Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ELSALVPVLFGHAAFQQLNAGCQLGLFELLHERGPLSAEEVADALRLPRRSADILLLGTTALGLSTVTDGGYRNGAPIGA
AFRDGLWPVLRDIVQYQDKIAYQPAADYVESLRTGQNAGIRHFPGTTRDLYSRLAAVPGLEELFYRGMHAWSQLSNPVLL
AQPDFTRVHRVLDVGGGDAVNAVALARAHPSLRVTVLDRPGALEVARKTIAEAGLEERVRTHAADIFTDSYPAGHDCVLF
AHQLVIWSPEQNLTLLRKAYDAVEPGGRVLVFNAFTDDDRTGPLYAALDNVYFTTLPFRHSTIHRWADCESWLREAGFTD
VGRTAPPGWTPHGVVSGSRPR

The query sequence (length=341) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4u1q:A 341 341 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 4u1q:B, 4u1q:C, 4u1q:D, 4x3q:A, 4x3q:B, 4x3q:C, 4x3q:D
2 7wdq:A 336 326 0.2639 0.2679 0.2761 1.10e-25 7wdq:B, 7wdq:C, 7wdw:A, 7wdw:B, 7wdw:C, 7wdw:D
3 8tjj:C 330 321 0.2874 0.2970 0.3053 1.53e-24 8tjj:A, 8tjj:B, 8tjj:D, 8tjk:A, 8tjk:B
4 4a6d:A 345 285 0.2346 0.2319 0.2807 2.80e-20 4a6e:A
5 1x1a:A 337 183 0.1554 0.1573 0.2896 1.65e-19 1x1b:A, 1x1c:A, 1x1d:A
6 6c5b:A 332 269 0.1965 0.2018 0.2491 9.62e-17 6c5b:B
7 1qzz:A 340 187 0.1906 0.1912 0.3476 1.36e-16 1r00:A, 1xds:A, 1xds:B, 1xdu:A
8 5i2h:A 335 290 0.2346 0.2388 0.2759 5.54e-16 5i2h:B
9 8har:A 357 350 0.2522 0.2409 0.2457 5.97e-16 8har:B
10 7pg7:D 329 140 0.1437 0.1489 0.3500 5.36e-15
11 3gwz:A 339 273 0.2199 0.2212 0.2747 1.37e-14 3gwz:D, 3gwz:C, 3gwz:B, 3gxo:A, 3gxo:D, 3gxo:C, 3gxo:B
12 6clx:B 342 163 0.1584 0.1579 0.3313 8.46e-14 6clx:A
13 7clf:A 335 125 0.1085 0.1104 0.2960 1.03e-13 7clf:B
14 1tw2:B 350 142 0.1349 0.1314 0.3239 5.87e-10 5eeg:A, 5eeg:B, 5eeh:A, 5eeh:B, 5eeh:C, 5jr3:A, 5jr3:B, 5jr3:C, 7owb:A, 7oy1:A, 7oy1:B, 7pga:A, 7pga:B, 7pga:C, 7pga:D, 7pgj:A, 7phd:A, 7phd:B, 7phe:A, 7phe:B, 7phf:A, 7phf:D, 7phf:C, 1tw2:A, 1tw3:A, 1tw3:B, 4wxh:A, 4wxh:B
15 5icc:A 352 274 0.1877 0.1818 0.2336 4.64e-09 5ice:A, 5icf:A
16 7ux7:A 378 110 0.1085 0.0979 0.3364 6.06e-09 7ux6:A, 7ux6:B, 7ux7:B, 7ux8:A, 7ux8:B
17 4evi:A 360 229 0.1730 0.1639 0.2576 6.24e-09 4e70:A, 4e70:B, 4evi:B
