BioLiP

>protein
EQQLQKEEEARKVKSGIRQMRLFSQDECAKIEARIDEVVSRAEKGLYNEHTVDRAPLRNKYFFGEGYTYGPGQERLYPPG
DVDEIPEWVHQLVIQKLVEHRVIPEGFVNSAVINDYQPGGCIVSHVDPIHIFERPIVSVSFFSDSALCFGCKFQFKPIRV
SEPVLSLPVRRGSVTVLSGYAADEITHCIRPQDIKERRAVIILRKTRLDAPRL

The query sequence (length=213) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7wkv:A	219	219	0.9953	0.9680	0.9680	4.37e-155	4nj4:A, 4nj4:B, 4nro:A, 4nrp:A, 4nrq:A, 4o7x:A, 4oct:A, 4oct:B, 7v4g:A, 7v4g:B, 7v4g:C, 7wkv:C, 7wkv:E, 7wl0:A, 7wl0:C, 7wl0:E, 7wl0:G, 7wl0:I
2	4npl:A	213	213	0.8169	0.8169	0.8169	5.46e-128	4npl:B, 4npm:A, 4npm:B
3	3tht:B	312	132	0.1690	0.1154	0.2727	0.004	3thp:A, 3tht:A, 3tht:C, 3tht:D
4	8x3a:A	151	35	0.0610	0.0861	0.3714	0.71	8x39:A, 8x39:B
5	6f2a:C	326	39	0.0657	0.0429	0.3590	5.0	6f2a:A, 6f2a:B, 6f2a:D, 6f2b:A, 6f2b:B, 6f2b:C, 6f2b:D, 6f6j:A, 6f6j:B, 6f6j:C, 6f6j:D
6	3j79:a	106	73	0.0845	0.1698	0.2466	5.6	3jbn:Aa, 3jbo:Aa, 3jbp:Aa, 8tpu:Aa, 5umd:a
7	6pk3:B	400	21	0.0563	0.0300	0.5714	6.4	6pk1:A, 6pk1:B, 6pk3:A
8	3nqy:B	307	64	0.0798	0.0554	0.2656	7.2	3nqx:A, 3nqz:B
9	7evv:A	489	64	0.0845	0.0368	0.2812	7.5	6a88:A, 6a88:B, 6a88:C, 6a88:D, 7evu:A, 7evu:B, 7f9p:A, 7f9q:A, 7f9q:B, 7f9r:A, 7f9s:A, 7f9t:A, 7f9t:B, 7f9u:A, 7f9u:B, 7f9u:C, 7f9u:D, 7f9v:A, 7f9v:B, 7fak:A, 7fal:A, 7fal:B, 7fam:A, 7fan:A, 7v8j:A, 7v8j:B, 7v8k:A, 7v8k:B, 7vc1:A, 7vc2:A, 7vc2:B, 7vc3:A, 7vc5:A, 5xig:A, 5xig:B, 5xig:C, 5xig:D, 5xih:A, 5xih:B, 5xih:C, 5xih:D, 5xii:A, 5xii:B, 5xii:C, 5xii:D, 5xij:A, 5xij:B, 5xij:C, 5xij:D, 5xik:A, 5xik:B, 5xik:C, 5xik:D, 5xiq:A, 5xiq:B, 5xiq:C, 5xiq:D
10	3glj:A	395	19	0.0423	0.0228	0.4737	7.7	5j1q:A, 5jc6:A, 2jew:A, 5lrg:A, 5lrg:B, 5lrg:C, 5lrj:A, 5lrj:B, 5lrj:C, 5lrk:A, 5lrk:B, 5lrk:C, 5lyd:A, 5lyf:A, 5lyi:A, 5lyl:A, 1nsa:A, 2piy:A, 2piy:B, 2piy:C, 2piz:A, 2piz:B, 2piz:C, 2pj0:A, 2pj0:B, 2pj0:C, 2pj1:A, 2pj1:B, 2pj1:C, 2pj2:A, 2pj2:B, 2pj2:C, 2pj3:A, 2pj3:B, 2pj3:C, 2pj4:A, 2pj4:B, 2pj5:A, 2pj5:B, 2pj5:C, 2pj6:A, 2pj7:A, 2pj7:B, 2pj7:C, 2pj8:A, 2pj8:B, 2pj8:C, 2pj9:A, 2pja:A, 2pja:B, 2pja:C, 2pjb:A, 2pjb:B, 2pjb:C, 2pjc:A, 2pjc:B, 2pjc:C, 4uia:A, 4uib:A, 3wab:A, 3wc5:A, 3wc6:A, 3wc7:A, 1z5r:A, 1z5r:B, 1z5r:C, 4z65:A, 5zeq:A, 1zg7:A, 1zg7:B, 1zg7:C, 1zg8:A, 1zg8:B, 1zg8:C, 1zg9:A, 1zg9:B, 1zg9:C
11	8aa2:E	497	21	0.0516	0.0221	0.5238	9.1	8aa2:M, 6r3r:A, 6r3u:A, 7znr:A, 7znr:B, 7zns:A, 7zns:B

[Back]