Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
FPQRYIELAIVVDHGMYKKYNQNSDKIKVRVHQMVNHINEMYRPLNIAISLNRLQIWSKKDLITVKSASNVTLESFGNWR
ETVLLKQQNNDCAHLLTATNLNDNTIGLAYKKGMCNPKLSVGLVQDYSPNVFMVAVTMTHELGHNLGMEHDDKDKCKCEA
CIMSDVISDKPSKLFSDCSKNDYQTFLTKYNPQCILNA

The query sequence (length=198) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1wni:A 198 198 1.0000 1.0000 1.0000 2.39e-150
2 4j4m:B 200 198 0.7071 0.7000 0.7071 2.39e-106 4j4m:A
3 1kuf:A 201 198 0.7071 0.6965 0.7071 8.74e-100 1kug:A, 1kui:A, 1kuk:A
4 1qua:A 197 196 0.5707 0.5736 0.5765 4.05e-80
5 1nd1:A 202 198 0.5354 0.5248 0.5354 1.68e-74 2w12:A, 2w13:A, 2w14:A, 2w15:A
6 3gbo:A 200 199 0.5505 0.5450 0.5477 2.26e-74
7 2aig:P 201 198 0.5455 0.5373 0.5455 6.19e-73 3aig:A, 4aig:A, 1iag:A
8 6x5x:A 200 197 0.5404 0.5350 0.5431 1.30e-72
9 4q1l:A 202 199 0.5455 0.5347 0.5427 4.10e-72
10 1dth:A 202 198 0.5253 0.5149 0.5253 2.81e-70 1atl:A, 1atl:B, 1dth:B, 1htd:A, 1htd:B
11 1bsw:A 197 196 0.5152 0.5178 0.5204 3.52e-67 1bud:A
12 1yp1:A 199 197 0.4444 0.4422 0.4467 1.84e-61
13 3dsl:A 416 198 0.5152 0.2452 0.5152 2.46e-59 3dsl:B
14 3k7n:A 396 197 0.4798 0.2399 0.4822 2.22e-58
15 2dw1:A 415 198 0.4949 0.2361 0.4949 4.88e-58 2dw0:A, 2dw0:B, 2dw1:B, 2dw2:B, 2dw2:A
16 2e3x:A 416 199 0.4646 0.2212 0.4623 4.29e-56
17 2ero:A 426 196 0.4545 0.2113 0.4592 2.56e-55 2ero:B, 2erp:A, 2erp:B, 2erq:A, 2erq:B
18 3hdb:A 417 198 0.4495 0.2134 0.4495 2.36e-54
19 9clp:A 420 199 0.4545 0.2143 0.4523 3.88e-53
20 3k7l:A 409 195 0.4394 0.2127 0.4462 7.08e-50
21 1r54:A 206 202 0.3485 0.3350 0.3416 1.42e-40 1r55:A
22 4dd8:D 208 202 0.3485 0.3317 0.3416 3.40e-38 4dd8:A, 4dd8:B, 4dd8:C
23 5y2z:G 462 203 0.2980 0.1277 0.2906 8.16e-19
24 3g5c:A 486 203 0.2980 0.1214 0.2906 9.01e-19 3g5c:B, 8hpy:A, 8hpy:B, 8hq0:A, 8hq0:B, 8hq0:C, 8hq1:A, 8hq1:B, 8hq1:C, 8hq2:A, 8hq2:B, 5y2z:A, 5y2z:C, 5y2z:E, 5y2z:I, 5y2z:K, 5y31:A, 5y31:C, 8y6b:A, 8y6b:B, 8y6b:C