18 2qyo:A 353 205 0.1466 0.1416 0.2439 2.19e-06 2qyo:B
19 8pha:A 450 150 0.1144 0.0867 0.2600 4.93e-06 8pha:B
20 1fp1:D 340 161 0.1202 0.1206 0.2547 8.34e-06 1fpq:A
21 3p9i:A 357 190 0.1466 0.1401 0.2632 1.22e-05 3p9c:A, 3p9i:B, 3p9i:C, 3p9i:D, 3p9k:A, 3p9k:B, 3p9k:C, 3p9k:D
22 3lst:A 333 179 0.1408 0.1441 0.2682 1.28e-05 3lst:B
23 5cvj:D 361 273 0.1906 0.1801 0.2381 1.33e-05 5cvj:A, 5cvj:B, 5cvj:C, 5cvu:A, 5cvu:B, 5cvu:C, 5cvu:D, 5cvv:A, 5cvv:B, 3reo:A, 3reo:B, 3reo:C, 3reo:D, 3tky:A, 3tky:B, 3tky:C, 3tky:D
24 6i6m:B 357 144 0.1056 0.1008 0.2500 1.52e-05 6i5z:A, 6i5z:B, 6i5z:D, 6i6k:A, 6i6k:B, 6i6l:A, 6i6l:B, 6i6m:A, 6i6n:A, 6i6n:B
25 6cig:A 349 190 0.1408 0.1375 0.2526 1.56e-05 1fp2:A
26 8bir:A 321 144 0.0968 0.1028 0.2292 2.22e-05 8big:A, 8big:B, 8big:C, 8big:D, 8big:E, 8big:F, 8big:G, 8big:H, 8bii:A, 8bii:B, 8bii:C, 8bii:D, 8bii:E, 8bii:F, 8bii:G, 8bii:H, 8bir:B
27 8bgt:A 319 126 0.0997 0.1066 0.2698 4.64e-05 8bgt:B, 8bgx:A, 8bgx:B, 8bgx:C, 8bgx:D, 8bgy:A, 8bgy:B, 8bgy:C, 8bgy:D, 8bgz:A, 8bgz:B, 8bgz:C, 8bgz:D, 8bh0:A, 8bh0:B, 8bh0:C, 8bh0:D, 8bh0:E, 8bh0:F, 8bh0:G, 8bh0:H, 8bib:A, 8bib:B, 8bib:C, 8bib:D, 8bid:A, 8bid:B, 8bid:C, 8bid:D, 8bih:A, 8bih:B, 8bih:C, 8bih:D, 8bih:E, 8bih:F, 8bih:G, 8bih:H, 8bih:I, 8bih:J, 8bih:K, 8bih:L
28 4pgh:D 358 140 0.1320 0.1257 0.3214 5.97e-05 4pgh:A, 4pgh:B, 4pgh:C
29 7v6l:B 347 193 0.1378 0.1354 0.2435 6.49e-05 7v6j:A, 7v6j:B, 7v6l:A
30 3i58:A 328 179 0.1613 0.1677 0.3073 1.67e-04 3i53:A, 3i53:B, 3i58:B, 3i5u:A, 3i5u:B, 3i64:A, 3i64:B
31 6hp2:A 297 83 0.0645 0.0741 0.2651 1.76e-04
32 5xoh:A 348 180 0.1026 0.1006 0.1944 1.91e-04
33 8bie:A 318 146 0.1026 0.1101 0.2397 2.04e-04 8bie:B, 8bij:A, 8bij:B
34 6i71:A 353 275 0.1730 0.1671 0.2145 2.80e-04 6i71:B, 6i72:A, 6i72:B, 6i73:A, 6i73:B, 6yjw:A, 6yjw:B
35 1kyw:C 361 135 0.1026 0.0970 0.2593 3.22e-04 1kyw:F, 1kyz:A, 1kyz:C, 1kyz:E
36 1zg3:A 358 147 0.1144 0.1089 0.2653 0.002 1zga:A, 1zgj:A, 1zhf:A
37 6ecx:A 283 83 0.0645 0.0777 0.2651 0.004 6ect:A
