Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ENNRLSVKLPGLDLKNPIIPASGCFGFGEEYAKYYDLNKLGSIMVKATTLHPRFGNPTPRVAETASGMLNAIGLQNPGLE
VIMTEKLPWLNENFPELPIIANVAGSEEADYVAVCAKIGDAANVKAIELNISCPNGQAFGTDPEVAAALVKACKAVSKVP
LYVKLSPNVTDIVPIAKAVEAAGADGLTMINTLMGVRFDLKTRQPILANITGGLSGPAIKPVALKLIHQVAQDVDIPIIG
MGGVANAQDVLEMYMAGASAVAVGTANFADPFVCPKIIDKLPELMDQYRIESLESLIQEVKEGKK

The query sequence (length=305) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1ep3:A 311 309 1.0000 0.9807 0.9871 0.0 1ep1:A, 1ep2:A, 5ksw:A, 5ksw:C, 5ue9:A, 5ue9:C
2 2bsl:A 311 309 0.3016 0.2958 0.2977 5.86e-30 2bsl:B, 2bx7:A, 2bx7:B, 1dor:A, 1dor:B, 2dor:A, 2dor:B, 1jqv:A, 1jqv:B, 1jqx:A, 1jqx:B, 1jrb:A, 1jrb:B, 1jrc:A, 1jrc:B, 1jub:A, 1jub:B, 1jue:A, 1jue:B, 1ovd:A, 1ovd:B
3 1gth:A 1019 295 0.2951 0.0883 0.3051 1.16e-28 8f5w:A, 8f5w:B, 8f5w:C, 8f5w:D, 8f61:A, 8f61:B, 8f61:C, 8f61:D, 8f6n:A, 8f6n:B, 8f6n:C, 8f6n:D, 1gt8:A, 1gt8:B, 1gt8:C, 1gt8:D, 1gte:A, 1gte:B, 1gte:C, 1gte:D, 1gth:B, 1gth:C, 1gth:D, 1h7w:A, 1h7w:B, 1h7w:C, 1h7w:D, 1h7x:A, 1h7x:B, 1h7x:C, 1h7x:D, 7ljs:A, 7ljs:B, 7ljs:C, 7ljs:D, 7ljt:A, 7ljt:B, 7ljt:C, 7ljt:D, 7lju:A, 7lju:C, 7lju:D, 7lju:B, 7m31:A, 7m31:B, 7m31:C, 7m31:D, 7m32:A, 7m32:B, 7m32:C, 7m32:D
4 3oix:A 310 304 0.2951 0.2903 0.2961 2.37e-25 3oix:B, 3oix:C, 3oix:D
5 4ori:A 355 307 0.3049 0.2620 0.3029 5.12e-21 1uum:A, 1uum:B, 1uuo:A
6 6et4:A 367 314 0.2951 0.2452 0.2866 1.45e-20 2b0m:A, 9bkm:A, 9bkn:A, 9bko:A, 2bxv:A, 6cjf:A, 6cjf:B, 6cjg:A, 1d3g:A, 1d3h:A, 8dhf:A, 8dhg:A, 8dhh:A, 3f1q:A, 3fj6:A, 3fjl:A, 6fmd:A, 2fpt:A, 2fpv:A, 2fpy:A, 2fqi:A, 3g0u:A, 3g0x:A, 6gk0:A, 5h2z:A, 5h73:A, 5hin:A, 5hqe:A, 6idj:A, 4igh:A, 6j3b:A, 6j3c:A, 4jgd:A, 6jmd:A, 6jme:A, 4js3:A, 4jts:A, 4jtt:A, 4jtu:A, 7k2u:A, 8k4f:A, 5k9c:A, 5k9d:A, 3kvj:A, 3kvk:A, 3kvl:A, 3kvm:A, 6lp6:A, 6lp7:A, 6lp8:A, 4ls0:A, 4ls1:A, 4ls2:A, 6lzl:A, 6m2b:A, 5mut:A, 5mvc:A, 5mvd:A, 6oc0:A, 6oc1:A, 4oqv:A, 2prh:A, 2prl:A, 2prm:A, 6qu7:A, 8rak:A, 4rk8:A, 4rka:A, 4rli:A, 4rr4:A, 6syp:AAA, 3u2o:A, 8vhl:A, 8vhm:A, 6vnd:A, 3w7r:A, 2wv8:A, 8yhr:A, 4ylw:A, 7z6c:A, 5zf4:A, 5zf7:A, 5zf8:A, 5zf9:A, 5zfa:A, 5zfb:A, 4zl1:A, 4zmg:A, 3zws:A, 3zwt:A
