Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
EWEALEKKLAALESKCQALEKKLQALEKKLEALEHG

The query sequence (length=36) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6egl:A 36 36 1.0000 1.0000 1.0000 1.42e-16 6egm:A, 6egn:C, 6egn:B, 6ego:A, 6egp:A, 5kb0:A, 5kb1:A, 5kb2:A, 6mcd:A, 7n2y:A, 7n2z:A
2 7p3h:A 36 36 0.7500 0.7500 0.7500 1.73e-13
3 5uxt:A 33 26 0.5278 0.5758 0.7308 2.82e-05 5uxt:C
4 1g6u:A 48 25 0.5278 0.3958 0.7600 0.001 1g6u:B
5 1g6u:A 48 38 0.5278 0.3958 0.5000 7.5 1g6u:B
6 4g1e:A 964 25 0.4167 0.0156 0.6000 0.024 5ffg:A, 5ffo:A, 5ffo:E, 4g1m:A, 3ije:A, 1jv2:A, 1l5g:A, 1m1x:A, 6mk0:A, 4mmx:A, 4mmy:A, 4mmz:A, 6msl:A, 6msu:A, 6naj:A, 5nem:A, 5ner:A, 5net:A, 4o02:A, 6om1:A, 6om1:C, 6om1:E, 6om1:G, 6om2:A, 6om2:C, 8tcf:A, 8tcg:A, 1u8c:A, 6uja:A, 6ujb:A, 6ujc:A, 4um8:C, 4um8:A, 4um9:A, 4um9:C, 8vs6:A, 8vsd:A, 7y1t:A
7 4g1e:A 964 23 0.3889 0.0145 0.6087 0.10 5ffg:A, 5ffo:A, 5ffo:E, 4g1m:A, 3ije:A, 1jv2:A, 1l5g:A, 1m1x:A, 6mk0:A, 4mmx:A, 4mmy:A, 4mmz:A, 6msl:A, 6msu:A, 6naj:A, 5nem:A, 5ner:A, 5net:A, 4o02:A, 6om1:A, 6om1:C, 6om1:E, 6om1:G, 6om2:A, 6om2:C, 8tcf:A, 8tcg:A, 1u8c:A, 6uja:A, 6ujb:A, 6ujc:A, 4um8:C, 4um8:A, 4um9:A, 4um9:C, 8vs6:A, 8vsd:A, 7y1t:A
8 4g1e:A 964 25 0.3611 0.0135 0.5200 0.89 5ffg:A, 5ffo:A, 5ffo:E, 4g1m:A, 3ije:A, 1jv2:A, 1l5g:A, 1m1x:A, 6mk0:A, 4mmx:A, 4mmy:A, 4mmz:A, 6msl:A, 6msu:A, 6naj:A, 5nem:A, 5ner:A, 5net:A, 4o02:A, 6om1:A, 6om1:C, 6om1:E, 6om1:G, 6om2:A, 6om2:C, 8tcf:A, 8tcg:A, 1u8c:A, 6uja:A, 6ujb:A, 6ujc:A, 4um8:C, 4um8:A, 4um9:A, 4um9:C, 8vs6:A, 8vsd:A, 7y1t:A
9 4etp:B 287 25 0.3889 0.0488 0.5600 0.30
10 4etp:B 287 25 0.3611 0.0453 0.5200 1.5
11 2lxy:A 67 23 0.3333 0.1791 0.5217 0.71 8vsw:A
12 3w8v:A 32 26 0.3611 0.4062 0.5000 1.4 3w8v:B, 3w92:A, 3w92:B, 3w92:C, 3w93:A, 3w93:B, 3w93:C
13 3w8v:A 32 24 0.3611 0.4062 0.5417 1.7 3w8v:B, 3w92:A, 3w92:B, 3w92:C, 3w93:A, 3w93:B, 3w93:C
14 1afa:1 154 33 0.3889 0.0909 0.4242 4.2 1afa:2, 1afa:3, 1afb:1, 1afb:2, 1afb:3, 1afd:1, 1afd:2, 1afd:3, 1bch:1, 1bch:2, 1bch:3, 1bcj:1, 1bcj:2, 1bcj:3, 1fif:A, 1fif:B, 1fif:C, 1fih:A, 1fih:B, 1fih:C, 1kmb:1, 1kmb:2, 1kmb:3, 2kmb:1, 2kmb:2, 2kmb:3, 3kmb:1, 3kmb:3, 3kmb:2, 4kmb:1, 4kmb:2, 4kmb:3, 1kwt:A, 1kwt:B, 1kwt:C, 1kwu:A, 1kwu:B, 1kwu:C, 1kwv:A, 1kwv:B, 1kwv:C, 1kww:A, 1kww:B, 1kww:C, 1kwx:A, 1kwx:B, 1kwx:C, 1kwy:A, 1kwy:B, 1kwy:C, 1kwz:A, 1kwz:B, 1kwz:C, 1kx0:A, 1kx0:B, 1kx0:C, 1kx1:C, 1kx1:F, 1kx1:A, 1kx1:B, 1kx1:D, 1kx1:E, 2msb:B, 2msb:A, 1rtm:1, 1rtm:2, 1rtm:3
15 5tvn:A 393 25 0.3056 0.0280 0.4400 4.7 6drx:A, 6dry:A, 6drz:A, 6ds0:A, 4ib4:A, 4nc3:A, 5tud:A, 5tud:D
16 8a82:A 354 19 0.2778 0.0282 0.5263 6.9
17 7q1s:E 30 28 0.3333 0.4000 0.4286 9.1 7q1s:M, 7q1s:A
18 1q9s:A 149 30 0.2778 0.0671 0.3333 9.4 1nb0:A, 1nb9:A, 1p4m:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218