25 2rjq:A 292 211 0.2576 0.1747 0.2417 3.43e-10 3b8z:A, 3b8z:B, 3hy7:A, 3hy7:B, 3hy9:A, 3hy9:B, 3hyg:A, 3hyg:B, 3ljt:A, 6yjm:A, 6yjm:B
26 2jih:B 286 217 0.2778 0.1923 0.2535 1.56e-09 2jih:A, 3q2g:A, 3q2g:B, 3q2h:A, 3q2h:B, 2v4b:A, 2v4b:B
27 6qig:A 581 212 0.2222 0.0757 0.2075 4.58e-08 3ghm:A, 3ghn:A, 3vn4:A
28 3b2z:F 293 214 0.2576 0.1741 0.2383 1.96e-07 3b2z:A, 3b2z:B, 3b2z:C, 3b2z:D, 3b2z:E, 3b2z:G, 3b2z:H, 2rjp:A, 2rjp:B, 2rjp:C, 2rjp:D, 4wk7:A, 4wke:A, 4wki:A
29 8esv:A 446 183 0.2374 0.1054 0.2568 2.73e-06 6bdz:A, 6be6:B, 6be6:A, 6be6:C, 6be6:D
30 8snl:A 656 240 0.2727 0.0823 0.2250 5.28e-05 2a8h:A, 2a8h:B, 3b92:A, 1bkc:A, 1bkc:C, 1bkc:E, 1bkc:I, 3cki:A, 2ddf:A, 2ddf:B, 3e8r:A, 3e8r:B, 3edz:A, 3edz:B, 3ewj:A, 3ewj:B, 2fv5:A, 2fv5:B, 2fv9:A, 2fv9:B, 3g42:A, 3g42:B, 3g42:C, 3g42:D, 2i47:A, 2i47:B, 2i47:C, 2i47:D, 3kmc:A, 3kmc:B, 3kme:A, 3kme:B, 3l0t:A, 3l0t:B, 3l0v:A, 3l0v:B, 3le9:A, 3le9:B, 3lea:A, 3lea:B, 3lgp:A, 3lgp:B, 3o64:A, 3o64:B, 2oi0:A, 8snm:B, 8snn:A, 8sno:A, 1zxc:A, 1zxc:B
31 2x7m:A 180 74 0.1061 0.1167 0.2838 0.017
32 4l63:A 249 150 0.1566 0.1245 0.2067 0.49 4l6t:A
33 1bqq:M 174 21 0.0657 0.0747 0.6190 0.56 1buv:M, 5h0u:A, 3ma2:D, 3ma2:A
34 8h3x:C 357 28 0.0707 0.0392 0.5000 0.80 8h3y:A, 8h3y:B, 8h3y:C, 3p24:A, 3p24:B, 3p24:C, 3p24:D, 7pnd:A, 7pnd:B, 7pol:A, 7poo:A, 7poo:B, 7poq:A, 7poq:B, 7pou:A, 7pou:B, 8wem:C, 8wem:A, 8weo:B, 8weo:A
35 1rm8:A 169 21 0.0657 0.0769 0.6190 0.97
36 6kmw:aL 144 92 0.0960 0.1319 0.2065 1.3 6kmw:cL, 6kmw:bL
37 7mq8:SG 389 34 0.0606 0.0308 0.3529 1.5 7mq9:SG, 7mqa:SG
38 1akl:A 470 65 0.0859 0.0362 0.2615 1.9 1jiw:P, 1kap:P, 3vi1:A, 3vi1:B
39 1t3n:A 388 60 0.0909 0.0464 0.3000 2.0 2alz:A, 2dpi:A, 2dpj:A, 4ebc:A, 4ebd:A, 4ebe:A, 3epg:A, 3epi:A, 4eyh:B, 4eyi:B, 2fll:A, 2fln:A, 2flp:A, 4fs1:A, 4fs2:A, 3g6v:A, 3g6x:A, 3g6y:A, 3gv5:B, 3gv5:D, 3gv7:B, 3gv8:B, 3h40:A, 3h4b:A, 3h4d:A, 5kt2:A, 5kt3:A, 5kt4:A, 5kt5:A, 5kt6:A, 5kt7:A, 3ngd:A, 3osn:A, 3q8p:B, 3q8q:B, 3q8r:B, 3q8s:B, 1t3n:B, 5ulw:A, 5ulx:A, 1zet:A
