Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
FKGNKVVLIGNGAVGSSYAFSLVNQSIVDELVIIDLDTEKVRGDVMDLKHATPYSPTTVRVKAGEYSDCHDADLVVICAG
AAQKPTRLDLVSKNLKIFKSIVGEVMASKFDGIFLVATNPVDILAYATWKFSGLPKERVIGSGTILDSARFRLLLSEAFD
VAPRSVDAQIIGEHGDTELPVWSHANIAGQPLKTLLEQRPEGKAQIEQIFVQTRDAAYDIIQAKGATYYGVAMGLARITE
AIFRNEDAVLTVSALLEGEYEEEDVYIGVPAVINRNGIRNVVEIPLNDEEQSKFAHSAKTLKDIMAE

The query sequence (length=307) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3h3j:B 314 309 0.9967 0.9745 0.9903 0.0 3d4p:A, 3d4p:B, 3h3j:A
2 1ldn:A 316 308 0.6515 0.6329 0.6494 2.55e-144 1ldn:C, 1ldn:B, 1ldn:D, 1ldn:E, 1ldn:F, 1ldn:H, 1ldn:G, 2ldb:A, 2ldb:B, 2ldb:C, 2ldb:D
3 3pqd:B 312 305 0.6450 0.6346 0.6492 5.09e-144 3pqd:A, 3pqd:C, 3pqd:D, 3pqd:F, 3pqd:H, 3pqd:E, 3pqd:G, 3pqf:C, 3pqf:D
4 4ln1:B 321 306 0.5928 0.5670 0.5948 7.51e-136 4ln1:A, 4ln1:C, 4ln1:D
5 1ldb:A 294 305 0.6189 0.6463 0.6230 1.43e-131
6 1llc:A 320 306 0.5472 0.5250 0.5490 2.62e-116 6j9t:B, 6j9t:D, 6j9t:E, 6j9t:C, 6j9t:F, 6j9u:A, 6j9u:C, 6j9u:D
7 1ez4:B 318 303 0.5179 0.5000 0.5248 9.68e-111 1ez4:A, 1ez4:C, 1ez4:D
8 3wsw:A 316 305 0.4625 0.4494 0.4656 2.38e-99 3wsw:B, 3wsw:C, 3wsw:D
9 8ab3:A 330 309 0.4365 0.4061 0.4337 1.38e-84 8ab3:B, 8ab3:C, 8ab3:D
10 6h9s:B 292 301 0.4397 0.4623 0.4485 5.78e-84 6h9s:A
11 2e37:C 310 309 0.4332 0.4290 0.4304 1.31e-78 2e37:A, 2e37:E, 2e37:G, 2v7p:A, 2v7p:B, 2v7p:C, 2v7p:D, 3vph:A, 3vph:D, 3vph:B, 3vph:C, 2xxb:A, 2xxb:B, 2xxj:B, 2xxj:D, 3zzn:A, 3zzn:D
12 4qsm:A 332 309 0.3974 0.3675 0.3948 1.25e-76 4aj1:A, 4aj1:B, 4aj1:C, 4aj1:D, 4aj2:A, 4aj2:B, 4aj2:C, 4aj2:D, 4aj4:A, 4aj4:B, 4aj4:C, 4aj4:D, 4aje:A, 4aje:B, 4aje:C, 4aje:D, 4ajh:A, 4ajh:B, 4ajh:C, 4ajh:D, 4aji:A, 4aji:B, 4aji:C, 4aji:D, 4ajj:A, 4ajj:B, 4ajj:C, 4ajj:D, 4ajk:A, 4ajk:B, 4ajk:C, 4ajk:D, 4ajl:A, 4ajl:B, 4ajl:C, 4ajl:D, 4ajn:A, 4ajn:B, 4ajn:C, 4ajn:D, 4ajo:A, 4ajo:B, 4ajo:C, 4ajo:D, 4ajp:A, 4ajp:B, 4ajp:C, 4ajp:D, 4al4:A, 4al4:B, 4al4:C, 4al4:D, 6bad:A, 6bad:B, 6bad:C, 6bad:D, 6bag:A, 6bag:B, 6bag:C, 6bag:D, 6bax:A, 6bax:B, 6bax:C, 6bax:D, 6baz:A, 6baz:B, 6baz:C, 6baz:D, 6bb0:A, 6bb0:B, 6bb0:C, 6bb0:D, 6bb1:A, 6bb1:B, 6bb1:C, 6bb1:D, 6bb1:E, 