Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ERPTLPIPDLLTTDARNRIQLTIGAGQSTFGGKTATTWGYNGNLLGPAVKLQRGKAVTVDIYNQLTEETTLHWHGLEVPG
EVDGGPQGIIPPGGKRSVTLNVDQPAATCWFHPHQHGKTGRQVAMGLAGLVVIEDDEILKLMLPKQWGIDDVPVIVQDKK
FSADGQIDYQLDVMTAAVGWFGDTLLTNGAIYPQHAAPRGWLRLRLLNGCNARSLNFATSDNRPLYVIASDGGLLPEPVK
VSELPVLMGERFEVLVEVNDNKPFDLVTLPVSQMGMAIAPFDKPHPVMRIQPIAISASGALPDTLSSLPALPSLEGLTVR
KLQLSMDGGANKINGQAFDMNKPMFAAAKGQYERWVISGVGDMMLHPFHIHGTQFRILSENGKPPAAHRAGWKDTVKVEG
NVSEVLVKFNHDAPKEHAYMAHCHLLEHEDTGMMLGFTVGHHHH

The query sequence (length=444) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7f19:A 444 443 0.9820 0.9820 0.9842 0.0 2yxv:A, 2yxv:B, 2yxw:A, 2yxw:B
2 5b7e:A 477 468 0.9865 0.9182 0.9359 0.0 5b7f:A, 5b7m:A, 5b7m:B, 5b7m:C, 4ef3:A, 2fqd:A, 2fqe:A, 2fqf:A, 2fqg:A, 6im7:A, 1kv7:A, 1n68:A, 3nsc:A, 3nsd:A, 3nsy:A, 3nt0:A, 3pau:A, 3pav:A, 1pf3:A, 3qqx:A, 5ys1:A, 5ys5:A
3 3od3:A 488 487 0.9887 0.8996 0.9014 0.0 4e9q:A, 4e9r:A, 4e9s:A, 4e9t:A, 7f0v:A, 7f0v:B, 4hak:A, 4hal:A, 4ner:A, 3uaa:A, 3uab:A, 3uac:A, 3uad:A, 3uae:A
4 6evg:A 444 444 0.3964 0.3964 0.3964 4.63e-101
5 6xiz:A 477 444 0.3896 0.3627 0.3896 9.49e-91 6xiz:B, 6z0j:A, 6z0k:A
6 9f1t:A 477 442 0.3739 0.3480 0.3756 9.94e-85 9f1t:B, 9f3z:B, 9f3z:A
7 6xj0:A 508 438 0.3806 0.3327 0.3858 2.28e-81
8 6ttd:A 457 419 0.3108 0.3020 0.3294 3.99e-64 6syy:A, 6ttd:B
9 6w2k:A 440 458 0.3491 0.3523 0.3384 4.39e-59 5afa:A, 5g3b:A, 5g3c:A, 5g3d:A, 5g3e:A, 5g3f:A, 5g3g:A, 5g3h:A, 5jrr:A, 5jx9:A, 5k0d:A, 5k15:A, 5k3k:A, 5k5k:A, 5k7a:A, 5k84:A, 6q29:A, 6tyr:A, 6w2k:B, 6w9x:A, 6wcg:A, 6wch:A, 6wcl:A, 6wcm:A, 6wcn:A, 6wcp:A, 2xu9:A, 2yae:A, 2yaf:A, 2yah:A, 2yam:A, 2yao:A, 2yap:A, 2yaq:A, 2yar:A
10 3aw5:A 438 439 0.3108 0.3151 0.3144 2.88e-51 6k3d:A, 8p4g:A, 8p4g:B
11 6iqy:A 536 421 0.2995 0.2481 0.3159 3.94e-45 3abg:A, 3abg:B, 6i3j:A, 6i3j:B, 6i3k:A, 6i3k:B, 6i3l:A, 6i3l:B, 6iqx:A, 6iqx:B, 6iqy:B, 6iqz:A, 2xll:A, 2xll:B, 2xll:C, 2xll:D
12 3zx1:A 471 425 0.2748 0.2590 0.2871 1.79e-43
13 4ako:A 506 500 0.2995 0.2628 0.2660 1.43e-37 4a66:A, 4a67:A, 4a68:A, 4akp:A, 4akq:A, 2bhf:A, 1gsk:A, 1of0:A, 4q89:A, 4q89:B, 4q8b:A, 4q8b:B, 1w6l:A, 1w6w:A, 1w8e:A, 2wsd:A, 2x87:A, 2x88:A, 7y8b:A, 7y8b:B, 7y8c:A, 7y8c:B, 4yvn:A, 4yvu:A, 3zdw:A, 5zlj:A, 5zlk:A, 5zll:A, 5zlm:A
