Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
EQPELEARVKEIIEVDGYQFRDLNDNGELDPYEDWRLPTPERVADLVGQMSLVEKSGLMLINTLNAACDPQTGEFGVLPA
QADNYINTQHMHRFVFRNVVDVRAEGVECTGTGTPVVSPAEAATFTNAVQEMSEATRLGIPSLFKSNARNHIDPAAGAFS
AFPKEAGIAAAALGEQARRTGEATTGDMSVVADFADVMGEEWASIGLRGMYGYMADLSTEPRWYRTHETFTEDAYLAAEI
METLVQTLQGEELTDNGLALSPQTRVALTLKHFPGGGPQELGLDPHYAFGKAQVYPAGRFEEHFLPFQAAIDAGVSSIMP
YYGVPVDVPVVGGEPGETYPHTGFAFSDSIVNGLLRDQLGFTGYVNSATGIINDRAWGLEGNTVPERVAAAINGGTDTLS
GFSDVSVITDLYEADLISEERIDLAAERLLEPLFDMGLFENPYVDPDVATATVGADDHRAVGLDLQRKSLVLLQNEETDE
GPVLPLKEGGDVYILGDFTEETVESYGYEVTNGNVAEGEERPSAAGSDYVLISMTAKTNAGDYVSDDPSLGLNPDHGTNP
SVIIGDDGEPLPGLDGQSLWGAADVCVHKEGHEENPSCTDNRLRFGGAYPWESSILDFTGMEAAESWEVVPSLETIQEVM
AEVEDPSKVILHVYFRQPYVLDEESGLRDAGAILAGFGMTDTALMDVLTGAYAPQGKLPFALAGTREAIIEQDSDRPGYD
ETEDGALYPFGYGLTYEDD

The query sequence (length=739) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7qg4:A 746 746 0.9973 0.9879 0.9879 0.0 7qe1:A, 7qe1:B, 7qe2:A, 7qe2:B, 7qea:A, 7qea:B, 7qee:A, 7qee:B, 7qef:A, 7qef:B, 7qg4:B
2 6jg1:A 606 484 0.1854 0.2261 0.2831 4.79e-34 1ex1:A, 1ieq:A, 1iev:A, 1iew:A, 1iex:A, 1j8v:A, 6jg2:A, 6jg6:A, 6jg7:A, 6jga:A, 6jgb:A, 6jgc:A, 6jgd:A, 6jge:A, 6jgg:A, 6jgk:A, 6jgl:A, 6jgn:A, 6jgo:A, 6jgp:A, 6jgq:A, 6jgr:A, 6jgs:A, 6jgt:A, 6k6v:A, 6kuf:A, 6l1j:A, 6lbb:A, 6lbv:A, 6lc5:A, 1lq2:A, 6md6:A, 6mi1:A, 3wlh:A, 3wlj:A, 3wlk:X, 3wll:A, 3wlo:A, 3wlp:A, 1x38:A, 1x39:A
3 3u48:B 742 649 0.2219 0.2210 0.2527 1.22e-31 3u48:A, 3u4a:B, 3u4a:A
4 5tf0:A 733 376 0.1475 0.1487 0.2899 2.58e-30 5tf0:B
5 5tf0:A 733 124 0.0474 0.0477 0.2823 0.93 5tf0:B
6 7zgz:X 753 475 0.1773 0.1740 0.2758 2.60e-30 8c7f:B
7 7zgz:X 753 63 0.0244 0.0239 0.2857 2.6 8c7f:B
8 8c7f:A 772 475 0.1773 0.1697 0.2758 3.50e-30 7zb3:A, 7zb3:B, 7zdy:W, 7zdy:Y, 7zgz:Y
9 8c7f:A 772 63 0.0244 0.0233 0.2857 2.6 7zb3:A, 7zb3:B, 7zdy:W, 7zdy:Y, 7zgz:Y
10 5m6g:A 579 513 0.1962 0.2504 0.2827 1.07e-28
11 5m6g:A 579 67 0.0311 0.0397 0.3433 2.9
