Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
FKGNKVVLIGNGAVGSSYAFSLVNQSIVDELVIIDLDTEKVRGDVMDLKHATPYSPTTVRVKAGEYSDCHDADLVVICAG
ARQKPGETRLDLVSKNLKIFKSIVGEVMASKFDGIFLVATNPVDILAYATWKFSGLPKERVIGSGTILDSARFRLLLSEA
FDVAPRSVDAQIIGEHGDTELPVWSHANIAGQPLKTLLEQRPEGKAQIEQIFVQTRDAAYDIIQAKGATYYGVAMGLARI
TEAIFRNEDAVLTVSALLEGEYEEEDVYIGVPAVINRNGIRNVVEIPLNDEEQSKFAHSAKTLKDIMAEAEEL

The query sequence (length=313) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3h3j:B 314 313 1.0000 0.9968 1.0000 0.0 3d4p:A, 3d4p:B, 3h3j:A
2 1ldn:A 316 309 0.6486 0.6424 0.6570 1.25e-148 1ldn:C, 1ldn:B, 1ldn:D, 1ldn:E, 1ldn:F, 1ldn:H, 1ldn:G, 2ldb:A, 2ldb:B, 2ldb:C, 2ldb:D
3 3pqd:B 312 305 0.6390 0.6410 0.6557 5.99e-148 3pqd:A, 3pqd:C, 3pqd:D, 3pqd:F, 3pqd:H, 3pqd:E, 3pqd:G, 3pqf:C, 3pqf:D
4 4ln1:B 321 306 0.5879 0.5732 0.6013 3.97e-139 4ln1:A, 4ln1:C, 4ln1:D
5 1ldb:A 294 308 0.6102 0.6497 0.6201 6.70e-132
6 1llc:A 320 307 0.5463 0.5344 0.5570 2.13e-120 6j9t:B, 6j9t:D, 6j9t:E, 6j9t:C, 6j9t:F, 6j9u:A, 6j9u:C, 6j9u:D
7 1ez4:B 318 306 0.5144 0.5063 0.5261 5.76e-114 1ez4:A, 1ez4:C, 1ez4:D
8 3wsw:A 316 305 0.4569 0.4525 0.4689 1.54e-102 3wsw:B, 3wsw:C, 3wsw:D
9 8ab3:A 330 309 0.4313 0.4091 0.4369 1.58e-87 8ab3:B, 8ab3:C, 8ab3:D
10 6h9s:B 292 309 0.4345 0.4658 0.4401 1.26e-83 6h9s:A
11 4qsm:A 332 311 0.3994 0.3765 0.4019 1.36e-81 4aj1:A, 4aj1:B, 4aj1:C, 4aj1:D, 4aj2:A, 4aj2:B, 4aj2:C, 4aj2:D, 4aj4:A, 4aj4:B, 4aj4:C, 4aj4:D, 4aje:A, 4aje:B, 4aje:C, 4aje:D, 4ajh:A, 4ajh:B, 4ajh:C, 4ajh:D, 4aji:A, 4aji:B, 4aji:C, 4aji:D, 4ajj:A, 4ajj:B, 4ajj:C, 4ajj:D, 4ajk:A, 4ajk:B, 4ajk:C, 4ajk:D, 4ajl:A, 4ajl:B, 4ajl:C, 4ajl:D, 4ajn:A, 4ajn:B, 4ajn:C, 4ajn:D, 4ajo:A, 4ajo:B, 4ajo:C, 4ajo:D, 4ajp:A, 4ajp:B, 4ajp:C, 4ajp:D, 4al4:A, 4al4:B, 4al4:C, 4al4:D, 6bad:A, 6bad:B, 6bad:C, 6bad:D, 6bag:A, 6bag:B, 6bag:C, 6bag:D, 6bax:A, 6bax:B, 6bax:C, 6bax:D, 6baz:A, 6baz:B, 6baz:C, 6baz:D, 6bb0:A, 6bb0:B, 6bb0:C, 6bb0:D, 6bb1:A, 6bb1:B, 6bb1:C, 6bb1:D, 6bb1:E, 6bb1:F, 6bb1:G, 6bb1:H, 6bb2:A, 6bb2:B, 6bb2:C, 6bb2:D, 6bb2:E, 6bb2:F, 6bb2:G, 6bb2:H, 6bb3:A, 6bb3:B, 6bb3:C, 6bb3:D, 9bk2:A, 9bk2:D, 9bk3:D, 8fw6:A, 8fw6:B, 3h3f:A, 3h3f:B, 3h3f:C, 3h3f:D, 3h3f:E, 3h3f:F, 3h3f:G, 3h3f:H, 1i10:A, 1i10:B, 1i10:C, 