Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ELQKLQWAKQTTSICCYCAVGCGLIVHTAKDGQGRAVNVEGDPDHPINEGSLCPKGASIFQLGENDQRGTQPLYRAPFSD
TWKPVTWDFALTEIAKRIKKTRDASFTEKNAAGDLVNRTEAIASFGSAAMDNEECWAYGNILRSLGLVYIEHQARICHSP
TVPALAESFGRGAMTNHWNDLANSDCILIMGSNAAENHPIAFKWVLRAKDKGATLIHVDPRFTRTSARCDVYAPIRSGAD
IPFLGGLIKYILDNKLYFTDYVREYTNASLIVGEKFSFKDGLFSGYDAANKKYDKSMWAFELDANGVPKRDPALKHPRCV
INLLKKHYERYNLDKVAAITGTSKEQLQQVYKAYAATGKPDKAGTIMYAMGWTQHSVGVQNIRAMAMIQLLLGNIGVAGG
GVNALRGESNVQGSTDQGLLAHIWPGYNPVPNSKAATLELYNAATPQSKDPMSVNWWQNRPKYVASYLKALYPDEEPAAA
YDYLPRIDAGRKLTDYFWLNIFEKMDKGEFKGLFAWGMNPACGGANANKNRKAMGKLEWLVNVNLFENETSSFWKGPGMN
PAEIGTEVFFLPCCVSIEKEGSVANSGRWMQWRYRGPKPYAETKPDGDIMLDMFKKVRELYAKEGGAYPAPIAKLNIADW
EEHNEFSPTKVAKLMNGYFLKDTEVGGKQFKKGQQVPSFAFLTADGSTCSGNWLHAGSFTDAGNLMARRDKTQTPEQARI
GLFPNWSFCWPVNRRILYNRASVDKTGKPWNPAKAVIEWKDGKWVGDVVDGGGDPGTKHPFIMQTHGFGALYGPGREEGP
FPEHYEPLECPVSKNPFSKQLHNPVAFQIEGEKKAVADPRYPFIGTTYRVTEHWQTGLMTRRCAWLVEAEPQIFCEISKE
LAKLRGIGNGDTVKVSSLRGALEAVAIVTERIRPFKIEGVDVHMVGLPWHYGWMVPKNGGDTANLLTPSAGDPNTGIPET
KAFMVDVRKVWSH

The query sequence (length=973) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8cm5:A 974 973 1.0000 0.9990 1.0000 0.0 8bqg:A, 8bqh:A, 8bqi:A, 8bqj:A, 8bqk:A, 8bql:A, 8cm4:A, 8cm4:C, 8cm5:C, 8cm5:K, 8cm5:R, 8cm6:A, 8cm6:C, 8cm7:A, 8rc8:A, 8rc9:A, 8rca:A, 8rcb:A, 8rcc:A, 8rcg:A, 6sdr:A, 6sdv:A, 7z5o:AAA
2 1h0h:A 977 971 0.6526 0.6499 0.6540 0.0 1h0h:K
3 1kqf:A 982 987 0.4635 0.4593 0.4569 0.0 1kqg:A
4 7qv7:S 571 603 0.1686 0.2872 0.2720 4.59e-58 7qv7:Y
5 7vw6:A 913 626 0.1675 0.1785 0.2604 7.20e-49 7e5z:A, 8j83:A, 7xqw:A
6 7vw6:A 913 127 0.0462 0.0493 0.3543 1.11e-08 7e5z:A, 8j83:A, 7xqw:A
7 7bkb:D 549 645 0.1747 0.3097 0.2636 5.68e-48 7bkb:d, 7bkc:D, 7bkc:d, 7bkd:D, 7bke:D
8 1fdi:A 715 615 0.1624 0.2210 0.2569 1.72e-45 1aa6:A, 1fdo:A, 2iv2:X, 7z0t:A
9 1fdi:A 715 72 0.0247 0.0336 0.3333 0.67 1aa6:A, 1fdo:A, 2iv2:X, 7z0t:A
10 6tg9:A 949 598 0.1501 0.1538 0.2441 5.82e-34 6tg9:E, 6tga:A, 6tga:E
11 6tg9:A 949 131 0.0432 0.0443 0.3206 1.01e-04 6tg9:E, 6tga:A, 6tga:E
12 2v45:A 723 643 0.1552 0.2089 0.2348 1.53e-33 2jim:A, 2jio:A, 2jip:A, 2jiq:A, 2jir:A, 2nap:A, 2v3v:A
13 2v45:A 723 132 0.0473 0.0636 0.3485 6.99e-10 2jim:A, 2jio:A, 2jip:A, 2jiq:A, 2jir:A, 2nap:A, 2v3v:A
14 2nya:A 791 441 0.1192 0.1466 0.2630 3.21e-28 2nya:F