12 5xxm:A 749 381 0.1448 0.1429 0.2808 9.14e-27 5xxl:A, 5xxl:B, 5xxm:B, 5xxn:A, 5xxn:B, 5xxo:B, 5xxo:A
13 5xxm:A 749 120 0.0460 0.0454 0.2833 5.1 5xxl:A, 5xxl:B, 5xxm:B, 5xxn:A, 5xxn:B, 5xxo:B, 5xxo:A
14 5z87:A 756 362 0.1407 0.1376 0.2873 7.95e-25 5z87:B
15 5z87:A 756 96 0.0379 0.0370 0.2917 5.1 5z87:B
16 8xrt:F 751 474 0.1786 0.1758 0.2785 8.98e-24 8xrt:E, 8xrt:A, 8xrt:B, 8xrt:C, 8xrt:D, 8xru:A, 8xru:B, 8xrv:A, 8xrv:B, 8xrv:C, 8xrv:F, 8xrv:D, 8xrv:E, 8xrx:A, 8xrx:D, 8xrx:F, 8xrx:B, 8xrx:C
17 7eap:A 755 478 0.1678 0.1642 0.2594 7.50e-23 5yot:A, 5yot:B, 5yqs:A, 5yqs:B
18 5z9s:A 765 446 0.1488 0.1438 0.2466 1.31e-20 5z9s:B
19 3ut0:A 804 396 0.1448 0.1331 0.2702 1.57e-20 3rrx:A, 3usz:A, 3ut0:B, 3ut0:C, 3ut0:D
20 6r5i:A 733 641 0.2246 0.2265 0.2590 3.55e-20 6r5i:B, 6r5n:B, 6r5n:A, 6r5o:B, 6r5o:A, 6r5p:B, 6r5p:A, 6r5r:B, 6r5r:A, 6r5t:B, 6r5t:A, 6r5u:B, 6r5u:A, 6r5v:B, 6r5v:A
21 5jp0:A 745 469 0.1502 0.1490 0.2367 5.34e-20 5jp0:B
22 4zo6:B 724 384 0.1286 0.1312 0.2474 4.99e-14 4zo6:A, 4zo7:B, 4zo7:A, 4zo8:A, 4zo8:B, 4zo9:A, 4zo9:B, 4zoa:A, 4zoa:B, 4zob:A, 4zob:B, 4zoc:A, 4zoc:B, 4zod:A, 4zod:B, 4zoe:A, 4zoe:B
23 7vc7:A 743 296 0.1042 0.1036 0.2601 6.95e-13
24 7vc7:A 743 65 0.0298 0.0296 0.3385 2.4
25 8j9f:D 749 407 0.1272 0.1255 0.2310 2.84e-12 8j9f:A, 8j9f:B
26 6q7i:A 770 319 0.1164 0.1117 0.2696 1.59e-10 6q7j:A, 6q7j:B
27 4gyj:A 618 372 0.1218 0.1456 0.2419 6.51e-10 3bmx:A, 3bmx:B, 4gyj:B, 4gyk:A, 3nvd:A, 3nvd:B
28 6k5j:A 526 314 0.1137 0.1597 0.2675 2.21e-07
29 4i8d:B 714 593 0.1813 0.1877 0.2260 2.46e-07 4i8d:A, 3zyz:A
30 7xtj:B 743 311 0.1110 0.1104 0.2637 1.21e-06 7xtj:A
31 8xrx:E 611 316 0.1028 0.1244 0.2405 5.00e-06
32 6jxg:A 713 328 0.1055 0.1094 0.2378 7.24e-06
33 6jxg:A 713 113 0.0433 0.0449 0.2832 0.016
34 4i3g:B 780 366 0.1177 0.1115 0.2377 1.16e-05 4i3g:A
35 5vqe:A 559 229 0.0704 0.0930 0.2271 2.63e-05
36 7vi6:A 342 95 0.0474 0.1023 0.3684 7.77e-05 7vi6:B, 7vi7:A, 7vi7:B
37 5ju6:A 835 348 0.1150 0.1018 0.2443 2.50e-04 5ju6:B, 5ju6:C, 5ju6:D