6bb1:F, 6bb1:G, 6bb1:H, 6bb2:A, 6bb2:B, 6bb2:C, 6bb2:D, 6bb2:E, 6bb2:F, 6bb2:G, 6bb2:H, 6bb3:A, 6bb3:B, 6bb3:C, 6bb3:D, 9bk2:A, 9bk2:D, 9bk3:D, 8fw6:A, 8fw6:B, 3h3f:A, 3h3f:B, 3h3f:C, 3h3f:D, 3h3f:E, 3h3f:F, 3h3f:G, 3h3f:H, 1i10:A, 1i10:B, 1i10:C, 1i10:D, 1i10:E, 1i10:F, 1i10:G, 1i10:H, 4i8x:A, 4i8x:B, 4i8x:C, 4i8x:D, 4i8x:E, 4i8x:F, 4i8x:G, 4i8x:H, 4i9h:A, 4i9h:B, 4i9h:C, 4i9h:D, 4i9h:E, 4i9h:F, 4i9h:G, 4i9h:H, 4i9n:A, 4i9n:B, 4i9n:C, 4i9n:D, 4i9n:E, 4i9n:F, 4i9n:G, 4i9n:H, 4i9u:A, 4i9u:B, 4i9u:C, 4i9u:D, 4i9u:E, 4i9u:F, 4i9u:G, 4i9u:H, 5ixs:A, 5ixs:B, 5ixs:C, 5ixs:D, 5ixy:A, 5ixy:B, 5ixy:C, 5ixy:D, 4jnk:A, 4jnk:B, 4jnk:C, 4jnk:D, 5kkc:A, 5kkc:B, 5kkc:C, 5kkc:D, 4l4s:H, 4l4s:A, 9ldb:A, 9ldb:B, 9ldt:A, 9ldt:B, 7m2n:A, 7m2n:B, 7m2n:C, 7m2n:D, 4m49:A, 4m49:B, 4m49:C, 4m49:D, 6mv8:A, 6mv8:B, 6mv8:C, 6mv8:D, 6mva:A, 6mva:B, 6mva:C, 6mva:D, 5nqq:A, 5nqq:B, 5nqq:C, 5nqq:D, 4okn:A, 4okn:B, 4okn:C, 4okn:D, 4okn:E, 4okn:F, 4okn:G, 4okn:H, 6p6u:C, 6p6u:E, 6q0d:A, 6q0d:B, 6q0d:C, 6q0d:D, 6q0d:E, 6q0d:F, 6q13:A, 6q13:B, 6q13:C, 6q13:D, 4qo7:A, 4qo7:B, 4qo7:C, 4qo7:D, 4qo8:A, 4qo8:B, 4qo8:C, 4qo8:D, 4qsm:B, 4qsm:C, 4qsm:D, 4qsm:E, 4qsm:F, 4qsm:G, 4qsm:H, 4qt0:A, 4qt0:B, 4qt0:C, 4qt0:D, 4qt0:E, 4qt0:F, 4qt0:G, 4qt0:H, 4r68:A, 4r68:B, 4r68:C, 4r68:D, 4r69:A, 4r69:B, 4r69:C, 4r69:D, 4rls:A, 4rls:B, 4rls:C, 4rls:D, 6sbu:A, 6sbu:B, 6sbu:C, 6sbu:D, 6sbu:E, 6sbu:F, 6sbu:G, 6sbu:H, 6sbv:A, 6sbv:B, 6sbv:C, 6sbv:D, 6sbv:E, 6sbv:F, 6sbv:G, 6sbv:H, 5w8h:A, 5w8h:B, 5w8h:C, 5w8i:A, 5w8i:C, 5w8i:D, 5w8j:A, 5w8j:B, 5w8j:C, 5w8j:D, 5w8k:A, 5w8k:B, 5w8k:C, 5w8k:D, 5w8l:A, 5w8l:B, 5w8l:C, 5w8l:D, 5zjd:A, 5zjd:B, 5zjd:C, 5zjd:D, 5zjd:E, 5zjd:F, 5zjd:G, 5zjd:H, 5zjf:A, 5zjf:C, 4zvv:A, 4zvv:B, 4zvv:C, 4zvv:D
13 7epm:A 335 305 0.4007 0.3672 0.4033 8.94e-75 7epm:B
14 1a5z:A 312 306 0.4137 0.4071 0.4150 1.63e-74
15 7dbj:A 333 309 0.3746 0.3453 0.3722 2.83e-72 6cep:A, 6cep:B, 6cep:C, 6cep:D, 7dbj:B, 7dbj:C, 7dbj:D, 7dbk:A, 7dbk:B, 7dbk:C, 7dbk:D, 7dbk:E, 7dbk:F, 7dbk:G, 7dbk:H, 1i0z:A, 1i0z:B, 5ldh:A, 5ldh:B, 8qde:A, 8qde:B, 8qde:C, 8qde:D, 1t2f:A, 1t2f:B, 1t2f:C, 1t2f:D, 5yta:A, 5yta:B