1i10:D, 1i10:E, 1i10:F, 1i10:G, 1i10:H, 4i8x:A, 4i8x:B, 4i8x:C, 4i8x:D, 4i8x:E, 4i8x:F, 4i8x:G, 4i8x:H, 4i9h:A, 4i9h:B, 4i9h:C, 4i9h:D, 4i9h:E, 4i9h:F, 4i9h:G, 4i9h:H, 4i9n:A, 4i9n:B, 4i9n:C, 4i9n:D, 4i9n:E, 4i9n:F, 4i9n:G, 4i9n:H, 4i9u:A, 4i9u:B, 4i9u:C, 4i9u:D, 4i9u:E, 4i9u:F, 4i9u:G, 4i9u:H, 5ixs:A, 5ixs:B, 5ixs:C, 5ixs:D, 5ixy:A, 5ixy:B, 5ixy:C, 5ixy:D, 4jnk:A, 4jnk:B, 4jnk:C, 4jnk:D, 5kkc:A, 5kkc:B, 5kkc:C, 5kkc:D, 4l4s:H, 4l4s:A, 9ldb:A, 9ldb:B, 9ldt:A, 9ldt:B, 7m2n:A, 7m2n:B, 7m2n:C, 7m2n:D, 4m49:A, 4m49:B, 4m49:C, 4m49:D, 6mv8:A, 6mv8:B, 6mv8:C, 6mv8:D, 6mva:A, 6mva:B, 6mva:C, 6mva:D, 5nqq:A, 5nqq:B, 5nqq:C, 5nqq:D, 4okn:A, 4okn:B, 4okn:C, 4okn:D, 4okn:E, 4okn:F, 4okn:G, 4okn:H, 6p6u:C, 6p6u:E, 6q0d:A, 6q0d:B, 6q0d:C, 6q0d:D, 6q0d:E, 6q0d:F, 6q13:A, 6q13:B, 6q13:C, 6q13:D, 4qo7:A, 4qo7:B, 4qo7:C, 4qo7:D, 4qo8:A, 4qo8:B, 4qo8:C, 4qo8:D, 4qsm:B, 4qsm:C, 4qsm:D, 4qsm:E, 4qsm:F, 4qsm:G, 4qsm:H, 4qt0:A, 4qt0:B, 4qt0:C, 4qt0:D, 4qt0:E, 4qt0:F, 4qt0:G, 4qt0:H, 4r68:A, 4r68:B, 4r68:C, 4r68:D, 4r69:A, 4r69:B, 4r69:C, 4r69:D, 4rls:A, 4rls:B, 4rls:C, 4rls:D, 6sbu:A, 6sbu:B, 6sbu:C, 6sbu:D, 6sbu:E, 6sbu:F, 6sbu:G, 6sbu:H, 6sbv:A, 6sbv:B, 6sbv:C, 6sbv:D, 6sbv:E, 6sbv:F, 6sbv:G, 6sbv:H, 5w8h:A, 5w8h:B, 5w8h:C, 5w8i:A, 5w8i:C, 5w8i:D, 5w8j:A, 5w8j:B, 5w8j:C, 5w8j:D, 5w8k:A, 5w8k:B, 5w8k:C, 5w8k:D, 5w8l:A, 5w8l:B, 5w8l:C, 5w8l:D, 5zjd:A, 5zjd:B, 5zjd:C, 5zjd:D, 5zjd:E, 5zjd:F, 5zjd:G, 5zjd:H, 5zjf:A, 5zjf:C, 4zvv:A, 4zvv:B, 4zvv:C, 4zvv:D
12 2e37:C 310 309 0.4281 0.4323 0.4337 3.15e-81 2e37:A, 2e37:E, 2e37:G, 2v7p:A, 2v7p:B, 2v7p:C, 2v7p:D, 3vph:A, 3vph:D, 3vph:B, 3vph:C, 2xxb:A, 2xxb:B, 2xxj:B, 2xxj:D, 3zzn:A, 3zzn:D
13 7epm:A 335 312 0.4058 0.3791 0.4071 8.77e-80 7epm:B
14 1a5z:A 312 311 0.4217 0.4231 0.4244 6.49e-78
15 7dbj:A 333 316 0.3802 0.3574 0.3766 1.10e-77 6cep:A, 6cep:B, 6cep:C, 6cep:D, 7dbj:B, 7dbj:C, 7dbj:D, 7dbk:A, 7dbk:B, 7dbk:C, 7dbk:D, 7dbk:E, 7dbk:F, 7dbk:G, 7dbk:H, 1i0z:A, 1i0z:B, 5ldh:A, 5ldh:B, 8qde:A, 8qde:B, 8qde:C, 8qde:D, 1t2f:A, 1t2f:B, 1t2f:C, 1t2f:D, 5yta:A, 5yta:B
16 1lld:A 313 308 0.3770 0.3770 0.3831 3.35e-76 1lld:B, 1lth:T, 1lth:R
17 6k13:A 332 310 0.3866 0.3645 0.3903 2.27e-75 6k13:B
18 1ldm:A 329 307 0.3802 0.3617 0.3876 1.93e-73 6ldh:A
