Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
EVDPRLYFENRSKFIQDQKDKGINPYPHKFERTISIPEFIEKYKDLGNGEHLEDTILNITGRIMRVSASGQKLRFFDLVG
DGEKIQVLANYSFHNHEKGNFAECYDKIRRGDIVGIVGFPGKSKKGELSIFPKETILLSACLHMLPMKYGLTEIRYRQRY
LDLLINESSRHTFVTRTKIINFLRNFLNERGFFEVETPMMNLIARPFITHHNDLDLDLYLRIATELPLKMLIVGGIDKVY
EIGKVFRNEGIDNTHNPEFTSCEFYWAYADYNDLIKWSEDFFSQLVYHLFGTYKISYNKDGPENQPIEIDFTPPYPKVSI
VEEIEKVTNTILEQPFDSNETIEKMINIIKEHKIELPNPPTAAKLLDQLASHFIENKYNDKPFFIVEHPQIMSPLAKYHR
TKPGLTERLEMFICGKEVLNAYTELNDPFKQKECFLDSAFCTSLEYGLPPTGGLGLGIDRITMFLTNKNSIKDVILFPTM
RP

The query sequence (length=482) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6agt:B 506 504 0.9979 0.9506 0.9544 0.0 6agt:A, 6agt:C, 6agt:D, 7bt5:A, 7bt5:B, 6hcu:A, 6hcu:B, 6hcv:A, 6hcv:B, 8k9s:A, 8k9s:B, 8k9u:A, 8k9u:B, 8k9v:A, 8k9v:B, 8k9w:A, 8k9w:B, 8k9x:A, 8k9x:B, 6ka6:A, 6ka6:B, 6ka6:C, 6ka6:D, 6kab:A, 6kab:B, 6kab:C, 6kab:D, 6kbf:A, 6kbf:B, 6kcn:A, 6kcn:B, 6kcn:C, 6kcn:D, 6kct:A, 6kct:B, 6kct:C, 6kct:D, 6l3y:B, 6l3y:A, 6l4q:B, 6l4q:A, 6m0t:A, 6m0t:B, 6m0t:C, 6m0t:D, 4pg3:A, 4pg3:B, 4pg3:C, 4pg3:D, 4ycv:A, 4ycv:B, 4ycv:C, 4ycv:D, 5zh2:B, 5zh3:A, 5zh3:B, 5zh4:A, 5zh4:B, 5zh5:A, 5zh5:B
2 5zh2:A 464 487 0.9523 0.9892 0.9425 0.0
3 6chd:A 506 507 0.5581 0.5316 0.5306 0.0 3bju:A, 3bju:B, 3bju:C, 3bju:D, 6chd:B, 4dpg:A, 4dpg:B, 4dpg:C, 4dpg:D, 4dpg:E, 4dpg:F, 4dpg:G, 4dpg:H, 7ea9:A, 7ea9:B, 7ea9:C, 7ea9:D, 6ild:A, 6ild:B, 6ilh:A, 6ilh:B, 4ycu:A, 4ycu:B, 4ycw:A, 4ycw:B, 4ycw:E, 4ycw:F
4 6bni:A 502 499 0.5519 0.5299 0.5331 0.0 6bni:B, 6c86:A, 6c86:B, 5eln:A, 5eln:B, 5eln:C, 5eln:D, 5elo:A, 5elo:B, 5elo:C, 5elo:D, 6hcw:A, 6hcw:B, 7zog:A, 7zog:B, 7zog:C, 7zog:D
5 5hgq:B 482 489 0.5415 0.5415 0.5337 0.0 5hgq:A, 5hgq:D, 5hgq:C
6 7f6w:A 506 510 0.5083 0.4842 0.4804 7.99e-163
7 4up7:A 529 503 0.4647 0.4234 0.4453 3.03e-145 4up9:A, 4upa:A
8 3a74:A 484 485 0.4191 0.4174 0.4165 1.33e-112 3a74:B, 3a74:C, 3a74:D, 3e9h:A, 3e9h:B, 3e9h:C, 3e9h:D, 3e9i:A, 3e9i:B, 3e9i:C, 3e9i:D