16 1lld:A 313 308 0.3779 0.3706 0.3766 7.35e-72 1lld:B, 1lth:T, 1lth:R
17 6k13:A 332 310 0.3844 0.3554 0.3806 1.42e-70 6k13:B
18 1ldm:A 329 307 0.3779 0.3526 0.3779 1.18e-68 6ldh:A
19 1v6a:A 332 306 0.3779 0.3494 0.3791 8.41e-65 1v6a:B
20 7f8d:A 313 312 0.3550 0.3482 0.3494 1.75e-60 7by9:A, 7by9:B, 7by9:C, 7by9:D, 7bya:A, 7bya:B, 7bya:C, 7bya:D, 7f8d:B, 7f8d:C, 7f8d:D, 7x1l:A, 7x1l:B, 7x1l:E, 7x1l:F, 7x1l:C, 7x1l:D
21 7nay:A 322 308 0.3453 0.3292 0.3442 3.04e-60
22 4plf:B 330 313 0.3225 0.3000 0.3163 2.58e-55 4plc:A, 4plc:B, 4plc:C, 4plc:D, 4plf:A, 4plg:A, 4plg:B, 6vdj:A
23 4plt:B 319 311 0.3257 0.3135 0.3215 8.25e-55 4plh:A, 4plh:B, 4plh:C, 4plh:D, 4plt:A, 4plt:C, 4plt:D, 4plv:A, 4plv:B, 4plv:C, 4plv:D, 4plw:A, 4plw:B, 4plw:C, 4plw:D, 4ply:B, 4ply:A, 4ply:C, 4ply:D, 4ply:F, 4ply:E, 4ply:G, 4ply:H
24 1guz:A 305 304 0.3192 0.3213 0.3224 4.62e-54 1guz:B, 1guz:C, 1guz:D
25 8rwl:A 312 310 0.3811 0.3750 0.3774 5.02e-54 9end:A, 9end:B, 8rs5:A, 8rs5:B, 8rwl:B
26 3gvh:A 318 303 0.3127 0.3019 0.3168 1.29e-53 3gvh:B, 3gvh:C, 3gvh:D, 3gvi:A, 3gvi:B, 3gvi:C, 3gvi:D, 3gvi:E, 3gvi:F
27 1d3a:A 303 288 0.3420 0.3465 0.3646 2.60e-53 1d3a:B, 1hlp:A, 1hlp:B, 2hlp:A, 1o6z:A, 1o6z:B, 1o6z:C, 1o6z:D, 2x0r:A, 2x0r:B
28 1gv0:A 301 298 0.3094 0.3156 0.3188 1.30e-51 1gv0:B
29 3czm:B 323 304 0.3192 0.3034 0.3224 7.26e-51 3czm:A, 1sow:A, 1sow:B
30 4ros:A 318 307 0.3127 0.3019 0.3127 1.20e-50 5ujk:A
31 2x0i:A 294 307 0.3453 0.3605 0.3453 1.15e-49 2x0j:A
32 1t2e:A 317 298 0.3029 0.2934 0.3121 2.29e-49 4b7u:B, 4b7u:C, 4b7u:D, 1cet:A, 1ldg:A, 1u4o:A, 1u4s:A, 1u5a:A, 1u5c:A, 1xiv:A
33 2a92:C 318 310 0.2997 0.2893 0.2968 6.63e-49 2a92:A, 2a92:B, 2a92:D, 2a94:A, 2aa3:A, 2aa3:B, 2aa3:C, 2aa3:D, 4b7u:A, 5hru:A, 5hru:B, 5hto:A, 5hto:B, 5hto:D, 5hto:E, 1oc4:A, 1oc4:B, 4plz:A, 1t24:A, 1t25:A, 1t26:A, 1t2c:A, 1t2d:A, 6txr:A, 6txr:B, 6txr:C, 6txr:D, 3zh2:A, 3zh2:B, 3zh2:C, 3zh2:D
34 1uxg:A 308 303 0.3127 0.3117 0.3168 6.36e-47 1guy:A, 1guy:C, 1ur5:A, 1ur5:C, 1uxg:B, 1uxh:A, 1uxh:B, 1uxi:A, 1uxi:B, 1uxj:A, 1uxj:C, 1uxk:A, 1uxk:C
35 2hjr:B 314 308 0.3160 0.3089 0.3149 9.45e-47 2hjr:A, 2hjr:C, 2hjr:D, 2hjr:E, 2hjr:F, 2hjr:G, 2hjr:H, 2hjr:I, 2hjr:J, 2hjr:K, 2hjr:L