15 2nya:A 791 146 0.0524 0.0645 0.3493 8.52e-08 2nya:F
16 3ml1:A 799 444 0.1161 0.1414 0.2545 8.60e-25 3o5a:A
17 3ml1:A 799 67 0.0267 0.0325 0.3881 3.10e-05 3o5a:A
18 1ogy:A 789 443 0.1182 0.1458 0.2596 5.64e-22 1ogy:C, 1ogy:E, 1ogy:G, 1ogy:I, 1ogy:K, 1ogy:M, 1ogy:O
19 1ogy:A 789 65 0.0267 0.0330 0.4000 4.50e-05 1ogy:C, 1ogy:E, 1ogy:G, 1ogy:I, 1ogy:K, 1ogy:M, 1ogy:O
20 2vpw:A 734 272 0.0761 0.1008 0.2721 8.11e-18 2vpw:E, 2vpx:A, 2vpx:E, 2vpy:A, 2vpy:E, 2vpz:A, 2vpz:E
21 2vpw:A 734 139 0.0360 0.0477 0.2518 1.1 2vpw:E, 2vpx:A, 2vpx:E, 2vpy:A, 2vpy:E, 2vpz:A, 2vpz:E
22 2ivf:A 912 412 0.0997 0.1064 0.2354 2.98e-15
23 2e7z:A 727 260 0.0627 0.0839 0.2346 4.78e-13
24 7b04:B 1120 368 0.0863 0.0750 0.2283 2.17e-12 7b04:E, 7b04:H, 7b04:K, 7b04:N, 7b04:Q, 7b04:T, 7b04:W
25 4aay:A 843 574 0.1398 0.1613 0.2369 3.52e-10 4aay:C, 4aay:E, 4aay:G, 8ccq:A, 8ccq:C, 8ccq:E, 8ccq:G, 8ed4:A, 8ed4:C, 8ed4:E, 8ed4:G, 5nqd:A, 5nqd:C, 5nqd:E, 5nqd:G
26 3egw:A 1244 273 0.0678 0.0531 0.2418 4.83e-07 3ir5:A, 3ir6:A, 3ir7:A, 1q16:A, 1r27:A, 1r27:C, 1siw:A, 1y4z:A, 1y5i:A, 1y5l:A, 1y5n:A
27 7bkb:H 438 235 0.0596 0.1324 0.2468 3.03e-06 7bkb:h, 7bkc:H, 7bkc:h
28 6cz7:A 814 244 0.0627 0.0749 0.2500 5.01e-06 6cz7:C, 6cz8:C, 6cz8:A, 6cz9:A, 6cz9:C, 6cza:A, 6cza:C
29 8oh5:C 1172 193 0.0555 0.0461 0.2798 4.94e-04 8oh5:F, 8oh5:I, 8oh5:L, 8oh9:C, 8oh9:F, 8oh9:I, 8oh9:L
30 8oh5:C 1172 106 0.0267 0.0222 0.2453 0.041 8oh5:F, 8oh5:I, 8oh5:L, 8oh9:C, 8oh9:F, 8oh9:I, 8oh9:L
31 8cff:A 823 330 0.0750 0.0887 0.2212 5.45e-04 8cff:C, 8cff:E, 8cff:G, 8cgs:A, 8cgs:C, 8cgs:E, 8cgs:G, 8ch9:A, 8ch9:C, 8ch9:E, 8ch9:G, 1g8j:A, 1g8j:C, 1g8k:A, 1g8k:C, 1g8k:E, 1g8k:G
32 5chc:A 895 282 0.0617 0.0670 0.2128 0.001 5ch7:A, 5ch7:C, 5ch7:E, 5chc:C, 5chc:E, 5e7o:A, 5e7o:C, 5e7o:E, 5e7o:G, 5e7o:I, 5e7o:K, 4ydd:A, 4ydd:C, 4ydd:E
33 5t5i:J 431 264 0.0565 0.1276 0.2083 0.012 5t5i:B, 5t5m:B, 5t61:B, 5t61:H, 5t61:N, 5t61:T, 5t61:Z, 5t61:f, 5t61:l, 5t61:r
34 7l5s:A 771 336 0.0709 0.0895 0.2054 0.012 7l5i:A
35 7l5s:A 771 142 0.0483 0.0610 0.3310 0.64 7l5i:A
36 7t30:A 666 91 0.0298 0.0435 0.3187 0.13 7t2r:A, 7t2r:F, 7t30:F
37 7rwk:A 368 78 0.0288 0.0761 0.3590 0.27 7rwk:B
38 5hsj:A 606 107 0.0308 0.0495 0.2804 0.34 5hsj:B