38 5fjj:A 839 423 0.1326 0.1168 0.2317 0.003 5fjj:B, 5fjj:C, 5fjj:D
39 5fjj:A 839 121 0.0392 0.0346 0.2397 3.4 5fjj:B, 5fjj:C, 5fjj:D
40 6sz6:A 836 186 0.0636 0.0562 0.2527 0.011
41 6sz6:A 836 74 0.0298 0.0263 0.2973 1.6
42 3ac0:A 841 375 0.1204 0.1058 0.2373 0.020 3ac0:B, 3ac0:C, 3ac0:D
43 4iib:A 834 121 0.0460 0.0408 0.2810 0.049 4iib:B, 4iic:A, 4iic:B, 4iid:A, 4iid:B, 4iie:A, 4iie:B, 4iif:A, 4iif:B, 4iig:A, 4iig:B, 4iih:A, 4iih:B
44 4iib:A 834 217 0.0704 0.0624 0.2396 0.51 4iib:B, 4iic:A, 4iic:B, 4iid:A, 4iid:B, 4iie:A, 4iie:B, 4iif:A, 4iif:B, 4iig:A, 4iig:B, 4iih:A, 4iih:B
45 5wvp:A 924 70 0.0325 0.0260 0.3429 0.11
46 5nbs:A 842 314 0.1028 0.0903 0.2420 0.15 5nbs:B
47 5nbs:A 842 112 0.0433 0.0380 0.2857 0.76 5nbs:B
48 2x41:A 715 417 0.1083 0.1119 0.1918 0.17 2x42:A
49 2i2a:A 264 222 0.0568 0.1591 0.1892 0.25 8a9v:A, 8b47:A, 8b47:B, 5dhp:A, 5dhp:C, 5dhp:B, 5dhp:D, 5dhq:A, 5dhq:C, 5dhq:B, 5dhq:D, 5dhr:A, 5dhr:C, 5dhr:B, 5dhr:D, 5dhs:A, 5dhs:C, 5dhs:B, 5dhs:D, 5dht:A, 5dht:C, 5dht:B, 5dht:D, 5dhu:A, 5dhu:C, 5dhu:B, 5dhu:D, 4dy6:A, 5ejh:A, 5eji:A, 2i29:A, 2i2b:A, 2i2c:A, 2i2d:A, 2i2f:A, 2q5f:A, 6rbo:A, 6rbp:A, 6rbq:A, 6rbr:A, 6rbs:A, 6rbt:A, 6rbu:A, 6rbv:A, 6rbw:A, 6rbx:A, 6rby:A, 6rbz:A, 6rc0:A, 6rc1:A, 6rc2:A, 6rc3:A, 6rc4:A, 6rc5:A, 6rc6:A, 6rg6:A, 6rg7:A, 6rg8:A, 6rg9:A, 6rga:A, 6rgb:A, 6rgc:A, 6rgd:A, 6rge:A, 6rgf:A, 6rr2:A, 3v7u:A, 3v7w:A, 3v7y:A, 3v80:A, 3v8m:A, 3v8n:A, 3v8p:A, 3v8q:A, 3v8r:A, 6z61:A, 6z64:A, 6z65:A, 7zz7:A, 7zz9:A, 7zza:A, 7zzb:A, 7zzc:A, 7zzd:A, 7zze:A, 7zzf:A, 7zzg:A, 7zzh:A, 7zzj:A
50 5fji:A 840 194 0.0622 0.0548 0.2371 0.28 5fji:B
51 5fji:A 840 75 0.0284 0.0250 0.2800 1.8 5fji:B
52 5wab:A 674 363 0.0988 0.1083 0.2011 1.3
53 4zm6:A 844 149 0.0528 0.0462 0.2617 3.1 4zm6:B
54 5wdh:A 296 54 0.0244 0.0608 0.3333 6.2
55 6y0k:AAA 377 41 0.0217 0.0424 0.3902 6.5
56 5b49:B 247 88 0.0338 0.1012 0.2841 8.1 5b49:A, 5b4a:A, 5b4a:B, 5b4b:A, 5b4b:B, 5b4c:A, 5b4c:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218