9 1e1t:A 485 502 0.4212 0.4186 0.4044 3.51e-109 1e1o:A, 1e22:A, 1e24:A, 1lyl:A, 1lyl:B, 1lyl:C, 5yzx:A, 5yzx:B, 5yzx:C
10 1bbu:A 486 508 0.4212 0.4177 0.3996 4.87e-105
11 4ex5:A 486 502 0.3817 0.3786 0.3665 5.62e-93 4ex5:B
12 6wbd:B 485 508 0.3755 0.3732 0.3563 1.80e-90 6wbd:A
13 6aqg:C 490 502 0.3589 0.3531 0.3446 1.10e-89 6aqg:A, 6aqg:B, 6aqg:D, 5vl1:A, 5vl1:B, 5vl1:C, 5vl1:D
14 6nrz:A 517 516 0.3734 0.3482 0.3488 3.58e-88 6nrz:B, 6ns0:A, 6ns0:B, 6o3f:A, 6o3f:B
15 6aqh:B 490 506 0.3506 0.3449 0.3340 1.20e-78 6aqh:A, 6aqh:C, 6aqh:D
16 7qh8:A 471 499 0.3465 0.3546 0.3347 1.62e-75 7qhn:A, 7qi8:A
17 3a5z:C 324 336 0.1701 0.2531 0.2440 2.50e-23 3a5y:B, 3a5y:C, 3a5y:D, 3a5z:A, 3a5z:E, 3a5z:G, 3g1z:A, 3g1z:B
18 3a5y:A 297 336 0.1639 0.2660 0.2351 1.18e-21
19 1b8a:A 438 405 0.2095 0.2306 0.2494 4.22e-17 1b8a:B, 3nel:A, 3nem:A, 3nem:B
20 4wj3:M 589 138 0.0851 0.0696 0.2971 2.95e-11 4wj3:N, 4wj3:O, 4wj3:P, 4wj4:A
21 4wj3:M 589 87 0.0581 0.0475 0.3218 2.80e-07 4wj3:N, 4wj3:O, 4wj3:P, 4wj4:A
22 1asy:A 490 354 0.1660 0.1633 0.2260 1.09e-10 1asy:B, 1asz:A, 1asz:B
23 6sjc:B 581 156 0.0788 0.0654 0.2436 9.16e-10 7ap4:A, 7ap4:B, 1efw:A, 1efw:B, 1g51:A, 1g51:B, 6hhv:A, 6hhv:B, 6hhw:A, 6hhw:B, 6hhx:A, 6hhx:B, 6sjc:A
24 6sjc:B 581 109 0.0705 0.0585 0.3119 1.15e-06 7ap4:A, 7ap4:B, 1efw:A, 1efw:B, 1g51:A, 1g51:B, 6hhv:A, 6hhv:B, 6hhw:A, 6hhw:B, 6hhx:A, 6hhx:B, 6sjc:A
25 1c0a:A 585 143 0.0871 0.0718 0.2937 9.20e-10 1il2:A, 1il2:B
26 1c0a:A 585 36 0.0415 0.0342 0.5556 2.04e-06 1il2:A, 1il2:B
27 5w25:A 583 180 0.0996 0.0823 0.2667 1.19e-09 5w25:B
28 5w25:A 583 49 0.0436 0.0360 0.4286 0.001 5w25:B
29 4o2d:B 515 179 0.0996 0.0932 0.2682 1.01e-08
30 4o2d:B 515 53 0.0498 0.0466 0.4528 2.23e-05
31 4o2d:A 580 179 0.0996 0.0828 0.2682 1.04e-08 4rmf:A
32 4o2d:A 580 53 0.0498 0.0414 0.4528 2.84e-05 4rmf:A
33 3kfu:C 377 370 0.1598 0.2042 0.2081 1.50e-08 3kfu:A, 3kfu:D, 3kfu:B
34 3m4p:A 435 330 0.1411 0.1563 0.2061 1.03e-06 3m4p:B, 3m4p:C, 3m4p:D
35 2xgt:B 433 163 0.0975 0.1085 0.2883 1.92e-06 2xgt:A, 2xti:A, 2xti:B