7 3w87:A 314 317 0.2820 0.2739 0.2713 1.43e-19 3c3n:A, 3c3n:B, 3c3n:C, 3c3n:D, 2djl:A, 2djl:B, 2djx:A, 2djx:B, 2e68:A, 2e68:B, 2e6a:A, 2e6a:B, 2e6d:A, 2e6d:B, 2e6f:A, 2e6f:B, 5e93:A, 5e93:B, 5ea9:A, 5ea9:B, 4jd4:A, 4jd4:B, 4jdb:A, 4jdb:B, 3w1a:A, 3w1a:B, 3w1l:A, 3w1l:B, 3w1m:A, 3w1m:B, 3w1n:A, 3w1n:B, 3w1p:A, 3w1p:B, 3w1q:A, 3w1q:B, 3w1r:A, 3w1r:B, 3w1t:A, 3w1t:B, 3w1u:A, 3w1u:B, 3w1x:A, 3w1x:B, 3w22:A, 3w22:B, 3w23:A, 3w23:B, 3w2j:A, 3w2j:B, 3w2k:A, 3w2k:B, 3w2l:A, 3w2l:B, 3w2m:A, 3w2m:B, 3w2n:A, 3w2n:B, 3w2u:A, 3w2u:B, 3w3o:A, 3w3o:B, 3w6y:A, 3w6y:B, 3w70:A, 3w70:B, 3w71:A, 3w71:B, 3w72:A, 3w72:B, 3w73:A, 3w73:B, 3w74:A, 3w74:B, 3w75:A, 3w75:B, 3w76:A, 3w76:B, 3w7c:A, 3w7c:B, 3w7d:A, 3w7d:B, 3w7e:A, 3w7e:B, 3w7g:A, 3w7g:B, 3w7h:A, 3w7h:B, 3w7i:A, 3w7i:B, 3w7j:A, 3w7j:B, 3w7k:A, 3w7k:B, 3w7l:A, 3w7l:B, 3w7m:A, 3w7m:B, 3w7n:A, 3w7n:B, 3w7o:A, 3w7o:B, 3w7p:A, 3w7p:B, 3w7q:A, 3w7q:B, 3w83:A, 3w83:B, 3w84:A, 3w84:B, 3w85:A, 3w85:B, 3w86:A, 3w86:B, 3w87:B, 3w88:A, 3w88:B
8 2b4g:B 313 315 0.2623 0.2556 0.2540 1.83e-19 2b4g:A, 2b4g:C, 2b4g:D, 5xfv:A, 5xfv:B, 5xfv:C, 5xfv:D
9 3c61:A 314 314 0.2787 0.2707 0.2707 7.37e-16 3c61:B, 3c61:C, 3c61:D, 6dgs:A, 6dgs:B, 6dwg:A, 6dwg:B, 6ebs:A, 6ebs:B, 4ef8:A, 4ef8:B, 4ef9:A, 4ef9:B, 3gye:A, 3gye:B, 3gz3:A, 3gz3:B, 3mhu:A, 3mhu:B, 3mjy:A, 3mjy:B, 7mx6:AAA, 7mx6:BBB, 7myd:AAA, 7myd:BBB, 3tjx:A, 3tjx:B, 3tq0:A, 3tq0:B, 3tro:A, 3tro:B
10 6aje:A 378 336 0.2820 0.2275 0.2560 2.76e-14 6aj5:A, 6aj5:B, 6aj5:C, 6aj5:D, 6aje:B, 6aje:C, 6aje:D
11 4wzh:A 304 275 0.2426 0.2434 0.2691 3.07e-13 4wzh:B
12 6uy4:A 354 311 0.2787 0.2401 0.2733 1.67e-12
13 8ofw:A 350 263 0.2328 0.2029 0.2700 1.17e-09 8ofw:B, 4xq6:A, 4xq6:B
14 1f76:A 336 274 0.2328 0.2113 0.2591 1.72e-09 1f76:B, 1f76:D, 1f76:E, 7t5k:A, 7t5k:B, 7t5y:A, 7t5y:B, 7t6c:A, 7t6c:B, 7t6h:A, 7t6h:B
