Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ESGFDYEGLIDSELQKKRLDKSYRYFNNINRLAKEFPLAHRQREADKVTVWCSNDYLALSKHPEVLDAMHKTIDKYGCGA
GGTRNIAGHNIPTLNLEAELATLHKKEGALVFSSCYVANDAVLSLLGQKMKDLVIFSDELNHASMIVGIKHANVKKHIFK
HNDLNELEQLLQSYPKSVPKLIAFESVYSMAGSVADIEKICDLADKYGALTFLDEVHAVGLYGPHGAGVAEHCDFESHRA
SGIATPKTNDKGGAKTVMDRVDMITGTLGKSFGSVGGYVAASRKLIDWFRSFAPGFIFTTTLPPSVMAGATAAIRYQRCH
IDLRTSQQKHTMYVKKAFHELGIPVIPNPSHIVPVLIGNADLAKQASDILINKHQIYVQAINFPTVARGTERLRITPTPG
HTNDLSDILINAVDDVFNELQLPRVRDWESQGGLLGVVEESNLWTSSQLSLTNDDLNPNVRDPIVKQLEVSSGIKQ

The query sequence (length=476) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5txr:A 479 479 0.9958 0.9896 0.9896 0.0 8eim:A, 8eim:B, 5txr:B
2 6hrh:A 429 425 0.3908 0.4336 0.4376 1.70e-132 6hrh:B, 5qqq:B, 5qqq:A, 5qqr:B, 5qqr:A, 5qqs:B, 5qqs:A, 5qqt:B, 5qqt:A, 5qqu:B, 5qqu:A, 5qqv:B, 5qqv:A, 5qqw:B, 5qqw:A, 5qqx:B, 5qqx:A, 5qqy:B, 5qqy:A, 5qqz:B, 5qqz:A, 5qr0:B, 5qr0:A, 5qr1:B, 5qr1:A, 5qr2:B, 5qr2:A, 5qr3:B, 5qr3:A, 5qr4:B, 5qr4:A, 5qr5:B, 5qr5:A, 5qr6:B, 5qr6:A, 5qr7:B, 5qr7:A, 5qr8:B, 5qr8:A, 5qr9:B, 5qr9:A, 5qra:B, 5qra:A, 5qrb:B, 5qrb:A, 5qrc:B, 5qrc:A, 5qrd:B, 5qrd:A, 5qre:B, 5qre:A, 5qt3:B, 5qt3:A
3 2bwo:B 399 416 0.4181 0.4987 0.4784 1.36e-129 2bwn:A, 2bwn:B, 2bwn:D, 2bwn:E, 2bwo:A, 2bwo:D, 2bwo:E, 2bwp:A, 2bwp:B, 2bwp:D, 2bwp:E
4 3tqx:A 396 379 0.2605 0.3131 0.3272 9.54e-66 3tqx:B
5 1fc4:A 401 359 0.2500 0.2968 0.3315 3.10e-62 1fc4:B
6 7v58:B 400 382 0.2437 0.2900 0.3037 5.86e-61 7v58:A, 7v5i:A, 7v5i:B, 7v5i:C, 7v5i:D
7 7poa:A 398 381 0.2605 0.3116 0.3255 1.14e-54 7poa:B, 7pob:A, 7pob:D, 7pob:B, 7pob:C, 7poc:A, 7poc:D, 7poc:B, 7poc:C
8 7bxq:A 399 392 0.2416 0.2882 0.2934 2.34e-46 7bxq:B, 7bxr:A, 7bxr:B, 7bxs:A, 7bxs:B
9 4bmk:A 398 362 0.2164 0.2588 0.2845 1.98e-42 4bmk:B, 2jg2:A, 2w8j:A, 2w8t:A, 2w8u:A, 2w8v:A, 2w8w:A, 2xbn:A
10 7yj1:B 502 393 0.2311 0.2191 0.2799 4.20e-40 7cqi:T, 7cqk:T, 7k0i:B, 7k0i:E, 7k0j:B, 7k0k:B, 7k0l:B, 7k0m:B, 7k0m:F, 7k0n:B, 7k0n:F, 7k0o:B, 7k0o:F, 7k0p:B, 7k0p:F, 7k0q:B, 6m4n:B, 6m4n:F, 6m4o:T, 7yiu:B, 7yiy:B, 7yj2:B
11 8guh:A 394 415 0.2311 0.2792 0.2651 2.38e-38 3a2b:A, 8h1q:A, 8h1y:A, 8h20:A, 8h21:A, 8h29:A, 8iyp:A, 8iyt:A
12 2x8u:A 399 360 0.1996 0.2381 0.2639 3.75e-37 2x8u:B
13 8c81:C 561 387 0.2290 0.1943 0.2817 9.02e-33 8c80:C, 8c82:C, 8c82:G, 8iaj:B, 8iaj:F, 8iak:B, 8iak:F, 8iam:B, 8iam:F, 8qof:C, 8qof:G, 8qog:C
14 7u7h:A 423 391 0.2017 0.2270 0.2455 1.68e-31 7u7h:B
15 1dj9:A 383 358 0.2080 0.2585 0.2765 2.97e-29 1dje:A, 8dle:A, 2g6w:A
16 7yjm:B 471 404 0.2059 0.2081 0.2426 1.27e-28 7yjk:B, 7yjk:F, 7yjn:B, 7yjo:B
17 7yjk:A 445 281 0.1492 0.1596 0.2527 1.62e-24 7yjk:E, 7yjn:A, 7yjo:A