14 7z5p:A 505 502 0.2928 0.2574 0.2590 2.24e-36 7z5p:B
15 3gyr:A 587 539 0.3198 0.2419 0.2635 1.54e-28 3gyr:B, 3gyr:C, 3gyr:D, 3gyr:E, 3gyr:F, 3gyr:G, 3gyr:H, 3gyr:I, 3gyr:J, 3gyr:K, 3gyr:L
16 6vow:A 409 436 0.2703 0.2934 0.2752 6.30e-25
17 6vox:A 407 427 0.2342 0.2555 0.2436 5.42e-22
18 1aoz:A 552 308 0.1757 0.1413 0.2532 6.78e-13 1aoz:B, 1aso:A, 1aso:B, 1asp:A, 1asp:B, 1asq:A, 1asq:B
19 3fu7:A 559 483 0.2635 0.2093 0.2422 9.09e-13 3dkh:A, 3dkh:B, 3fu7:B, 3fu8:A, 3fu8:B, 3fu9:A, 3fu9:B, 1gw0:A, 1gw0:B, 2ih8:A, 2ih8:B, 2ih9:A, 2ih9:B, 2q9o:A, 2q9o:B, 3qpk:A, 3qpk:B
20 3pps:A 564 477 0.2613 0.2057 0.2432 6.87e-12 3pps:B, 3pps:C, 3pps:D
21 6f5k:A 558 474 0.2455 0.1953 0.2300 1.77e-11
22 3sqr:A 539 267 0.1644 0.1354 0.2734 6.57e-11 3v9e:A, 4x4k:A
23 3sqr:A 539 100 0.0563 0.0464 0.2500 0.035 3v9e:A, 4x4k:A
24 5lwx:A 554 228 0.1261 0.1011 0.2456 9.13e-10 5lm8:A, 5lww:A
25 5z1x:A 495 460 0.2387 0.2141 0.2304 2.06e-09 5z1x:B, 5z22:A
26 6klg:A 547 319 0.1599 0.1298 0.2226 1.15e-08 6kli:A, 6klj:A
27 1zpu:A 529 463 0.2252 0.1890 0.2160 1.48e-07 1zpu:B, 1zpu:C, 1zpu:D, 1zpu:E, 1zpu:F
28 8r7i:A 628 239 0.1464 0.1035 0.2720 2.33e-07
29 8r7i:A 628 94 0.0608 0.0430 0.2872 0.004
30 3kw7:A 502 481 0.2342 0.2072 0.2162 3.21e-07 3kw7:B
31 1a65:A 504 450 0.2207 0.1944 0.2178 4.07e-07 1hfu:A
32 3g5w:A 318 110 0.0788 0.1101 0.3182 4.08e-07 3g5w:B, 3g5w:C, 3g5w:D, 3g5w:E, 3g5w:F
33 5ehf:A 497 455 0.2140 0.1911 0.2088 5.25e-07
34 7rab:A 299 102 0.0721 0.1070 0.3137 1.17e-06 7rab:B, 7rab:C, 7rab:D, 7rab:E, 7rab:F, 7rab:G, 7rab:H, 7rac:A, 7rac:B, 7rac:C, 7rac:D, 7rac:E, 7rac:F, 7rac:G, 7rac:H, 7rac:I, 7rac:J, 7rac:K, 7rac:L
35 5mej:A 499 73 0.0541 0.0481 0.3288 2.77e-06 5e9n:A, 5mew:A, 5mhu:A, 5mhv:A, 5mhw:A, 5mhx:A, 5mhy:A, 5mhz:A, 5mi1:A, 5mi2:A, 5mia:A, 5mib:A, 5mic:A, 5mid:A, 5mie:A, 5mig:A, 6rgh:A, 6rgp:A, 6rhh:A, 6rhi:A, 6rho:A, 6rhp:A, 6rhr:A, 6rhu:A, 6rhx:A, 6ri0:A, 6ri2:A, 6ri4:A, 6ri6:A, 6ri8:A, 6rii:A, 6rik:A, 6ril:A
