Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
FAQYNQVYSTDAANFEHVDHYLTAESWYRPKYILKDGKTWTQSTEKDFRPLLMTWWPDQETQRQYVNYMNAQLGIHQTYN
TATSPLQLNLAAQTIQTKIEEKITAEKNTNWLRQTISAFVKTQSAWNSDSEKPFDDHLQKGALLYSNNSKLTSQANSNYR
ILNRTPTNQTGKKDPRYTADRTIGGYEFLLANDVDNSNPVVQAEQLNWLHFLMNFGNIYANDPDANFDSIRVDAVDNVDA
DLLQIAGDYLKAAKGIHKNDKAANDHLSILEAWSYNDTPYLHDDGDNMINMDNRLRLSLLYSLAKPLNQRSGMNPLITNS
LVNRTDDNAETAAVPSYSFIRAHDSEVQDLIRDIIKAEINPNVVGYSFTMEEIKKAFEIYNKDLLATEKKYTHYNTALSY
ALLLTNKSSVPRVYYGDMFTDDGQYMAHKTINYEAIETLLKARIKYVSGGQAMRNQQVGNSEIITSVRYGKGALKATDTG
DRITRTSGVVVIEGNNPSLRLKASDRVVVNMGAAHKNQAYRPLLLTTDNGIKAYHSDQEAAGLVRYTNDRGELIFTAADI
KGYANPQVSGYLGVWVPVGAAADQDVRVAASTAPSTDGKSVHQNAALDSRVMFEGFSNFQAFATKKEEYTNVVIAKNVDK
FAEWGVTDFEMAPQYVSSTDGSFLDSVIQNGYAFTDRYDLGISKPNKYGTADDLVKAIKALHSKGIKVMADWVPDQMYAL
PEKEVVTATRVDKYGTPVAGSQIKNTLYVVDGKSSGKDQQAKYGGAFLEELQAKYPELFARKQISTGVPMDPSVKIKQWS
AKYFNGTNILGRGAGYVLKDQATNTYFSLVSDNTFLPKSLVNP

The query sequence (length=843) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3aib:G 844 843 1.0000 0.9988 1.0000 0.0 3aib:A, 3aib:B, 3aib:C, 3aib:D, 3aib:E, 3aib:F, 3aib:H, 3aic:A, 3aic:B, 3aic:C, 3aic:D, 3aic:E, 3aic:F, 3aic:G, 3aic:H, 3aie:A, 3aie:B, 3aie:C, 3aie:D, 3aie:E, 3aie:F, 3aie:G, 3aie:H, 8fg8:A, 8fg8:B, 8fj9:A, 8fj9:B, 8fjc:A, 8fjc:B, 8fk4:A, 8fk4:B, 8fk4:C, 8fk4:D, 8fk4:E, 8fk4:F, 8fk4:G, 8fk4:H, 8uf5:A, 8uf5:B
2 4amc:A 1019 858 0.5136 0.4249 0.5047 0.0
3 6hvg:A 1278 906 0.5469 0.3607 0.5088 0.0 6hvg:B, 6syq:A, 6syq:B, 6szi:A, 6szi:B, 6t16:B, 6t16:A, 6t18:A, 6t18:B, 6t1p:A, 6t1p:B
4 5ngy:A 1265 894 0.5386 0.3589 0.5078 0.0 6htv:A, 5lfc:A, 5lfc:B, 5ngy:B, 5o8l:A
5 4ayg:A 1028 849 0.5136 0.4212 0.5100 0.0 4ayg:B, 3hz3:A, 3klk:A, 3kll:A
6 3tto:A 1055 889 0.4899 0.3915 0.4646 0.0 3tto:B, 3tto:C, 3tto:D, 3ttq:A, 4ttu:A, 4tvc:A, 4tvd:A
7 7p38:A 832 854 0.4021 0.4075 0.3970 0.0 8hw3:A, 8hw3:B, 8hwk:A, 8hwk:B, 7p38:B, 7p39:A, 7p39:B
8 5jbd:B 855 872 0.4104 0.4047 0.3968 0.0 5jbd:A, 5jbe:A, 5jbe:B, 5jbf:A, 5jbf:B
9 7dt1:A 846 875 0.3986 0.3972 0.3840 2.36e-176 7dt1:B
10 7zc0:AAA 710 411 0.1625 0.1930 0.3333 3.05e-51
11 7zc0:AAA 710 259 0.0985 0.1169 0.3205 2.13e-24