15 7l01:B 385 297 0.2590 0.2052 0.2660 2.82e-08 5boo:A, 5boo:B, 4cq8:A, 4cq8:B, 4cq9:A, 4cq9:B, 4cqa:A, 4cqa:B, 5del:A, 6e0b:A, 5fi8:A, 6gjg:A, 6gjg:B, 6i4b:A, 6i4b:B, 6i55:A, 6i55:B, 3i65:A, 3i68:A, 3i6r:A, 7kyk:A, 7kyk:B, 7kyk:C, 7kyk:D, 7kyv:A, 7kyy:A, 7kyy:B, 7kyy:C, 7kyy:D, 7kz4:A, 7kz4:B, 7kzy:A, 7kzy:B, 7l01:A, 7l0k:A, 7l0k:B, 3o8a:A, 4orm:A, 4rx0:A, 7s87:A, 7s87:B, 3sfk:A, 5tbo:A, 1tv5:A, 6vtn:A, 6vty:A, 6vty:B, 6vty:C, 6vty:D, 7wyf:A
16 6b8s:B 336 307 0.2328 0.2113 0.2313 2.12e-07 6b8s:A
17 3b0v:C 315 190 0.1607 0.1556 0.2579 5.89e-07 3b0p:A, 3b0p:B, 3b0u:X, 3b0u:Y, 3b0v:D
18 7ut5:A 324 253 0.2131 0.2006 0.2569 5.77e-06 7ut5:B
19 4jej:A 241 49 0.0721 0.0913 0.4490 6.01e-05
20 3iiv:B 262 58 0.0623 0.0725 0.3276 0.002 7ac8:A, 7ac8:C, 7ac8:E, 6ct3:A, 5d2t:A, 5d2w:A, 6dc1:A, 6dc1:B, 6dc1:H, 6dc1:K, 6dkv:A, 6dnj:A, 1gpw:C, 1gpw:E, 6rtz:A, 6ru0:A, 6ru0:C, 6ru0:E, 2wjz:A, 2wjz:C
21 3iiv:B 262 67 0.0689 0.0802 0.3134 7.7 7ac8:A, 7ac8:C, 7ac8:E, 6ct3:A, 5d2t:A, 5d2w:A, 6dc1:A, 6dc1:B, 6dc1:H, 6dc1:K, 6dkv:A, 6dnj:A, 1gpw:C, 1gpw:E, 6rtz:A, 6ru0:A, 6ru0:C, 6ru0:E, 2wjz:A, 2wjz:C
22 2z6i:B 321 46 0.0623 0.0592 0.4130 0.002 2z6i:A, 2z6j:A, 2z6j:B
23 4xp7:A 324 194 0.1475 0.1389 0.2320 0.003 6eza:A, 6eza:B, 6ezb:A, 6ezc:A, 4wfs:A
24 7qc8:A 250 58 0.0557 0.0680 0.2931 0.004 4ewn:D, 2wjz:E, 3zr4:E
25 7l00:C 315 51 0.0656 0.0635 0.3922 0.004 7l00:A, 7l00:B, 7l00:D
26 5lsm:A 339 53 0.0689 0.0619 0.3962 0.006 5lsm:B, 5lsm:C, 5lsm:D, 5lsm:E, 5lsm:F, 5lsm:G, 5lsm:H
27 1h5y:B 253 79 0.0787 0.0949 0.3038 0.010 1h5y:A
28 3tdm:A 120 42 0.0459 0.1167 0.3333 0.25 3tdm:B, 3tdm:C, 3tdm:D
29 5mcp:E 387 51 0.0557 0.0439 0.3333 0.28 5mcp:G
30 6e2a:A 326 162 0.1410 0.1319 0.2654 0.55 2gjl:A, 2gjn:A
31 4n6f:A 242 40 0.0492 0.0620 0.3750 0.85 4n6f:B
32 5gvh:A 311 136 0.1344 0.1318 0.3015 0.93
33 2y88:A 244 78 0.0787 0.0984 0.3077 0.94 2y85:A, 2y85:B, 2y85:C, 2y85:D, 3zs4:A
