Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
FGEVYHLTLGESVHCGLWFPPDAPVPQDMELVTMSSQAQDRYTDYLIETLDPKAGQHLLDIGCGTGRTALKAARQRGIAV
TGVAVSKEQIAAANRLAAGHGLTERLTFEVADAMRLPYEDESFDCAWAIESLCHMDRAKALGEAWRVLKPGGDLLVLESV
VTEELTEPETALFETLYAANVPPRLGEFFDIVSGAGFHTLSLKDLSANLAMTMNVFALGVYSRRAEFTERFGAEFVDGLL
AGLGSAQETLIRKTRFFMATLRKPAV

The query sequence (length=266) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 5gm2:B 282 266 1.0000 0.9433 1.0000 0.0 5gm1:A, 5gm1:B, 5gm1:C, 5gm1:D, 5gm1:E, 5gm1:F, 5gm1:G, 5gm1:H, 5gm1:I, 5gm1:J, 5gm1:K, 5gm1:L, 5gm1:M, 5gm1:N, 5gm1:O, 5gm1:P, 5gm1:Q, 5gm1:R, 5gm2:A, 5gm2:C, 5gm2:D, 5gm2:E, 5gm2:F, 5gm2:G, 5gm2:H, 5gm2:I, 5gm2:J, 5gm2:L, 5gm2:M, 5gm2:N, 5gm2:O, 5gm2:P, 5gm2:Q, 5gm2:R
2 5gm2:K 267 266 0.9248 0.9213 0.9248 3.17e-176
3 3bus:A 251 259 0.3383 0.3586 0.3475 8.92e-39 3bus:B
4 6uv6:C 264 206 0.2932 0.2955 0.3786 1.19e-32 6uv6:A, 6uv6:B
5 4pne:B 272 233 0.3195 0.3125 0.3648 4.34e-32 4pne:A
6 7v6h:A 267 206 0.2707 0.2697 0.3495 9.32e-28 7v6h:B
7 5wp4:A 485 213 0.2105 0.1155 0.2629 1.11e-13
8 5wp5:A 463 213 0.2105 0.1210 0.2629 1.67e-13 5wp5:B
9 4ine:A 431 196 0.2068 0.1276 0.2806 3.10e-13 4ine:B
10 4krh:A 430 198 0.2143 0.1326 0.2879 1.06e-12 4krh:B, 4kri:A, 4kri:B, 4kri:C
11 5z9o:A 373 203 0.1805 0.1287 0.2365 7.30e-11 5z9o:B
12 7fbo:A 282 151 0.1767 0.1667 0.3113 8.08e-11 7fbh:B, 7fbh:C, 7fbo:B, 7fbo:C
13 1ve3:B 226 119 0.1429 0.1681 0.3193 1.54e-10 1ve3:A
14 3uj7:A 259 230 0.1805 0.1853 0.2087 6.24e-10 4fgz:A, 4fgz:B, 4r6w:A, 4r6w:B, 4r6x:A, 4r6x:B, 3uj6:A, 3uj7:B, 3uj8:A, 3uj9:A, 3uja:A, 3ujb:A, 3ujb:B, 3ujc:A, 3ujd:A
15 4f86:A 275 165 0.1541 0.1491 0.2485 6.75e-10 4f84:A, 4f86:B, 4f86:C, 4f86:E, 4f86:F, 4f86:H, 4f86:I, 4f86:J, 4f86:K, 4f86:L
16 5fcd:A 228 118 0.1316 0.1535 0.2966 1.54e-09 5fcd:B
17 2glu:A 234 122 0.1579 0.1795 0.3443 3.94e-09 2glu:B
18 6uak:A 297 102 0.1391 0.1246 0.3627 1.58e-08
19 3kkz:A 256 108 0.1391 0.1445 0.3426 9.20e-08 3kkz:B
20 4mwz:B 265 194 0.1504 0.1509 0.2062 3.02e-07 4iv0:A, 4iv0:B, 4mwz:A
