Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
ETLGEKWKARLNQMSALEFYSYKKSGITEVCREEARRALKDGVATGGHAVSRGSAKLRWLVERGYLQPYGKVIDLGCGRG
GWSYYAATIRKVQEVKGYTKGGPGHEEPVLVQSYGWNIVRLKSGVDVFHMAAEPCDTLLCDIGESSSSPEVEEARTLRVL
SMVGDWLEKRPGAFCIKVLCPYTSTMMETLERLQRRYGGGLVRVPLSRNSTHEMYWVSGAKSNTIKSVSTTSQLLLGRMD
GPRRPVKYEEDVNLGSGTR

The query sequence (length=259) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6i7p:A 883 259 1.0000 0.2933 1.0000 0.0 5goz:A, 5goz:B, 5goz:C, 5gp1:A, 5gp1:B, 5gp1:C, 6i7p:B, 6i7p:C, 6i7p:D, 6i7p:E, 6i7p:F, 5kqr:A, 5kqs:A, 5m2x:A, 5m2x:B, 5m2x:C, 5m2x:D, 5m2x:E, 5m2x:F, 5m2z:A, 5m2z:C, 5m2z:B, 5m2z:D, 5m2z:E, 5m2z:F, 5m5b:A, 5m5b:B, 5mrk:A, 5mrk:B, 5nju:A, 5nju:B, 5njv:A, 5njv:B, 5njv:C, 5njv:D, 8pem:A, 5tfr:A, 5tfr:B, 5tmh:A, 5tmh:B, 5u0b:A, 5u0b:B, 5u0c:A, 5u0c:B, 5u0c:C, 5u0c:D, 5u0c:E, 5u0c:F, 5u0c:G, 5u0c:H, 5ulp:A, 5ulp:B, 6ux2:B, 5vim:A, 5vim:B, 6wcz:B, 5wxb:A, 5wz1:A, 5wz1:B, 5wz1:C, 5wz1:D, 5wz1:E, 5wz1:F, 5wz1:G, 5wz1:H, 5wz2:A, 5wz2:B, 5wz2:C
2 2px5:A 265 263 0.6988 0.6830 0.6882 4.05e-127 2px2:A, 2px2:B, 2px4:A, 2px5:B, 2px8:A, 2px8:B, 2pxa:A, 2pxa:B, 2pxc:A
3 8b52:B 262 263 0.7027 0.6947 0.6920 2.92e-126 8b51:A, 8b51:B, 8b52:A
4 8bxk:A 265 258 0.6486 0.6340 0.6512 1.26e-125 8bxk:B, 8cqh:A, 8qdj:A
5 3lkz:A 262 263 0.7066 0.6985 0.6958 7.04e-122 3lkz:B, 2oy0:A, 2oy0:B
6 4k6m:A 888 263 0.7027 0.2050 0.6920 3.25e-120 4hdg:A, 4hdg:B, 4hdh:A, 4hdh:B, 4k6m:B, 4mtp:A, 4mtp:B
7 5ikm:A 259 259 0.6332 0.6332 0.6332 4.54e-116
8 8gzp:A 854 259 0.6525 0.1979 0.6525 3.92e-109 4c11:A, 5ccv:B, 5ccv:C, 5ccv:D, 5ccv:F, 5ccv:G, 5dto:A, 5f3t:A, 5f3z:A, 5f41:A, 8gzq:A, 4hhj:A, 5hmw:A, 5hmx:A, 5hmy:A, 5hmz:A, 5hn0:A, 5i3p:A, 5i3q:A, 5iq6:A, 6j00:A, 2j7u:A, 2j7w:A, 5jjr:A, 5jjs:A, 4v0q:A, 4v0r:A, 6xd0:A
9 5ccv:A 849 259 0.6486 0.1979 0.6486 6.41e-109 6h80:A, 6h9r:A, 6izz:A
10 8gzr:A 880 259 0.6525 0.1920 0.6525 7.01e-109 8bcr:A, 8bcr:B, 4c11:B, 5ccv:E, 4ctj:A, 4ctj:C, 4ctk:A, 4ctk:C, 5cuq:A, 5cuq:B, 5e9q:A, 5e9q:C, 5ec8:A, 5ec8:C, 5ehg:A, 5ehg:C, 5ehi:A, 5ehi:C, 5eif:A, 5eif:C, 5eiw:A, 5eiw:C, 5ekx:A, 5ekx:B, 3p8z:A, 3p8z:C, 3p97:A, 3p97:C, 4r8s:A, 4r8s:B, 3vws:A, 2xbm:B, 2xbm:A, 2xbm:C, 2xbm:D, 6xd1:A
