Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ELPQMVQQLNSPDQQELQSALRKLSQIASGGNEQIQAVIDAGALPALVQLLSSPNEQILQEALWALSNIASGGNEQIQAV
IDAGALPALVQLLSSPNEQILQEALWALSNIASGGNEQIQAVIDAGALPALVQLLSSPNEQILQEALWALSNIASGGNEQ
IQAVIDAGALPALVQLLSSPNEQILQEALWALSNIASGGNEQIQAVIDAGALPALVQLLSSPNEQILQEALWALSNIASG
GNEQIQAVIDAGALPALVQLLSSPNEQILQEALWALSNIASGGNEQKQAVKEAGALEKLEQLQSHENEKIQKEAQEALEK
LGGKRKRKRKRKR

The query sequence (length=333) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6s9o:F 343 340 0.9760 0.9475 0.9559 0.0 5aei:A, 5aei:B, 5aei:C, 5mfd:A, 5mfd:C, 5mfd:E, 5mfd:I, 5mfd:G, 5mfd:J, 5mfd:K, 5mfd:L, 5mfe:A, 5mfe:B, 5mfe:C, 5mfe:D, 5mff:A, 5mff:B, 5mff:C, 5mff:D, 5mfg:A, 5mfh:A, 5mfh:B, 5mfh:C, 5mfh:D, 5mfl:A, 5mfl:B, 5mfl:C, 5mfm:A, 5mfm:B, 5mfm:C, 5mfm:E, 5mfm:D, 5mfm:F, 5mfn:B, 5mfn:A, 5mfo:A, 5mfo:C, 5mfo:E, 6s9l:A, 6s9l:B, 6s9m:A, 6s9m:E, 6s9m:B, 6s9m:C, 6s9m:D, 6s9m:F, 6s9n:A, 6s9n:E, 6s9n:B, 6s9n:C, 6s9n:F, 6s9n:D, 6s9o:A, 6s9o:B, 6s9o:C, 6s9o:D, 6s9o:E
2 6sa8:A 665 320 0.8619 0.4316 0.8969 0.0 7dne:B, 5mfg:C, 5mfg:D, 5mfg:B
3 6sa8:A 665 298 0.8168 0.4090 0.9128 6.61e-171 7dne:B, 5mfg:C, 5mfg:D, 5mfg:B
4 6sa8:A 665 257 0.6937 0.3474 0.8988 1.41e-140 7dne:B, 5mfg:C, 5mfg:D, 5mfg:B
5 4plr:A 289 279 0.7688 0.8858 0.9176 5.02e-164 4plr:B, 4pls:A, 4pls:C, 4pls:D, 4pls:B, 4v3o:A, 4v3o:D, 4v3o:B, 4v3o:C, 4v3q:A, 4v3q:B, 4v3q:C, 4v3q:D
6 4plr:A 289 278 0.7538 0.8685 0.9029 1.20e-160 4plr:B, 4pls:A, 4pls:C, 4pls:D, 4pls:B, 4v3o:A, 4v3o:D, 4v3o:B, 4v3o:C, 4v3q:A, 4v3q:B, 4v3q:C, 4v3q:D
7 4db8:B 239 236 0.6517 0.9079 0.9195 7.56e-137
8 4db8:B 239 237 0.6336 0.8828 0.8903 5.96e-131
9 4db8:B 239 236 0.6006 0.8368 0.8475 1.26e-120
10 5mfo:F 201 197 0.5495 0.9104 0.9289 1.91e-112 5mfo:B, 5mfo:D
11 5mfo:F 201 194 0.5315 0.8806 0.9124 1.45e-108 5mfo:B, 5mfo:D
12 5mfo:F 201 196 0.5135 0.8507 0.8724 5.39e-102 5mfo:B, 5mfo:D
13 5mfo:F 201 196 0.5135 0.8507 0.8724 5.39e-102 5mfo:B, 5mfo:D
14 5mfi:B 240 234 0.4535 0.6292 0.6453 1.30e-95 4d49:A, 4d49:B, 4d49:E, 4d49:F, 5mfi:A, 5mfj:A, 5mfj:B, 5mfk:A