21 3vc1:D 288 111 0.1128 0.1042 0.2703 5.79e-07 4f86:D, 4f86:G, 3vc1:A, 3vc1:B, 3vc1:C, 3vc1:E, 3vc1:F, 3vc1:G, 3vc1:H, 3vc1:I, 3vc1:J, 3vc1:K, 3vc1:L, 3vc2:A, 3vc2:B, 3vc2:C, 3vc2:D, 3vc2:E, 3vc2:F, 3vc2:G, 3vc2:H, 3vc2:I, 3vc2:J, 3vc2:K, 3vc2:L
22 3t7s:A 246 103 0.1203 0.1301 0.3107 7.46e-07 3t7s:B, 3t7s:C, 3t7s:D, 3t7t:A, 3t7t:B, 3t7t:C, 3t7t:D
23 7wdq:A 336 144 0.1504 0.1190 0.2778 8.74e-07 7wdq:B, 7wdq:C, 7wdw:A, 7wdw:B, 7wdw:C, 7wdw:D
24 4iv8:A 245 198 0.1541 0.1673 0.2071 1.09e-06 4iv8:B
25 7qos:A 352 238 0.1692 0.1278 0.1891 5.30e-06 7qos:B
26 1p91:A 268 108 0.1617 0.1604 0.3981 7.62e-06 1p91:B
27 3sxj:A 245 102 0.1015 0.1102 0.2647 1.42e-05 3sxj:B, 3t0i:A, 3t0i:B
28 4nec:B 244 99 0.1579 0.1721 0.4242 1.93e-05 4nec:A, 4nec:C, 4nec:D
29 7q2d:A 286 63 0.0902 0.0839 0.3810 3.27e-05 2fk8:A, 3ha3:A, 3ha5:A, 3ha7:A, 7q2b:A, 7q2c:A, 7q2e:A, 7q2f:A, 7q2g:A, 7q2h:A
30 5f8f:B 361 117 0.1316 0.0970 0.2991 7.19e-05 5f8e:A, 5f8e:B, 5f8f:A, 5f8f:C
31 3dlc:A 219 114 0.1165 0.1416 0.2719 8.04e-05
32 2yqz:A 261 106 0.1504 0.1533 0.3774 9.14e-05 2yqz:B
33 1tpy:A 285 227 0.2030 0.1895 0.2379 1.40e-04
34 6wlf:B 434 139 0.1504 0.0922 0.2878 2.03e-04 6wlf:A
35 1wzn:A 244 100 0.1015 0.1107 0.2700 3.21e-04 1wzn:B, 1wzn:C
36 1kpg:A 285 64 0.0789 0.0737 0.3281 5.73e-04 1kpg:B, 1kpg:C, 1kpg:D, 1kph:A, 1kph:B, 1kph:C, 1kph:D
37 6bqc:A 348 66 0.0902 0.0690 0.3636 6.08e-04
38 3e23:A 198 102 0.1316 0.1768 0.3431 6.23e-04
39 5bp7:A 249 104 0.1203 0.1285 0.3077 7.40e-04 5bp7:B, 5bp7:C
40 2gs9:A 211 130 0.1617 0.2038 0.3308 0.001 2gs9:B
41 7lxi:A 279 206 0.1842 0.1756 0.2379 0.002 7mcj:A, 7mcj:B
42 2zfu:A 212 106 0.1316 0.1651 0.3302 0.003 2zfu:B
43 5bxy:A 155 70 0.0714 0.1226 0.2714 0.004 5bxy:B
44 1l1e:A 272 212 0.1654 0.1618 0.2075 0.004 1l1e:B
45 7pd7:B 250 100 0.1128 0.1200 0.3000 0.004 7pd7:A, 7pd7:C, 7pd7:D
46 6cu5:A 314 105 0.1241 0.1051 0.3143 0.005 6cu5:B, 8ft7:A, 8ft7:B
47 4kdr:A 208 112 0.1165 0.1490 0.2768 0.005 5dpm:A
48 5kok:A 348 47 0.0752 0.0575 0.4255 0.006 5koc:A, 5koc:B, 5kok:B, 5kpc:A, 5kpc:B, 5kpg:A, 5kpg:B
