Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
EYKTKVSRNSNMSKLQAGYLFPEIARRRSAHLLKYPDAQVISLGIGDTTEPIPEVITSAMAKKAHELSTIEGYSGYGAEQ
GAKPLRAAIAKTFYGGLGIGDDDVFVSDGAKCDISRLQVMFGSNVTIAVQDPSYPAYVDSSVIMGQTGQFNTDVQKYGNI
EYMRCTPENGFFPDLSTVGRTDIIFFCSPNNPTGAAATREQLTQLVEFAKKNGSIIVYDSAYAMYMSDDNPRSIFEIPGA
EEVAMETASFSKYAGFTGVRLGWTVIPKKLLYSDGFPVAKDFNRIICTCFNGASNISQAGALACLTPEGLEAMHKVIGFY
KENTNIIIDTFTSLGYDVYGGKNAPYVWVHFPNQSSWDVFAEILEKTHVVTTPGSGFGPGGEGFVRVSAFGHRENILEAC
RRFKQLYKHHH

The query sequence (length=411) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 3ei9:A 412 411 0.9976 0.9951 0.9976 0.0 3ei5:A, 3ei5:B, 3ei6:A, 3ei6:B, 3ei8:A, 3ei8:B, 3ei9:B, 3eia:A, 3eia:B, 3eib:A, 3eib:B, 2z1z:A, 2z1z:B, 2z20:A, 2z20:B
2 3qgu:A 406 403 0.6691 0.6773 0.6824 0.0
3 4fl0:B 409 404 0.6229 0.6259 0.6337 0.0 4fl0:A
4 6l1l:B 393 387 0.2774 0.2901 0.2946 1.88e-30 6l1l:A, 6l1n:A, 6l1n:B, 6l1o:B, 6l1o:A
5 2x5d:D 380 398 0.2360 0.2553 0.2437 4.53e-25 2x5d:A
6 1gd9:A 388 382 0.2384 0.2526 0.2565 3.05e-22 1dju:A, 1dju:B, 1gd9:B, 1gde:A, 1gde:B
7 1o4s:B 384 374 0.2457 0.2630 0.2701 3.27e-19 1o4s:A
8 2o1b:A 376 384 0.2141 0.2340 0.2292 9.50e-18
9 3jtx:B 393 399 0.2287 0.2392 0.2356 4.20e-17
10 5yhv:A 394 381 0.2311 0.2411 0.2493 1.46e-16 5yhv:B, 5yhv:C, 5yhv:D
11 1b5o:A 382 390 0.2311 0.2487 0.2436 9.60e-16 1b5o:B, 1b5p:A, 1b5p:B, 1bjw:A, 1bjw:B, 5bj3:A, 5bj3:B, 5bj3:C, 5bj3:D, 5bj4:A, 5bj4:B, 1bkg:A, 1bkg:B, 1bkg:C, 1bkg:D, 1gc3:A, 1gc3:B, 1gc3:C, 1gc3:D, 1gc3:E, 1gc3:F, 1gc3:G, 1gc3:H, 1gc4:A, 1gc4:B, 1gc4:C, 1gc4:D, 1gck:A, 1gck:B
12 1v2e:A 368 344 0.1922 0.2147 0.2297 2.77e-15 1v2d:A, 1v2e:B, 1v2f:A, 1v2f:B
13 1j32:A 388 395 0.2311 0.2448 0.2405 1.62e-14 1j32:B
14 1xi9:C 393 400 0.2652 0.2774 0.2725 1.65e-14 1xi9:A, 1xi9:B, 1xi9:D
15 4cvq:A 404 253 0.1533 0.1559 0.2490 6.38e-13 4cvq:B
16 3ele:A 398 415 0.2190 0.2261 0.2169 8.47e-13 3ele:B, 3ele:C, 3ele:D
17 6qp3:A 387 229 0.1363 0.1447 0.2445 4.66e-11 6qp3:B, 6qp3:C, 6qp3:D
18 1u08:A 382 366 0.1873 0.2016 0.2104 4.87e-11 1u08:B