18 7k0n:A 464 264 0.1492 0.1530 0.2689 2.90e-23 7cqi:S, 7cqk:S, 7k0i:A, 7k0i:D, 7k0j:A, 7k0k:A, 7k0l:A, 7k0n:E, 7k0o:A, 7k0o:E, 7k0p:A, 7k0p:E, 7k0q:A, 6m4n:A, 6m4n:E, 7yiy:A, 7yj2:A
19 2wk8:B 364 382 0.1765 0.2308 0.2199 9.04e-21
20 3hqt:B 386 382 0.1744 0.2150 0.2173 1.08e-20 3hqt:A, 3kki:A, 3kki:B, 2wk8:A, 2wk9:A, 2wk9:B, 2wka:A, 2wka:B
21 8qog:B 500 308 0.1576 0.1500 0.2435 1.85e-20 8iaj:A, 8iaj:E, 8iak:A, 8iak:E, 8qof:F, 8qof:B
22 8xha:A 401 363 0.1849 0.2195 0.2424 8.70e-06 8i7u:C, 8i7u:F, 8i7u:A, 8i7u:E, 8i7u:B, 8i7u:D, 8xha:B, 8xhd:A, 8xhd:B, 8xhk:C, 8xhk:A, 8xhk:B, 8xhk:E, 8xhk:D, 8xhk:F
23 2cfb:A 360 159 0.0903 0.1194 0.2704 4.93e-05
24 1pg8:A 398 130 0.0819 0.0980 0.3000 0.002 7f1u:A, 7f1u:B, 7f1u:C, 7f1u:D, 7f1v:A, 7f1v:B, 7f1v:C, 7f1v:D, 1pg8:C, 1pg8:B, 1pg8:D, 3vk3:A, 3vk3:B, 3vk3:C, 3vk3:D, 5x2w:A, 5x2w:B, 5x2w:C, 5x2w:D, 5x2x:A, 5x2x:B, 5x2x:C, 5x2x:D, 5x2z:A, 5x2z:B, 5x2z:C, 5x2z:D, 5x30:A, 5x30:B, 5x30:C, 5x30:D
25 1n8p:A 393 115 0.0672 0.0814 0.2783 0.057 1n8p:B, 1n8p:C, 1n8p:D
26 1cs1:D 384 47 0.0399 0.0495 0.4043 0.14
27 1gd9:A 388 192 0.0861 0.1057 0.2135 0.25 1dju:A, 1dju:B, 1gd9:B, 1gde:A, 1gde:B
28 8jui:A 380 192 0.1050 0.1316 0.2604 0.44
29 6egr:A 396 131 0.0735 0.0884 0.2672 0.54 5d5s:A, 5e4z:A, 4hf8:A, 3jw9:A, 3jwa:A, 3jwb:A, 5k30:A, 5m3z:A, 3mkj:A, 4oma:A, 6s0c:A
30 1ibj:A 380 120 0.0672 0.0842 0.2667 0.79 1ibj:C
31 8om5:A 828 61 0.0420 0.0242 0.3279 0.84 8omo:A
32 8ag6:A 896 61 0.0420 0.0223 0.3279 0.93 2o8b:A, 2o8c:A, 2o8d:A, 2o8e:A, 2o8f:A, 8olx:A, 8om9:A, 8oma:A, 8omq:A, 3thw:A, 3thx:A, 3thy:A, 3thz:A
33 8ht4:B 390 91 0.0441 0.0538 0.2308 2.2 8ht4:A
34 6a2f:A 358 86 0.0504 0.0670 0.2791 2.6 6a2f:B
35 6ylg:K 234 81 0.0420 0.0855 0.2469 2.6
36 6ld8:A 388 126 0.0756 0.0928 0.2857 3.0 6ld8:D, 6ld8:B, 6ld8:C, 6ld9:A, 6ld9:B, 6ld9:C, 6ld9:D, 6lgo:A, 6lgo:B, 6lgo:C, 6lgo:D
37 1dfo:B 417 61 0.0420 0.0480 0.3279 3.2 1dfo:A, 1dfo:D, 1dfo:C, 1eqb:A, 1eqb:B, 1eqb:D, 1eqb:C, 3g8m:A
38 6ylh:K 258 81 0.0420 0.0775 0.2469 3.4
39 2eig:A 230 34 0.0315 0.0652 0.4412 4.7 2eig:B, 2eig:C, 2eig:D
40 7cep:A 414 237 0.1113 0.1280 0.2236 5.7 7ceo:A, 7cer:A, 7ces:A, 7e6b:A, 7e6c:A, 7e6e:A, 7e6f:A, 5j8q:A, 6kfz:A, 7xej:A, 7xek:A, 7xen:A, 7xep:A, 7xet:A, 5xt5:A, 5xt5:B, 5xt6:A, 5xt6:B, 5zsk:A, 5zso:A
41 8q5x:A 280 168 0.0777 0.1321 0.2202 6.0 8q5x:C, 8q5x:B, 8q5x:D
42 4ad9:A 288 54 0.0336 0.0556 0.2963 6.7 4ad9:B, 4ad9:C, 4ad9:D, 4ad9:E, 4ad9:F
43 1e5e:A 394 126 0.0777 0.0939 0.2937 6.8 1e5e:B, 1e5f:A, 1e5f:B
44 8e9b:B 387 116 0.0672 0.0827 0.2759 7.1 8uxw:B, 8uxx:B, 6w17:B, 6w18:B
45 4v2k:A 235 81 0.0546 0.1106 0.3210 8.9 4wq7:A, 4wq8:A, 4wq9:A, 4wqa:A, 4wqb:A, 4wqc:A, 4wqd:A, 4wqe:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218