Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
EMSLIMLAAGNSTRFNTKVKKQFLRLGNDPLWLYATKNLSSFYPFKKIVVTSSNITYMKKFTKNYEFIEGGDTRAESLKK
ALELIDSEFVMVSDVARVLVSKNLFDRLIENLDKADCITPALKVADTTLFDNEALQREKIKLIQTPQISKTKLLKKALDQ
NLEFTDDSTAIAAMGGKIWFVEGEENARKLTFKEDLKKLDLPTPSFEIFTGNGFDVHEFGENRPLLLAGVQIHPTMGLKA
HSDGDVLAHSLTDAILGAAGLGDIGELYPDTDMKFKNANSMELLKQAYDKVREIGFELINIDICVMAQSPKLKDFKQAMQ
SNIAHTLDLDEFRINVKATTTEKLGFIGRKEGMAVLSSVNLKYFDWTR

The query sequence (length=368) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1w55:A 369 368 1.0000 0.9973 1.0000 0.0 1w57:A
2 8xkf:C 377 371 0.4375 0.4271 0.4340 2.92e-98 8xhu:A, 8xhu:B, 8xhu:C, 8xkf:A, 8xkf:B, 8xkf:D, 8xkf:F, 8xkf:E
3 1jn1:A 157 148 0.2283 0.5350 0.5676 3.71e-56 1jn1:B, 1jn1:C, 1vh8:A, 1vh8:B, 1vh8:C, 1vh8:D, 1vh8:E, 1vh8:F, 1vha:A, 1vha:B, 1vha:C, 1vha:D, 1vha:E, 1vha:F
4 1t0a:A 158 155 0.2255 0.5253 0.5355 1.16e-50 1t0a:B, 1t0a:C
5 3fpi:A 161 153 0.2228 0.5093 0.5359 4.66e-47
6 5iwx:A 158 149 0.2011 0.4684 0.4966 1.07e-45 5iwx:B, 5iwx:C, 5iwx:D, 5iwx:E, 5iwx:F, 5iwy:A, 5iwy:C, 5iwy:B, 5iwy:D, 5iwy:E, 5iwy:F
7 3iew:A 160 149 0.1984 0.4562 0.4899 1.25e-44 3f0d:A, 3f0d:C, 3f0d:D, 3f0d:E, 3f0d:F, 3f0e:A, 3f0e:B, 3f0e:C, 3f0f:A, 3f0f:B, 3f0f:C, 3f0g:A, 3f0g:B, 3f0g:C, 3f0g:D, 3f0g:E, 3f0g:F, 3ieq:A, 3ieq:C, 3ieq:B, 3iew:C, 3iew:B, 3ike:A, 3ike:B, 3ike:C, 3ikf:A, 3ikf:B, 3ikf:C, 3jvh:A, 3jvh:B, 3jvh:C, 3k14:A, 3k14:B, 3k14:C, 3k2x:C, 3k2x:B, 3ke1:A, 3ke1:B, 3ke1:C, 5l03:A, 5l03:B, 5l03:C, 5l12:A, 5l12:B, 5l12:C, 3mbm:A, 3mbm:C, 6mwf:A, 6mwf:B, 6mwf:C, 6mwi:A, 6mwi:B, 6mwi:C, 6mwj:A, 6mwj:B, 6mwj:C, 6mwk:A, 6mwk:B, 6mwk:C, 6nmo:A, 6nmo:B, 6nmo:C, 3p0z:A, 3p0z:C, 3p0z:B, 3p10:A, 3p10:C, 3p10:B, 3q8h:A, 3q8h:B, 3q8h:C, 3qhd:A, 3qhd:C, 3qhd:B, 6v3m:A, 6v3m:B, 6v3m:C
8 5b8f:C 164 145 0.2038 0.4573 0.5172 2.56e-44 5b8f:A, 5b8f:B
9 4c8e:A 161 148 0.1957 0.4472 0.4865 2.95e-43 4c8e:C, 4c8e:B, 4c8g:A, 4c8g:C, 4c8g:B, 4c8i:A, 4c8i:B, 4c8i:C, 3f0d:B, 3k2x:A, 3mbm:B