36 1hyh:A 297 295 0.3062 0.3165 0.3186 1.33e-45 1hyh:B, 1hyh:C, 1hyh:D
37 6ct6:B 331 293 0.2736 0.2538 0.2867 2.81e-45 6ct6:A
38 3ldh:A 329 326 0.3290 0.3070 0.3098 3.26e-41
39 1hyg:A 313 315 0.3420 0.3355 0.3333 7.44e-40 1hye:A, 1hyg:B
40 2fn7:A 317 305 0.2834 0.2744 0.2852 7.38e-39 2fn7:B, 4nd1:A, 4nd1:B, 4nd2:A, 4nd2:B, 4nd3:A, 4nd3:B, 4nd4:A, 4nd4:B
41 6r8g:C 312 302 0.2932 0.2885 0.2980 1.32e-38 6r8g:A, 6r8g:B, 6r8g:D, 6y91:A, 6y91:B, 6y91:C, 6y91:D
42 3om9:A 329 315 0.3192 0.2979 0.3111 4.25e-37 3om9:B, 3om9:C, 3om9:D, 1pzf:A, 1pzf:B, 1pzf:C, 1pzf:D, 1pzg:A, 1pzg:B, 1pzg:C, 1pzg:D, 1pzh:A, 1pzh:B, 1pzh:C, 1pzh:D
43 6qss:A 303 302 0.3029 0.3069 0.3079 5.71e-35 6qss:D
44 6ihd:B 304 272 0.2541 0.2566 0.2868 4.45e-26 6ihd:A, 6ihe:A, 6ihe:B
45 1emd:A 312 322 0.2736 0.2692 0.2609 1.67e-09 1ib6:A, 1ib6:C, 1ib6:D, 1ie3:A, 1ie3:B, 1ie3:C, 1ie3:D, 5kka:A, 5kka:B
46 6itl:A 312 152 0.1596 0.1571 0.3224 5.97e-07
47 7qoz:A 323 247 0.1987 0.1889 0.2470 6.62e-06 7qoz:B, 7qoz:C, 7qoz:D, 7qoz:E, 7qoz:F, 7qoz:G, 7qoz:H
48 5zi2:A 339 310 0.2638 0.2389 0.2613 7.87e-05 5zi2:B, 5zi4:A, 5zi4:B
49 1bdm:B 327 231 0.2020 0.1896 0.2684 8.16e-05 1bdm:A, 1bmd:A, 1bmd:B, 2cvq:A, 2cvq:B, 1wze:A, 1wze:B, 1wzi:A, 1wzi:B, 1y7t:A, 1y7t:B
50 5nue:B 332 247 0.2085 0.1928 0.2591 0.002 5nue:A, 5nue:C, 5nuf:A, 5nuf:B, 5nuf:C
51 6itk:A 318 252 0.1792 0.1730 0.2183 0.19 6itk:B
52 6a0t:B 332 98 0.0912 0.0843 0.2857 0.41 6a0s:B, 6a0s:A, 6a0t:A, 6a0u:B, 6a0u:A, 2ejw:A, 2ejw:B, 2ejw:E, 2ejw:F, 5xdf:A, 5xdf:B
53 6lbp:A 460 66 0.0619 0.0413 0.2879 3.5 6lbp:B
54 8crv:A 312 71 0.0717 0.0705 0.3099 4.3
55 4uup:A 335 317 0.2443 0.2239 0.2366 4.5 4uup:B
56 6qmm:B 280 61 0.0651 0.0714 0.3279 6.1 6qmm:A
57 7kc0:A 1004 37 0.0489 0.0149 0.4054 6.2 3iay:A, 6p1h:A
58 5kvv:A 327 239 0.2085 0.1957 0.2678 6.4 5kvv:B
59 1pdz:A 433 46 0.0554 0.0393 0.3696 7.4 8uel:A, 8uel:B
60 7mdh:B 360 207 0.1661 0.1417 0.2464 8.5 7mdh:A, 7mdh:C, 7mdh:D
61 6skf:BF 169 75 0.0586 0.1065 0.2400 8.9 6skg:BF, 6th6:BF
62 5xlx:A 201 96 0.0847 0.1294 0.2708 9.1 5xlx:B, 5xlx:C, 5xlx:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218