Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
EVYKGDGYKVWKLEPSLGDPLELGRKTKTEMNAMTHDEFDRMKGDKPSKGYDKLRVLLDLMDRPRLGTTVDLCAGRGGWS
ELVKDLEGPKGITAVSLWEWMADPAIHRINANVKHLRPWQVDTLLFDGGEAFKRDQNLRKEENFNDSLLDAVDAWMMQPV
PPRNFVIKIQVPYTQKAIALLEKWQVKTGKGRLVRLAGDRLSNTVMYFLSVRLETQIRGRVTTFVRELAERRKDRSLTAD
PSL

The query sequence (length=243) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8gy9:A 249 245 0.9959 0.9719 0.9878 4.27e-178 8gy9:B, 8gya:A, 8gya:B, 8gyb:A, 8gyb:B, 8gyb:C, 8gyb:D
2 2px5:A 265 223 0.2634 0.2415 0.2870 3.98e-12 2px2:A, 2px2:B, 2px4:A, 2px5:B, 2px8:A, 2px8:B, 2pxa:A, 2pxa:B, 2pxc:A
3 8bxk:A 265 222 0.2716 0.2491 0.2973 4.81e-11 8bxk:B, 8cqh:A, 8qdj:A
4 2wa2:A 223 230 0.2428 0.2646 0.2565 1.36e-10
5 2wa2:B 259 205 0.2222 0.2085 0.2634 1.82e-10
6 4k6m:A 888 224 0.2593 0.0709 0.2812 2.70e-10 4hdg:A, 4hdg:B, 4hdh:A, 4hdh:B, 4k6m:B, 4mtp:A, 4mtp:B
7 3gcz:A 259 199 0.2469 0.2317 0.3015 3.86e-10
8 3eld:A 277 250 0.2716 0.2383 0.2640 5.07e-09 3elu:A, 3elw:A, 3ely:A, 3emb:A, 3emd:A
9 8b52:B 262 184 0.2099 0.1947 0.2772 8.67e-09 8b51:A, 8b51:B, 8b52:A
10 6qsn:B 884 222 0.2510 0.0690 0.2748 1.55e-08 3eva:A, 3evb:A, 3evc:A, 3evd:A, 3eve:A, 3evf:A, 6qsn:A
11 5ikm:A 259 222 0.2510 0.2355 0.2748 1.83e-08
12 6i7p:A 883 239 0.2757 0.0759 0.2803 5.81e-08 5goz:A, 5goz:B, 5goz:C, 5gp1:A, 5gp1:B, 5gp1:C, 6i7p:B, 6i7p:C, 6i7p:D, 6i7p:E, 6i7p:F, 5kqr:A, 5kqs:A, 5m2x:A, 5m2x:B, 5m2x:C, 5m2x:D, 5m2x:E, 5m2x:F, 5m2z:A, 5m2z:C, 5m2z:B, 5m2z:D, 5m2z:E, 5m2z:F, 5m5b:A, 5m5b:B, 5mrk:A, 5mrk:B, 5nju:A, 5nju:B, 5njv:A, 5njv:B, 5njv:C, 5njv:D, 8pem:A, 5tfr:A, 5tfr:B, 5tmh:A, 5tmh:B, 5u0b:A, 5u0b:B, 5u0c:A, 5u0c:B, 5u0c:C, 5u0c:D, 5u0c:E, 5u0c:F, 5u0c:G, 5u0c:H, 5ulp:A, 5ulp:B, 6ux2:B, 5vim:A, 5vim:B, 6wcz:B, 5wxb:A, 5wz1:A, 5wz1:B, 5wz1:C, 5wz1:D, 5wz1:E, 5wz1:F, 5wz1:G, 5wz1:H, 5wz2:A, 5wz2:B, 5wz2:C
13 5ccv:A 849 221 0.2510 0.0718 0.2760 8.02e-08 6h80:A, 6h9r:A, 6izz:A
14 8gzp:A 854 221 0.2510 0.0714 0.2760 1.32e-07 4c11:A, 5ccv:B, 5ccv:C, 5ccv:D, 5ccv:F, 5ccv:G, 5dto:A, 5f3t:A, 5f3z:A, 5f41:A, 8gzq:A, 4hhj:A, 5hmw:A, 5hmx:A, 5hmy:A, 5hmz:A, 5hn0:A, 5i3p:A, 5i3q:A, 5iq6:A, 6j00:A, 2j7u:A, 2j7w:A, 5jjr:A, 5jjs:A, 4v0q:A, 4v0r:A, 6xd0:A
