BioLiP

>protein
EKVEMYIKNLQDDSLTVRINAANALGKIGDERAVEPLIKALKDEDALVRLSAAWALGKIGDERAVEPLIKALKDEDSDVR
YRAATALGQIGDERAVEPLIKALKDEDERVRQSAAGALGQIGDERAVEPLIKALKDEDWRVRQEAAFALGQIGDERAVEP
LIKALKDEDSAVRWAAALALGKIGGERVRAAMEKLAETGTGFARKVAVNYLETHGGSAGSPMRCLTCLKLSFKPLCPNCL
NDLPLSLKVRVLEGVSVYSFYAYSEIEELIKSKYALIGSRILPLLSQKAGAEFVKILQEQGLNIPLYGIAIDDKIKSFYS
HSAALLKGFCQGNLKPTYGRLRANNAVSYAGKSLEFRANNPRNFTFKGDESLDYFLLDDIITTGTTLKEALKYLKTLNIK
VHFAIALCSAD

The query sequence (length=411) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7p0h:A	411	411	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	7p0h:B, 7p0h:C, 7p0h:D
2	4d4z:B	290	241	0.1776	0.2517	0.3029	6.17e-09	4d4z:A, 4d50:A, 4d50:B
3	4d4z:B	290	209	0.1509	0.2138	0.2967	3.91e-07	4d4z:A, 4d50:A, 4d50:B
4	4d4z:B	290	209	0.1582	0.2241	0.3110	2.76e-05	4d4z:A, 4d50:A, 4d50:B
5	5mfi:B	240	154	0.1168	0.2000	0.3117	2.77e-06	4d49:A, 4d49:B, 4d49:E, 4d49:F, 5mfi:A, 5mfj:A, 5mfj:B, 5mfk:A
6	5mfi:B	240	124	0.0900	0.1542	0.2984	0.14	4d49:A, 4d49:B, 4d49:E, 4d49:F, 5mfi:A, 5mfj:A, 5mfj:B, 5mfk:A
7	6kbn:C	504	223	0.1290	0.1052	0.2377	8.08e-04	6kbm:A, 6kbn:A
8	6kbn:C	504	158	0.0949	0.0774	0.2468	0.57	6kbm:A, 6kbn:A
9	6oxl:B	564	102	0.0754	0.0550	0.3039	0.012	7rwc:B
10	6oxl:B	564	67	0.0584	0.0426	0.3582	0.024	7rwc:B
11	6oxl:B	564	62	0.0560	0.0408	0.3710	0.16	7rwc:B
12	3lww:C	871	69	0.0633	0.0299	0.3768	0.092	1f59:A, 1f59:B, 1m5n:S, 1o6o:A, 1o6o:C, 1o6o:B, 1o6p:B, 1o6p:A, 1qgr:A
13	3lww:C	871	30	0.0292	0.0138	0.4000	4.2	1f59:A, 1f59:B, 1m5n:S, 1o6o:A, 1o6o:C, 1o6o:B, 1o6p:B, 1o6p:A, 1qgr:A
14	3lww:C	871	105	0.0852	0.0402	0.3333	4.5	1f59:A, 1f59:B, 1m5n:S, 1o6o:A, 1o6o:C, 1o6o:B, 1o6p:B, 1o6p:A, 1qgr:A
15	2q5d:B	845	69	0.0633	0.0308	0.3768	0.094
16	2q5d:B	845	30	0.0292	0.0142	0.4000	4.2
17	2q5d:B	845	71	0.0608	0.0296	0.3521	4.6
18	5d08:A	384	46	0.0462	0.0495	0.4130	0.10	5d08:B, 5d0a:A, 5d0a:B, 5d0a:C, 5d0a:D, 5d0b:A, 5d0b:B, 5t8y:B, 5t8y:A
19	5d08:A	384	51	0.0438	0.0469	0.3529	6.0	5d08:B, 5d0a:A, 5d0a:B, 5d0a:C, 5d0a:D, 5d0b:A, 5d0b:B, 5t8y:B, 5t8y:A
20	6xu2:A	1091	133	0.0827	0.0312	0.2556	0.23	6xte:A
21	6xu2:A	1091	80	0.0487	0.0183	0.2500	1.2	6xte:A
22	7ok0:A	880	71	0.0511	0.0239	0.2958	0.46	7oq4:A, 7oqy:A
23	4kgi:C	206	124	0.0730	0.1456	0.2419	1.3	1a0f:A, 1a0f:B, 4kgi:A, 4kgi:B, 4kgi:D, 1n2a:A, 1n2a:B
24	1ly8:A	339	34	0.0292	0.0354	0.3529	1.4	1arp:A, 1aru:A, 1arv:A, 1arw:A, 1arx:A, 1ary:A, 1c8i:A, 1ck6:A, 2e39:A, 2e3a:A, 2e3b:A, 1gza:A, 1gzb:A, 1h3j:A, 1h3j:B, 1hsr:A, 1ly8:B, 1ly9:A, 1ly9:B, 1lyc:A, 1lyc:B, 1lyk:A, 1lyk:B
25	1u9z:A	274	23	0.0316	0.0474	0.5652	1.7	1u9z:B, 1u9z:C, 1u9z:D
26	4rxh:B	421	91	0.0657	0.0641	0.2967	2.1	5vqi:B
27	5yvg:A	830	92	0.0560	0.0277	0.2500	2.2	2h4m:B, 2ot8:B, 5yvh:A
28	8sgh:A	844	92	0.0560	0.0273	0.2500	2.3	7cyl:A, 4fdd:A, 4fq3:A, 2h4m:A, 5j3v:A, 5j3v:B, 4jlq:A, 4oo6:A, 2ot8:A, 5tqc:A, 7vpw:A, 5yvi:A, 2z5k:A, 2z5m:A, 2z5n:A, 2z5o:A
29	5yvg:B	764	92	0.0560	0.0301	0.2500	2.3
30	4i2w:A	904	39	0.0438	0.0199	0.4615	5.1	4i2z:A
31	2yt9:A	95	37	0.0341	0.1474	0.3784	6.0
32	4bqk:A	424	67	0.0535	0.0519	0.3284	7.6	4b8o:A, 4b8p:A, 4b8p:B, 4bpl:A, 4bqk:B, 2yns:A, 2yns:B
33	4twb:A	278	39	0.0365	0.0540	0.3846	8.8	4twb:B, 4twb:C, 4twb:D, 4twb:E, 4twb:F

[Back]