Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
EREELAQQYEAILRECGHGRFQWTLYFVLGLALMADGVEVFVVGFVLPSAEKDMLGLIVYLGMMVGAFLWGGLADRLGRR
QCLLISLSVNSVFAFFSSFVQGYGTFLFCRLLSGVGIGGSIPIVFSYFSEFLAQEKRGEHLSWLCMFWMIGGVYAAAMAW
AIIPHYGWSFQMGSAYQFHSWRVFVLVCAFPSVFAIGALTTQPESPRFFLENGKHDEAWMVLKQVHDTNMRAKGHPERVF
SVTHIYQRWGVRALSLGGQVWGNFLSCFGPEYRRITLMMMGVWFTMSFSYYGLTVWFPDMIRHLQAVDYASRTKVFPGER
VEHVTFNFTLENQIHRGGQYFNDKFIGLRLKSVSFEDSLFEECYFEDVTSSNTFFRNCTFINTVFYNTDLFEYKFVNSRL
INSTFLHNKEAYMVYFVSFLGTLAVLPGNIVSALLMDKIGRLRMLAGSSVMSCVSCFFLSFGNSESAMIALLCLFGGVSI
ASWNALDVLTVELYPSDKRTTAFGFLNALCKLAAVLGISIFTSFVGITKAAPILFASAALALGSSLALKLPETRG

The query sequence (length=555) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8jlc:A 592 581 0.9982 0.9358 0.9535 0.0 8jlh:A, 8jli:A, 8jli:B, 8js8:A, 8k77:A, 8uo9:A, 8yf1:B, 8yf1:A
2 8uo8:A 574 573 0.6649 0.6429 0.6440 0.0
3 8et9:A 517 256 0.1225 0.1315 0.2656 1.59e-14
4 8et9:A 517 142 0.0577 0.0619 0.2254 0.33
5 8jtz:A 530 235 0.1063 0.1113 0.2511 4.99e-12 8jtt:A
6 8jtz:A 530 221 0.1045 0.1094 0.2624 1.09e-07 8jtt:A
7 8et7:A 532 246 0.1081 0.1128 0.2439 6.69e-12 8et8:A
8 8et7:A 532 220 0.0865 0.0902 0.2182 6.01e-04 8et8:A
9 7zha:A 487 243 0.1045 0.1191 0.2387 1.08e-09 7zh6:A
10 7zha:A 487 209 0.0739 0.0842 0.1962 1.54e-04 7zh6:A
11 6m20:B 478 178 0.0937 0.1088 0.2921 1.49e-09 6m20:A, 6m20:C, 6m20:D, 6m2l:A, 6m2l:B, 6rw3:A, 6rw3:B, 6rw3:C, 6rw3:D
12 8bvt:A 508 236 0.1063 0.1161 0.2500 4.68e-09 8bvs:A, 8bw7:A, 8sdz:A
13 8bvt:A 508 137 0.0649 0.0709 0.2628 0.11 8bvs:A, 8bw7:A, 8sdz:A
14 7aaq:A 487 171 0.0847 0.0965 0.2749 1.27e-08 7aar:A, 6h7d:A
15 4gby:A 475 244 0.0991 0.1158 0.2254 1.25e-06 4gbz:A, 4gc0:A
16 8sc2:A 453 146 0.0739 0.0905 0.2808 1.75e-05 8jtv:A, 8ju0:A, 8sc3:A, 8sc6:A
17 8sc2:A 453 162 0.0739 0.0905 0.2531 2.77e-04 8jtv:A, 8ju0:A, 8sc3:A, 8sc6:A
18 7spt:A 470 203 0.0955 0.1128 0.2611 6.18e-05 5c65:A, 5c65:B, 7crz:A, 7sps:A, 7sps:B, 4zw9:A, 4zwb:A, 4zwc:A, 4zwc:B