19 5wml:A 404 392 0.2117 0.2153 0.2219 5.70e-11 6f5v:A, 6f5v:B, 6f5v:C, 6f5v:D, 5wmh:A, 5wmh:B, 5wmh:C, 5wmh:D, 5wmh:E, 5wmh:F, 5wmi:A, 5wml:B
20 6f77:A 399 415 0.2555 0.2632 0.2530 1.98e-10 6f77:C, 6f77:D, 6f77:E, 6f77:F
21 3dyd:A 388 410 0.2360 0.2500 0.2366 3.58e-10 3dyd:B
22 6f35:A 400 402 0.2263 0.2325 0.2313 5.26e-10 6f35:B
23 2zc0:A 405 406 0.2530 0.2568 0.2562 9.23e-09 2zc0:B, 2zc0:C, 2zc0:D
24 8ffu:A 360 192 0.1022 0.1167 0.2188 1.79e-08 8fft:A, 8fft:B, 8fft:C, 8fft:D, 8ffu:B, 8ffu:C, 8ffu:D
25 4m2j:A 382 214 0.1460 0.1571 0.2804 4.87e-08 4m2k:A, 4m2m:A
26 8wkj:A 391 386 0.2190 0.2302 0.2332 5.08e-08
27 3aov:A 404 315 0.1679 0.1708 0.2190 6.60e-08 3aov:C, 3aow:A, 3aow:C, 3ath:A, 3ath:C, 3av7:A, 3av7:C, 3wx9:A, 3wx9:C
28 8juj:B 380 409 0.2092 0.2263 0.2103 1.35e-07 8juj:A
29 3tcm:A 479 401 0.2433 0.2088 0.2494 3.06e-07 3tcm:B
30 1vp4:A 420 400 0.2287 0.2238 0.2350 4.86e-07 1vp4:B
31 2zyj:A 397 353 0.1922 0.1990 0.2238 1.39e-06 3cbf:A, 3cbf:B, 2egy:A, 2egy:B, 2egy:C, 2egy:D, 2z1y:A, 2z1y:B, 2zp7:A, 2zp7:C, 2zp7:B, 2zp7:D, 2zp7:E, 2zp7:F, 2zyj:B
32 4r2n:A 353 92 0.0754 0.0878 0.3370 2.69e-06 4r2n:C, 4r2n:B, 4r2n:D, 4r5z:A, 4r5z:B, 4r5z:C, 4r5z:D
33 3fvs:B 419 242 0.1338 0.1313 0.2273 3.23e-06 3fvu:A, 3fvu:B, 1w7l:A, 1w7m:A, 1w7n:A, 4wlj:A, 4wlj:B
34 3b1c:A 387 416 0.2117 0.2248 0.2091 3.97e-06 3b1c:B, 3b1c:C, 3b1c:D, 3b1d:A, 3b1d:B, 3b1d:C, 3b1d:D, 3b1e:A, 3b1e:B, 3b1e:C, 3b1e:D
35 3e2y:A 410 246 0.1265 0.1268 0.2114 1.19e-05 3e2y:B, 3e2z:A, 3e2z:B, 5vep:A, 5veq:A, 5veq:B, 5ver:A, 5ver:B
36 4r8d:A 369 216 0.1217 0.1355 0.2315 1.91e-05 4r8d:B
37 6ezl:A 392 170 0.1168 0.1224 0.2824 3.16e-05 6ezl:B
38 7rf9:A 381 225 0.1241 0.1339 0.2267 9.32e-05 7rf9:B, 7rf9:C, 7rf9:D, 7rgb:A, 7rgb:B, 7rgb:C, 7rgb:D
39 2r5c:B 419 93 0.0657 0.0644 0.2903 1.19e-04 2r5e:A, 2r5e:B, 1yiy:A, 1yiy:B
40 3ly1:D 354 85 0.0633 0.0734 0.3059 1.24e-04 3ly1:A, 3ly1:B, 3ly1:C
41 4dq6:A 388 296 0.1582 0.1675 0.2196 1.50e-04 4dgt:A, 4dgt:B, 4dq6:B