36 5mej:A 499 240 0.1284 0.1142 0.2375 7.54e-04 5e9n:A, 5mew:A, 5mhu:A, 5mhv:A, 5mhw:A, 5mhx:A, 5mhy:A, 5mhz:A, 5mi1:A, 5mi2:A, 5mia:A, 5mib:A, 5mic:A, 5mid:A, 5mie:A, 5mig:A, 6rgh:A, 6rgp:A, 6rhh:A, 6rhi:A, 6rho:A, 6rhp:A, 6rhr:A, 6rhu:A, 6rhx:A, 6ri0:A, 6ri2:A, 6ri4:A, 6ri6:A, 6ri8:A, 6rii:A, 6rik:A, 6ril:A
37 2qt6:A 498 451 0.2185 0.1948 0.2151 4.80e-06 2qt6:B
38 7zn6:A 576 265 0.1329 0.1024 0.2226 6.13e-06
39 7zn6:A 576 149 0.0923 0.0712 0.2752 3.0
40 3x1b:A 500 486 0.2252 0.2000 0.2058 6.53e-06 3x1b:B
41 3gdc:A 288 117 0.0833 0.1285 0.3162 7.33e-06 3gdc:B, 3gdc:C
42 1v10:A 487 248 0.1351 0.1232 0.2419 1.38e-05
43 1v10:A 487 73 0.0473 0.0431 0.2877 0.013
44 4a2e:A 496 479 0.2230 0.1996 0.2067 1.57e-05 4a2d:A, 4a2f:A, 4a2g:A, 4a2h:A, 5a7e:A, 5anh:A, 5anh:B, 5anh:C, 6h5y:A, 6h5y:B, 2hrg:A, 2hrh:A, 4jhu:A, 4jhv:A
45 4e9v:A 317 88 0.0631 0.0883 0.3182 2.49e-05 4e9v:C, 4e9v:B, 4e9w:A, 4e9w:B, 4e9w:C, 4e9x:A, 4e9x:C, 4e9x:B, 4e9y:A, 4e9y:C, 4e9y:B, 2zwn:A, 2zwn:B, 2zwn:C
46 3t6v:A 495 74 0.0541 0.0485 0.3243 1.22e-04 3t6v:B, 3t6v:C, 3t6w:A, 3t6w:B, 3t6w:C, 3t6x:A, 3t6x:B, 3t6x:C, 3t6z:A, 3t6z:B, 3t6z:C, 3t71:A, 3t71:B, 3t71:C
47 3t6v:A 495 240 0.1284 0.1152 0.2375 0.008 3t6v:B, 3t6v:C, 3t6w:A, 3t6w:B, 3t6w:C, 3t6x:A, 3t6x:B, 3t6x:C, 3t6z:A, 3t6z:B, 3t6z:C, 3t71:A, 3t71:B, 3t71:C
48 1gyc:A 499 461 0.2162 0.1924 0.2082 3.82e-04
49 5nq7:A 497 451 0.2027 0.1811 0.1996 0.007 5nq8:A, 5nq9:A, 5nq9:C, 2xyb:A
50 4kns:A 285 124 0.0586 0.0912 0.2097 0.015 4kns:B, 4kns:C, 4kns:D, 4kns:E, 4kns:F, 4knt:A, 4knt:B, 4knt:C, 4knu:A, 4knu:B, 4knu:C, 4knu:D, 4knu:E, 4knu:F
51 8aip:A 275 107 0.0653 0.1055 0.2710 0.027
52 8aip:A 275 102 0.0653 0.1055 0.2843 0.038
53 3tas:B 301 139 0.0833 0.1229 0.2662 0.029 6fc7:A, 6fc7:B, 6fc7:C, 6fc7:D, 6fc7:E, 6fc7:F, 6fc7:G, 6fc7:H, 6fc7:I, 6fc7:J, 6fc7:L, 6fc7:K, 6fdj:A, 6fdj:B, 6fdj:C, 6fdj:D, 6fdj:F, 6fdj:E, 6fdj:G, 6fdj:I, 6fdj:H, 6fdj:J, 6fdj:K, 6fdj:L, 5lhl:A, 5lhl:B, 5lhl:C, 5lhl:D, 5lhl:F, 5lhl:E, 4m3h:A, 4m3h:B, 4m3h:C, 5mkm:A, 5mkm:B, 5mkm:C, 5mkm:D, 5mkm:E, 5mkm:F, 5o3k:A, 5o3k:C, 5o3k:B, 5o3k:D, 5o3k:E, 5o3k:F, 5o3k:G, 5o3k:H, 5o3k:I, 5o3k:J, 5o3k:K, 5o3k:L, 5o4i:A, 