19 5eqg:A 447 241 0.1081 0.1342 0.2490 9.52e-05 5eqh:A, 5eqi:A
20 8fvz:A 433 192 0.0739 0.0947 0.2135 0.002 8fvz:B, 7sp5:A, 7sp5:B
21 9b1l:A 529 247 0.1045 0.1096 0.2348 0.013 9b1g:A, 9b1h:A, 9b1i:A, 9b1j:A, 9b1k:A, 9b1m:A, 9b1n:A, 9b1o:A
22 9b1l:A 529 88 0.0450 0.0473 0.2841 5.8 9b1g:A, 9b1h:A, 9b1i:A, 9b1j:A, 9b1k:A, 9b1m:A, 9b1n:A, 9b1o:A
23 8y65:A 467 167 0.0721 0.0857 0.2395 0.019 8y66:A
24 8ttg:A 374 109 0.0486 0.0722 0.2477 0.10 8tte:A
25 8ttg:A 374 105 0.0468 0.0695 0.2476 1.6 8tte:A
26 9g11:A 476 182 0.0721 0.0840 0.2198 0.65
27 3ing:A 319 37 0.0252 0.0439 0.3784 5.8
28 5aor:A 1009 38 0.0234 0.0129 0.3421 7.2 5aor:B, 8b9i:A, 8b9j:A
29 8pjb:A 962 38 0.0234 0.0135 0.3421 8.0 8b9g:A, 8b9k:A, 8pjj:A
30 8ovj:SW 115 40 0.0252 0.1217 0.3500 8.1 6az1:W, 8rxh:SW, 8rxx:SW
31 7q3y:A 1201 54 0.0306 0.0142 0.3148 9.1 5am8:A, 5am8:B, 5am8:C, 5am8:D, 5am9:A, 5am9:B, 5am9:C, 5am9:D, 5ama:A, 5ama:B, 5ama:C, 5ama:D, 5amb:A, 5amb:B, 5amc:A, 5amc:B, 4aph:A, 4apj:A, 3bkk:A, 3bkl:A, 4bxk:A, 4bxk:B, 4bzr:A, 4bzs:A, 4bzs:B, 4c2n:A, 4c2o:A, 4c2p:A, 4c2q:A, 4c2r:A, 2c6f:A, 2c6f:B, 2c6n:A, 2c6n:B, 4ca5:A, 4ca6:A, 4ca6:B, 6en5:A, 6en5:B, 6en5:C, 6en5:D, 6en6:A, 6en6:B, 6en6:C, 6en6:D, 6f9r:A, 6f9r:B, 6f9t:A, 6f9u:A, 6f9v:A, 6f9v:B, 6h5w:A, 6h5x:A, 6h5x:B, 2iul:A, 2iux:A, 3l3n:A, 3nxq:A, 3nxq:B, 1o86:A, 1o8a:A, 2oc2:A, 7q24:B, 7q24:A, 7q25:B, 7q25:A, 7q26:B, 7q26:A, 7q27:A, 7q28:A, 7q29:A, 7q49:A, 7q4d:A, 7q4d:B, 7q4e:A, 8qfx:C, 8qfx:B, 8qfx:A, 8qfx:D, 8qhl:B, 8qhl:A, 6qs1:A, 6qs1:B, 6tt1:A, 6tt1:B, 6tt3:A, 6tt3:B, 6tt4:A, 6tt4:B, 4ufa:A, 4ufa:B, 4ufb:A, 4ufb:B, 4ufb:C, 4ufb:D, 1uze:A, 1uzf:A, 2xy9:A, 2xyd:A, 2xyd:B, 2ydm:A, 7z6z:B, 7z6z:A, 7z70:A, 6zpq:A, 6zpq:B, 6zpq:C, 6zpq:D, 6zpt:A, 6zpt:B, 6zpt:C, 6zpt:D, 6zpu:A
32 8r8r:A 1188 48 0.0216 0.0101 0.2500 9.8

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218