BioLiP

>protein
EQFRIRRDKRARLLAQGRDPYPVAVPRTHTLAEVRAAHPDLPIDTATEDIVGVAGRVIFARNSGKLCFATLQDGDGTQLQ
VMISLDKVGQAALDAWKADVDLGDIVYVHGAVISSRELSVLADCWRIAAKSLRPLPVMSEESRVRQRYVDLIVRPEARAV
ARLRIAVVRAIRTALQRRGFLEVETPVLQTLAGGAAARPFATHSNALDIDLYLRIAPELFLKRCIVGGFDKVFELNRVFR
NEGADSTHSPEFSMLETYQTYGTYDDSAVVTRELIQEVADEAIGTRQLPLPDGSVYDIDGEWATIQMYPSLSVALGEEIT
PQTTVDRLRGIADSLGFGHGKLIEELWERTVGKSLSAPTFVKDFPVQTTPLTRQHRSIPGVTEKWDLYLRGIELATGYSE
LSDPVVQRERFADQARAAVLDEDFLAALEYGMPPCTGTGMGIDRLLMSLTGLSIRETVLFPI

The query sequence (length=462) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7qh8:A	471	470	0.9978	0.9788	0.9809	0.0	7qhn:A, 7qi8:A
2	6aqg:C	490	483	0.8615	0.8122	0.8240	0.0	6aqg:A, 6aqg:B, 6aqg:D, 5vl1:A, 5vl1:B, 5vl1:C, 5vl1:D
3	6aqh:B	490	484	0.8160	0.7694	0.7789	0.0	6aqh:A, 6aqh:C, 6aqh:D
4	3a74:A	484	482	0.4242	0.4050	0.4066	6.98e-118	3a74:B, 3a74:C, 3a74:D, 3e9h:A, 3e9h:B, 3e9h:C, 3e9h:D, 3e9i:A, 3e9i:B, 3e9i:C, 3e9i:D
5	4ex5:A	486	481	0.4416	0.4198	0.4241	2.17e-106	4ex5:B
6	6wbd:B	485	432	0.4113	0.3918	0.4398	3.12e-105	6wbd:A
7	1e1t:A	485	482	0.3939	0.3753	0.3776	2.45e-104	1e1o:A, 1e22:A, 1e24:A, 1lyl:A, 1lyl:B, 1lyl:C, 5yzx:A, 5yzx:B, 5yzx:C
8	1bbu:A	486	481	0.3918	0.3724	0.3763	4.18e-104
9	5hgq:B	482	482	0.4026	0.3859	0.3859	1.02e-96	5hgq:A, 5hgq:D, 5hgq:C
10	4up7:A	529	483	0.3874	0.3384	0.3706	1.33e-90	4up9:A, 4upa:A
11	6chd:A	506	499	0.3853	0.3518	0.3567	1.52e-89	3bju:A, 3bju:B, 3bju:C, 3bju:D, 6chd:B, 4dpg:A, 4dpg:B, 4dpg:C, 4dpg:D, 4dpg:E, 4dpg:F, 4dpg:G, 4dpg:H, 7ea9:A, 7ea9:B, 7ea9:C, 7ea9:D, 6ild:A, 6ild:B, 6ilh:A, 6ilh:B, 4ycu:A, 4ycu:B, 4ycw:A, 4ycw:B, 4ycw:E, 4ycw:F
12	7f6w:A	506	488	0.3918	0.3577	0.3709	1.23e-84
13	6bni:A	502	445	0.3463	0.3187	0.3596	1.42e-82	6bni:B, 6c86:A, 6c86:B, 5eln:A, 5eln:B, 5eln:C, 5eln:D, 5elo:A, 5elo:B, 5elo:C, 5elo:D, 6hcw:A, 6hcw:B, 7zog:A, 7zog:B, 7zog:C, 7zog:D