42 2f8j:A 335 153 0.0973 0.1194 0.2614 2.24e-04 2f8j:B, 2f8j:C, 2f8j:D, 1h1c:A, 1h1c:B, 1h1c:C, 1h1c:D, 1uu0:A, 1uu0:B, 1uu0:C, 1uu0:D, 1uu1:A, 1uu1:B, 1uu1:C, 1uu1:D, 1uu2:A, 1uu2:B
43 5bk7:H 369 109 0.0608 0.0678 0.2294 3.36e-04 5bk7:A, 5bk7:B, 5bk7:C, 5bk7:D, 5bk7:E, 5bk7:F, 5bk7:G, 6c8t:A, 6c8t:B, 6c8t:C, 6c92:A, 6c92:B, 6c92:C, 6c92:D, 6c9b:B, 5dj3:A, 5dj3:B, 5dj3:C, 5dj3:D
44 7tur:B 414 356 0.1849 0.1836 0.2135 3.66e-04 1ajs:A, 1ajs:B, 6dnb:A, 6dnd:A, 6dnd:B, 6lig:A, 6lig:B, 7tur:A, 5vjz:A, 5vjz:B
45 3cq5:B 366 247 0.1338 0.1503 0.2227 5.24e-04 3cq5:A, 3cq5:C, 3cq6:A, 3cq6:C, 3cq6:E
46 2o0r:A 385 238 0.1460 0.1558 0.2521 7.61e-04 2o0r:B
47 1ay4:A 394 116 0.0754 0.0787 0.2672 0.001 1ay4:B, 1ay5:A, 1ay5:B, 1ay8:A, 1ay8:B, 2ay1:A, 2ay1:B, 2ay2:A, 2ay2:B, 2ay3:A, 2ay3:B, 2ay4:A, 2ay4:B, 2ay5:A, 2ay5:B, 2ay6:A, 2ay6:B, 2ay7:A, 2ay7:B, 2ay8:A, 2ay8:B, 2ay9:A, 2ay9:B
48 8bj3:A 360 88 0.0584 0.0667 0.2727 0.001 8bj3:B
49 1lc7:A 358 95 0.0657 0.0754 0.2842 0.001 1lc5:A, 1lc8:A, 1lkc:A
50 1yaa:A 412 101 0.0681 0.0680 0.2772 0.002 1yaa:B, 1yaa:C, 1yaa:D
51 6c3a:A 378 60 0.0438 0.0476 0.3000 0.002 6c3a:B, 6c3c:A, 6c3c:B, 6c3d:A, 6c3d:B
52 7dlw:B 419 398 0.2092 0.2053 0.2161 0.002 7dlw:A, 7dlw:C, 7dlw:D, 7dly:A, 7dly:B
53 7aat:A 401 102 0.0730 0.0748 0.2941 0.003 7aat:B, 8aat:A, 8aat:B, 9aat:A, 9aat:B, 1aka:A, 1aka:B, 1akb:A, 1akc:A, 1ama:A, 1ivr:A, 1map:A, 1maq:A, 1oxo:A, 1oxo:B, 1oxp:A, 1tar:A, 1tar:B, 1tas:A, 1tas:B, 1tat:A, 1tat:B
54 8bob:A 390 243 0.1119 0.1179 0.1893 0.004 8bob:B, 1d2f:A, 1d2f:B
55 8tn3:A 388 84 0.0657 0.0696 0.3214 0.007 8tn3:B, 7uky:A, 7uky:B
56 7szp:A 353 162 0.0852 0.0992 0.2160 0.008 7szp:B, 7szp:C, 7szp:D
57 4gdy:B 428 183 0.1071 0.1028 0.2404 0.009 4gdy:A, 4ge4:A, 4ge4:B, 4ge7:A, 4ge7:B, 4ge9:A, 4ge9:B, 4ge9:C, 4ge9:D, 4geb:A, 4geb:B, 2r2n:A, 2r2n:B, 2r2n:C, 2r2n:D, 6t8p:A, 6t8p:B, 6t8q:A, 5tf5:A, 5tf5:B, 3ue8:A, 3ue8:B, 2vgz:A, 2vgz:B, 2xh1:B, 2xh1:A
58 1b8g:B 425 297 0.1484 0.1435 0.2054 0.011 1b8g:A, 1m4n:A, 1m7y:A, 3piu:A, 1ynu:A
59 3if2:A 437 46 0.0438 0.0412 0.3913 0.011 3if2:B
60 4wbt:A 369 93 0.0608 0.0678 0.2688 0.016 4wbt:B, 4wbt:C
