BioLiP

>protein
FESVALIIGVTGIVGNSLAEILPLSDTPGGPWKVYGVARRPRPTWNADHPIDYIQCDVSDAEDTRSKLSPLTDVTHVFYV
TWTNRESESENCEANGSMLRNVLQAIIPYAPNLRHVCLQTGTKHYLGPFTNVDGPRHDPPFTEDMPRLQIQNFYYTQEDI
LFEEIKKIETVTWSIHRPNMIFGFSPYSLMNIVGTLCVYAAICKHEGSPLLFPGSKKAWEGFMTASDADLIAEQQIWAAV
DPYAKNEAFNCNNADIFKWKHLWKILAEQFGIEEYGFEEGKNLGLVEMMKGKERVWEEMVKENQLQEKKLEEVGVWWFAD
VILGVEGMIDSMNKSKEYGFLGFRNSNNSFISWIDKYKAFKIVP

The query sequence (length=364) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6el3:A	364	364	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	6el3:B, 6el3:C, 6el3:D, 6el3:E, 6el3:F
2	6gsd:A	364	363	0.7060	0.7060	0.7080	0.0	5mlh:A, 5mlm:A, 5mlr:A
3	2v6g:A	364	363	0.6978	0.6978	0.6997	0.0
4	5dcy:A	366	368	0.5989	0.5956	0.5924	1.34e-166	5cob:A, 5cob:B, 5cob:C, 5cob:D, 5dbf:A, 5dbf:B, 5dbg:A, 5dbg:B, 5dbi:A, 5dbi:B, 5dcu:A, 5dcu:B, 5dcy:B, 5df1:A, 5df1:B, 5emh:A
5	7xrx:A	398	47	0.0522	0.0477	0.4043	1.6	7xrx:B, 7xrx:C
6	8g9v:E	293	41	0.0440	0.0546	0.3902	4.0	8g9v:A, 8g9v:B, 8g9v:C, 8g9v:D, 8g9v:F, 8g9v:G, 8g9v:H
7	4ha9:A	219	62	0.0440	0.0731	0.2581	4.9
8	5ex0:A	429	73	0.0604	0.0513	0.3014	7.1	7bj1:A, 5ccl:A, 5ccm:A, 5ex3:A, 5hi7:A, 5hq8:A, 5hq8:B, 6ijl:A, 3mek:A, 7o2a:A, 7o2b:A, 7o2c:A, 6o9o:A, 8owo:A, 3oxf:A, 3oxf:B, 3oxg:A, 3oxl:A, 6p6g:A, 6p6k:A, 6p7z:A, 6paf:A, 3pdn:A, 7qlb:A, 7qnr:A, 7qnu:A, 3qwp:A, 3ru0:A, 3ru0:B, 5v37:A, 5xxd:A, 5xxg:A, 5xxj:A, 5yjo:A, 6yuh:A, 6zrb:A
9	1l0y:D	221	59	0.0495	0.0814	0.3051	8.6	1ha5:A, 1ha5:B, 1ha5:C, 1ha5:D, 1l0y:B, 1uup:A, 1uup:B, 1uup:C, 1uup:D
10	5uzh:A	345	37	0.0467	0.0493	0.4595	8.9
11	6ltb:A	928	74	0.0604	0.0237	0.2973	9.7	6ltc:A, 6ltd:A, 6ltd:B

[Back]