14	6agt:B	506	504	0.3745	0.3419	0.3433	1.70e-82	6agt:A, 6agt:C, 6agt:D, 7bt5:A, 7bt5:B, 6hcu:A, 6hcu:B, 6hcv:A, 6hcv:B, 8k9s:A, 8k9s:B, 8k9u:A, 8k9u:B, 8k9v:A, 8k9v:B, 8k9w:A, 8k9w:B, 8k9x:A, 8k9x:B, 6ka6:A, 6ka6:B, 6ka6:C, 6ka6:D, 6kab:A, 6kab:B, 6kab:C, 6kab:D, 6kbf:A, 6kbf:B, 6kcn:A, 6kcn:B, 6kcn:C, 6kcn:D, 6kct:A, 6kct:B, 6kct:C, 6kct:D, 6l3y:B, 6l3y:A, 6l4q:B, 6l4q:A, 6m0t:A, 6m0t:B, 6m0t:C, 6m0t:D, 4pg3:A, 4pg3:B, 4pg3:C, 4pg3:D, 4ycv:A, 4ycv:B, 4ycv:C, 4ycv:D, 5zh2:B, 5zh3:A, 5zh3:B, 5zh4:A, 5zh4:B, 5zh5:A, 5zh5:B
15	5zh2:A	464	480	0.3571	0.3556	0.3438	1.08e-81
16	6nrz:A	517	509	0.3723	0.3327	0.3379	3.23e-77	6nrz:B, 6ns0:A, 6ns0:B, 6o3f:A, 6o3f:B
17	3a5z:C	324	325	0.2316	0.3302	0.3292	7.53e-34	3a5y:B, 3a5y:C, 3a5y:D, 3a5z:A, 3a5z:E, 3a5z:G, 3g1z:A, 3g1z:B
18	3a5y:A	297	321	0.2251	0.3502	0.3240	2.90e-32
19	1b8a:A	438	434	0.2446	0.2580	0.2604	6.99e-25	1b8a:B, 3nel:A, 3nem:A, 3nem:B
20	4o2d:B	515	506	0.2771	0.2485	0.2530	2.38e-16
21	1asy:A	490	454	0.2294	0.2163	0.2335	3.26e-16	1asy:B, 1asz:A, 1asz:B
22	4wj3:M	589	156	0.0996	0.0781	0.2949	5.95e-14	4wj3:N, 4wj3:O, 4wj3:P, 4wj4:A
23	4wj3:M	589	166	0.1061	0.0832	0.2952	1.75e-08	4wj3:N, 4wj3:O, 4wj3:P, 4wj4:A
24	1c0a:A	585	252	0.1515	0.1197	0.2778	1.08e-13	1il2:A, 1il2:B
25	1c0a:A	585	166	0.1017	0.0803	0.2831	9.80e-05	1il2:A, 1il2:B
26	4o2d:A	580	278	0.1667	0.1328	0.2770	1.51e-12	4rmf:A
27	4o2d:A	580	92	0.0649	0.0517	0.3261	0.004	4rmf:A
28	5w25:A	583	172	0.1082	0.0858	0.2907	1.86e-12	5w25:B
29	5w25:A	583	86	0.0584	0.0463	0.3140	0.008	5w25:B
30	6sjc:B	581	131	0.0952	0.0757	0.3359	4.13e-12	7ap4:A, 7ap4:B, 1efw:A, 1efw:B, 1g51:A, 1g51:B, 6hhv:A, 6hhv:B, 6hhw:A, 6hhw:B, 6hhx:A, 6hhx:B, 6sjc:A
31	6sjc:B	581	86	0.0758	0.0602	0.4070	2.87e-07	7ap4:A, 7ap4:B, 1efw:A, 1efw:B, 1g51:A, 1g51:B, 6hhv:A, 6hhv:B, 6hhw:A, 6hhw:B, 6hhx:A, 6hhx:B, 6sjc:A
32	3kfu:C	377	434	0.2338	0.2865	0.2488	2.28e-11	3kfu:A, 3kfu:D, 3kfu:B
