Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
EWTGDKTNAYYSDEVISELHVGQIDTSPYFCIKTVKANGSGTPVVACAVSKQSIWAPSFKELLDQARYFYSTGQSVRIHV
QKNIWTYPLFVNTFSANALVGLSSCSATQCFGPKL

The query sequence (length=115) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6p4q:B 115 115 1.0000 1.0000 1.0000 3.21e-84 7k7h:E, 6p4m:A, 6p4m:B, 6p4m:C, 6p4m:D, 6p4m:E, 6p4n:C, 6p4n:D, 6p4n:E, 6p4q:A, 6p4q:C, 6p4q:D, 6p4q:E, 6p4r:A, 6p4r:B, 6p4r:C, 6p4r:D, 6p4r:E, 6p4t:A, 6p4t:C, 6p4t:D, 4rhs:C, 4rhs:E, 6tyn:A, 6tyn:C, 6tyn:D, 6tyn:E, 6tyo:A, 6tyo:C, 6tyo:D, 6tyo:E, 6tyq:C, 6tyq:D, 6tyq:E, 5wht:A, 5wht:C, 5wht:B, 5wht:D
2 3dwp:C 120 114 0.4957 0.4750 0.5000 1.55e-38 3dwp:A, 3dwp:B, 3dwp:D, 3dwp:E, 3dwq:A, 3dwq:C, 3dwq:D, 3dwq:E
3 5whu:H 124 115 0.3304 0.3065 0.3304 1.51e-14 5whu:A, 5whu:C, 5whu:D, 5whu:E, 5whu:I, 5whu:J, 5whv:F
4 7ee5:E 120 90 0.2348 0.2250 0.3000 1.15e-12 7ee4:A, 7ee4:D, 7ee4:E, 7ee5:A, 7ee5:D
5 1pto:B 196 101 0.2696 0.1582 0.3069 0.002
6 1bcp:C 196 63 0.1652 0.0969 0.3016 0.024 1bcp:I, 1pto:C, 1pto:I
7 1q3b:A 259 84 0.2087 0.0927 0.2857 0.52 2ea0:A, 6fbu:A, 1k3w:A, 1k3x:A, 2opf:A, 2oq4:A, 2oq4:B, 1q39:A, 1q3c:A
8 4q4f:A 394 20 0.0957 0.0279 0.5500 0.59 5xbm:F
9 5uph:B 324 22 0.0957 0.0340 0.5000 0.71 5uph:A
10 8gr7:A 326 37 0.1217 0.0429 0.3784 0.99 8gr7:B
11 8jgw:A 500 41 0.1304 0.0300 0.3659 1.7
12 7a4k:A 382 47 0.1130 0.0340 0.2766 2.4 7a0b:A, 7a3v:A, 7a3x:A, 7a4x:A, 7a6d:A, 7a9e:A, 7adn:A, 7apl:A, 7apm:A, 2bbf:A, 3bl3:A, 3c2y:A, 4dxx:A, 4dy1:A, 4e2v:A, 1efz:A, 5egr:A, 1enu:A, 3eos:A, 1f3e:A, 6fmn:A, 4fps:A, 6fpu:A, 6fso:A, 3gc4:A, 3gc5:A, 4gcx:A, 3ge7:A, 4gg9:A, 4gh1:A, 4gh3:A, 4ghr:A, 4gi4:A, 4gkt:A, 4h6e:A, 4h7z:A, 6h7c:A, 3hfy:A, 4hqv:A, 4hsh:A, 4htb:A, 4hvx:A, 5i00:A, 5i02:A, 5i03:A, 5i06:A, 5i07:A, 5i07:B, 5i09:A, 4ipp:A, 5j9m:A, 5j9n:A, 5j9o:A, 4jbr:A, 5jgm:A, 5jgo:A, 5jsv:A, 5jsw:A, 5jt5:A, 5jt6:A, 5jt7:A, 5jxq:A, 1k4g:A, 1k4h:A, 4l56:A, 4lbu:A, 4leq:A, 5lpo:A, 5lpq:A, 5lpq:B, 5lpt:A, 5lpt:B, 1n2v:A, 5n6f:A, 2nqz:A, 2nso:A, 2oko:A, 1ozm:A, 1ozq:A, 1p0b:A, 1p0d:A, 