49 5h02:A 252 132 0.1466 0.1548 0.2955 0.006 5gwx:A, 5hik:A, 5hil:A, 5him:A
50 5epe:A 248 106 0.1090 0.1169 0.2736 0.008
51 6mro:A 194 119 0.1353 0.1856 0.3025 0.009 8gdu:A
52 3hem:A 291 214 0.1654 0.1512 0.2056 0.011 1kpi:A
53 8joz:A 257 108 0.1203 0.1245 0.2963 0.012 4htf:A, 4htf:B
54 7qcb:A 240 127 0.1353 0.1500 0.2835 0.015
55 6p3o:A 341 158 0.1391 0.1085 0.2342 0.015 6p3m:A, 6p3n:A
56 1qzz:A 340 116 0.1391 0.1088 0.3190 0.017 1r00:A, 1xds:A, 1xds:B, 1xdu:A
57 3e8s:A 220 101 0.1165 0.1409 0.3069 0.023
58 5dm2:A 258 40 0.0639 0.0659 0.4250 0.036 5dm1:A, 5dm4:A, 4kwc:A
59 5u1e:A 321 69 0.0977 0.0810 0.3768 0.037 5tyq:A, 5u0n:A, 5u0t:A, 5u18:A, 5u19:A, 5u1i:A, 5u4t:A
60 3wst:I 644 51 0.0677 0.0280 0.3529 0.057 3wst:A, 3wst:D, 3wst:B, 3wst:C, 3wst:F, 3wst:E, 3wst:G, 3wst:H, 3wst:M, 3wst:N, 3wst:O, 3wst:P, 3wst:Q, 3wst:R, 3wst:J, 3wst:K, 3wst:L, 3x0d:A
61 6gkv:A 351 106 0.1203 0.0912 0.3019 0.065 6gkv:B, 6gky:A, 6gky:B, 6gkz:A, 6gkz:B, 6gkz:C, 6gkz:D
62 6f5z:B 228 186 0.1880 0.2193 0.2688 0.067 6f5z:A
63 5je1:A 244 106 0.1090 0.1189 0.2736 0.076 5jdy:A, 5jdy:B, 5jdz:A, 5jdz:B, 5je0:A, 5je0:B, 5je1:B, 5je2:A, 5je2:B, 5je3:A, 5je3:B, 5je4:A, 5je4:B, 5je5:A
64 3lcc:A 216 200 0.1767 0.2176 0.2350 0.12
65 5m58:A 230 142 0.1353 0.1565 0.2535 0.12 5m58:B
66 3jwh:A 191 112 0.1316 0.1832 0.3125 0.13 3jwh:B
67 5e72:A 323 143 0.1466 0.1207 0.2727 0.24
68 6cx6:B 333 134 0.1353 0.1081 0.2687 0.24 6cx6:A, 5eg5:A, 4fr0:A, 4fsd:A, 4kw7:A, 4rsr:A
69 5fad:A 160 95 0.0865 0.1437 0.2421 0.34 5fa8:A
70 2xva:A 199 110 0.1165 0.1558 0.2818 0.58 2xva:B, 2xva:C, 2xva:D, 2xvm:A, 2xvm:B
71 7cpx:A 2262 116 0.1128 0.0133 0.2586 0.59 7cpx:B, 7cpy:A, 7cpy:B
72 1l3i:A 186 111 0.1203 0.1720 0.2883 0.69 1l3i:B, 1l3i:C, 1l3i:D, 1l3i:E, 1l3i:F
73 8khq:A 700 63 0.0752 0.0286 0.3175 0.74 8khq:B, 8khq:C, 8khq:D
74 7vru:A 497 98 0.1090 0.0584 0.2959 1.1 7vs4:A
75 7cta:A 329 131 0.1203 0.0973 0.2443 1.2 7ct9:A, 7ct9:B, 7cta:B
76 5dm0:B 272 40 0.0564 0.0551 0.3750 1.2 5dly:A, 5dm0:A, 4kvz:A
77 1ri1:A 252 67 0.0639 0.0675 0.2537 1.5 2hv9:A, 1ri2:A, 1ri3:A, 1ri4:A, 1z3c:A