15 5mfi:B 240 238 0.4264 0.5917 0.5966 1.11e-86 4d49:A, 4d49:B, 4d49:E, 4d49:F, 5mfi:A, 5mfj:A, 5mfj:B, 5mfk:A
16 5mfi:B 240 233 0.4174 0.5792 0.5966 7.79e-85 4d49:A, 4d49:B, 4d49:E, 4d49:F, 5mfi:A, 5mfj:A, 5mfj:B, 5mfk:A
17 1un0:A 439 320 0.3964 0.3007 0.4125 1.53e-67 1bk6:A, 1bk6:B, 1ee4:A, 1ee4:B, 1ee5:A, 5h2w:A, 5h2w:C, 5h2x:A, 4pvz:B, 1un0:B, 4xzr:B
18 8gai:C 434 375 0.4024 0.3088 0.3573 3.13e-66 5b56:A, 5b56:B, 4ba3:A, 3btr:C, 6bw0:E, 6bw1:E, 7cru:A, 7cru:C, 5ctt:A, 5d5k:C, 5e6q:B, 8ech:E, 1ejl:I, 1ejy:I, 5ekf:A, 5ekg:A, 8f2q:A, 5fc8:E, 8fk3:A, 8fua:A, 8fuc:B, 8fzk:C, 8g8q:A, 8g8r:A, 8g8s:A, 8gai:A, 5gxw:A, 5h43:A, 8he0:A, 8he3:A, 5hhg:E, 4htv:A, 5huw:C, 5huy:C, 1iq1:C, 6iu7:A, 6iua:A, 6iw8:C, 6iwa:C, 7jjm:B, 7jk7:B, 7jvo:A, 6k06:C, 5k9s:A, 5klr:B, 5klt:B, 3knd:A, 7l04:E, 3l3q:A, 7leq:E, 7let:E, 7leu:E, 7m60:A, 6mjl:B, 4mz5:E, 4mz6:E, 7n8j:A, 7n9h:C, 4oih:A, 3oqs:A, 6p6a:B, 6p6e:A, 1pjm:B, 1pjn:B, 1q1s:C, 1q1t:C, 3q5u:A, 8q8k:A, 8q8k:B, 8qxw:A, 8qxx:A, 7rfx:A, 7rfz:A, 7rg0:A, 7rg1:A, 7rg2:A, 7rg3:A, 7rg4:E, 7rg6:A, 3rz9:A, 3rzx:A, 8sg7:B, 8sud:A, 5svz:A, 8sv0:B, 7tmx:I, 7tmy:I, 3tpm:A, 8tuq:A, 8tur:A, 8tus:A, 8tut:A, 8tuu:A, 8tuv:A, 8u36:A, 4u54:A, 4u58:A, 4u5l:A, 4u5n:A, 4u5o:A, 4u5s:A, 4u5u:A, 4u5v:A, 5u5p:A, 5u5r:A, 3ukw:B, 3ukx:B, 3uky:B, 3ukz:B, 3ul0:B, 3ul1:B, 5umz:B, 7umi:E, 3uvu:A, 5v5o:C, 5v5p:C, 3ve6:A, 8vpr:A, 8vpu:A, 5w41:A, 5w4e:B, 5w4f:B, 5w4g:B, 6wba:A, 6wbb:I, 6wbc:A, 5wum:A, 5wun:A, 4wv6:A, 6wx7:A, 5x8n:A, 1y2a:C, 4yi0:C, 2ynr:A, 4zdu:A, 3zin:A, 3zio:A, 3zip:A, 3ziq:A, 3zir:A
19 6bvv:A 416 369 0.3994 0.3197 0.3604 1.72e-65 6bw9:A, 6bwa:A, 6bwb:A, 8fub:A, 8fzm:A, 8fzm:C, 8hkw:A, 8hkw:B, 7jjl:A, 7lf4:A, 7lf4:C, 7lfc:A, 7rfy:A, 7rg5:A, 5xzx:A
20 6bvv:A 416 309 0.3604 0.2885 0.3883 2.30e-55 6bw9:A, 6bwa:A, 6bwb:A, 8fub:A, 8fzm:A, 8fzm:C, 8hkw:A, 8hkw:B, 7jjl:A, 7lf4:A, 7lf4:C, 7lfc:A, 7rfy:A, 7rg5:A, 5xzx:A