12 1bli:A 481 335 0.0925 0.1622 0.2328 1.91e-11 1ob0:A, 6toy:A, 6toz:A, 6tp0:A, 6tp1:A, 6tp2:A
13 1bli:A 481 97 0.0403 0.0707 0.3505 6.34e-04 1ob0:A, 6toy:A, 6toz:A, 6tp0:A, 6tp1:A, 6tp2:A
14 3bh4:A 483 310 0.0842 0.1470 0.2290 1.96e-09 3bh4:B, 1e3x:A, 1e3z:A, 1e40:A, 1e43:A
15 3bh4:A 483 106 0.0380 0.0663 0.3019 0.010 3bh4:B, 1e3x:A, 1e3z:A, 1e40:A, 1e43:A
16 6gxv:A 481 352 0.0878 0.1538 0.2102 1.05e-06 6gxv:B, 6gya:A, 6gya:B, 6gya:C, 6gya:D
17 6gxv:A 481 67 0.0273 0.0478 0.3433 0.048 6gxv:B, 6gya:A, 6gya:B, 6gya:C, 6gya:D
18 6ag0:C 483 304 0.0890 0.1553 0.2467 1.98e-05 6ag0:A, 1hvx:A, 4uzu:A
19 6ag0:C 483 104 0.0356 0.0621 0.2885 0.026 6ag0:A, 1hvx:A, 4uzu:A
20 2d3l:A 481 321 0.0890 0.1559 0.2336 4.39e-05 2d3n:A, 1wp6:A, 1wpc:A
21 2d3l:A 481 67 0.0273 0.0478 0.3433 0.87 2d3n:A, 1wp6:A, 1wpc:A
22 1ud2:A 480 277 0.0700 0.1229 0.2130 9.37e-05 1ud3:A, 1ud4:A, 1ud5:A, 1ud8:A
23 2gjp:A 481 282 0.0759 0.1331 0.2270 3.41e-04 2gjr:A, 1w9x:A
24 2die:A 481 278 0.0724 0.1268 0.2194 7.87e-04
25 2die:A 481 68 0.0273 0.0478 0.3382 0.53
26 5e6y:C 584 127 0.0427 0.0616 0.2835 0.001 5e6z:C, 5e70:C, 4lpc:C
27 3bsg:A 404 102 0.0415 0.0866 0.3431 0.002 3bsh:A, 1ht6:A, 1p6w:A, 2qps:A, 2qpu:B, 2qpu:A, 2qpu:C, 1rp8:A, 1rp9:A, 1rpk:A
28 8sdb:C 604 94 0.0356 0.0497 0.3191 0.002 5e6y:A, 5e6y:B, 5e6y:D, 5e6z:A, 5e6z:B, 5e6z:D, 5e70:A, 5e70:B, 5e70:D, 4lpc:A, 4lpc:B, 4lpc:D, 4lq1:B, 4lq1:C, 4lq1:D, 4lq1:A, 8sdb:A, 8sdb:B
29 1amy:A 403 102 0.0415 0.0868 0.3431 0.002 1ava:A, 1ava:B, 1bg9:A
30 1amy:A 403 76 0.0297 0.0620 0.3289 2.5 1ava:A, 1ava:B, 1bg9:A
31 3wn6:A 404 102 0.0403 0.0842 0.3333 0.004 3wn6:B, 3wn6:C, 3wn6:D
32 3wn6:A 404 61 0.0237 0.0495 0.3279 0.68 3wn6:B, 3wn6:C, 3wn6:D
33 8jjm:A 484 276 0.0688 0.1198 0.2101 0.008 8jjm:B
34 6k5p:A 531 117 0.0391 0.0621 0.2821 0.031 6k5p:B, 6k5p:C, 6k5p:D
35 3bc9:A 585 285 0.0819 0.1179 0.2421 0.038 3bcd:A, 3bcf:A
36 3bc9:A 585 101 0.0368 0.0530 0.3069 0.54 3bcd:A, 3bcf:A
37 5m99:A 506 51 0.0249 0.0415 0.4118 0.049 5m99:B
38 5gqv:A 755 73 0.0261 0.0291 0.3014 0.049 5gqx:A, 5gqy:A, 5gr1:A, 5gr4:A
39 2aaa:A 476 32 0.0178 0.0315 0.4688 0.092
40 6lga:A 570 83 0.0261 0.0386 0.2651 0.12 6lga:B, 6lgb:A, 6lgb:B, 6lgc:A, 6lgc:B, 6lgd:A, 6lgd:B, 6lge:A, 6lge:B, 6lgf:A, 6lgf:B, 6lgg:A, 6lgg:B, 6lgh:A, 6lgh:B, 6lgi:A, 6lgi:B