19 1v6a:A 332 306 0.3802 0.3584 0.3889 1.16e-69 1v6a:B
20 7nay:A 322 308 0.3482 0.3385 0.3539 1.75e-62
21 7f8d:A 313 312 0.3482 0.3482 0.3494 5.44e-62 7by9:A, 7by9:B, 7by9:C, 7by9:D, 7bya:A, 7bya:B, 7bya:C, 7bya:D, 7f8d:B, 7f8d:C, 7f8d:D, 7x1l:A, 7x1l:B, 7x1l:E, 7x1l:F, 7x1l:C, 7x1l:D
22 4plf:B 330 313 0.3195 0.3030 0.3195 2.02e-56 4plc:A, 4plc:B, 4plc:C, 4plc:D, 4plf:A, 4plg:A, 4plg:B, 6vdj:A
23 1guz:A 305 300 0.3163 0.3246 0.3300 2.41e-56 1guz:B, 1guz:C, 1guz:D
24 3gvh:A 318 303 0.3099 0.3050 0.3201 7.44e-56 3gvh:B, 3gvh:C, 3gvh:D, 3gvi:A, 3gvi:B, 3gvi:C, 3gvi:D, 3gvi:E, 3gvi:F
25 1d3a:A 303 288 0.3387 0.3498 0.3681 7.50e-56 1d3a:B, 1hlp:A, 1hlp:B, 2hlp:A, 1o6z:A, 1o6z:B, 1o6z:C, 1o6z:D, 2x0r:A, 2x0r:B
26 4plt:B 319 311 0.3227 0.3166 0.3248 8.16e-56 4plh:A, 4plh:B, 4plh:C, 4plh:D, 4plt:A, 4plt:C, 4plt:D, 4plv:A, 4plv:B, 4plv:C, 4plv:D, 4plw:A, 4plw:B, 4plw:C, 4plw:D, 4ply:B, 4ply:A, 4ply:C, 4ply:D, 4ply:F, 4ply:E, 4ply:G, 4ply:H
27 8rwl:A 312 315 0.3834 0.3846 0.3810 2.25e-54 9end:A, 9end:B, 8rs5:A, 8rs5:B, 8rwl:B
28 1gv0:A 301 300 0.3099 0.3223 0.3233 5.09e-53 1gv0:B
29 4ros:A 318 307 0.3099 0.3050 0.3160 5.76e-53 5ujk:A
30 3czm:B 323 304 0.3163 0.3065 0.3257 5.01e-52 3czm:A, 1sow:A, 1sow:B
31 2x0i:A 294 307 0.3387 0.3605 0.3453 4.30e-51 2x0j:A
32 1t2e:A 317 298 0.3003 0.2965 0.3154 7.82e-51 4b7u:B, 4b7u:C, 4b7u:D, 1cet:A, 1ldg:A, 1u4o:A, 1u4s:A, 1u5a:A, 1u5c:A, 1xiv:A
33 2a92:C 318 310 0.2971 0.2925 0.3000 3.29e-50 2a92:A, 2a92:B, 2a92:D, 2a94:A, 2aa3:A, 2aa3:B, 2aa3:C, 2aa3:D, 4b7u:A, 5hru:A, 5hru:B, 5hto:A, 5hto:B, 5hto:D, 5hto:E, 1oc4:A, 1oc4:B, 4plz:A, 1t24:A, 1t25:A, 1t26:A, 1t2c:A, 1t2d:A, 6txr:A, 6txr:B, 6txr:C, 6txr:D, 3zh2:A, 3zh2:B, 3zh2:C, 3zh2:D
34 1uxg:A 308 303 0.3099 0.3149 0.3201 2.63e-49 1guy:A, 1guy:C, 1ur5:A, 1ur5:C, 1uxg:B, 1uxh:A, 1uxh:B, 1uxi:A, 1uxi:B, 1uxj:A, 1uxj:C, 1uxk:A, 1uxk:C
35 2hjr:B 314 312 0.3131 0.3121 0.3141 8.54e-49 2hjr:A, 2hjr:C, 2hjr:D, 2hjr:E, 2hjr:F, 2hjr:G, 2hjr:H, 2hjr:I, 2hjr:J, 2hjr:K, 2hjr:L
36 6ct6:B 331 293 0.2716 0.2568 0.2901 1.72e-46 6ct6:A
37 3ldh:A 329 326 0.3323 0.3161 0.3190 7.66e-46
38 1hyh:A 297 295 0.2971 0.3131 0.3153 1.87e-45 1hyh:B, 1hyh:C, 1hyh:D