78 6dxp:A 206 105 0.1203 0.1553 0.3048 1.6 6dxp:C, 6dxp:B, 6dxp:D, 8h4j:A, 8h4j:B, 8h4j:C, 8h4j:D, 8h4j:E, 8h4j:F, 8h4j:G, 8h4j:H, 7n2w:A, 7n2w:B, 7n2w:C, 7n2w:D
79 4a6d:A 345 88 0.0902 0.0696 0.2727 1.7 4a6e:A
80 6p2l:A 685 117 0.1241 0.0482 0.2821 1.7
81 4hh4:C 256 104 0.0940 0.0977 0.2404 1.9 4hh4:A, 4hh4:B, 4hh4:D, 4hh4:E, 4hh4:F
82 6eqo:A 1804 69 0.0977 0.0144 0.3768 2.1 6eqo:B
83 7wzf:A 243 111 0.1353 0.1481 0.3243 2.2
84 6hp2:A 297 87 0.0865 0.0774 0.2644 2.3
85 4obw:D 235 88 0.0977 0.1106 0.2955 2.5 4obw:A, 4obw:C, 4obw:B
86 3mq2:A 215 80 0.0865 0.1070 0.2875 2.6 3mq2:B
87 5i2h:A 335 126 0.1316 0.1045 0.2778 2.8 5i2h:B
88 8hkr:B 384 47 0.0526 0.0365 0.2979 2.9 8hkr:A
89 6dnz:A 317 50 0.0602 0.0505 0.3200 3.0 6dnz:C
90 7wzg:B 243 110 0.1053 0.1152 0.2545 3.1 7wzg:A, 7wzg:C, 7wzg:D, 7wzg:E, 7wzg:F
91 7rbq:A 614 69 0.0677 0.0293 0.2609 3.3 7t39:A
92 4o29:A 207 96 0.0865 0.1111 0.2396 3.6
93 1sg9:A 274 47 0.0526 0.0511 0.2979 4.0 1nv8:A, 1nv8:B, 1nv9:A, 1sg9:B, 1sg9:C, 1vq1:A, 1vq1:B
94 4qtu:B 191 110 0.1015 0.1414 0.2455 4.2 4qtu:D
95 8pjd:A 347 68 0.0677 0.0519 0.2647 4.2 8bva:A, 8c1j:A, 5ful:A, 5fwa:A, 5fwd:A, 5jmq:A
96 8i4q:A 479 52 0.0752 0.0418 0.3846 4.3 8i4q:B
97 6ecx:A 283 79 0.0677 0.0636 0.2278 5.1 6ect:A
98 2jae:A 478 114 0.1241 0.0690 0.2895 5.5 2jae:B, 2jb1:A, 2jb1:B, 2jb2:A, 2jb2:B, 2jb3:A, 2jb3:B
99 5w7m:A 273 93 0.0902 0.0879 0.2581 5.6
100 1hro:A 105 33 0.0489 0.1238 0.3939 6.0 1hro:B
101 6i6m:B 357 150 0.1316 0.0980 0.2333 8.2 6i5z:A, 6i5z:B, 6i5z:D, 6i6k:A, 6i6k:B, 6i6l:A, 6i6l:B, 6i6m:A, 6i6n:A, 6i6n:B
102 4oqd:C 241 50 0.0714 0.0788 0.3800 8.3 6m81:A, 6m81:B, 6m81:C, 6m81:D, 6m82:A, 6m83:A, 4oqd:A, 4oqd:B, 4oqd:D, 4oqe:A, 4oqe:B, 3pfg:A, 3pfh:A, 3pfh:D, 3px2:A, 3px2:D, 3px3:A, 3px3:D
103 7clf:A 335 131 0.1165 0.0925 0.2366 8.9 7clf:B
104 1f3l:A 321 51 0.0564 0.0467 0.2941 9.9 2fyt:A, 8g2f:A, 8g2g:A, 8g2g:B, 4hsg:A, 4qqn:A, 4ryl:A, 8shb:A, 8shr:A, 8sio:A, 8sio:B, 3smq:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218