21 6bvv:A 416 123 0.1321 0.1058 0.3577 8.44e-08 6bw9:A, 6bwa:A, 6bwb:A, 8fub:A, 8fzm:A, 8fzm:C, 8hkw:A, 8hkw:B, 7jjl:A, 7lf4:A, 7lf4:C, 7lfc:A, 7rfy:A, 7rg5:A, 5xzx:A
22 4bqk:A 424 374 0.4114 0.3231 0.3663 1.75e-65 4b8o:A, 4b8p:A, 4b8p:B, 4bpl:A, 4bqk:B, 2yns:A, 2yns:B
23 4bqk:A 424 327 0.3934 0.3090 0.4006 4.71e-60 4b8o:A, 4b8p:A, 4b8p:B, 4bpl:A, 4bqk:B, 2yns:A, 2yns:B
24 4bqk:A 424 121 0.1111 0.0873 0.3058 2.79e-07 4b8o:A, 4b8p:A, 4b8p:B, 4bpl:A, 4bqk:B, 2yns:A, 2yns:B
25 4rxh:B 421 320 0.3694 0.2922 0.3844 1.46e-60 5vqi:B
26 4rxh:B 421 322 0.3724 0.2945 0.3851 3.81e-60 5vqi:B
27 4rxh:B 421 242 0.2613 0.2067 0.3595 1.04e-35 5vqi:B
28 4b18:A 427 355 0.3844 0.2998 0.3606 1.92e-58 6wx9:A
29 4b18:A 427 90 0.0961 0.0749 0.3556 4.97e-05 6wx9:A
30 6kbn:C 504 275 0.2462 0.1627 0.2982 1.30e-24 6kbm:A, 6kbn:A
31 6kbn:C 504 244 0.2162 0.1429 0.2951 1.11e-16 6kbm:A, 6kbn:A
32 6kbn:C 504 260 0.2312 0.1528 0.2962 1.19e-15 6kbm:A, 6kbn:A
33 1qz7:A 524 331 0.2613 0.1660 0.2628 7.50e-21 7afw:A, 7ar4:AAA, 4djs:A, 8ei9:A, 8eia:A, 8eib:A, 8eic:A, 2gl7:A, 2gl7:D, 1i7w:A, 1i7w:C, 1jpp:A, 1jpp:B, 1jpw:A, 1jpw:B, 1jpw:C, 3ouw:A, 8ru3:A, 8ru4:A, 8ru4:B, 3sl9:A, 3sl9:E, 3sl9:B, 3sl9:G, 1t08:A, 7uwi:A, 7uwo:A, 8y0p:A, 8y0p:B, 8z10:A
34 1qz7:A 524 297 0.2523 0.1603 0.2828 1.81e-20 7afw:A, 7ar4:AAA, 4djs:A, 8ei9:A, 8eia:A, 8eib:A, 8eic:A, 2gl7:A, 2gl7:D, 1i7w:A, 1i7w:C, 1jpp:A, 1jpp:B, 1jpw:A, 1jpw:B, 1jpw:C, 3ouw:A, 8ru3:A, 8ru4:A, 8ru4:B, 3sl9:A, 3sl9:E, 3sl9:B, 3sl9:G, 1t08:A, 7uwi:A, 7uwo:A, 8y0p:A, 8y0p:B, 8z10:A
35 1qz7:A 524 249 0.1862 0.1183 0.2490 9.73e-14 7afw:A, 7ar4:AAA, 4djs:A, 8ei9:A, 8eia:A, 8eib:A, 8eic:A, 2gl7:A, 2gl7:D, 1i7w:A, 1i7w:C, 1jpp:A, 1jpp:B, 1jpw:A, 1jpw:B, 1jpw:C, 3ouw:A, 8ru3:A, 8ru4:A, 8ru4:B, 3sl9:A, 3sl9:E, 3sl9:B, 3sl9:G, 1t08:A, 7uwi:A, 7uwo:A, 8y0p:A, 8y0p:B, 8z10:A
36 1qz7:A 524 219 0.1652 0.1050 0.2511 2.08e-08 7afw:A, 7ar4:AAA, 4djs:A, 8ei9:A, 8eia:A, 8eib:A, 8eic:A, 2gl7:A, 2gl7:D, 1i7w:A, 1i7w:C, 1jpp:A, 1jpp:B, 1jpw:A, 1jpw:B, 1jpw:C, 3ouw:A, 8ru3:A, 8ru4:A, 8ru4:B, 3sl9:A, 3sl9:E, 3sl9:B, 3sl9:G, 1t08:A, 7uwi:A, 7uwo:A, 8y0p:A, 8y0p:B, 8z10:A
