Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
FLGEEDIPREPRRIVIHRGSTGLGFNIIGGEDGEGIFISFILAGGPADLSGELRKGDQILSVNGVDLRNASHEQAAIALK
NAGQTVTIIAQYKPEEYSRFEANSRVNSSGRIVTN

The query sequence (length=115) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5heb:A 119 115 0.9739 0.9412 0.9739 3.45e-78 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
2 3jxt:A 96 97 0.6783 0.8125 0.8041 1.05e-54 3jxt:B
3 2i0i:A 81 81 0.6087 0.8642 0.8642 1.20e-39 2i0i:B, 2i0i:C
4 7p73:A 420 86 0.3391 0.0929 0.4535 1.27e-16 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
5 8cn1:H 101 96 0.3565 0.4059 0.4271 7.01e-16 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
6 5wou:A 95 89 0.3130 0.3789 0.4045 2.53e-14
7 2ka9:A 189 92 0.3478 0.2116 0.4348 2.68e-13 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
8 2ka9:A 189 77 0.2696 0.1640 0.4026 1.06e-09 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
9 2pdz:A 86 83 0.3130 0.4186 0.4337 2.67e-12
10 7p70:A 407 90 0.3391 0.0958 0.4333 2.88e-12 7pc4:A, 7qql:A
11 8bq8:C 93 87 0.2957 0.3656 0.3908 5.19e-12 8bq8:A, 8bq8:B
12 8b82:A 108 89 0.3304 0.3519 0.4270 5.43e-12 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
13 6xa7:B 96 82 0.2783 0.3333 0.3902 1.44e-11 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
14 7pc3:A 405 95 0.2957 0.0840 0.3579 1.78e-11 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
15 2m0z:A 97 73 0.2348 0.2784 0.3699 1.90e-11 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
16 2r4h:C 98 79 0.2348 0.2755 0.3418 7.23e-11
17 8c1t:A 90 81 0.2609 0.3333 0.3704 1.42e-10 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
18 2qt5:A 194 84 0.2435 0.1443 0.3333 1.45e-10 2qt5:B
19 2qt5:A 194 80 0.2348 0.1392 0.3375 1.01e-05 2qt5:B
20 4e34:A 87 75 0.3043 0.4023 0.4667 2.07e-10 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
21 5zys:A 90 72 0.2435 0.3111 0.3889 3.09e-10
22 3tsz:A 341 89 0.3130 0.1056 0.4045 3.33e-10 3shw:A
23 2exg:A 101 85 0.2609 0.2970 0.3529 4.00e-10 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
24 4wyu:A 201 90 0.2957 0.1692 0.3778 1.30e-09 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
25 4wyu:A 201 77 0.2435 0.1393 0.3636 6.43e-05 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
26 8bv7:A 95 58 0.2087 0.2526 0.4138 2.10e-09 8buw:A, 8buw:B
27 7qqn:C 414 83 0.2696 0.0749 0.3735 1.27e-08 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
28 1ihj:B 95 68 0.2609 0.3158 0.4412 1.74e-08 1ihj:A
29 6ezi:A 86 82 0.2261 0.3023 0.3171 2.13e-08 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
30 3vqg:A 85 68 0.2174 0.2941 0.3676 2.30e-08
31 2l4t:A 124 102 0.2957 0.2742 0.3333 3.32e-08 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
32 7x2e:A 163 76 0.2957 0.2086 0.4474 4.01e-08 2kbs:A
33 2m0v:A 128 88 0.2348 0.2109 0.3068 1.26e-07
34 8bp4:A 93 73 0.2435 0.3011 0.3836 1.33e-07 8bp4:C, 8bp4:B
35 7d6f:A 87 78 0.2609 0.3448 0.3846 1.33e-07
36 7qqm:A 413 79 0.2609 0.0726 0.3797 1.55e-07
37 7qct:A 90 78 0.2174 0.2778 0.3205 2.31e-07 7qct:B
38 2m0u:A 117 79 0.2000 0.1966 0.2911 3.15e-07
39 6x23:A 89 75 0.2087 0.2697 0.3200 3.29e-07
40 5ez0:D 95 64 0.1913 0.2316 0.3438 8.78e-07 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
