BioLiP

>protein
ELTLRTIADEDDYESYMASAYSVFLRDPQKDEIEVNRKFTELDRMIGFHDGKKWVATTGAFSRHVVLPGGAVVPVAAVTA
VTVSPTHRRRGLLTTMMRHQLADIRSRGESLAMLFASEALIYGRFGYGVATESAELSGQVRELAFRPTVDLGDGTLEEVS
AETFLASAPAIYDAVIPGLPGQMSRTPEWWASWTLDSEELQKESGKVRFVLHYESDGTASGFAIYRPKPGWPNAELHVQE
VLGTNPRSYARTWRYLLDMDLVRKIKYHGASVQEELRYLVANHPSLECVVSDAIQVRLVDIPRALAQRRYAADVDVVLEV
TDDFLPENSGRYRLRGGLDHASCEITTDDADIALTVRDLGSVYMGGVSLQVLASAGLVTELRAGAVQRAATAFGWPVAPS
APDDF

The query sequence (length=405) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6rft:A	406	405	1.0000	0.9975	1.0000	0.0	6rft:B, 6rft:C, 6rft:D, 6rft:E, 6rft:F, 6rfx:D, 6rfx:A, 6rfx:B, 6rfx:C, 6rfx:E
2	6yca:A	390	374	0.3062	0.3179	0.3316	1.68e-44	6yca:F, 6yca:B, 6yca:C, 6yca:D, 6yca:E
3	4qb9:A	402	333	0.2765	0.2786	0.3363	1.72e-40	4qb9:B, 4qb9:C, 4qb9:D, 4qb9:E, 4qb9:F, 3sxn:A, 3sxn:B, 3sxn:C, 3sxn:D, 3sxn:E, 3sxn:F
4	6b3t:A	396	394	0.2716	0.2778	0.2792	1.10e-26	6b0u:A, 6b0u:B, 6b0u:C, 8d1r:A, 8d23:A, 8d25:A, 5ebv:A, 5ec4:A, 8f4a:A, 8f4t:A, 8f4u:A, 8f4w:A, 8f4z:A, 8f51:A, 8f55:A, 8f57:A, 8f58:A, 5iv0:A, 4jd6:A, 4jd6:B, 4jd6:C, 4jd6:D, 4jd6:E, 4jd6:F, 6p3t:A, 6p3u:A, 6p3v:A, 3r1k:A, 3ryo:A, 3ryo:B, 3ryo:C, 3ryo:D, 3ryo:E, 3ryo:F, 3ryo:G, 3ryo:H, 3ryo:I, 3ryo:J, 3ryo:K, 3ryo:L, 5tvj:A, 6vur:A, 6vus:A, 6vut:A, 6vuu:A, 6vuw:A, 6vux:A, 6vuy:A, 6vuz:A, 6vv0:A, 6vv1:A, 6vv2:A, 6vv3:A, 6x10:A, 6x6g:AAA, 6x6i:AAA, 6x6y:AAA, 6x7a:AAA
5	4my0:C	392	406	0.2519	0.2602	0.2512	1.66e-12	4my0:A, 4my0:E, 4my0:B, 4my0:D, 4my0:F
6	2ozg:A	388	316	0.1704	0.1778	0.2184	3.62e-08
7	2q0y:A	153	60	0.0469	0.1242	0.3167	0.015
8	1xx4:A	254	67	0.0519	0.0827	0.3134	0.29
9	4j3h:A	42	28	0.0296	0.2857	0.4286	0.63	4j3h:B
10	8sgh:A	844	44	0.0370	0.0178	0.3409	1.5	7cyl:A, 4fdd:A, 4fq3:A, 2h4m:A, 5j3v:A, 5j3v:B, 4jlq:A, 4oo6:A, 2ot8:A, 5tqc:A, 7vpw:A, 5yvi:A, 2z5k:A, 2z5m:A, 2z5n:A, 2z5o:A
11	5yvg:B	764	44	0.0370	0.0196	0.3409	1.5
12	5yvg:A	830	44	0.0370	0.0181	0.3409	1.6	2h4m:B, 2ot8:B, 5yvh:A
13	5nnp:B	179	68	0.0568	0.1285	0.3382	2.8	5nnp:F
14	4evy:A	147	55	0.0370	0.1020	0.2727	4.3	4evy:B
15	3hip:A	82	52	0.0420	0.2073	0.3269	4.5	3hip:B, 3hip:C
16	5t7e:D	175	32	0.0321	0.0743	0.4062	4.9	5t7d:A, 5t7d:B, 5t7d:C, 5t7d:D, 5t7e:A, 5t7e:B, 5t7e:C
17	7k36:I	599	53	0.0420	0.0284	0.3208	5.6
18	2zg3:A	210	39	0.0321	0.0619	0.3333	6.4	2zg1:A
19	1gqy:B	469	60	0.0494	0.0426	0.3333	8.1	1gqy:A, 1p31:A, 1p31:B, 1p3d:A, 1p3d:B
20	8fia:A	1772	26	0.0346	0.0079	0.5385	8.5
21	9c4m:A	335	92	0.0568	0.0687	0.2500	9.0	9c4m:B, 9c4m:C, 9c4m:D, 9c4m:E, 9c4m:F, 9c4m:G, 9c4m:H

[Back]