BioLiP

>protein
EKKKQVGILGGTFNPVHLAHLVMAEQAGRNLGLDRVFLMPSYQPTIDAKHRLNMLELAVEDNPFLQIETIELARGGKSYT
YDTMKELTQNNPDTDYYFIIGGDMVEYLPKWYKIDELTSMVNFVGIRRPGYTTDTPYPVIWVDVPEIDISSTKIRQKIKE
GCSIRYLVPDKVIDYIQNEGLYEY

The query sequence (length=184) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8aih:A	184	185	0.9837	0.9837	0.9784	5.85e-131	8aii:A, 9fyb:A, 9fyb:B
2	1kaq:A	186	186	0.4674	0.4624	0.4624	9.54e-64	1kaq:B, 1kaq:C, 1kaq:D, 1kaq:E, 1kaq:F
3	3e27:C	189	187	0.4783	0.4656	0.4706	5.13e-59	3e27:A, 3e27:B, 3e27:D, 3hfj:A, 3hfj:B, 3mla:A, 3mla:B, 3mlb:A, 3mlb:B, 3mmx:B, 3mmx:C, 3mmx:A, 3mmx:D, 2qtn:B, 2qtr:A, 2qtr:B, 2qtr:C
4	2h2a:A	189	188	0.4076	0.3968	0.3989	8.30e-49	2h29:A, 2h29:B, 2h2a:B
5	4ymi:B	198	197	0.3641	0.3384	0.3401	3.40e-40	5db4:A, 5deo:A, 5deo:B, 5deo:C, 5deo:D, 5vir:A, 5vir:B, 4ymi:A
6	5das:A	198	193	0.3533	0.3283	0.3368	8.84e-39	6buv:B, 4s1o:A, 4ybr:A, 4ybr:B
7	5das:C	180	185	0.3533	0.3611	0.3514	7.41e-38	5das:B, 5das:D, 4s1o:B
8	5db4:B	175	182	0.3478	0.3657	0.3516	1.56e-37
9	1k4m:A	213	211	0.3696	0.3192	0.3223	3.52e-32	1k4m:B, 1k4m:C
10	1yum:A	212	208	0.3315	0.2877	0.2933	3.28e-27	1yum:B, 1yum:C, 1yum:D, 1yun:A, 1yun:B
11	4wso:A	227	207	0.2880	0.2335	0.2560	2.31e-16	4wso:B
12	1kqo:A	233	220	0.3533	0.2790	0.2955	1.20e-13	1gzu:A, 1gzu:B, 1gzu:C, 1kqn:A, 1kqn:B, 1kqn:C, 1kqn:D, 1kqn:E, 1kqn:F, 1kqo:B, 1kqo:C, 1kqo:D, 1kqo:E, 1kqo:F, 1kr2:A, 1kr2:B, 1kr2:C, 1kr2:D, 1kr2:E, 1kr2:F, 8qe8:4, 8qe8:3
13	1nup:A	213	210	0.2935	0.2535	0.2571	3.70e-09	1nup:B, 1nuq:A, 1nuq:B, 1nus:A, 1nus:B, 1nut:A, 1nut:B, 1nuu:A, 1nuu:B
14	5llt:A	205	202	0.2391	0.2146	0.2178	5.10e-05	5llt:B, 5lm3:A
15	5o08:A	160	109	0.1250	0.1437	0.2110	0.79	5o08:B, 5o08:C, 5o0a:A, 5o0a:B, 5o0a:C, 5o0b:A, 5o0b:B, 5o0b:C, 5o0c:A, 5o0c:B, 5o0c:C, 5o0d:B, 5o0d:C, 5o0f:B, 5o0f:C, 5o0h:B, 5o0h:C, 8qid:A, 8qid:B, 8qid:C, 8qix:B, 8qix:C, 8qiy:A, 8qiy:B, 8qj8:A, 8qj8:B, 8qj8:C, 7ywm:A, 7ywm:B, 7ywm:C, 7yxz:A, 7yxz:B, 7yxz:C, 7yy0:B, 7yy0:C, 7yy1:A, 7yy1:B, 7yy1:C, 7yy2:A, 7yy2:B, 7yy2:C, 7yy3:A, 7yy3:B, 7yy3:C, 7yy4:B, 7yy4:C, 7yy5:B, 7yy5:C, 7yy6:A, 7yy6:B, 7yy6:C, 7yy7:B, 7yy7:C, 7yy8:B, 7yy8:C, 7yy9:A, 7yy9:B, 7yy9:C, 7yya:A, 7yya:B, 7yyb:B, 7yyb:C, 7yyc:A, 7yyc:B, 7yyc:C
16	1lw7:A	344	25	0.0598	0.0320	0.4400	2.9
17	4g9i:A	766	37	0.0815	0.0196	0.4054	3.2	4g9i:B, 4g9i:C, 4g9i:D, 4g9i:E, 4g9i:F
18	2qjo:B	336	204	0.2826	0.1548	0.2549	4.8	2qjo:A, 2qjo:C
19	3nbk:D	163	143	0.1413	0.1595	0.1818	5.5	6g6v:A, 3lcj:A, 3nba:A, 3nba:B, 3nba:C, 3nba:D, 3nbk:A, 3nbk:B, 3nbk:C, 3pnb:A, 3pnb:B, 3pnb:C, 3pnb:D, 6qmf:A, 6qmg:A, 6qmh:A, 6qmi:A, 3rba:A, 3rhs:A, 3uc5:A
20	3fys:A	282	70	0.1033	0.0674	0.2714	5.5
21	4exa:F	259	18	0.0652	0.0463	0.6667	5.8	4exa:A, 4exa:B, 4exa:C, 4exa:D, 4exa:E
22	6w4x:C	375	101	0.1467	0.0720	0.2673	7.8	7ai8:A, 7ai9:A, 2alx:A, 1av8:A, 1av8:B, 2av8:A, 2av8:B, 7bet:A, 1biq:A, 1biq:B, 5ci0:A, 5ci1:A, 5ci2:A, 5ci3:A, 5ci4:A, 5cns:E, 5cns:F, 5cns:G, 5cns:H, 5cnt:E, 5cnt:F, 5cnt:G, 5cnt:H, 5cnu:E, 5cnu:F, 5cnu:G, 5cnu:H, 5cnv:E, 5cnv:F, 5cnv:G, 5cnv:H, 4erm:E, 4erm:F, 4erm:G, 4erm:H, 4erp:E, 4erp:F, 4erp:G, 4erp:H, 1jpr:A, 1jpr:B, 1jqc:A, 1jqc:B, 1mrr:A, 1mrr:B, 1mxr:A, 1mxr:B, 1pfr:A, 1pfr:B, 1pim:A, 1pim:B, 1piu:A, 1piu:B, 1piy:A, 1piy:B, 1piz:A, 1piz:B, 1pj0:A, 1pj0:B, 1pj1:A, 1pj1:B, 1pm2:A, 1pm2:B, 1r65:A, 1r65:B, 1rib:A, 1rib:B, 1rnr:A, 1rnr:B, 1rsr:A, 1rsr:B, 1rsv:A, 1rsv:B, 3uus:E, 3uus:F, 3uus:G, 3uus:H, 6w4x:D, 1xik:A, 1xik:B, 2xof:A, 2xof:B, 1yfd:A, 1yfd:B

[Back]