11 8t13:B 877 259 0.6178 0.1824 0.6178 2.29e-105 3evg:A, 1l9k:A, 2p1d:A, 2p3l:A, 2p3o:A, 2p3q:A, 2p40:A, 2p41:A, 1r6a:A, 8t12:B, 7xd8:A, 7xd8:D, 7xd8:G, 7xd8:J, 7xd8:M, 7xd8:P, 7xd9:A, 7xd9:D, 7xd9:G, 7xd9:J, 7xd9:M, 7xd9:P, 5zqk:A, 5zqk:B
12 6kr3:B 836 258 0.6139 0.1902 0.6163 6.67e-105 5k5m:A
13 6kr2:A 857 258 0.6139 0.1855 0.6163 7.14e-105 6izx:A, 6izy:A, 6kr2:B, 6kr3:A
14 5ccv:H 767 258 0.6332 0.2138 0.6357 3.40e-103
15 3gcz:A 259 259 0.5676 0.5676 0.5676 9.78e-101
16 3eld:A 277 258 0.5714 0.5343 0.5736 1.07e-99 3elu:A, 3elw:A, 3ely:A, 3emb:A, 3emd:A
17 2wa2:B 259 261 0.5367 0.5367 0.5326 9.19e-93
18 2oxt:A 265 259 0.5135 0.5019 0.5135 1.10e-86 2oxt:B, 2oxt:C, 2oxt:D
19 7wnj:A 262 260 0.4903 0.4847 0.4885 1.42e-86
20 7d6m:A 260 259 0.4903 0.4885 0.4903 7.67e-85 7d6m:B, 7fjt:A, 7v1b:A, 7v1c:A, 7v1d:A, 7v1e:A, 7v1f:A, 7v1g:A, 7v1h:A, 7v1i:A, 7v1j:A
21 6qsn:B 884 259 0.5521 0.1618 0.5521 1.31e-83 3eva:A, 3evb:A, 3evc:A, 3evd:A, 3eve:A, 3evf:A, 6qsn:A
22 2wa2:A 223 240 0.4672 0.5426 0.5042 1.08e-80
23 8gy9:A 249 231 0.2587 0.2691 0.2900 7.62e-11 8gy9:B, 8gya:A, 8gya:B, 8gyb:A, 8gyb:B, 8gyb:C, 8gyb:D
24 6bqc:A 348 45 0.0695 0.0517 0.4000 0.023
25 5wp4:A 485 80 0.1081 0.0577 0.3500 0.032
26 5wp5:A 463 80 0.1042 0.0583 0.3375 0.090 5wp5:B
27 7aso:G 155 64 0.0734 0.1226 0.2969 0.61 7asp:p, 7bge:g, 8bh6:g, 8bh7:g, 8byv:g, 6fxc:Ag, 6fxc:Bg, 7kwg:g, 5li0:g, 5nd8:g, 5nd9:g, 5ngm:Ag, 7nhl:h, 7nhm:h, 8p2f:h, 8p2g:h, 8p2h:h, 7p48:g, 6s0x:g, 6s13:g, 5tcu:SG, 8y38:g, 8y39:g, 6yef:g
28 1ve3:B 226 20 0.0425 0.0487 0.5500 0.63 1ve3:A
29 6gkv:A 351 132 0.1313 0.0969 0.2576 0.86 6gkv:B, 6gky:A, 6gky:B, 6gkz:A, 6gkz:B, 6gkz:C, 6gkz:D
30 1kpg:A 285 98 0.0927 0.0842 0.2449 0.94 1kpg:B, 1kpg:C, 1kpg:D, 1kph:A, 1kph:B, 1kph:C, 1kph:D
31 3wmt:A 503 79 0.0888 0.0457 0.2911 1.6 3wmt:B
32 6p3o:A 341 66 0.0772 0.0587 0.3030 3.2 6p3m:A, 6p3n:A
33 6mro:A 194 31 0.0425 0.0567 0.3548 3.3 8gdu:A
34 1md9:A 536 44 0.0579 0.0280 0.3409 3.7 1mdb:A
35 7qrd:C 364 44 0.0734 0.0522 0.4318 4.7 6arj:A, 6arj:B, 6arj:C, 6arj:D, 6arv:A, 6arv:B, 6arv:C, 6arv:D, 3b3f:A, 3b3f:B, 3b3f:C, 3b3f:D, 6d2l:A, 6d2l:B, 6d2l:C, 6d2l:D, 6d2l:E, 6d2l:F, 6dvr:A, 6dvr:B, 5dwq:B, 5dwq:D, 5dwq:A, 5dwq:C, 5dx0:A, 5dx0:B, 5dx0:C, 5dx0:D, 5dx1:A, 5dx1:B, 5dx1:C, 5dx1:D, 5dx8:A, 5dx8:B, 5dx8:C, 5dx8:D, 5dxa:A, 5dxa:B, 5dxa:D, 5dxa:C, 5dxj:A, 5dxj:B, 5dxj:C, 5dxj:D, 7fai:A, 7fai:B, 