15 3lkz:A 262 224 0.2551 0.2366 0.2768 1.44e-07 3lkz:B, 2oy0:A, 2oy0:B
16 8gzr:A 880 221 0.2510 0.0693 0.2760 1.48e-07 8bcr:A, 8bcr:B, 4c11:B, 5ccv:E, 4ctj:A, 4ctj:C, 4ctk:A, 4ctk:C, 5cuq:A, 5cuq:B, 5e9q:A, 5e9q:C, 5ec8:A, 5ec8:C, 5ehg:A, 5ehg:C, 5ehi:A, 5ehi:C, 5eif:A, 5eif:C, 5eiw:A, 5eiw:C, 5ekx:A, 5ekx:B, 3p8z:A, 3p8z:C, 3p97:A, 3p97:C, 4r8s:A, 4r8s:B, 3vws:A, 2xbm:B, 2xbm:A, 2xbm:C, 2xbm:D, 6xd1:A
17 2oxt:A 265 249 0.2716 0.2491 0.2651 4.02e-07 2oxt:B, 2oxt:C, 2oxt:D
18 6kr3:B 836 223 0.2593 0.0754 0.2825 1.32e-06 5k5m:A
19 6kr2:A 857 223 0.2593 0.0735 0.2825 1.36e-06 6izx:A, 6izy:A, 6kr2:B, 6kr3:A
20 8t13:B 877 223 0.2593 0.0718 0.2825 1.48e-06 3evg:A, 1l9k:A, 2p1d:A, 2p3l:A, 2p3o:A, 2p3q:A, 2p40:A, 2p41:A, 1r6a:A, 8t12:B, 7xd8:A, 7xd8:D, 7xd8:G, 7xd8:J, 7xd8:M, 7xd8:P, 7xd9:A, 7xd9:D, 7xd9:G, 7xd9:J, 7xd9:M, 7xd9:P, 5zqk:A, 5zqk:B
21 7d6m:A 260 213 0.2551 0.2385 0.2911 2.27e-06 7d6m:B, 7fjt:A, 7v1b:A, 7v1c:A, 7v1d:A, 7v1e:A, 7v1f:A, 7v1g:A, 7v1h:A, 7v1i:A, 7v1j:A
22 7wnj:A 262 185 0.2181 0.2023 0.2865 2.73e-06
23 5ccv:H 767 228 0.2428 0.0769 0.2588 3.68e-06
24 6jpl:B 231 65 0.0782 0.0823 0.2923 0.17 6jpl:D
25 8ia0:CS 629 75 0.0823 0.0318 0.2667 0.25 8i9w:CS, 8i9x:CS, 8i9y:CS, 8i9z:CS
26 8esq:w 504 71 0.0782 0.0377 0.2676 0.26 8esr:w
27 8etc:w 420 71 0.0782 0.0452 0.2676 0.29
28 1ker:B 347 79 0.0864 0.0605 0.2658 0.78 1kep:A, 1kep:B, 1ker:A, 1ket:A, 1ket:B, 1oc2:A, 1oc2:B
29 5ju7:A 107 48 0.0658 0.1495 0.3333 1.4
30 5mac:A 473 26 0.0576 0.0296 0.5385 1.5 5mac:B, 5mac:D, 5mac:C, 5mac:E
31 1vl0:A 281 68 0.0823 0.0712 0.2941 2.2 1vl0:B, 1vl0:C
32 4pve:A 490 37 0.0576 0.0286 0.3784 3.3 4pvh:A, 4pvj:A, 4pvk:A, 4pwb:A, 4pwc:A, 3tsh:A, 3tsj:A, 3tsj:B
33 8fkv:SJ 340 71 0.0823 0.0588 0.2817 3.6 8fkp:SJ, 8fkq:SJ, 8fks:SJ, 8fkt:SJ, 8fku:SJ, 8fkw:SJ
34 6elz:w 436 73 0.0658 0.0367 0.2192 4.4 6em5:w
35 6ylx:w 360 73 0.0658 0.0444 0.2192 4.4
36 7nac:w 672 73 0.0658 0.0238 0.2192 4.5 7naf:w, 7r6k:w, 7r7a:w, 7r7o:A, 7r7o:B
37 7f0b:A 282 65 0.0823 0.0709 0.3077 7.2 7f0c:A, 7f0f:A
38 2d5v:A 135 45 0.0576 0.1037 0.3111 8.0 2d5v:B, 8t0f:A, 8t11:A
39 8glv:OD 370 36 0.0576 0.0378 0.3889 8.3

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218