36 1x54:A 434 351 0.1722 0.1912 0.2365 0.002 1x55:A
37 8tc8:A 435 455 0.1950 0.2161 0.2066 0.003 8h53:A, 8h53:B, 8h53:C, 8h53:D, 8tc8:B, 8tc8:C, 8tc8:D, 8tc9:A, 8tc9:B, 8tc9:C, 8tc9:D
38 3p8v:A 294 320 0.1328 0.2177 0.2000 0.016 3p8v:B, 3p8y:A, 3p8y:B, 3reu:A, 3reu:B, 3rex:A, 3rex:B, 3rl6:A, 3rl6:B
39 6hxi:C 410 81 0.0539 0.0634 0.3210 0.26 6hxi:A, 6znw:A
40 7u0r:B 278 114 0.0643 0.1115 0.2719 0.40 8c49:A, 8c49:B, 8dqg:D, 8dqg:A, 8dqh:D, 8dqh:A, 8dqi:D, 8dqi:A, 8dqj:D, 7u0r:A
41 8ci0:AAA 666 195 0.0913 0.0661 0.2256 1.4 8ci0:BBB, 8ci0:CCC, 1itz:A, 1itz:B, 1itz:C
42 7by6:A 299 26 0.0270 0.0435 0.5000 1.8
43 7dpi:C 292 26 0.0270 0.0445 0.5000 2.4 7dpi:A
44 5hb3:C 709 84 0.0539 0.0367 0.3095 3.2 5hb3:A, 7tbi:D1, 7tbi:D2, 7tbi:D3, 7tbi:D4
45 3l4g:C 508 55 0.0373 0.0354 0.3273 3.3 3l4g:A, 3l4g:E, 3l4g:G, 3l4g:I, 3l4g:K, 3l4g:M, 3l4g:O
46 2eq6:A 460 89 0.0477 0.0500 0.2584 3.4 2eq6:B, 2eq8:A, 2eq8:B, 2eq8:D, 2eq8:E, 2eq9:A, 2eq9:B, 2eq9:D, 2eq9:E, 2eq9:G, 2eq9:H, 2eq9:J, 2eq9:K
47 5mgu:A 407 44 0.0311 0.0369 0.3409 4.2 3cmq:A, 3hfv:A, 5mgh:A, 5mgw:A, 8p8x:A, 3teg:A, 3tup:A
48 6z1p:BS 433 130 0.0664 0.0739 0.2462 4.3
49 6ofr:A 758 62 0.0353 0.0224 0.2742 4.9
50 2du4:A 466 67 0.0332 0.0343 0.2388 5.4 2du3:B, 2du5:B, 2du6:B
51 2du3:A 534 67 0.0332 0.0300 0.2388 5.7 2du5:A, 2du6:A
52 6ha8:V 541 42 0.0270 0.0240 0.3095 6.2
53 4cs3:A 270 96 0.0477 0.0852 0.2396 7.2 6aac:A, 6aad:A, 6aan:A, 6aao:A, 6aap:A, 6aaq:A, 6aaz:A, 6ab0:A, 6ab1:A, 6ab2:A, 6ab8:A, 6abk:A, 6abl:A, 6abm:A, 4bw9:A, 4bwa:A, 4ch3:A, 4ch4:A, 4ch5:A, 4ch6:A, 4cs4:A, 5k1p:A, 5k1x:A, 8ke1:A, 8ke2:A, 8ke3:A, 8ke4:A, 8ke5:A, 8ke6:A, 6ly3:A, 6ly6:A, 6ly7:A, 6lya:A, 6lyb:A, 4q6g:A, 2q7e:A, 2q7g:A, 2q7h:A, 3qtc:A, 7rsm:A, 7rsm:B, 7rsm:C, 7rsm:D, 4tqd:A, 4tqf:A, 3vqv:A, 3vqw:A, 3vqx:A, 3vqx:B, 3vqx:C, 3vqx:D, 3vqy:A, 2zce:A, 2zim:A, 2zin:A, 2zio:A, 4zib:A
54 3m49:A 665 84 0.0477 0.0346 0.2738 9.9 3hyl:A, 3hyl:B, 3m49:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218