BioLiP

>protein
EYYEVFGEFRGVLMDKRFTKYWEDVEMFLARPDDLVIATYPKSGTTWISEVVYMIYKEGDAIFNRIPYLECRNEDLINGI
KQLKEKESPRIVKTHLPPKLLPASFWEKNCKMIYLCRNAKDVAVSYYYFLLMITSYPNPKSFSEFVEKFMQGQVPYGSWY
DHVKAWWEKSKNSRVLFMFYEDMKEDIRREVVKLIEFLERKPSAELVDRIIQHTSFQEMKNNPSTNYTMMPEEMMNQKVS
PFMRKGIIGDWKNHFPEALRERFDEHYKQQMKDCTVKFRME

The query sequence (length=281) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1aqy:A	283	283	1.0000	0.9929	0.9929	0.0	1aqu:A, 1aqu:B, 1aqy:B, 1bo6:A, 1bo6:B
2	4jvl:A	292	288	0.7794	0.7500	0.7604	1.28e-169	1g3m:A, 1g3m:B, 1hy3:A, 1hy3:B, 4jvl:B, 4jvm:A, 4jvm:B, 4jvn:A, 4jvn:B
3	2zyt:X	291	281	0.5231	0.5052	0.5231	8.11e-108	2zpt:X, 2zvp:X, 2zvq:X, 2zyu:X, 2zyv:X, 2zyw:X
4	3ckl:B	296	280	0.5231	0.4966	0.5250	1.52e-103	3ckl:A, 2z5f:A, 2z5f:B
5	3u3k:A	289	279	0.4911	0.4775	0.4946	3.79e-102	2a3r:A, 2a3r:B, 2d06:A, 2d06:B, 4gra:A, 4gra:B, 1ls6:A, 3qvu:A, 3qvu:B, 3qvv:A, 3qvv:B, 3u3j:A, 3u3j:B, 3u3k:B, 3u3m:A, 3u3o:A, 3u3r:A, 1z28:A, 1z29:A
6	2gwh:B	288	279	0.4591	0.4479	0.4624	3.04e-93	2gwh:A
7	2h8k:A	245	260	0.4199	0.4816	0.4538	9.48e-84	2h8k:B, 2reo:A
8	3bfx:A	253	274	0.4270	0.4743	0.4380	7.59e-83	3bfx:B
9	1q20:A	294	250	0.3274	0.3129	0.3680	1.03e-63	1q1q:A, 1q1z:A, 1q22:A
10	1j99:A	284	253	0.3488	0.3451	0.3874	8.89e-61	1efh:A, 1efh:B, 3f3y:A, 3f3y:B, 3f3y:C, 3f3y:D, 4ifb:A, 4ifb:B, 1ov4:A, 2qp3:A, 2qp4:A
11	7v1o:A	288	265	0.3238	0.3160	0.3434	1.82e-58	7v1o:B
12	5x2b:L	283	255	0.3132	0.3110	0.3451	6.08e-48	5x2b:C, 5x2b:A, 5x2b:B, 5x2b:D, 5x2b:E, 5x2b:F, 5x2b:G, 5x2b:H, 5x2b:I, 5x2b:J, 5x2b:K
13	7eov:A	274	253	0.3096	0.3175	0.3439	3.32e-47	7d1x:A, 7d1x:B
14	7r0s:A	336	295	0.3132	0.2619	0.2983	6.16e-40	7r0s:B, 7r0u:A, 7r0u:B
15	1x8k:A	344	309	0.2989	0.2442	0.2718	2.02e-32	1fmj:A, 1fmj:B, 1fml:A, 1fml:B, 1x8j:A, 1x8j:B, 1x8k:B, 1x8l:A, 1x8l:B
16	8k9y:A	322	271	0.2633	0.2298	0.2731	3.34e-28	8k9y:B
17	5mek:A	322	271	0.2740	0.2391	0.2841	1.22e-25	5mex:A
18	3mg9:A	255	201	0.2064	0.2275	0.2886	3.83e-15	3mgc:A
19	3mgb:A	286	241	0.2313	0.2273	0.2697	4.65e-12	3mgb:B
20	4eec:A	253	199	0.1708	0.1897	0.2412	1.71e-07	2ovb:A, 2ovf:A
21	4n0w:A	416	169	0.1423	0.0962	0.2367	0.24	4n0w:B, 4n0w:C, 4n0w:D, 4ot8:A, 4ot8:C, 4ot8:B, 4ot8:D, 4otl:A, 4otl:B, 4otl:D, 4otl:C
22	3ci0:K	280	21	0.0391	0.0393	0.5238	4.6
23	7poa:A	398	97	0.0996	0.0704	0.2887	5.0	7poa:B, 7pob:A, 7pob:D, 7pob:B, 7pob:C, 7poc:A, 7poc:D, 7poc:B, 7poc:C
24	5csl:B	2072	203	0.1530	0.0208	0.2118	8.4	5ctb:A, 5ctb:C, 5ctc:A, 5ctc:B, 5ctc:C, 5cte:B, 5cte:C, 3h0s:A, 3k8x:A, 3k8x:B, 3k8x:C, 1od2:A, 1od2:B, 3pgq:A, 3pgq:C, 3tv5:A, 3tv5:B, 3tv5:C, 3tvu:A, 3tvu:B, 3tvu:C, 3tvw:A, 3tvw:B, 3tvw:C, 3tz3:A, 3tz3:B, 3tz3:C, 1w96:A, 1w96:B, 1w96:C, 4wyo:B, 4wyo:C, 4wz8:B, 4wz8:C

[Back]