BioLiP

>protein
ENITQWNLQDNGTEGIQRAMFQRGVNRSLHGIWPEKICTGVPSHLATDTELKAIHGMMDASEKTNYTCCRLQRHEWNKHG
WCNWYNIEPWILLMNKTQANLTEGQPLRECAVTCRYDRDSDLNVVTQARDSPTPLTGCKKGKNFSFAGILVQGPCNFEIA
V

The query sequence (length=161) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4dw4:B	163	161	1.0000	0.9877	1.0000	1.55e-122	4dvl:A, 4dvl:B, 4dvn:B, 4dvn:A, 4dw3:A, 4dw3:B, 4dw4:A, 4dw5:A, 4dw5:B, 4dw7:A, 4dw7:B, 4dwa:A, 4dwa:B, 4dwc:A
2	1t5j:A	301	38	0.0807	0.0432	0.3421	0.72
3	3d3z:A	238	71	0.1118	0.0756	0.2535	3.1
4	2ea1:A	245	70	0.0994	0.0653	0.2286	3.2	2pqx:A, 2pqy:A, 2z70:A
5	4za2:D	247	39	0.0932	0.0607	0.3846	3.6
6	1v9h:A	193	63	0.0994	0.0829	0.2540	3.9	1j1f:A, 1j1g:A, 1uca:A, 1ucc:A, 1ucd:A
7	6cnh:A	321	33	0.0683	0.0343	0.3333	4.6
8	1vcz:A	204	112	0.1739	0.1373	0.2500	5.7	1vd1:A, 1vd3:A
9	1yb1:B	242	30	0.0807	0.0537	0.4333	7.1
10	1g8x:A	1009	60	0.1304	0.0208	0.3500	8.6	1g8x:B
11	1jwy:A	1039	60	0.1304	0.0202	0.3500	8.7	4ae3:A, 2aka:A, 7b19:A, 7b1a:A, 3bz7:A, 3bz8:A, 3bz9:A, 1d0x:A, 1d0y:A, 1d0z:A, 1d1a:A, 1d1b:A, 1d1c:A, 1fmw:A, 2jhr:A, 2jj9:A, 1jx2:A, 1lvk:A, 3mjx:A, 3mkd:A, 1mma:A, 1mmd:A, 1mmg:A, 1mmn:A, 1mne:A, 3mnq:A, 3myh:X, 3myk:X, 3myl:X, 4pjk:A, 1vom:A, 1w9i:A, 1w9j:A, 1w9k:A, 1w9l:A, 2x9h:A, 2xel:A, 2xo8:A, 2y8i:X, 1yv3:A, 6z2s:A, 6z7t:A, 6z7t:B, 6z7u:A
12	3wmw:B	278	81	0.1366	0.0791	0.2716	9.0	3wmw:A

[Back]