952	0.0	4gji:A, 4gji:B, 4gji:C, 4gji:D, 4gjj:A, 4gjj:B, 4gjj:C, 4gjj:D, 2hcv:A, 2hcv:B, 2hcv:C, 2hcv:D, 2i56:A, 2i56:B, 2i56:C, 2i56:D, 2i57:A, 2i57:B, 2i57:C, 2i57:D, 3itl:A, 3itl:B, 3itl:C, 3itl:D, 3ito:A, 3ito:B, 3ito:C, 3ito:D, 3itt:A, 3itt:B, 3itt:C, 3itt:D, 3itv:A, 3itv:B, 3itv:C, 3itv:D, 3itx:A, 3itx:B, 3itx:C, 3itx:D, 3iud:A, 3iud:B, 3iud:C, 3iud:D, 3iuh:A, 3iuh:B, 3iuh:C, 3iuh:D, 3iui:A, 3iui:B, 3iui:C, 3iui:D, 3m0h:A, 3m0h:B, 3m0h:C, 3m0h:D, 3m0l:A, 3m0l:B, 3m0l:C, 3m0l:D, 3m0m:A, 3m0m:B, 3m0m:C, 3m0m:D, 3m0v:A, 3m0v:B, 3m0v:D, 3m0x:A, 3m0x:B, 3m0x:C, 3m0x:D, 3m0y:A, 3m0y:B, 3m0y:C, 3m0y:D
2	3uva:C	405	265	0.1449	0.1506	0.2302	0.027	3uu0:A, 3uu0:B, 3uu0:C, 3uu0:D, 3uva:A, 3uva:B, 3uva:D, 3uxi:A
3	1xim:A	392	88	0.0499	0.0536	0.2386	0.049	1xim:B, 1xim:C, 1xim:D, 1xin:A, 1xin:B, 1xin:C, 1xin:D, 2xim:A, 2xim:B, 2xim:C, 2xim:D, 2xin:A, 2xin:B, 2xin:C, 2xin:D, 3xim:A, 3xim:B, 3xim:C, 3xim:D, 4xim:A, 4xim:B, 4xim:C, 4xim:D, 5xim:A, 5xim:B, 5xim:C, 5xim:D, 5xin:A, 5xin:B, 5xin:C, 5xin:D, 6xim:A, 6xim:B, 6xim:C, 6xim:D, 8xim:A, 8xim:B, 8xim:C, 8xim:D, 9xim:A, 9xim:B, 9xim:C, 9xim:D
4	7v3n:A	317	86	0.0665	0.0883	0.3256	1.3	8hiv:A, 7v2t:A, 7v2u:A, 7v2x:A, 7v34:A, 7v36:A, 7v3e:A, 7v3e:B, 7v3e:C, 7v3o:A
5	8s9u:D	518	69	0.0499	0.0405	0.3043	1.3	8s9t:D, 8s9v:D, 8s9x:D
6	6d3r:A	1127	37	0.0356	0.0133	0.4054	3.1	6d3s:A
7	7loz:B	390	53	0.0333	0.0359	0.2642	4.1	7ll3:A, 7ll3:B, 7lnn:A, 7lnn:B, 7lo2:A, 7lo2:B, 7lo2:C, 7lo2:D, 7loo:A, 7loo:Q, 7loo:B, 7loo:R, 7low:A, 7low:B, 7loz:A, 1mxa:A, 1mxb:A, 1mxc:A, 1p7l:A, 1p7l:B, 1p7l:C, 1p7l:D, 7r2w:A, 1rg9:A, 1rg9:B, 1rg9:C, 1rg9:D, 1xra:A
8	7mfp:B	354	45	0.0380	0.0452	0.3556	6.5	7mfo:A, 7mfo:B, 7mfo:C, 7mfo:D, 7mfo:E, 7mfo:F, 7mfo:G, 7mfo:H, 7mfo:I, 7mfo:J, 7mfp:A, 7mfp:C, 7mfp:D, 7mfq:A, 7mfq:B, 7mfq:C, 7mfq:D
9	4xyd:B	145	50	0.0356	0.1034	0.3000	6.5
10	1f3t:B	381	78	0.0594	0.0656	0.3205	6.9	1f3t:A, 1f3t:C, 1f3t:D, 1njj:A, 1njj:B, 1njj:C, 1njj:D, 1qu4:A, 1qu4:B, 1qu4:C, 1qu4:D, 1szr:C, 1szr:D, 1szr:A, 1szr:B, 2tod:A, 2tod:B, 2tod:C, 2tod:D
11	6yxx:EN	638	82	0.0428	0.0282	0.2195	7.7	6yxy:EN

[Back]