BioLiP

>protein
ELTLRTIADEDDYESYMASAYSVFLRDPQKDEIEVNRKFTELDRMIGFHDGKKWVATTGAFSRHVVLPGGAVVPVAAVTA
VTVSPTHRRRGLLTTMMRHQLADIRSRGESLAMLFASEALIYGRFGYGVATESAELSGQVRELAFRPTVDLGDGTLEEVS
AETFLASAPAIYDAVIPGLPGQMSRTPEWWASWTLDSEELQKESGKVRFVLHYESDGTASGFAIYRPKPGNAELHVQEVL
GTNPRSYARTWRYLLDMDLVRKIKYHGASVQEELRYLVANHPSLECVVSDAIQVRLVDIPRALAQRRYAADVDVVLEVTD
DFLPENSGRYRLRGGLDHASCEITTDDADIALTVRDLGSVYMGGVSLQVLASAGLVTELRAGAVQRAATAFGWPVAPSAP
DDF

The query sequence (length=403) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6rft:A	406	405	1.0000	0.9926	0.9951	0.0	6rft:B, 6rft:C, 6rft:D, 6rft:E, 6rft:F, 6rfx:D, 6rfx:A, 6rfx:B, 6rfx:C, 6rfx:E
2	6yca:A	390	375	0.3102	0.3205	0.3333	1.67e-44	6yca:F, 6yca:B, 6yca:C, 6yca:D, 6yca:E
3	4qb9:A	402	395	0.3027	0.3035	0.3089	1.04e-40	4qb9:B, 4qb9:C, 4qb9:D, 4qb9:E, 4qb9:F, 3sxn:A, 3sxn:B, 3sxn:C, 3sxn:D, 3sxn:E, 3sxn:F
4	6b3t:A	396	390	0.2730	0.2778	0.2821	2.15e-28	6b0u:A, 6b0u:B, 6b0u:C, 8d1r:A, 8d23:A, 8d25:A, 5ebv:A, 5ec4:A, 8f4a:A, 8f4t:A, 8f4u:A, 8f4w:A, 8f4z:A, 8f51:A, 8f55:A, 8f57:A, 8f58:A, 5iv0:A, 4jd6:A, 4jd6:B, 4jd6:C, 4jd6:D, 4jd6:E, 4jd6:F, 6p3t:A, 6p3u:A, 6p3v:A, 3r1k:A, 3ryo:A, 3ryo:B, 3ryo:C, 3ryo:D, 3ryo:E, 3ryo:F, 3ryo:G, 3ryo:H, 3ryo:I, 3ryo:J, 3ryo:K, 3ryo:L, 5tvj:A, 6vur:A, 6vus:A, 6vut:A, 6vuu:A, 6vuw:A, 6vux:A, 6vuy:A, 6vuz:A, 6vv0:A, 6vv1:A, 6vv2:A, 6vv3:A, 6x10:A, 6x6g:AAA, 6x6i:AAA, 6x6y:AAA, 6x7a:AAA
5	4my0:C	392	404	0.2506	0.2577	0.2500	8.52e-12	4my0:A, 4my0:E, 4my0:B, 4my0:D, 4my0:F
6	2ozg:A	388	314	0.1712	0.1778	0.2197	2.20e-08
7	2q0y:A	153	60	0.0471	0.1242	0.3167	0.013
8	4j3h:A	42	28	0.0298	0.2857	0.4286	0.67	4j3h:B
9	5yvg:B	764	44	0.0372	0.0196	0.3409	1.4
10	8sgh:A	844	44	0.0372	0.0178	0.3409	1.5	7cyl:A, 4fdd:A, 4fq3:A, 2h4m:A, 5j3v:A, 5j3v:B, 4jlq:A, 4oo6:A, 2ot8:A, 5tqc:A, 7vpw:A, 5yvi:A, 2z5k:A, 2z5m:A, 2z5n:A, 2z5o:A
11	5yvg:A	830	44	0.0372	0.0181	0.3409	1.6	2h4m:B, 2ot8:B, 5yvh:A
12	1xx4:A	254	67	0.0521	0.0827	0.3134	2.0
13	6u3j:A	876	163	0.0868	0.0400	0.2147	2.9	5rvw:A, 5rvw:B, 5rvx:A, 5rvx:B, 5rvy:A, 5rvy:B, 5rvz:A, 5rvz:B, 5rw0:A, 5rw0:B, 5rw1:A, 5rw1:B, 6sy1:A, 6sy1:B, 6u3j:B
14	5nnp:B	179	68	0.0571	0.1285	0.3382	3.0	5nnp:F
15	4evy:A	147	55	0.0372	0.1020	0.2727	4.3	4evy:B
16	5t7e:D	175	32	0.0323	0.0743	0.4062	5.0	5t7d:A, 5t7d:B, 5t7d:C, 5t7d:D, 5t7e:A, 5t7e:B, 5t7e:C
17	7k36:I	599	53	0.0422	0.0284	0.3208	5.3
18	2zg3:A	210	39	0.0323	0.0619	0.3333	6.4	2zg1:A
19	4txl:C	290	53	0.0397	0.0552	0.3019	7.4	4txl:D, 4txl:A, 4txl:B, 4txm:A, 4txm:B, 4txn:A, 4txn:B, 4txn:C, 4txn:D
20	8fia:A	1772	26	0.0347	0.0079	0.5385	7.8

[Back]