5o4i:B, 5o4i:C, 5o4i:D, 5o4i:E, 5o4i:F, 5o4i:G, 5o4i:H, 5o4i:I, 5o4i:J, 5o4i:K, 5o4i:L, 5o4q:A, 5o4q:B, 5o4q:C, 5o4q:D, 5o4q:E, 5o4q:F, 5o4q:G, 5o4q:H, 5o4q:I, 5o4q:J, 5o4q:K, 5o4q:L, 8p9u:A, 8p9u:C, 8p9u:B, 8p9u:D, 8p9u:F, 8p9u:E, 8p9v:A, 8p9v:B, 8p9v:C, 8p9v:D, 8p9v:E, 8p9v:F, 7pen:A, 7pen:B, 7pen:C, 7pen:D, 7pen:E, 7pen:F, 7pes:A, 7pes:B, 7pes:C, 7pes:D, 7pes:E, 7pes:F, 7pfr:A, 7pfr:B, 7pfr:C, 7pfr:D, 7pfr:E, 7pfr:F, 7ptm:A, 7ptm:C, 7ptm:B, 7ptm:D, 7ptm:F, 7ptm:E, 7pu0:A, 7pu0:B, 7pu0:C, 7pu0:D, 7pu0:E, 7pu0:F, 7puh:A, 7puh:C, 7puh:B, 7puh:D, 7puh:F, 7puh:E, 6rh9:A, 6rh9:B, 6rh9:C, 6rh9:D, 6rh9:E, 6rh9:F, 6rh9:G, 6rh9:H, 6rh9:I, 6rh9:J, 6rh9:K, 6rh9:L, 6rhq:A, 6rhq:B, 6rhq:C, 6rhq:D, 6rhq:E, 6rhq:F, 6s0o:A, 6s0o:B, 6s0o:C, 6s0o:D, 6s0o:E, 6s0o:F, 3tas:A, 3tas:C, 3tbb:A, 3tbb:B, 3tbb:C, 3tbc:A, 3tbc:B, 3tbc:C, 4uah:A, 4uah:B, 4uah:C, 4uan:A, 4uan:B, 4uan:C, 4w1t:A, 4w1t:B, 4w1t:C, 4wtq:A, 4wtq:B, 4wtq:C, 6y4a:AAA, 6y4a:BBB, 6y4a:CCC, 6yo5:AAA, 6yo5:BBB, 6yo5:CCC, 6yzd:AAA, 6yzd:BBB, 6yzd:CCC, 6yzf:CCC, 6yzf:AAA, 6yzf:BBB, 6yzy:AAA, 6yzy:BBB, 6yzy:CCC, 6zij:A, 6zij:C, 6zij:B, 6zij:D, 6zij:F, 6zij:E, 6zip:A, 6zip:B, 6zip:C, 6zip:D, 6zip:E, 6zip:F, 6zip:G, 6zip:H, 6zip:I, 6zip:J, 6zip:L, 6zip:K
54 4n8u:B 276 107 0.0698 0.1123 0.2897 0.033 4n8u:A, 4n8u:C
55 7b2k:A 282 107 0.0631 0.0993 0.2617 0.059 7b2k:B, 7b4y:A, 7b4y:B, 7bdn:A, 7bdn:B, 7bfm:A, 7bfm:C, 3cg8:A, 3cg8:C, 3cg8:B, 4gxf:A, 4gxf:B, 4gxf:C, 4gy4:A, 4gy4:B, 4gy4:C, 4gyb:A, 3kw8:A, 4naj:A, 4nb7:A, 8u8p:A, 8u8p:C, 8u8p:B, 8u8q:A, 8u8q:B, 8u8q:C, 8u8r:A, 8u8r:B, 8u8r:C, 8u8s:A, 8u8s:B, 8u8s:C, 8u8t:A, 8u8t:C, 8u8t:B, 7w6v:A
56 3div:A 499 105 0.0721 0.0641 0.3048 0.060 3fpx:A, 2h5u:A, 5ldu:A, 3pxl:A, 3v9c:A
57 1kya:A 499 455 0.2117 0.1884 0.2066 0.068 1kya:B, 1kya:C, 1kya:D
58 2hzh:A 499 75 0.0450 0.0401 0.2667 0.16
59 2hzh:A 499 84 0.0541 0.0481 0.2857 0.21