41 2taa:A 478 47 0.0249 0.0439 0.4468 0.14 2guy:A, 2gvy:A, 2gvy:B, 3kwx:A, 7p4w:A, 2taa:B, 2taa:C, 6taa:A, 7taa:A, 3vx0:A, 3vx1:A, 6xsj:A, 6xsj:B, 6xsv:A, 6yq7:A, 6yq7:B, 6yq9:AAA, 6yq9:BBB, 6yqa:AAA, 6yqa:BBB, 6yqb:AAA, 6yqb:BBB, 6yqc:AAA, 6yqc:BBB
42 6smo:E 352 89 0.0308 0.0739 0.2921 0.23 6smo:C, 6smp:C, 6smp:F, 6smp:I, 6smp:L
43 7p01:A 572 129 0.0427 0.0629 0.2791 0.26 7p01:B, 7p07:A, 7p07:B
44 1cyg:A 680 34 0.0178 0.0221 0.4412 0.31
45 5ot1:A 572 84 0.0273 0.0402 0.2738 0.34
46 2x3l:B 423 122 0.0368 0.0733 0.2541 0.34 2x3l:A
47 1jda:A 418 72 0.0297 0.0598 0.3472 0.41 2amg:A, 1gcy:A, 6iwk:A, 6iyg:A, 6j3x:A, 1jdc:A, 1jdd:A, 6jqb:A, 1qi3:A, 1qi4:A, 1qi5:A, 1qpk:A
48 1wza:A 488 42 0.0214 0.0369 0.4286 0.63
49 8xx9:A 620 80 0.0261 0.0355 0.2750 0.63 8xxa:A
50 8uzh:B 626 52 0.0214 0.0288 0.3462 0.74 4lxf:A, 8uqv:A, 8uqv:B, 8uqv:C, 8uqv:D, 8uzh:A
51 4lxf:B 546 52 0.0214 0.0330 0.3462 0.78
52 6sau:B 442 75 0.0273 0.0520 0.3067 0.88 6sau:A
53 2ze0:A 531 80 0.0273 0.0433 0.2875 0.92
54 5jy7:B 571 52 0.0214 0.0315 0.3462 0.95 5jy7:A, 5jy7:C, 5jy7:D, 5jy7:E, 5jy7:F, 5jy7:G, 5jy7:H, 3zo9:A, 3zo9:B, 3zoa:B, 3zoa:A
55 7u3d:C 677 93 0.0285 0.0355 0.2581 1.0
56 7u3b:C 696 93 0.0285 0.0345 0.2581 1.0 7u3a:A, 7u3a:B, 7u3a:C, 7u3a:D, 7u3b:H, 7u3b:D, 7u3b:F, 7u3b:E, 7u3b:I, 7u3b:G, 7u3b:J, 7u3d:B, 7u3d:F, 7u3d:A
57 6li9:A 623 50 0.0178 0.0241 0.3000 1.1 6li9:C, 6lid:A, 6lid:C, 6yup:A, 6yup:C, 6yuz:A, 6yuz:C
58 1mxd:A 435 46 0.0202 0.0391 0.3696 1.3 1mwo:A, 1mxg:A
59 5zcr:A 725 82 0.0249 0.0290 0.2561 1.3 5zcr:B
60 5a2a:A 452 80 0.0249 0.0465 0.2625 1.9 5a2b:A, 5a2c:A
61 7s3d:A 749 147 0.0403 0.0454 0.2313 2.0 7s3d:G, 7s3d:a
62 7nf6:A 623 29 0.0119 0.0161 0.3448 2.4 7nf7:A, 7nf8:A
63 6ibl:A 397 61 0.0178 0.0378 0.2459 2.6 5a8e:A, 4ami:A, 4ami:B, 4amj:A, 4amj:B, 4bvn:A, 8dcr:R, 8dcs:R, 2eiq:A, 2eiq:B, 2eir:A, 2eir:B, 2eir:C, 2eir:D, 5f8u:B, 5f8u:A, 6h7j:A, 6h7j:B, 6h7l:A, 6h7l:B, 6h7m:A, 6h7m:B, 6h7n:A, 6h7n:B, 6h7o:A, 6h7o:B, 5hr0:A, 5hr0:B, 5hr1:D, 5hr2:A, 4hu7:A, 4hu7:B, 4hu9:A, 4hua:A, 6ibl:B, 7jjo:R, 1keb:A, 1keb:B, 7s0f:R, 7s0g:R, 1tho:A, 6tko:A, 2trx:A, 2trx:B, 1txx:A, 2vt4:A, 2vt4:B, 2vt4:C, 2vt4:D, 2y00:A, 2y00:B, 2y01:A, 2y01:B, 2y02:A, 2y02:B, 2y03:A, 2y03:B, 2y04:A, 2y04:B, 2ycw:A, 2ycw:B, 2ycx:A, 2ycx:B, 2ycy:A, 2ycy:B, 2ycz:A, 2ycz:B, 3zpq:A, 3zpq:B, 3zpr:A, 3zpr:B