38 5wp5:A 463 167 0.1232 0.0907 0.2515 0.014 5wp5:B
39 8bic:B 323 113 0.0792 0.0836 0.2389 0.025 8bic:A
40 9fcx:A 214 167 0.1320 0.2103 0.2695 0.098 9fcd:A, 9fcl:A, 9fcq:A, 9fcs:A, 9fcs:B, 9fcu:A, 9fcu:B, 9fcu:C, 9fcu:D, 9fcx:B, 9fcy:A, 9fcy:B, 9fcy:C, 9fcy:D, 9fd3:A, 9g0k:A, 9g0k:B
41 9fce:B 209 172 0.1320 0.2153 0.2616 0.11 9fce:A
42 1dl5:A 317 129 0.0997 0.1073 0.2636 0.15 1dl5:B
43 6inw:B 390 229 0.1642 0.1436 0.2445 0.24 6inw:A, 6iv7:A, 6iv7:B, 6ix3:A, 6ix3:B, 6ix5:A, 6ix5:B, 6ix7:A, 6ix7:B, 6ix8:A, 6ix8:B, 6ix9:A, 6ix9:B, 6j1o:A, 6j1o:B, 6j24:B, 6j24:A, 6j46:A, 6j46:B, 5zzd:A, 5zzd:B
44 7rlk:D 117 91 0.0645 0.1880 0.2418 0.27 7rlk:A, 7rlk:C, 7rlk:E, 7rlk:F
45 5bxy:A 155 69 0.0587 0.1290 0.2899 0.30 5bxy:B
46 6ecv:A 286 95 0.0880 0.1049 0.3158 0.30 6ecu:A, 6ecu:B, 6ecv:B, 6ecw:A, 6ecw:B
47 7wh9:A 476 95 0.0616 0.0441 0.2211 0.42 7wh9:B, 7wh9:C
48 3ou7:A 214 85 0.0821 0.1308 0.3294 0.67 3ou2:A, 3ou6:A, 3ou6:B, 3ou6:C, 3ou6:D, 3ou7:B, 3ou7:C, 3ou7:D
49 7cfe:A 214 128 0.1026 0.1636 0.2734 0.80
50 7wm6:A 240 61 0.0469 0.0667 0.2623 0.84 7wm6:C, 7wm6:D
51 7kjj:A 115 43 0.0381 0.1130 0.3023 1.2 7kjj:B
52 8bif:A 318 108 0.0704 0.0755 0.2222 1.2 8bif:B, 8bif:C, 8bif:D
53 7bgg:A 216 157 0.1408 0.2222 0.3057 1.3 7ndm:A, 7nmk:A, 7noy:A
54 6nej:B 346 279 0.1789 0.1763 0.2186 1.4 6neg:A, 6neg:B, 6neh:A, 6neh:B, 6nej:A
55 4kdr:A 208 119 0.1056 0.1731 0.3025 1.5 5dpm:A
56 2b3t:A 276 41 0.0440 0.0543 0.3659 1.6 1t43:A
57 1kgj:A 123 55 0.0411 0.1138 0.2545 1.6 1ie4:A, 1ie4:C, 1ie4:B, 1ie4:D, 1kgi:A, 1kgi:C, 1kgi:B, 1kgi:D, 1kgj:B, 1kgj:D, 1kgj:C
58 2gpy:B 192 72 0.0557 0.0990 0.2639 1.9 2gpy:A
59 3dtn:A 220 164 0.1056 0.1636 0.2195 2.7 3dtn:B
60 4y2h:B 352 73 0.0616 0.0597 0.2877 3.1 4c03:A, 4c03:B, 4c04:A, 4c05:A, 4c07:A, 4c08:A, 5e8r:A, 5e8r:B, 5egs:A, 5egs:B, 5egs:C, 5egs:D, 5fqn:A, 5fqo:A, 4hc4:A, 5hzm:A, 5lv4:A, 5lv5:A, 7nr4:A, 7nr4:B, 7nr4:C, 7nr4:D, 7nud:A, 7nud:B, 7nue:A, 7nue:B, 7p2r:A, 7p2r:B, 6p7i:A, 6p7i:B, 6p7i:C, 6p7i:D, 4qpp:B, 4qpp:C, 4qpp:A, 4qqk:A, 6sq3:A, 6sq3:B, 6sq4:A, 6sq4:B, 6sqi:A, 6sqk:B, 6sqk:A, 6w6d:A, 6wad:A, 5wcf:A, 4y2h:A, 4y30:A, 4y30:B