39 4v4c:A 875 67 0.0226 0.0251 0.3284 1.1 4v4c:C, 4v4c:E, 4v4c:G, 4v4c:I, 4v4c:K, 4v4c:M, 4v4c:O, 4v4c:Q, 4v4c:S, 4v4c:U, 4v4c:W, 4v4d:A, 4v4d:C, 4v4d:E, 4v4d:G, 4v4d:I, 4v4d:K, 4v4d:M, 4v4d:O, 4v4d:Q, 4v4d:S, 4v4d:U, 4v4d:W, 4v4e:A, 4v4e:C, 4v4e:E, 4v4e:G, 4v4e:I, 4v4e:K, 4v4e:M, 4v4e:O, 4v4e:Q, 4v4e:S, 4v4e:U, 4v4e:W
40 7wtp:CC 661 112 0.0298 0.0439 0.2589 1.5 6eml:t, 6wdr:k, 7wtq:CC
41 8cbj:k 670 112 0.0298 0.0433 0.2589 1.6 6fai:k, 6y7c:t
42 8c00:t 619 112 0.0298 0.0468 0.2589 1.6 8c01:t, 6rbd:k, 7wtr:CC
43 1eu1:A 767 214 0.0462 0.0587 0.2103 1.7
44 1eu1:A 767 44 0.0154 0.0196 0.3409 9.6
45 6xm7:A 488 60 0.0206 0.0410 0.3333 2.3 6xm6:A, 6xm8:A, 6xm9:A, 6xma:A
46 3nu1:A 254 77 0.0267 0.1024 0.3377 2.6 3nu1:B
47 3bc9:A 585 62 0.0195 0.0325 0.3065 3.1 3bcd:A, 3bcf:A
48 1tmo:A 794 79 0.0308 0.0378 0.3797 3.4
49 6lod:B 929 35 0.0144 0.0151 0.4000 3.6 6loe:B
50 7cx0:B 603 177 0.0442 0.0713 0.2429 3.8 7cwz:A, 7cwz:B, 7cwz:C, 7cx0:A, 7cx0:C, 7cx1:A, 7cx1:B, 7cx1:C
51 7zaz:CCC 690 55 0.0185 0.0261 0.3273 4.2
52 4hea:3 756 119 0.0288 0.0370 0.2353 4.3 2fug:3, 2fug:C, 2fug:L, 2fug:U, 4hea:D, 6i0d:3, 6i0d:D, 6i1p:3, 6i1p:D, 3i9v:3, 3i9v:C, 3iam:3, 3iam:C, 3ias:3, 3ias:C, 3ias:L, 3ias:U, 3m9s:3, 3m9s:C, 6q8o:3, 6q8o:D, 6q8w:3, 6q8w:D, 6q8x:3, 6q8x:D, 6y11:3, 6y11:D, 2ybb:3, 6ziy:3, 6zjl:3, 6zjn:3, 6zjy:3
53 4xo4:A 870 75 0.0226 0.0253 0.2933 4.9 3b2p:A, 3b2x:A, 3b34:A, 3b37:A, 3b3b:A, 2dq6:A, 2dqm:A, 6g8b:A, 2hpo:A, 2hpt:A, 3ked:A, 5mfr:A, 5mfs:A, 5mft:A, 3puu:A, 4q4e:A, 4q4i:A, 3qjx:A, 4xmt:A, 4xmu:A, 4xmv:A, 4xmw:A, 4xmx:A, 4xmz:A, 4xn1:A, 4xn2:A, 4xn4:A, 4xn5:A, 4xn7:A, 4xn8:A, 4xn9:A, 4xna:A, 4xnb:A, 4xnd:A, 4xo3:A, 4xo5:A, 5yo1:A, 5yq1:A, 5yq2:A, 5yqb:A, 2zxg:A
54 4kub:A 160 43 0.0144 0.0875 0.3256 6.1 4klv:A, 4klw:A, 4kor:A, 4kos:A, 4kot:A, 4kou:A, 4kov:A, 4kow:A, 4kox:A, 4koy:A, 4l89:A, 4l8a:A, 4m3s:A, 4oad:A, 4oae:A, 3pgp:A, 5vd6:A, 5vdb:A
55 7zaz:AAA 727 55 0.0185 0.0248 0.3273 6.1 7zaz:BBB, 7zaz:DDD, 7zb0:A, 7zb0:B, 7zb0:C, 7zb0:D, 7zb1:A, 7zb1:B, 7zb1:C, 7zb1:D, 7zb2:CCC, 7zb2:FFF
56 7vpg:A 341 75 0.0236 0.0674 0.3067 6.8 7f60:A, 7f60:B, 7f90:A, 7f90:C, 7vpg:C, 7vpg:E, 7vpg:G, 7vph:C, 7vph:E, 7vph:G, 7vph:A
57 6s8f:F 2571 28 0.0123 0.0047 0.4286 7.1 7mq8:NR, 7mq9:NR, 7mqa:NR, 6s8f:H
58 7zm7:A 711 61 0.0226 0.0309 0.3607 7.1 7zmb:A, 7zmg:A
59 7dmw:A 200 52 0.0195 0.0950 0.3654 8.8 7dmw:B, 7dmw:C, 7dmw:D, 7dmw:E
60 6rfq:E 263 35 0.0113 0.0418 0.3143 9.4

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218