33	1x54:A	434	440	0.2316	0.2465	0.2432	1.65e-09	1x55:A
34	2xgt:B	433	444	0.2511	0.2679	0.2613	3.15e-08	2xgt:A, 2xti:A, 2xti:B
35	8tc8:A	435	430	0.2273	0.2414	0.2442	8.86e-08	8h53:A, 8h53:B, 8h53:C, 8h53:D, 8tc8:B, 8tc8:C, 8tc8:D, 8tc9:A, 8tc9:B, 8tc9:C, 8tc9:D
36	3m4p:A	435	357	0.1623	0.1724	0.2101	7.99e-06	3m4p:B, 3m4p:C, 3m4p:D
37	7dpi:C	292	55	0.0476	0.0753	0.4000	0.010	7dpi:A
38	2zni:A	279	93	0.0649	0.1075	0.3226	0.025	2zni:B
39	7u0r:B	278	118	0.0758	0.1259	0.2966	0.025	8c49:A, 8c49:B, 8dqg:D, 8dqg:A, 8dqh:D, 8dqh:A, 8dqi:D, 8dqi:A, 8dqj:D, 7u0r:A
40	7by6:A	299	55	0.0455	0.0702	0.3818	0.048
41	3l4g:C	508	26	0.0303	0.0276	0.5385	0.24	3l4g:A, 3l4g:E, 3l4g:G, 3l4g:I, 3l4g:K, 3l4g:M, 3l4g:O
42	3p8v:A	294	107	0.0714	0.1122	0.3084	0.33	3p8v:B, 3p8y:A, 3p8y:B, 3reu:A, 3reu:B, 3rex:A, 3rex:B, 3rl6:A, 3rl6:B
43	4cs3:A	270	102	0.0649	0.1111	0.2941	0.60	6aac:A, 6aad:A, 6aan:A, 6aao:A, 6aap:A, 6aaq:A, 6aaz:A, 6ab0:A, 6ab1:A, 6ab2:A, 6ab8:A, 6abk:A, 6abl:A, 6abm:A, 4bw9:A, 4bwa:A, 4ch3:A, 4ch4:A, 4ch5:A, 4ch6:A, 4cs4:A, 5k1p:A, 5k1x:A, 8ke1:A, 8ke2:A, 8ke3:A, 8ke4:A, 8ke5:A, 8ke6:A, 6ly3:A, 6ly6:A, 6ly7:A, 6lya:A, 6lyb:A, 4q6g:A, 2q7e:A, 2q7g:A, 2q7h:A, 3qtc:A, 7rsm:A, 7rsm:B, 7rsm:C, 7rsm:D, 4tqd:A, 4tqf:A, 3vqv:A, 3vqw:A, 3vqx:A, 3vqx:B, 3vqx:C, 3vqx:D, 3vqy:A, 2zce:A, 2zim:A, 2zin:A, 2zio:A, 4zib:A
44	3icc:A	255	90	0.0455	0.0824	0.2333	2.6	3icc:B
45	8sw0:A	864	48	0.0390	0.0208	0.3750	4.1	8sw1:A
46	8dqj:A	251	187	0.1104	0.2032	0.2727	4.1
47	3e7w:A	508	131	0.0606	0.0551	0.2137	6.1	3e7x:A
48	5v5z:A	488	48	0.0346	0.0328	0.3333	6.7	5fsa:A, 5fsa:B, 5tz1:A, 5tz1:B
49	3n0g:B	524	66	0.0411	0.0363	0.2879	7.4	3n0g:A
50	5ko6:A	285	27	0.0303	0.0491	0.5185	8.9	6awe:A, 6axa:A, 6b2l:A, 6b37:A, 6b3l:A, 6b4q:A, 6b4t:A, 6b56:A, 6b6k:A, 6b71:A, 6b7i:A, 6bb7:A, 6bfv:A, 6bhb:A, 6bi1:A, 6bi9:A, 6bif:A, 6bj6:A, 6bj7:A, 5ko5:A, 5tbs:A, 5tbt:A, 5tbu:A, 5tbv:A

[Back]