60 2bo0:A 336 226 0.1149 0.1518 0.2257 0.17 5b1j:A, 5b1j:B, 5b1k:A, 2bp0:A, 2bp0:B, 2bp8:A, 2bp8:B, 1bq5:A, 4csp:A, 4csp:F, 4csz:A, 1gs6:X, 1gs7:A, 1gs8:A, 1hau:A, 1haw:A, 2jfc:A, 2jfc:B, 2jfc:C, 2jfc:D, 2jfc:E, 2jfc:F, 1ndt:A, 1oe1:A, 1oe2:A, 1oe3:A, 5onx:A, 5ony:A, 2vm3:A, 2vm4:A, 2vmj:A, 2vn3:A, 2vw4:A, 2vw4:B, 2vw6:A, 2vw6:B, 2vw7:A, 2vw7:B, 1wa0:X, 1wa1:X, 1wa2:X, 1wae:A, 2xwz:A, 2xwz:E, 2xwz:D, 2xwz:B, 2xwz:F, 2xwz:C, 2xx0:A, 2xx0:B, 2xx1:A, 2xx1:D, 2xx1:B, 2xx1:C, 2xx1:E, 2xx1:F, 2xxf:A, 2xxf:B, 2xxg:A, 2xxg:C, 2zon:A, 2zon:B, 2zon:C
61 3h0g:B 1150 114 0.0698 0.0270 0.2719 0.40 3h0g:N
62 5zl1:A 306 106 0.0676 0.0980 0.2830 0.49 5zl1:B, 5zl1:C, 5zl1:D
63 3ta4:F 282 107 0.0631 0.0993 0.2617 0.87 3t9w:A, 3ta4:E, 3ta4:D
64 3ox6:E 118 61 0.0405 0.1525 0.2951 1.4
65 6the:A 299 133 0.0698 0.1037 0.2331 1.6
66 3wi9:A 303 95 0.0608 0.0891 0.2842 1.8 6l46:A, 3wia:A, 3wia:B, 3wia:C, 3wia:D, 3wia:E, 3wia:F, 3wia:G, 3wia:H, 3wia:I, 3wkp:A, 3wkq:A, 3wni:A, 3wnj:A, 3x1e:A, 3x1f:A, 3x1g:A, 3x1n:A, 4ysa:A, 4ysd:A, 4yso:A, 4ysp:A, 4ysq:A, 4ysr:A, 4yss:A, 4yst:A, 4ysu:A, 5ytl:A, 5ytm:A, 5ytn:A, 4zk8:A
67 5n0k:A 1034 107 0.0563 0.0242 0.2336 2.5 5n4l:A, 5n4l:B
68 5q0c:A 328 81 0.0608 0.0823 0.3333 2.6 5et6:A, 5et6:C, 5et6:B, 5et6:D, 4he0:A, 4he1:A, 4he2:A, 3ifa:A, 3ifa:B, 3ifa:C, 3ifa:D, 3ifc:A, 3ifc:B, 3ifc:C, 3ifc:D, 5k56:A, 5l0a:A, 5q0c:B, 5q0c:C, 5q0c:D, 5q0c:E, 5q0c:F, 5q0c:G, 5q0c:H
69 5k55:A 290 81 0.0608 0.0931 0.3333 2.6 5et8:A
70 7orc:B 1299 38 0.0315 0.0108 0.3684 2.7 5epg:A, 7opn:A, 7opn:B, 7orc:A, 6q6q:A, 4uhw:A, 4uhx:A
71 8emt:B 1221 38 0.0315 0.0115 0.3684 2.7
72 8emt:A 1254 38 0.0315 0.0112 0.3684 2.7
73 4bxs:V 1262 118 0.0608 0.0214 0.2288 3.6
74 1rf4:A 427 50 0.0405 0.0422 0.3600 3.9 1rf4:B, 1rf4:C, 1rf4:D, 1rf6:A, 1rf6:B, 1rf6:C, 1rf6:D
75 6c9r:A 337 117 0.0676 0.0890 0.2564 5.2 6c67:A, 6c67:B, 6c9n:A, 6c9n:B, 6c9p:A, 6c9p:B, 6c9q:A, 6c9r:B, 6c9s:A, 6c9s:B, 6c9v:A, 6c9v:B, 4o1g:A, 2pkk:A, 2pkm:A, 2pkn:A, 4pvv:A, 4ube:A
76 8dy7:C 1118 79 0.0495 0.0197 0.2785 6.1 8dy9:C, 8hvr:C, 8jke:C, 8k60:C, 7vpd:C, 7vpz:C, 7x74:C, 7x75:C, 7x76:C
77 4ejx:A 1034 110 0.0653 0.0280 0.2636 7.6 4enz:A, 2j5w:A, 1kcw:A
78 4ejx:A 1034 42 0.0315 0.0135 0.3333 9.3 4enz:A, 2j5w:A, 1kcw:A
79 4e6n:A 407 65 0.0428 0.0467 0.2923 7.6 4e6n:C, 3ty5:A, 3ty5:B, 3ty9:A, 3ty9:B, 3ty9:C, 3ty9:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218