61 2x8u:A 399 58 0.0487 0.0501 0.3448 0.019 2x8u:B
62 5z0q:C 379 203 0.1022 0.1108 0.2069 0.021 5z0q:A, 5z0q:B, 5z0q:D, 5z0q:E, 5z0q:F, 5z0q:G, 5z0q:H, 5z0q:I, 5z0q:J, 5z0q:K, 5z0q:L
63 1c7n:A 394 251 0.1192 0.1244 0.1952 0.030 1c7n:B, 1c7n:C, 1c7n:D, 1c7n:E, 1c7n:F, 1c7n:G, 1c7n:H, 1c7o:A, 1c7o:B, 1c7o:C, 1c7o:D, 1c7o:E, 1c7o:F, 1c7o:G, 1c7o:H
64 3l8a:B 385 40 0.0365 0.0390 0.3750 0.030 3l8a:A
65 3ii0:C 407 265 0.1484 0.1499 0.2302 0.033 6dna:A, 6dna:B, 6dna:C, 6dna:D, 6dna:E, 6dna:F, 3ii0:A, 3ii0:B, 3ii0:D
66 1fg3:A 354 84 0.0584 0.0678 0.2857 0.055 1fg7:A, 1gew:A, 1gex:A, 1gey:A, 1iji:A
67 3ihj:A 461 369 0.1898 0.1692 0.2114 0.056
68 2zy4:F 535 82 0.0657 0.0505 0.3293 0.063 3fdd:A, 2zy3:A, 2zy3:B, 2zy3:C, 2zy3:D, 2zy3:E, 2zy3:F, 2zy4:A, 2zy4:B, 2zy4:C, 2zy4:D, 2zy4:E, 2zy5:A, 2zy5:B, 2zy5:C, 2zy5:D, 2zy5:E, 2zy5:F
69 6jpk:A 409 146 0.0827 0.0831 0.2329 0.065 6jpk:B
70 3meb:A 426 86 0.0560 0.0540 0.2674 0.070 3meb:B
71 4bmk:A 398 58 0.0438 0.0452 0.3103 0.091 4bmk:B, 2jg2:A, 2w8j:A, 2w8t:A, 2w8u:A, 2w8v:A, 2w8w:A, 2xbn:A
72 1iay:A 419 415 0.2336 0.2291 0.2313 0.091 1iax:A, 1iax:B
73 2zy2:A 521 107 0.0730 0.0576 0.2804 0.10
74 6hnu:B 480 161 0.0998 0.0854 0.2547 0.14 6hnu:A
75 3k7y:A 405 225 0.1168 0.1185 0.2133 0.14
76 3fsl:A 397 98 0.0706 0.0730 0.2959 0.15 3fsl:B, 3fsl:C, 3fsl:D, 3fsl:E, 3fsl:F, 3tat:A, 3tat:B, 3tat:C, 3tat:D, 3tat:E, 3tat:F
77 8skr:A 402 97 0.0560 0.0572 0.2371 0.23 3pd6:A, 3pd6:B, 3pd6:C, 3pdb:B, 3pdb:D, 8skr:C
78 7yeo:B 382 46 0.0438 0.0471 0.3913 0.26 7yeo:A
79 6m53:B 339 132 0.0876 0.1062 0.2727 0.27 7bp1:A, 7bp1:C, 7bp1:D, 7bpc:A, 7bpc:C, 6m53:A, 6m53:C, 6m53:D
80 2x5f:A 428 59 0.0487 0.0467 0.3390 0.38 2x5f:B
81 7qug:A 397 196 0.0925 0.0957 0.1939 0.47
82 2hox:B 427 87 0.0608 0.0585 0.2874 0.77 2hor:A, 2hox:C, 2hox:A, 2hox:D, 1lk9:B, 1lk9:A
83 7p8n:a 642 142 0.0949 0.0607 0.2746 0.83 7p5h:A, 7p5h:D, 7p5h:a, 7p5h:d, 7p8n:A, 7p91:a, 7p91:A, 7p92:A
84 1coj:A 211 42 0.0414 0.0806 0.4048 0.91
85 6s8w:C 470 136 0.0900 0.0787 0.2721 1.1
