BioLiP

>protein
EKKFMRESKAIKTTRVFPNDLNNHQTLFGGKLLAEIDSIASIAAARHSRKHCVTASIDSVDFLTPIHQADSVCYEAFVCY
TGKSSMEVFVKVIAENLLAGERRIAATCFITFVAIKDGKPSSVPQVLPETQEEHWLHKTGLERAENRKKGRLKSKEMAEV
LT

The query sequence (length=162) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7cz3:A	168	161	0.9938	0.9583	1.0000	7.56e-120	7cz3:B, 7cz3:C, 7cz3:D, 7cz3:E, 7cz3:F
2	1y7u:A	164	161	0.5617	0.5549	0.5652	6.43e-64	1y7u:B, 1y7u:C
3	5egj:A	167	160	0.4630	0.4491	0.4688	2.29e-46	5egl:A, 5egl:B, 5egl:C
4	1vpm:A	155	143	0.4383	0.4581	0.4965	6.84e-44	1vpm:B, 1vpm:C
5	4ien:A	154	148	0.3457	0.3636	0.3784	1.89e-28	4ien:B, 4ien:C, 4ien:D, 5szu:A, 5szu:B, 5szu:D, 5szv:A, 5szv:B, 5szv:C, 5szv:D, 5szy:A, 5szy:B, 5szy:D, 5szy:C, 5szz:A, 5szz:B, 5szz:D, 5szz:C, 5t02:A, 5t02:B, 5t02:C, 5t02:D, 5t02:E, 5t02:F, 5v3a:A, 5v3a:B, 5v3a:C, 5v3a:D
6	2eis:A	121	113	0.2778	0.3719	0.3982	1.05e-18	2eis:B
7	6vfy:F	304	121	0.2654	0.1414	0.3554	4.98e-18	2v1o:A, 2v1o:D, 2v1o:B, 2v1o:C, 2v1o:E, 2v1o:F, 6vfy:D, 6vfy:E, 4zv3:A, 4zv3:B, 4zv3:C
8	6vfy:F	304	150	0.2531	0.1349	0.2733	2.42e-10	2v1o:A, 2v1o:D, 2v1o:B, 2v1o:C, 2v1o:E, 2v1o:F, 6vfy:D, 6vfy:E, 4zv3:A, 4zv3:B, 4zv3:C
9	1yli:B	148	127	0.2407	0.2635	0.3071	7.88e-14	1yli:A
10	4moc:A	273	131	0.2593	0.1538	0.3206	1.64e-12	3b7k:A, 3b7k:B, 3b7k:C
11	4moc:A	273	105	0.1914	0.1136	0.2952	5.01e-08	3b7k:A, 3b7k:B, 3b7k:C
12	4mob:A	319	122	0.2469	0.1254	0.3279	1.65e-12
13	4mob:A	319	136	0.2160	0.1097	0.2574	9.61e-09
14	5hmc:A	125	64	0.1296	0.1680	0.3281	0.49
15	7sn8:K	588	66	0.1420	0.0391	0.3485	1.1	8uic:K