34 2y88:A 244 54 0.0459 0.0574 0.2593 4.9 2y85:A, 2y85:B, 2y85:C, 2y85:D, 3zs4:A
35 5mcp:H 321 43 0.0557 0.0530 0.3953 1.3
36 6nke:A 249 46 0.0426 0.0522 0.2826 1.9
37 8d4i:A 462 165 0.1180 0.0779 0.2182 2.0 8d2y:A, 8d4i:C, 8d5d:A, 8d5d:B, 8d5r:A, 8d5r:B, 8d88:A, 8d88:B
38 4q4k:A 351 54 0.0590 0.0513 0.3333 2.4 4q4k:B, 4qis:A, 4qis:B, 4qit:A, 4qit:B, 4qiu:A, 4qiu:B
39 7zsq:C 268 31 0.0426 0.0485 0.4194 3.6 8c25:A, 8c25:B, 1g2o:A, 1g2o:B, 1g2o:C, 1i80:A, 1i80:B, 1i80:C, 3iom:A, 3iom:B, 3ix2:A, 3ix2:B, 3ix2:C, 1n3i:A, 1n3i:B, 1n3i:C, 3scz:A, 3scz:B, 7zsq:A, 7zsq:B, 7zsr:A, 7zsr:B, 7zsr:C
40 3lor:B 154 82 0.0656 0.1299 0.2439 3.9
41 7e1q:A 366 64 0.0623 0.0519 0.2969 4.1 7e1r:A, 7e1r:C, 7e1s:C, 7e1s:A
42 4z0g:B 390 35 0.0426 0.0333 0.3714 4.5 4xtd:A, 4xtd:B, 4xti:A, 4xti:B, 4z0g:A
43 4tx9:A 246 75 0.0656 0.0813 0.2667 5.3
44 5dn1:A 240 53 0.0557 0.0708 0.3208 5.6
45 5mcp:F 342 35 0.0426 0.0380 0.3714 5.6
46 4fxs:A 467 36 0.0492 0.0321 0.4167 5.7
47 4z87:A 498 35 0.0426 0.0261 0.3714 5.8 5tc3:A, 5tc3:B, 4z87:B, 4z87:C, 4z87:D
48 2cu0:A 358 56 0.0590 0.0503 0.3214 6.3 2cu0:B
49 5mcp:C 446 35 0.0426 0.0291 0.3714 6.3 5mcp:A, 5mcp:B, 5mcp:D, 6rpu:A
50 7suk:SP 2234 63 0.0656 0.0090 0.3175 6.6 6zqb:UT
51 7aju:UT 2313 63 0.0656 0.0086 0.3175 6.7 7ajt:UT, 6zqc:UT, 6zqd:UT, 6zqe:UT
52 1ub3:A 211 177 0.1475 0.2133 0.2542 6.7 1ub3:B, 1ub3:C, 1ub3:D
53 4qq3:A 302 36 0.0492 0.0497 0.4167 7.1
54 3khj:A 302 58 0.0623 0.0629 0.3276 7.2 3khj:E, 3khj:F, 3khj:G
55 4fo4:A 348 36 0.0492 0.0431 0.4167 7.6 4fo4:B, 4ix2:A, 4ix2:B, 4ix2:C, 4ix2:D, 4qne:A, 4qne:B, 4x3z:A, 4x3z:B
56 6m73:A 364 110 0.0984 0.0824 0.2727 7.9 6m74:A
57 4qj1:D 346 58 0.0623 0.0549 0.3276 8.5 4ixh:A, 4ixh:D, 4ixh:B, 4ixh:C, 3khj:B, 3khj:C, 3khj:D, 3khj:H, 4qj1:A, 4qj1:B, 4qj1:C, 4rv8:A, 4rv8:D, 4rv8:B, 4rv8:C
58 3bw2:A 347 94 0.0984 0.0865 0.3191 8.8 3bw3:A, 3bw4:A
59 4fe7:A 380 19 0.0361 0.0289 0.5789 9.1

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218