37 1qz7:A 524 154 0.1141 0.0725 0.2468 8.02e-06 7afw:A, 7ar4:AAA, 4djs:A, 8ei9:A, 8eia:A, 8eib:A, 8eic:A, 2gl7:A, 2gl7:D, 1i7w:A, 1i7w:C, 1jpp:A, 1jpp:B, 1jpw:A, 1jpw:B, 1jpw:C, 3ouw:A, 8ru3:A, 8ru4:A, 8ru4:B, 3sl9:A, 3sl9:E, 3sl9:B, 3sl9:G, 1t08:A, 7uwi:A, 7uwo:A, 8y0p:A, 8y0p:B, 8z10:A
38 3l6x:A 434 314 0.2132 0.1636 0.2261 1.98e-07 3l6y:A, 3l6y:C, 3l6y:E
39 5zhx:A 469 259 0.2072 0.1471 0.2664 1.55e-06 5zhx:B, 5zhx:C, 5zhx:D
40 5zhx:A 469 277 0.2132 0.1514 0.2563 4.99e-04 5zhx:B, 5zhx:C, 5zhx:D
41 5zhx:A 469 35 0.0420 0.0299 0.4000 7.6 5zhx:B, 5zhx:C, 5zhx:D
42 7dvq:K 188 115 0.0781 0.1383 0.2261 2.99e-04
43 7dvq:K 188 65 0.0571 0.1011 0.2923 0.006
44 7dvq:K 188 65 0.0571 0.1011 0.2923 0.006
45 7dvq:K 188 65 0.0571 0.1011 0.2923 0.006
46 7dvq:K 188 38 0.0360 0.0638 0.3158 0.58
47 7p0h:A 411 204 0.1622 0.1314 0.2647 0.005 7p0h:B, 7p0h:C, 7p0h:D
48 3lww:C 871 147 0.1141 0.0436 0.2585 0.020 1f59:A, 1f59:B, 1m5n:S, 1o6o:A, 1o6o:C, 1o6o:B, 1o6p:B, 1o6p:A, 1qgr:A
49 3lww:C 871 117 0.0811 0.0310 0.2308 0.28 1f59:A, 1f59:B, 1m5n:S, 1o6o:A, 1o6o:C, 1o6o:B, 1o6p:B, 1o6p:A, 1qgr:A
50 2q5d:B 845 148 0.1201 0.0473 0.2703 0.064
51 2q5d:B 845 148 0.1201 0.0473 0.2703 0.20
52 5wbj:A 1058 197 0.1441 0.0454 0.2437 0.25 5wbk:A, 5wbl:A
53 8tua:A 1329 42 0.0541 0.0135 0.4286 0.25 5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
54 8tkd:A 2249 227 0.1652 0.0245 0.2423 0.53 8tkd:B, 8tkd:C, 8tkd:D, 8tke:A, 8tke:B, 8tke:C, 8tke:D, 8tkg:A, 8tkg:B, 8tkg:C, 8tkg:D, 8tl9:A, 8tl9:B, 8tla:A, 8tla:B
55 8tkf:A 2272 232 0.1532 0.0224 0.2198 0.59 8tkf:D, 8tkf:B, 8tkf:C
56 7t3p:A 2066 179 0.1411 0.0227 0.2626 0.60 7t3p:B, 7t3p:C, 7t3p:D
57 7t3p:A 2066 179 0.1411 0.0227 0.2626 0.60 7t3p:B, 7t3p:C, 7t3p:D
58 7t3p:A 2066 179 0.1381 0.0223 0.2570 0.71 7t3p:B, 7t3p:C, 7t3p:D
59 7t3p:A 2066 179 0.1381 0.0223 0.2570 4.4 7t3p:B, 7t3p:C, 7t3p:D
60 7t3u:A 2020 173 0.1261 0.0208 0.2428 0.77 7t3u:D
61 7t3u:A 2020 190 0.1321 0.0218 0.2316 3.1 7t3u:D
