Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
EKIICRDVARGYENVPIPCVNGVDGEPCPEDYKYISENCETSTMNIDRNITHLQHCTCVDDCSSSNCLCGQLSIRCWYDK
DGRLLQEFNKIEPPLIFECNQACSCWRNCKNRVVQSGIKVRLQLYRTAKMGWGVRALQTIPQGTFICEYVGELISDAEAD
VREDDSYLFDLDEVYCIDARYYGNISRFINHLCDPNIIPVRVFMLHQDLRFPRIAFFSSRDIRTGEELGFDYGDRFWDIK
SKYFTCQCGSEKCKHSAEAIALEQSRL

The query sequence (length=267) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7x73:A 274 271 1.0000 0.9745 0.9852 0.0 7btv:A, 7btv:B, 7buc:A, 7buc:B, 7dcf:A, 7dcf:B, 5jhn:A, 5jhn:B, 5jin:A, 5jin:B, 5jiy:A, 5jiy:B, 5jj0:A, 5jj0:B, 3k5k:A, 3k5k:B, 4nvq:A, 4nvq:B, 2o8j:A, 2o8j:B, 2o8j:C, 2o8j:D, 3rjw:A, 3rjw:B, 5t0k:A, 5t0k:B, 5t0m:A, 5t0m:B, 7t7l:A, 7t7l:B, 7t7l:C, 7t7l:D, 5ttf:A, 5ttf:B, 5ttf:C, 5ttf:D, 5tuy:A, 5tuy:B, 5v9i:A, 5v9i:B, 5v9i:C, 5v9i:D, 5vsc:A, 5vsc:B, 5vse:A, 5vse:B, 7x73:B, 7xua:A, 7xua:B, 7xub:A, 7xub:B, 7xuc:A, 7xuc:B, 7xud:A, 7xud:B
2 3hna:A 280 260 0.7528 0.7179 0.7731 2.07e-159 3fpd:A, 3fpd:B, 3hna:B, 4i51:A, 4i51:B, 2igq:A, 2igq:B, 6mbo:A, 6mbo:B, 6mbp:A, 6mbp:B, 3mo0:A, 3mo0:B, 3mo2:A, 3mo2:B, 3mo2:C, 3mo2:D, 3mo5:A, 3mo5:B, 3mo5:C, 3mo5:D, 2rfi:A, 2rfi:B, 3sw9:A, 3sw9:B, 3swc:A, 3swc:B, 7t7m:A, 7t7m:B, 7t7m:C, 7t7m:D, 5ttg:A, 5ttg:B, 5tuz:A, 5tuz:B, 5v9j:A, 5v9j:B, 5vsd:A, 5vsd:B, 5vsf:A, 5vsf:B, 8xpt:A, 8xpt:B, 8xpt:C, 8xpt:D
3 6z2a:A 283 267 0.3708 0.3498 0.3708 2.79e-44 6box:A, 6box:B, 6bp4:B, 6bp4:A, 1mvh:A, 1mvx:A, 6z2a:B
4 2r3a:A 270 245 0.3483 0.3444 0.3796 3.28e-43 6p0r:A, 6p0r:B
5 4qen:A 472 266 0.3446 0.1949 0.3459 7.88e-40 4qeo:A, 4qep:A
6 3bo5:A 269 245 0.3184 0.3160 0.3469 1.38e-38
7 6a5m:A 488 275 0.3558 0.1947 0.3455 4.47e-38 6a5k:A
8 6a5n:A 502 261 0.3258 0.1733 0.3333 5.67e-35
9 4nj5:A 482 259 0.2996 0.1660 0.3089 7.61e-35
10 1peg:A 266 274 0.3071 0.3083 0.2993 7.05e-31 1ml9:A, 1peg:B
11 5jlb:A 248 168 0.2060 0.2218 0.3274 4.14e-21 7ea8:L, 4fmu:A, 4h12:A, 6j9j:A, 5jjy:A, 5jle:A, 5lss:A, 5lsx:A, 5lsy:A, 5lsz:A, 5lt6:A, 5lt6:B, 5lt7:A, 5lt8:A, 7lzb:A, 7lzd:A, 7lzf:A, 8q5p:A, 7ty2:A, 7ty3:A, 5v21:A, 5v22:A, 6vdb:A
12 5wf7:B 765 146 0.2135 0.0745 0.3904 1.29e-20 5kji:B