7fai:C, 7fai:D, 7faj:A, 7faj:B, 7faj:C, 7faj:D, 8g2h:A, 8g2i:A, 5ih3:A, 5ih3:B, 5ih3:C, 5ih3:D, 4ikp:A, 4ikp:B, 4ikp:C, 4ikp:D, 5is6:A, 5is6:B, 5is6:C, 5is6:D, 5is7:A, 5is7:B, 5is7:C, 5is7:D, 5is8:A, 5is8:B, 5is8:D, 5is8:C, 5is9:A, 5is9:B, 5is9:C, 5is9:D, 5isa:C, 5isa:D, 5isa:A, 5isa:B, 5isb:A, 5isb:B, 5isb:C, 5isb:D, 5isc:A, 5isc:B, 5isc:C, 5isc:D, 5isd:A, 5isd:B, 5isd:C, 5isd:D, 5ise:A, 5ise:B, 5ise:C, 5ise:D, 5isf:A, 5isf:B, 5isf:C, 5isf:D, 5isg:A, 5isg:B, 5isg:C, 5isg:D, 5ish:A, 5ish:B, 5ish:C, 5ish:D, 5isi:A, 5isi:B, 5isi:C, 5isi:D, 6izq:A, 5k8v:A, 5k8v:B, 5k8v:C, 5k8v:D, 5k8w:A, 5k8w:B, 5k8w:C, 5k8w:D, 5k8x:A, 5k8x:B, 5k8x:C, 5k8x:D, 5lgp:A, 5lgp:B, 5lgp:C, 5lgp:D, 5lgq:B, 5lgq:A, 5lgq:C, 5lgq:D, 5lgr:A, 5lgr:B, 5lgr:C, 5lgr:D, 5lgs:A, 5lgs:B, 5lgs:C, 5lgs:D, 5lkj:A, 5lkj:B, 5lkj:C, 5lkj:D, 5lv2:A, 5lv2:B, 5lv2:C, 5lv2:D, 5lv2:E, 5lv2:F, 5lv2:G, 5lv2:H, 5lv3:A, 5lv3:B, 5lv3:C, 5lv3:D, 5ntc:A, 5ntc:B, 5ntc:C, 5ntc:D, 7okp:A, 7okp:B, 7okp:C, 7okp:D, 7os4:A, 7os4:B, 7os4:C, 7os4:D, 7ppq:A, 7ppq:B, 7ppq:C, 7ppq:D, 7ppy:A, 7ppy:B, 7ppy:C, 7ppy:D, 7pu8:A, 7pu8:B, 7pu8:C, 7pu8:D, 7puc:A, 7puc:B, 7puc:C, 7puc:D, 7puq:A, 7puq:B, 7puq:C, 7puq:D, 7pv6:A, 7pv6:B, 7pv6:C, 7pv6:D, 7qph:A, 7qph:D, 7qph:C, 7qph:B, 7qrd:A, 7qrd:B, 7qrd:D, 6s70:A, 6s70:B, 6s70:C, 6s70:D, 6s71:A, 6s71:B, 6s71:C, 6s71:D, 6s74:A, 6s74:B, 6s74:C, 6s74:D, 6s77:A, 6s77:B, 6s77:C, 6s77:D, 6s79:A, 6s79:B, 6s79:C, 6s79:D, 6s7a:A, 6s7a:B, 6s7a:C, 6s7a:D, 6s7b:A, 6s7b:B, 6s7b:C, 6s7b:D, 6s7c:A, 6s7c:B, 6s7c:C, 6s7c:D, 8sig:A, 8sih:A, 5tbh:A, 5tbh:B, 5tbh:C, 5tbh:D, 5tbi:A, 5tbi:B, 5tbi:C, 5tbi:D, 5tbj:A, 5tbj:B, 5tbj:C, 5tbj:D, 5u4x:A, 5u4x:B, 5u4x:C, 5u4x:D, 7u9i:A, 7u9i:B, 2v74:B, 2v74:D, 2v74:F, 2v74:H, 2y1w:A, 2y1w:B, 2y1w:C, 2y1w:D, 2y1x:A, 2y1x:D, 2y1x:B, 2y1x:C
36 1eiz:A 180 23 0.0425 0.0611 0.4783 4.8 1ej0:A
37 7q2d:A 286 86 0.0927 0.0839 0.2791 4.8 2fk8:A, 3ha3:A, 3ha5:A, 3ha7:A, 7q2b:A, 7q2c:A, 7q2e:A, 7q2f:A, 7q2g:A, 7q2h:A
38 5imt:A 460 69 0.0656 0.0370 0.2464 5.2
39 7ezx:k6 285 49 0.0888 0.0807 0.4694 5.4 7ezx:kH, 6kgx:31, 6kgx:34, 7y4l:fA, 7y4l:hA, 7y5e:fB, 7y5e:hB, 7y7a:fA, 7y7a:hA, 7y7a:fW, 7y7a:hW
40 4ru4:B 590 137 0.1351 0.0593 0.2555 5.9 4ru4:A, 4ru4:C, 4ru4:D, 4ru4:E, 4ru4:F

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218