10 3esj:A 162 150 0.2120 0.4815 0.5200 3.27e-42 2amt:A, 2amt:B, 2amt:C, 2amt:D, 2amt:F, 2amt:E, 3elc:A, 3elc:B, 3elc:C, 3eor:A, 3ern:A, 3ern:B, 3ern:C, 3ern:D, 3ern:E, 3ern:F, 3fba:A, 3ghz:A, 3ghz:B, 3ghz:C, 1gx1:A, 1gx1:C, 1gx1:B, 2gzl:A, 1h47:A, 1h47:B, 1h47:C, 1h47:D, 1h47:E, 1h47:F, 1h48:A, 1h48:F, 1h48:C, 1h48:B, 1h48:D, 1h48:E, 1jy8:A, 1knj:A, 1knk:A, 3t80:A, 3t80:B, 3t80:C, 3t80:D, 3t80:E, 3t80:F, 1u3l:A, 1u3p:A, 1u40:A, 1u43:A, 1yqn:A
11 2pmp:A 160 151 0.1658 0.3812 0.4040 7.90e-34
12 3re3:B 144 151 0.1793 0.4583 0.4371 3.61e-29
13 4c81:A 156 155 0.1630 0.3846 0.3871 2.21e-27 4c82:A
14 1iv2:A 150 134 0.1413 0.3467 0.3881 1.31e-24 1iv2:C, 1iv2:B, 1iv2:D, 1iv2:F, 1iv2:E, 1iv3:A, 1iv3:B, 1iv3:C, 1iv3:D, 1iv3:E, 1iv3:F, 1iv4:A, 1iv4:B, 1iv4:C, 1iv4:D, 1iv4:E, 1iv4:F
15 5esv:G 187 118 0.1522 0.2995 0.4746 2.77e-24 5esv:E, 5esv:F
16 2uzh:C 155 143 0.1332 0.3161 0.3427 2.06e-21 2uzh:A, 2uzh:B
17 1vpa:A 221 208 0.1875 0.3122 0.3317 4.44e-20 1vpa:B
18 2xwl:B 222 206 0.1685 0.2793 0.3010 6.32e-18 2xwl:A, 2xwm:A, 2xwm:B
19 3b6n:A 150 150 0.1168 0.2867 0.2867 1.16e-16
20 5hs2:A 226 212 0.1630 0.2655 0.2830 3.42e-15
21 2xwn:B 227 216 0.1658 0.2687 0.2824 1.40e-14 3okr:D, 3q7u:A, 3q7u:B, 3q80:A, 3q80:B, 2xwn:A
22 2yc3:A 219 215 0.1576 0.2648 0.2698 9.57e-11 5mrm:A, 5mro:A, 5mrp:A, 4nak:A, 4nal:A, 4nan:A, 1w77:A, 2yc5:A, 2ycm:A
23 1i52:A 225 215 0.1495 0.2444 0.2558 2.64e-10 1h3m:A, 1h3m:B, 1ini:A
24 4zdq:A 230 216 0.1440 0.2304 0.2454 4.28e-07 4zdq:D
25 6xhq:A 237 220 0.1386 0.2152 0.2318 7.01e-06 6xhq:B, 6xhs:B, 6xhs:E, 6xht:A, 6xht:B, 6xht:E, 6xht:F
26 2vsi:B 227 220 0.1467 0.2379 0.2455 1.32e-05 2vsi:A
27 4cvh:A 391 205 0.1386 0.1304 0.2488 1.88e-04
28 7vax:F 471 69 0.0598 0.0467 0.3188 0.44 3a5c:E, 8gxw:E, 8gxx:E, 6r0w:E, 6r0y:D, 6r10:F, 7val:E, 7van:E, 7vap:E, 7vaq:E, 7var:E, 7vas:E, 7vat:E, 7vav:E, 7vaw:E, 7vay:E, 7vb0:E, 3w3a:E, 3w3a:M
29 6ip0:A 472 97 0.0652 0.0508 0.2474 0.88 6ip4:A
30 4ccl:B 372 65 0.0571 0.0565 0.3231 3.5 4ccl:A, 4lit:A, 4liv:A, 4nub:A
31 4nwj:A 504 111 0.0788 0.0575 0.2613 4.0 4my4:A, 4nwx:A, 4qax:A, 7tl8:A