41 7pcb:A 415 112 0.3217 0.0892 0.3304 1.29e-06 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
42 2koh:A 111 72 0.2261 0.2342 0.3611 2.46e-06 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
43 1n7t:A 103 76 0.2522 0.2816 0.3816 5.38e-06 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
44 8blu:B 195 65 0.2174 0.1282 0.3846 5.50e-06 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
45 3ch8:A 190 76 0.2522 0.1526 0.3816 7.05e-06 2qbw:A
46 2kpl:A 129 74 0.2261 0.2016 0.3514 1.23e-05
47 5n7d:A 423 72 0.2261 0.0615 0.3611 2.00e-05 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
48 1n7f:A 86 67 0.2174 0.2907 0.3731 2.20e-05 1n7f:B
49 4xh7:A 110 54 0.1739 0.1818 0.3704 4.31e-05
50 1zub:A 109 57 0.1826 0.1927 0.3684 4.56e-05
51 6hks:B 94 65 0.1913 0.2340 0.3385 5.83e-05 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
52 6gbe:A 119 83 0.2174 0.2101 0.3012 1.31e-04
53 2kaw:A 90 75 0.2087 0.2667 0.3200 2.38e-04 6lcb:A, 2mx6:A
54 1u38:A 89 32 0.1391 0.1798 0.5000 2.54e-04
55 7pc5:A 405 101 0.2174 0.0617 0.2475 3.01e-04
56 1l6o:A 95 62 0.1913 0.2316 0.3548 3.17e-04 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
57 7weg:B 96 74 0.1913 0.2292 0.2973 3.33e-04 7weg:A
58 4wsi:A 372 65 0.1826 0.0565 0.3231 4.59e-04 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
59 4xhv:A 94 73 0.2174 0.2660 0.3425 5.54e-04
60 3pv3:A 392 61 0.1826 0.0536 0.3443 6.69e-04 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
61 6q0m:B 94 76 0.2348 0.2872 0.3553 8.41e-04
62 1rzx:A 98 92 0.2261 0.2653 0.2826 0.001 5i7z:A, 1x8s:A
63 1b8q:A 127 78 0.2174 0.1969 0.3205 0.002
64 6kz1:A 97 72 0.2174 0.2577 0.3472 0.002 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
65 6zbq:A 89 58 0.1739 0.2247 0.3448 0.002 6zc4:A
66 4ynn:A 400 90 0.2435 0.0700 0.3111 0.002 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
67 5f67:A 98 80 0.2609 0.3061 0.3750 0.002 5f67:B
68 2ejy:A 85 49 0.1478 0.2000 0.3469 0.004
69 2kqf:A 96 83 0.2174 0.2604 0.3012 0.015 2kyl:A
70 4ydp:A 83 69 0.1826 0.2530 0.3043 0.018 4ydp:B
71 2os6:A 89 83 0.1826 0.2360 0.2530 0.036
72 6nid:B 88 59 0.1478 0.1932 0.2881 0.059 6nid:A, 6nid:C
73 5oak:A 90 52 0.1478 0.1889 0.3269 0.075 5oak:C
74 2egn:A 83 56 0.1478 0.2048 0.3036 0.076
75 6ar4:B 87 80 0.1826 0.2414 0.2625 0.12 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
76 6yx0:B 112 100 0.2174 0.2232 0.2500 0.15 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
77 3bpu:A 86 84 0.2174 0.2907 0.2976 0.18
78 7w6z:A 414 96 0.2522 0.0700 0.3021 0.62 7w6y:A
79 8dr5:A 646 78 0.1913 0.0341 0.2821 1.1 8dqx:A, 8dqz:A, 8dr0:A, 8dr1:A, 8dr3:A, 8dr4:A, 8dr6:A, 8dr7:A, 1sxj:A, 7tfh:A, 7tfi:A, 7tfj:A, 7thj:A, 7thv:A, 7ti8:A, 7tib:A, 7tic:A, 7tid:A, 7tku:A, 7u19:A, 7u1a:A, 7u1p:A
80 6bxg:A 98 26 0.1130 0.1327 0.5000 1.4
81 4c2c:A 433 65 0.1652 0.0439 0.2923 2.1 4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
82 5hj1:A 97 36 0.1217 0.1443 0.3889 3.4
83 3oul:A 222 58 0.1565 0.0811 0.3103 4.7 3oum:A, 3pkw:A, 3pkx:A
84 1f0p:A 284 23 0.0870 0.0352 0.4348 6.7
85 4iz9:A 381 62 0.1652 0.0499 0.3065 7.6
86 3cyy:B 81 56 0.1217 0.1728 0.2500 7.7 3cyy:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218