61 4gek:G 231 119 0.0821 0.1212 0.2353 3.2 4gek:A, 4iwn:A, 4iwn:B
62 6k8d:A 290 47 0.0469 0.0552 0.3404 3.4 6ikz:B, 6k8d:B, 6k8d:C, 6k8d:D, 6knj:A, 6knj:B, 6knl:A, 6knl:B
63 4dzr:A 163 29 0.0411 0.0859 0.4828 3.4
64 5zw3:B 193 125 0.0821 0.1451 0.2240 3.6
65 2pfz:A 301 158 0.0938 0.1063 0.2025 3.8
66 3uaw:A 233 33 0.0469 0.0687 0.4848 4.2 2ac7:A, 2ac7:B, 3uav:A, 3uax:A, 3uay:A, 3uaz:A
67 6jcl:G 219 57 0.0616 0.0959 0.3684 4.4 6jcl:A, 6jcl:C, 6jcl:B, 6jcl:E, 6jcl:D, 6jcl:H, 6jcl:F
68 2p4s:A 282 46 0.0440 0.0532 0.3261 4.6 2p4s:B, 2p4s:C
69 3w5m:A 1030 82 0.0792 0.0262 0.3293 4.7 3w5n:A
70 7wzg:B 243 99 0.0762 0.1070 0.2626 4.8 7wzg:A, 7wzg:C, 7wzg:D, 7wzg:E, 7wzg:F
71 5zw4:A 216 125 0.0821 0.1296 0.2240 4.9 5zw3:A
72 7al4:D 524 132 0.0880 0.0573 0.2273 5.1 7al4:C, 7al4:B, 7al4:A
73 4kif:B 339 98 0.0762 0.0767 0.2653 5.2 4kib:A, 4kib:B, 4kic:A, 4kic:B, 4kif:A, 4kig:A, 4kig:B, 4m6x:A, 4m6x:B, 4m6y:A, 4m6y:B, 4m71:A, 4m71:B, 4m72:A, 4m72:B, 4m73:A, 4m73:B, 4m74:A, 4m74:B
74 6uv6:C 264 74 0.0733 0.0947 0.3378 5.9 6uv6:A, 6uv6:B
75 8joz:A 257 111 0.0938 0.1245 0.2883 6.9 4htf:A, 4htf:B
76 3qsy:A 415 59 0.0499 0.0410 0.2881 7.4 2aho:A, 3cw2:B, 6i5m:A, 5jb3:7, 5jbh:7, 4m0l:A, 4m0l:B, 4m0l:C, 4m0l:D, 4m0l:E, 4m0l:F, 4m2l:A, 4m4s:A, 4nbs:A, 3pen:A, 2pmd:A, 2pmd:B, 4qfm:A, 4qhy:A, 2qmu:A, 2qn6:A, 6r8s:A, 6r8t:A, 4rcy:A, 4rcz:A, 4rd0:A, 4rd1:A, 4rd2:A, 4rd3:A, 4rd4:A, 4rd6:A, 4rjl:A, 3sjz:A, 6sw9:7, 6swc:7, 3v11:A
77 7wzf:A 243 102 0.0850 0.1193 0.2843 8.1
78 5bp9:A 237 128 0.0880 0.1266 0.2344 8.2
79 3mq2:A 215 28 0.0411 0.0651 0.5000 8.5 3mq2:B
80 7yf2:A 275 116 0.0821 0.1018 0.2414 8.9 8gze:B, 8gze:A, 8gzf:A, 8gzf:B, 7y9c:A, 7y9c:B, 7yf2:B, 7yf3:A, 7yf3:B, 7yf4:A, 7yf4:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218