32 2gm3:A 153 68 0.0571 0.1373 0.3088 4.3 2gm3:B, 2gm3:C, 2gm3:D, 2gm3:E, 2gm3:F
33 2z36:B 404 58 0.0462 0.0421 0.2931 4.8 2z36:A
34 8ttp:B 359 51 0.0435 0.0446 0.3137 6.0 3bls:A, 3bls:B, 3bm6:A, 3bm6:B, 1c3b:A, 1c3b:B, 9c6p:A, 9c6p:B, 9c81:A, 9c81:B, 9c83:A, 9c83:B, 9c84:A, 9c84:B, 9c8j:A, 9c8j:B, 7cin:A, 7cin:B, 6dpt:A, 6dpt:B, 6dpx:A, 6dpx:B, 6dpy:A, 6dpy:B, 6dpz:A, 6dpz:B, 4e3i:A, 4e3i:B, 4e3j:A, 4e3j:B, 4e3k:A, 4e3k:B, 4e3l:A, 4e3l:B, 4e3m:A, 4e3m:B, 4e3n:A, 4e3n:B, 4e3o:A, 4e3o:B, 5f1g:A, 1fcm:A, 1fcm:B, 1fcn:A, 1fcn:B, 1fco:A, 1fco:B, 2ffy:A, 2ffy:B, 3fkv:A, 3fkv:B, 1fsw:A, 1fsw:B, 1fsy:A, 1fsy:B, 1ga9:A, 1ga9:B, 3gqz:A, 3gr2:A, 3grj:A, 3grj:B, 3gsg:A, 3gsg:B, 3gtc:A, 3gtc:B, 3gv9:A, 3gv9:B, 3gvb:A, 5gzw:A, 5gzw:B, 2hdq:A, 2hdq:B, 2hdr:A, 2hdr:B, 2hds:A, 2hds:B, 2hdu:A, 2hdu:B, 1i5q:A, 1i5q:B, 2i72:A, 2i72:B, 1iel:A, 1iel:B, 1iem:A, 1iem:B, 3iwo:A, 3iwo:B, 3ixb:B, 3ixb:A, 3ixg:B, 3ixh:B, 4jxg:B, 4jxg:A, 4jxs:B, 4jxv:A, 4jxv:B, 4jxw:A, 4jxw:B, 1kds:A, 1kds:B, 1kdw:A, 1kdw:B, 1ke0:A, 1ke0:B, 1ke3:A, 1ke3:B, 4ken:B, 4kg2:B, 4kg2:A, 4kg5:B, 4kg5:A, 4kg5:C, 4kg5:D, 1kvl:A, 1kvl:B, 1kvm:B, 4kz3:A, 4kz3:B, 4kz4:B, 4kz5:A, 4kz5:B, 4kz6:B, 4kz7:A, 4kz7:B, 4kz8:A, 4kz8:B, 4kz9:A, 4kza:A, 4kza:B, 4kzb:A, 4kzb:B, 1l0g:A, 1l2s:A, 1l2s:B, 1ll5:A, 1ll5:B, 1ll9:B, 1llb:B, 4lv0:A, 4lv0:B, 4lv1:A, 4lv1:B, 4lv2:A, 4lv2:B, 4lv3:A, 4lv3:B, 1mxo:A, 1mxo:B, 1my8:A, 1my8:B, 1o07:A, 1o07:B, 3o86:A, 3o86:B, 3o87:A, 3o87:B, 3o88:A, 3o88:B, 4okp:B, 4old:A, 4old:B, 4olg:A, 4olg:B, 1pi4:A, 1pi4:B, 1pi5:A, 1pi5:B, 2pu2:A, 2pu2:B, 2pu4:A, 2pu4:B, 2r9w:A, 2r9w:B, 2r9x:A, 2r9x:B, 2rcx:A, 2rcx:B, 6t35:A, 6t5y:A, 6t7l:A, 6tbw:A, 6tpm:A, 8ttp:A, 6whf:A, 6whf:B, 6xfs:A, 6xfs:B, 6xfs:C, 6xfs:D, 1xgi:B, 1xgj:A, 1xgj:B, 6yen:A, 6yeo:A, 6yeo:B, 6yeo:C, 6yeo:D, 6ypd:A
35 1a0c:A 437 71 0.0625 0.0526 0.3239 7.1 1a0c:B, 1a0c:C, 1a0c:D
36 3al5:B 311 35 0.0299 0.0354 0.3143 9.3 3al5:D, 3al6:B, 3al6:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218