1p0e:A, 2pot:A, 1pud:A, 4puj:A, 4puk:A, 4pul:A, 4pum:A, 4pun:A, 2pwu:A, 2pwv:A, 1pxg:A, 1q2r:A, 1q2r:B, 1q2r:C, 1q2r:D, 1q2s:A, 1q2s:B, 1q2s:C, 1q2s:D, 1q4w:A, 4q4m:A, 4q4o:A, 4q4p:A, 4q4q:A, 4q4r:A, 4q4s:A, 1q63:A, 1q65:A, 1q66:A, 4q8m:A, 4q8n:A, 4q8o:A, 4q8p:A, 4q8q:A, 4q8t:A, 4q8u:A, 4q8v:A, 4q8w:A, 2qii:A, 2qzr:A, 1r5y:A, 6rkq:A, 6rkt:A, 3rr4:A, 3s1g:A, 1s38:A, 1s39:A, 3sm0:A, 5sw3:A, 3tll:A, 3unt:A, 5uti:A, 5utj:A, 3uvi:A, 5v3c:A, 1wkd:A, 1wke:A, 1wkf:A, 1y5v:A, 1y5w:A, 1y5x:A, 1y5x:D, 6yfw:A, 6yfx:A, 6ygk:A, 6ygl:A, 6ygm:A, 6ygo:A, 6ygp:A, 6ygr:A, 6ygv:A, 6ygw:A, 6ygy:A, 6ygz:A, 6yh1:A, 6yh2:A, 6yh3:A, 6yhd:A, 6yhe:A, 6yiq:A, 6yiq:B, 6yry:A, 6yyz:A, 6z0d:A, 2z1v:A, 2z1w:A, 2z1x:A, 2z7k:A
13 5v1x:D 447 13 0.0696 0.0179 0.6154 3.8 5v12:F, 5v12:B, 5v1x:C, 5v1x:A, 5v1x:B
14 2qpz:A 103 32 0.0957 0.1068 0.3438 5.0
15 7qfo:A 379 46 0.1304 0.0396 0.3261 6.0 7qfn:A, 7zbg:A
16 7prw:A 326 56 0.1478 0.0521 0.3036 9.4 3bqd:A, 6bqu:B, 6bqu:A, 6bse:A, 6bse:B, 6bsf:B, 6bsf:A, 5cbx:A, 5cbx:B, 5cbx:E, 5cbx:F, 5cby:A, 5cby:B, 5cbz:A, 5cbz:B, 5cbz:E, 5cc1:A, 5cc1:B, 5cc1:W, 5cc1:X, 6cfn:B, 6cfn:D, 6cfn:G, 6cfn:H, 3cld:A, 3cld:B, 4csj:A, 6dxk:A, 6dxk:B, 5e69:A, 5e69:B, 5e6a:A, 5e6a:B, 5e6b:A, 5e6b:B, 5e6c:B, 5e6d:A, 5e6d:B, 3e7c:A, 3e7c:B, 6el6:A, 6el7:A, 6el9:A, 5emc:A, 5emc:B, 5emp:A, 5emp:B, 5emq:A, 5emq:B, 8ffv:C, 8ffw:C, 3fyl:A, 5g3j:A, 5g5w:A, 3g6p:A, 3g6q:B, 3g6r:B, 3g6t:B, 3g8u:B, 3g97:B, 3g97:A, 3g99:B, 3g9j:A, 3g9o:B, 3g9o:A, 3g9p:B, 3g9p:A, 1gdc:A, 2gda:A, 3h52:A, 3h52:B, 3h52:C, 3h52:D, 4hn5:A, 4hn5:B, 4hn6:A, 4hn6:B, 3k22:A, 3k22:B, 3k23:A, 3k23:B, 3k23:C, 7krj:D, 4lsj:A, 1m2z:A, 1m2z:D, 4mdd:A, 4mdd:B, 3mne:A, 3mno:A, 3mnp:A, 5nfp:A, 5nft:A, 1nhz:A, 4p6w:A, 4p6x:A, 4p6x:C, 4p6x:I, 4p6x:E, 4p6x:G, 4p6x:K, 1p93:A, 1p93:B, 1p93:C, 1p93:D, 7prv:A, 7prv:B, 7prw:B, 7prx:A, 1r4r:A, 1rgd:A, 4tnt:A, 4tnt:B, 5uc1:A, 5uc1:B, 5uc3:A, 5uc3:B, 4udc:A, 4udd:A, 5va0:A, 5va0:B, 5va7:A, 5va7:B, 8vkz:A, 8vkz:B, 6x6d:A, 6x6d:B, 6x6e:A, 6x6e:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218