64 5brp:A 555 44 0.0190 0.0288 0.3636 3.0 5brp:B, 5brp:C, 5brp:D, 5brq:A, 5brq:B, 5brq:C, 5brq:D
65 7oro:A 2008 92 0.0297 0.0125 0.2717 3.1 7ori:A
66 7orj:A 2129 92 0.0297 0.0117 0.2717 3.1
67 7orl:A 2183 92 0.0297 0.0115 0.2717 3.2 7oa4:AAA, 7oa4:BBB, 7oa4:DDD, 7oa4:GGG, 7ork:A, 7plr:AAA, 7plr:BBB, 7plr:DDD, 7plr:GGG, 2xi5:A, 2xi5:B, 2xi5:C, 2xi5:D, 2xi7:A, 2xi7:B, 2xi7:C, 2xi7:D
68 6z6b:PPP 2036 92 0.0297 0.0123 0.2717 3.4 6z6b:EEE
69 7orm:A 2145 92 0.0297 0.0117 0.2717 3.4
70 1fdj:A 363 48 0.0202 0.0468 0.3542 3.4 1fdj:B
71 6z6g:A 2142 92 0.0297 0.0117 0.2717 3.4 5amr:A
72 6z8k:A 2158 92 0.0297 0.0116 0.2717 3.5 5amq:A, 7orn:A
73 8ibk:A 546 81 0.0261 0.0403 0.2716 3.8 8ids:A, 5zcb:A, 5zcc:A, 5zcd:A, 5zce:A
74 1cgt:A 684 55 0.0214 0.0263 0.3273 4.3 1cgu:A, 3cgt:A, 4cgt:A, 5cgt:A, 6cgt:A, 7cgt:A, 8cgt:A, 9cgt:A
75 6c4m:C 418 82 0.0285 0.0574 0.2927 4.4
76 7bvq:A 455 76 0.0237 0.0440 0.2632 4.5 7bts:A, 7bu6:A, 7bu7:A, 7bvq:B
77 1v9t:B 166 73 0.0261 0.1325 0.3014 5.0 1vai:B
78 6y9t:A 536 80 0.0249 0.0392 0.2625 6.5 6y9t:B
79 7lv6:B 559 44 0.0166 0.0250 0.3182 7.0 4m56:A, 4m56:B, 4m8u:A, 4maz:A, 4mb1:A, 5wcz:A, 5wcz:B
80 1cdg:A 686 29 0.0154 0.0190 0.4483 7.2 1cgv:A, 1cgw:A, 1cgx:A, 1cgy:A, 1cxe:A, 1cxf:A, 1cxh:A, 1cxi:A, 1cxk:A, 1cxl:A, 2cxg:A, 1d3c:A, 2dij:A, 1dtu:A, 1eo5:A, 1eo7:A, 1kck:A, 1kcl:A, 1ot1:A, 1ot2:A, 1pez:A, 1pj9:A, 1tcm:A, 1tcm:B
81 7pxc:E 483 264 0.0735 0.1284 0.2348 7.6 7px9:A, 7px9:B, 7px9:C, 7px9:E, 7px9:F, 7pxb:A, 7pxb:B, 7pxb:C, 7pxb:E, 7pxb:F, 7pxc:B, 7pxc:C, 7pxc:F, 7pxc:A, 7pxd:B, 7pxd:C, 7pxd:E, 7pxd:F, 7pxd:A
82 2k7f:A 109 43 0.0178 0.1376 0.3488 8.0
83 1ofh:A 309 55 0.0249 0.0680 0.3818 8.3 1ofh:B, 1ofh:C, 1ofi:A, 1ofi:B, 1ofi:C
84 8jbr:A 1023 89 0.0344 0.0283 0.3258 8.3
85 4lim:A 381 80 0.0225 0.0499 0.2375 8.6
86 7jjt:A 513 26 0.0142 0.0234 0.4615 9.7
87 6sao:A 438 29 0.0154 0.0297 0.4483 9.7

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218