39 1hyg:A 313 319 0.3419 0.3419 0.3354 1.34e-42 1hye:A, 1hyg:B
40 6r8g:C 312 311 0.2971 0.2981 0.2990 1.23e-41 6r8g:A, 6r8g:B, 6r8g:D, 6y91:A, 6y91:B, 6y91:C, 6y91:D
41 2fn7:A 317 305 0.2780 0.2744 0.2852 2.16e-40 2fn7:B, 4nd1:A, 4nd1:B, 4nd2:A, 4nd2:B, 4nd3:A, 4nd3:B, 4nd4:A, 4nd4:B
42 3om9:A 329 314 0.3163 0.3009 0.3153 3.42e-38 3om9:B, 3om9:C, 3om9:D, 1pzf:A, 1pzf:B, 1pzf:C, 1pzf:D, 1pzg:A, 1pzg:B, 1pzg:C, 1pzg:D, 1pzh:A, 1pzh:B, 1pzh:C, 1pzh:D
43 6qss:A 303 303 0.2971 0.3069 0.3069 1.45e-34 6qss:D
44 6ihd:B 304 272 0.2524 0.2599 0.2904 2.41e-28 6ihd:A, 6ihe:A, 6ihe:B
45 1emd:A 312 327 0.2780 0.2788 0.2661 2.35e-13 1ib6:A, 1ib6:C, 1ib6:D, 1ie3:A, 1ie3:B, 1ie3:C, 1ie3:D, 5kka:A, 5kka:B
46 2dfd:A 314 289 0.2332 0.2325 0.2526 3.93e-12 2dfd:B, 2dfd:C, 2dfd:D, 4wlo:A, 4wlo:B, 4wlo:C, 4wlo:D, 4wlu:A, 4wlu:B, 4wlu:C, 4wlu:D, 4wlv:A, 4wlv:B, 4wlv:C, 4wlv:D
47 7qoz:A 323 249 0.2013 0.1950 0.2530 1.66e-08 7qoz:B, 7qoz:C, 7qoz:D, 7qoz:E, 7qoz:F, 7qoz:G, 7qoz:H
48 6itl:A 312 152 0.1565 0.1571 0.3224 2.16e-08
49 1bdm:B 327 322 0.2620 0.2508 0.2547 9.56e-07 1bdm:A, 1bmd:A, 1bmd:B, 2cvq:A, 2cvq:B, 1wze:A, 1wze:B, 1wzi:A, 1wzi:B, 1y7t:A, 1y7t:B
50 5zi2:A 339 310 0.2620 0.2419 0.2645 1.09e-06 5zi2:B, 5zi4:A, 5zi4:B
51 5nue:B 332 247 0.2077 0.1958 0.2632 1.81e-05 5nue:A, 5nue:C, 5nuf:A, 5nuf:B, 5nuf:C
52 4i1i:A 320 159 0.1470 0.1437 0.2893 0.004
53 4uun:B 337 231 0.1725 0.1602 0.2338 0.007 5a1t:A, 5a1t:B, 4uun:A
54 4mdh:A 333 311 0.2396 0.2252 0.2412 0.007 4mdh:B, 5mdh:A, 5mdh:B, 7rm9:A
55 4uup:A 335 317 0.2428 0.2269 0.2397 0.045 4uup:B
56 7mdh:B 360 207 0.1661 0.1444 0.2512 0.12 7mdh:A, 7mdh:C, 7mdh:D
57 5kvv:A 327 239 0.2109 0.2018 0.2762 0.14 5kvv:B
58 1civ:A 374 153 0.1214 0.1016 0.2484 0.19
59 4obi:A 87 67 0.0671 0.2414 0.3134 3.5
60 6lbp:A 460 66 0.0607 0.0413 0.2879 3.8 6lbp:B
61 6qmm:B 280 61 0.0639 0.0714 0.3279 5.7 6qmm:A
62 7kc0:A 1004 37 0.0479 0.0149 0.4054 6.0 3iay:A, 6p1h:A
63 1b8u:A 327 66 0.0703 0.0673 0.3333 7.3 1b8v:A
64 6skf:BF 169 75 0.0575 0.1065 0.2400 9.3 6skg:BF, 6th6:BF
65 1pdz:A 433 46 0.0511 0.0370 0.3478 9.3 8uel:A, 8uel:B
66 5xlx:A 201 96 0.0831 0.1294 0.2708 9.5 5xlx:B, 5xlx:C, 5xlx:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218