86 4rkc:A 398 93 0.0608 0.0628 0.2688 1.5 4rkc:B, 4rkd:A, 4rkd:B, 4rkd:C, 4rkd:D, 4rkd:E, 4rkd:F, 4rkd:G, 4rkd:H, 6t3v:A, 6zup:B, 6zup:A, 6zur:B, 6zur:A, 6zvg:A, 6zvg:B, 6zvg:C, 6zvg:D
87 8e9c:B 399 195 0.0973 0.1003 0.2051 1.6 4a00:A, 1aam:A, 1aaw:A, 2aat:A, 3aat:A, 1ahe:A, 1ahe:B, 1ahf:A, 1ahf:B, 1ahg:A, 1ahg:B, 1ahx:A, 1ahx:B, 1ahy:A, 1ahy:B, 1aia:A, 1aia:B, 1aib:A, 1aib:B, 1aic:A, 1aic:B, 1amq:A, 1amr:A, 1ams:A, 1arg:A, 1arg:B, 1arh:A, 1arh:B, 1ari:A, 1ari:B, 1ars:A, 1art:A, 1asa:A, 1asb:A, 1asc:A, 1asd:A, 1ase:A, 1asf:A, 1asg:A, 1asl:A, 1asl:B, 1asm:A, 1asm:B, 1asn:A, 1asn:B, 1b4x:A, 1c9c:A, 1cq6:A, 1cq7:A, 1cq8:A, 1czc:A, 1cze:A, 2d5y:A, 2d61:A, 2d63:A, 2d64:A, 2d65:A, 2d66:A, 2d7y:A, 2d7z:A, 4dbc:A, 8e9c:A, 8e9d:A, 8e9d:B, 8e9j:A, 8e9j:B, 8e9k:A, 8e9k:B, 8e9l:A, 8e9l:B, 8e9m:A, 8e9m:B, 8e9n:A, 8e9n:B, 8e9o:A, 8e9o:B, 8e9p:A, 8e9p:B, 8e9q:A, 8e9q:B, 8e9r:A, 8e9r:B, 8e9s:A, 8e9s:B, 8e9t:A, 8e9t:B, 8e9u:A, 8e9u:B, 8e9v:A, 8e9v:B, 5eaa:A, 1g4v:A, 1g4x:A, 1g7w:A, 1g7x:A, 1ix6:A, 1ix7:A, 1ix8:A, 3pa9:A, 3paa:A, 2q7w:A, 2qa3:A, 2qb2:A, 2qb3:A, 2qbt:A, 1qir:A, 1qis:A, 1qit:A, 3qpg:A, 1spa:A, 5t4l:A, 1tog:A, 1tog:B, 1toi:A, 1toj:A, 5vwq:A, 5vwq:D, 5vwq:G, 5vwq:J, 5vwr:A, 1x28:A, 1x28:B, 1x29:A, 1x29:B, 1x2a:A, 1x2a:B, 1yoo:A, 3zzj:A, 3zzk:A
88 6qp1:B 398 54 0.0389 0.0402 0.2963 1.6 6qp1:A, 6qp2:A, 6qp2:B
89 6s8w:B 491 138 0.0900 0.0754 0.2681 2.2 6s8w:A, 6s8w:D
90 3bwn:B 369 123 0.0827 0.0921 0.2764 2.4 3bwn:A, 3bwn:D, 3bwn:F
91 8iua:A 555 43 0.0292 0.0216 0.2791 2.7 8iu9:A, 8iub:A
92 8iaz:A 384 86 0.0414 0.0443 0.1977 3.8
93 4iz9:A 381 79 0.0487 0.0525 0.2532 4.0
94 2vdv:E 216 140 0.0754 0.1435 0.2214 4.7 2vdv:F
95 4yng:E 470 46 0.0511 0.0447 0.4565 7.7 8eq0:B, 8eq0:A, 4yng:A, 4yng:B, 4yng:C, 4yng:D, 4yng:F, 4yng:G, 4yng:H
96 4bal:A 207 51 0.0389 0.0773 0.3137 7.8 4bar:A, 6c6w:A, 6e0d:A, 3e3s:A, 5jvx:A, 5l4r:A, 2pe7:A, 5sw1:A, 5t3g:A, 4tvt:A
97 6x1o:C 624 20 0.0316 0.0208 0.6500 8.2 6x1o:A, 6x6u:A, 6x6u:C

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218