16	3t0u:B	668	33	0.0926	0.0225	0.4545	1.3	1a2v:A, 1a2v:B, 1a2v:C, 1a2v:F, 1a2v:E, 1a2v:D, 1ekm:A, 1ekm:B, 1ekm:C, 4ev2:A, 4ev2:B, 4ev2:C, 4ev2:D, 4ev2:E, 4ev2:F, 4ev5:A, 4ev5:B, 4ev5:C, 4ev5:D, 4ev5:E, 4ev5:F, 4kfd:A, 4kfd:B, 4kfd:C, 4kfd:D, 4kfd:E, 4kfd:F, 4kfe:A, 4kfe:B, 4kfe:C, 4kfe:D, 4kfe:E, 4kfe:F, 4kff:A, 4kff:B, 4kff:C, 3n9h:A, 3n9h:B, 3n9h:C, 3n9h:D, 3n9h:E, 3n9h:F, 3nbb:A, 3nbb:B, 3nbb:C, 3nbb:D, 3nbb:E, 3nbb:F, 3nbj:A, 3nbj:B, 3nbj:C, 3nbj:D, 3nbj:E, 3nbj:F, 2oov:A, 2oov:B, 2oov:C, 2oov:D, 2oov:E, 2oov:F, 2oqe:A, 2oqe:B, 2oqe:C, 2oqe:D, 2oqe:E, 2oqe:F, 3sxx:A, 3sxx:B, 3sxx:C, 3sxx:D, 3sxx:E, 3sxx:F, 3t0u:A, 3t0u:C
17	4zrb:E	128	40	0.0741	0.0938	0.3000	3.2	4zrb:A, 4zrb:D, 4zrb:B, 4zrb:C, 4zrb:G, 4zrb:H, 4zrb:F
18	5cuy:D	396	81	0.1420	0.0581	0.2840	5.8	5c5v:A, 5c5v:B, 5cuy:A, 5cuy:B, 5cuy:C
19	1nju:A	230	34	0.0741	0.0522	0.3529	7.3	8j3s:A, 8j3s:B, 8j3s:C, 8j3t:A, 8j3t:B, 1jq7:A, 1jq7:B, 1njt:A, 1njt:B, 1njt:C, 1njt:D, 1nju:B, 1nju:C, 1nju:D, 1nkk:A, 1nkk:B, 1nkk:C, 1nkk:D, 1nkm:A, 7tcz:A, 2wpo:A, 2wpo:B, 2wpo:C, 2wpo:D
20	7q3y:A	1201	41	0.0926	0.0125	0.3659	7.4	5am8:A, 5am8:B, 5am8:C, 5am8:D, 5am9:A, 5am9:B, 5am9:C, 5am9:D, 5ama:A, 5ama:B, 5ama:C, 5ama:D, 5amb:A, 5amb:B, 5amc:A, 5amc:B, 4aph:A, 4apj:A, 3bkk:A, 3bkl:A, 4bxk:A, 4bxk:B, 4bzr:A, 4bzs:A, 4bzs:B, 4c2n:A, 4c2o:A, 4c2p:A, 4c2q:A, 4c2r:A, 2c6f:A, 2c6f:B, 2c6n:A, 2c6n:B, 4ca5:A, 4ca6:A, 4ca6:B, 6en5:A, 6en5:B, 6en5:C, 6en5:D, 6en6:A, 6en6:B, 6en6:C, 6en6:D, 6f9r:A, 6f9r:B, 6f9t:A, 6f9u:A, 6f9v:A, 6f9v:B, 6h5w:A, 6h5x:A, 6h5x:B, 2iul:A, 2iux:A, 3l3n:A, 3nxq:A, 3nxq:B, 1o86:A, 1o8a:A, 2oc2:A, 7q24:B, 7q24:A, 7q25:B, 7q25:A, 7q26:B, 7q26:A, 7q27:A, 7q28:A, 7q29:A, 7q49:A, 7q4d:A, 7q4d:B, 7q4e:A, 8qfx:C, 8qfx:B, 8qfx:A, 8qfx:D, 8qhl:B, 8qhl:A, 6qs1:A, 6qs1:B, 6tt1:A, 6tt1:B, 6tt3:A, 6tt3:B, 6tt4:A, 6tt4:B, 4ufa:A, 4ufa:B, 4ufb:A, 4ufb:B, 4ufb:C, 4ufb:D, 1uze:A, 1uzf:A, 2xy9:A, 2xyd:A, 2xyd:B, 2ydm:A, 7z6z:B, 7z6z:A, 7z70:A, 6zpq:A, 6zpq:B, 6zpq:C, 6zpq:D, 6zpt:A, 6zpt:B, 6zpt:C, 6zpt:D, 6zpu:A

[Back]