40 8sgt:A 687 66 0.1061 0.0306 0.3182 2.1
41 3hda:P 382 32 0.0556 0.0288 0.3438 2.1 3hbv:P
42 7koe:B 336 117 0.1465 0.0863 0.2479 2.2 7koe:F
43 1go7:P 462 43 0.0707 0.0303 0.3256 2.4 1go8:P, 3hb2:P, 3hbu:P, 1k7g:A, 1k7i:A, 1k7q:A
44 8k5v:B 232 31 0.0758 0.0647 0.4839 2.6 5cuh:A, 5cuh:B, 6esm:A, 1gkc:A, 1gkc:B, 1gkd:A, 1gkd:B, 4h1q:A, 4h1q:B, 4h2e:A, 4h2e:B, 4h3x:A, 4h3x:B, 4h82:A, 4h82:B, 4h82:C, 4h82:D, 4hma:A, 4hma:B, 5i12:A, 4jij:A, 4jij:B, 4jqg:A, 4jqg:B, 8k5v:A, 8k5w:A, 8k5w:B, 8k5x:A, 8k5x:B, 8k5y:A, 8k5y:B, 2ovx:A, 2ovx:B, 2ovz:A, 2ovz:B, 2ow0:A, 2ow0:B, 2ow1:A, 2ow1:B, 2ow2:A, 2ow2:B, 5th6:A, 5th6:B, 5th6:C, 5th6:D, 5th9:A, 5th9:B, 5th9:C, 5ue3:A, 5ue3:B, 5ue4:A, 5ue4:B, 4wzv:A, 4wzv:B, 4xct:A
45 6ixx:A 463 14 0.0455 0.0194 0.6429 3.1 1g9k:A, 1h71:P, 1o0q:A, 1o0t:A, 1om6:A, 1om7:A, 1om8:A, 1omj:A, 3u1r:A
46 3ba0:A 365 27 0.0606 0.0329 0.4444 3.2 8b2n:A, 8b2n:C, 5cxa:A, 5czm:A, 5d2b:A, 5d3c:A, 4efs:A, 3ehx:A, 3ehy:A, 6ekn:A, 6ela:A, 6ela:B, 6ela:C, 6ela:D, 6enm:A, 6enm:B, 6eox:A, 3f15:A, 3f16:A, 3f17:A, 3f18:A, 3f19:A, 3f1a:A, 4gql:A, 4gr0:A, 4gr3:A, 4gr8:A, 4guy:A, 4h30:A, 4h30:B, 4h49:A, 4h49:B, 4h49:C, 4h49:D, 4h76:A, 4h84:A, 4h84:B, 2hu6:A, 4i03:A, 5i0l:A, 5i0l:B, 5i2z:A, 5i2z:B, 5i2z:C, 5i2z:D, 5i3m:A, 5i3m:B, 5i3m:C, 5i3m:D, 5i43:A, 5i43:B, 5i43:C, 5i43:D, 5i4o:A, 5i4o:C, 5i4o:B, 5i4o:D, 4ijo:A, 1jiz:A, 1jiz:B, 1jk3:A, 2jxy:A, 2k2g:A, 2k9c:A, 2krj:A, 5l79:A, 5l7f:A, 5l7f:B, 5lab:A, 3lik:A, 3lil:A, 3lir:A, 3ljg:A, 3lk8:A, 3lka:A, 2mlr:A, 2mls:A, 3n2u:A, 3n2v:A, 5n5j:A, 5n5k:A, 2n8r:A, 3nx7:A, 1os2:A, 1os2:B, 1os2:C, 1os2:D, 1os2:E, 1os2:F, 1os9:A, 1os9:B, 1os9:C, 1os9:D, 1os9:E, 1os9:F, 7ovy:A, 2oxu:A, 2oxw:A, 2oxz:A, 2poj:A, 6rd0:A, 8rij:A, 6rly:A, 1rmz:A, 1ros:A, 1ros:B, 3rts:A, 3rtt:A, 3ts4:A, 3tsk:A, 1utt:A, 1utz:A, 1utz:B, 3uvc:A, 3uvc:B, 2w0d:A, 2w0d:B, 2w0d:C, 2w0d:D, 2wo8:A, 2wo8:B, 2wo8:C, 2wo8:D, 2wo9:A, 2wo9:B, 2wo9:C, 2wo9:D, 2woa:A, 2woa:B, 2woa:C, 2woa:D, 1y93:A, 1ycm:A, 2z2d:A, 1z3j:A