62 7t3u:A 2020 190 0.1321 0.0218 0.2316 3.1 7t3u:D
63 6dr0:C 2193 180 0.1261 0.0192 0.2333 0.80 6dqj:A, 6dqj:B, 6dqj:C, 6dqj:D, 6dqn:A, 6dqn:B, 6dqn:C, 6dqn:D, 6dqs:A, 6dqs:B, 6dqs:C, 6dqs:D, 6dqv:A, 6dqv:B, 6dqv:C, 6dqv:D, 6dqz:A, 6dqz:B, 6dqz:D, 6dqz:C, 6dr0:A, 6dr0:B, 6dr0:D, 6dr2:A, 6dr2:B, 6dr2:C, 6dr2:D, 6dra:A, 6dra:B, 6dra:C, 6dra:D, 6drc:A, 6drc:B, 6drc:C, 6drc:D
64 6xu2:A 1091 107 0.0781 0.0238 0.2430 1.4 6xte:A
65 6xu2:A 1091 98 0.0631 0.0192 0.2143 8.2 6xte:A
66 8tl9:D 2034 182 0.1231 0.0202 0.2253 1.6 8tla:D
67 8pnt:A 749 24 0.0420 0.0187 0.5833 1.6 8by6:A, 6d0y:C, 1n52:A, 5oo6:D, 5oo6:G, 5oo6:J, 5oo6:M, 5oo6:P, 5oob:I, 5oob:A, 8pmp:A
68 3v7p:A 409 98 0.0961 0.0782 0.3265 2.1 4m51:A
69 7t3r:A 2130 170 0.1351 0.0211 0.2647 2.9 7t3r:B, 7t3r:C, 7t3r:D, 7t3t:A, 7t3t:B, 7t3t:C, 7t3t:D
70 7t3q:A 2103 174 0.1231 0.0195 0.2356 3.3 7t3q:B, 7t3q:C, 7t3q:D, 7t3u:B
71 7t3q:A 2103 207 0.1411 0.0223 0.2271 9.9 7t3q:B, 7t3q:C, 7t3q:D, 7t3u:B
72 7t3q:A 2103 207 0.1411 0.0223 0.2271 9.9 7t3q:B, 7t3q:C, 7t3q:D, 7t3u:B
73 8tk8:A 2268 235 0.1562 0.0229 0.2213 3.7 8tk8:B, 8tk8:C, 8tk8:D, 8tkh:A, 8tkh:B, 8tkh:C, 8tkh:D, 8tki:A, 8tki:B, 8tki:C, 8tki:D, 8tl9:C, 8tla:C
74 5m5w:B 1183 92 0.0661 0.0186 0.2391 7.2 4c2m:B, 4c2m:Q, 4c3h:B, 4c3i:B, 4c3j:B, 5g5l:B, 6h67:B, 6h68:B, 6hko:B, 6hlq:B, 6hlr:B, 5m3f:B, 5m3m:B, 5m5x:B, 5m5y:B, 5m64:B, 5n5y:B, 5n5z:B, 5n60:B, 5n61:B, 5oa1:B, 6rqh:B, 6rql:B, 6rqt:B, 6rrd:B, 6rui:B, 6ruo:B, 6rwe:B, 6tps:B, 5w5y:B, 5w64:B, 5w65:B, 5w66:B, 4ym7:AB, 4ym7:BB, 4ym7:CB, 4ym7:DB, 4ym7:EB, 4ym7:FB
75 1l9m:B 681 86 0.0721 0.0352 0.2791 9.3 1l9m:A, 1l9n:A, 1l9n:B, 1nud:A, 1nud:B, 1nuf:A, 1nug:A, 1nug:B, 8oxv:A, 8oxw:A, 8oxx:A
76 1l9m:B 681 86 0.0721 0.0352 0.2791 9.3 1l9m:A, 1l9n:A, 1l9n:B, 1nud:A, 1nud:B, 1nuf:A, 1nug:A, 1nug:B, 8oxv:A, 8oxw:A, 8oxx:A
77 1l9m:B 681 86 0.0721 0.0352 0.2791 9.3 1l9m:A, 1l9n:A, 1l9n:B, 1nud:A, 1nud:B, 1nuf:A, 1nug:A, 1nug:B, 8oxv:A, 8oxw:A, 8oxx:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218