47 1l6j:A 405 29 0.0606 0.0296 0.4138 3.8
48 1af0:A 470 40 0.0657 0.0277 0.3250 4.1 5d7w:A, 4i35:A, 1sat:A, 1smp:A, 1srp:A
49 3lmc:A 191 76 0.1162 0.1204 0.3026 4.1
50 7z8e:A 590 44 0.0606 0.0203 0.2727 4.4
51 1bzs:A 165 21 0.0556 0.0667 0.5238 4.5 1a85:A, 1a86:A, 3dng:A, 3dng:B, 3dpe:A, 3dpf:A, 3dpf:B, 5h8x:A, 1i73:A, 1i76:A, 1jan:A, 1jao:A, 1jap:A, 1jaq:A, 1jh1:A, 1jj9:A, 1kbc:A, 1kbc:B, 1mmb:A, 1mnc:A, 2oy2:A, 2oy2:F, 2oy4:A, 2oy4:F, 4qkz:A, 3tt4:A, 1zp5:A, 1zs0:A, 1zvx:A
52 1q3a:B 160 21 0.0606 0.0750 0.5714 4.5 4ilw:D, 4ilw:F, 1q3a:A, 1q3a:C, 3v96:B
53 1jn9:A 158 50 0.0808 0.1013 0.3200 5.0 8c0i:AAA
54 8cdb:A 306 43 0.0758 0.0490 0.3488 5.5 8cd8:A, 8cd8:C, 8cdb:B, 8cdb:C, 8cdb:D, 8cdb:E, 8cdb:F, 8cdb:G, 8cdb:H, 8cdb:I, 8cdb:J, 8cdb:K, 8cdb:L, 8cdb:M, 8cdb:N, 2cki:A, 2cki:B, 2j83:A, 2j83:B, 3lum:A, 3lum:B, 3lum:C, 3lum:D, 3lun:A, 3lun:B
55 6o38:A 573 14 0.0455 0.0157 0.6429 6.2 6o38:B, 6o38:C, 6o38:D, 6o38:E, 6o38:F
56 4on1:A 334 19 0.0505 0.0299 0.5263 7.2 4on1:B
57 5gwd:A 239 72 0.1111 0.0921 0.3056 7.4 5czw:A, 5gwd:B, 5zjk:A, 5zjk:B, 5zjk:C, 5zjk:D, 5zjk:E, 5zjk:F, 5zjk:G, 5zjk:H, 5zjk:I, 5zjk:J, 5zjk:K, 5zjk:L, 5zjk:M, 5zjk:N, 5zjk:O, 5zjk:P, 5zjk:Q, 5zjk:R
58 7pol:B 336 28 0.0657 0.0387 0.4643 8.0 8wen:C, 8wen:A
59 1slm:A 226 21 0.0556 0.0487 0.5238 9.6 1b3d:A, 1b3d:B, 1b8y:A, 1biw:A, 1biw:B, 1bm6:A, 1bqo:A, 1bqo:B, 1c3i:A, 1c3i:B, 1c8t:A, 1c8t:B, 1caq:A, 1ciz:A, 1cqr:A, 1cqr:B, 2d1o:A, 2d1o:B, 1d5j:A, 1d5j:B, 1d7x:A, 1d7x:B, 1d8f:A, 1d8f:B, 1d8m:A, 1d8m:B, 4dpe:A, 4dpe:B, 1g05:A, 1g05:B, 1g49:A, 1g49:B, 1g4k:A, 1g4k:B, 1g4k:C, 4g9l:A, 4g9l:B, 1hfs:A, 1hy7:A, 1hy7:B, 4ja1:A, 4ja1:B, 2jnp:A, 2jt5:A, 2jt6:A, 6mav:A, 6n9d:A, 3ohl:A, 3oho:A, 1qia:A, 1qia:B, 1qia:C, 1qia:D, 1qic:A, 1qic:B, 1qic:C, 1qic:D, 7s7l:A, 7s7m:A, 1sln:A, 2srt:A, 1uea:A, 1uea:C, 1ums:A, 1umt:A, 1usn:A, 2usn:A, 3usn:A
60 2zuy:A 604 26 0.0455 0.0149 0.3462 9.9

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218