13 5kjh:B 807 146 0.2135 0.0706 0.3904 1.38e-20 5m5g:B
14 5tqr:B 809 146 0.2135 0.0705 0.3904 1.80e-20 5bjs:B, 5vk3:B
15 5kkl:B 839 143 0.2097 0.0667 0.3916 3.17e-20
16 7kso:A 395 187 0.2434 0.1646 0.3476 4.13e-20 7ksr:A, 7ktp:A
17 7td5:F 447 187 0.2434 0.1454 0.3476 4.64e-20
18 7td5:A 497 187 0.2434 0.1308 0.3476 5.23e-20
19 8fbh:A 232 168 0.2060 0.2371 0.3274 6.90e-20 8fbg:A, 8fbg:B, 6kqp:A, 6kqq:A, 6kqq:B, 3ooi:A
20 6ine:A 247 170 0.2135 0.2308 0.3353 1.10e-19 6ago:A, 6ago:B, 3ope:A, 3ope:B, 6wzw:A, 6x0p:A, 6x0p:B, 6x0p:C, 6x0p:D, 4ynm:A, 4ynm:B, 4ynp:A, 4ynp:B, 4ypa:A, 4ypa:B, 4ypa:C, 4ypa:D, 4ype:A, 4ype:B, 4ypu:A, 4ypu:B
21 7at8:A 311 187 0.2434 0.2090 0.3476 2.35e-19
22 6wkr:C 606 187 0.2434 0.1073 0.3476 2.98e-19 4mi0:A, 4mi5:A, 8t9g:I
23 8tas:E 570 187 0.2434 0.1140 0.3476 3.17e-19 8tb9:E
24 9c8u:A 475 187 0.2434 0.1368 0.3476 3.20e-19
25 5hyn:A 581 187 0.2434 0.1119 0.3476 3.55e-19 5hyn:F, 5hyn:K, 5hyn:Q, 5ls6:A, 5ls6:G, 5ls6:J, 5ls6:D
26 8t9g:C 536 187 0.2434 0.1213 0.3476 3.57e-19 8fyh:A, 8fyh:G
27 5wfd:B 774 112 0.1835 0.0633 0.4375 3.88e-19 5wfc:B
28 5ij7:B 469 187 0.2434 0.1386 0.3476 4.03e-19 6b3w:A, 6b3w:B, 6c23:K, 6c24:K, 5ij7:A, 5ij8:A, 5ij8:B, 4w2r:A, 4w2r:B
29 6ugm:M 188 144 0.2060 0.2926 0.3819 5.75e-19
30 6ven:N 218 141 0.1985 0.2431 0.3759 6.20e-19
31 5wg6:A 517 131 0.1985 0.1025 0.4046 7.11e-19 5wg6:C
32 5lsu:A 231 169 0.2172 0.2511 0.3432 1.13e-18 7cro:I, 7e8d:K, 5lsu:B
33 6cen:A 226 168 0.1985 0.2345 0.3155 5.21e-18 7crp:I, 7crq:L, 7crq:I, 7crr:I, 5upd:A
34 6uh5:M 222 137 0.2022 0.2432 0.3942 9.58e-18 6chg:C
35 2w5z:A 180 150 0.1873 0.2778 0.3333 2.12e-17 5f5e:A, 5f6l:A, 6pwv:C, 6pww:C, 7u5v:A, 6u9k:A, 6u9k:B, 6u9m:A, 6u9m:B, 6u9n:A, 6u9n:B, 6u9r:A, 6u9r:B, 2w5y:A, 7w67:C, 7w6a:C, 7w6i:C, 7w6j:C
36 7bre:B 163 150 0.1760 0.2883 0.3133 4.28e-16 7bre:E
37 7w6l:C 158 155 0.1835 0.3101 0.3161 6.34e-16 5f59:A, 5f6k:C, 5f6k:E, 6kiw:K, 7w6l:E
38 6kiu:K 179 150 0.1798 0.2682 0.3200 1.34e-15 6kiv:K, 6kix:K, 6kiz:K, 7ud5:K
39 7ea5:K 228 142 0.1873 0.2193 0.3521 1.83e-15
40 6nzo:S 233 160 0.1910 0.2189 0.3187 2.54e-15 6px3:S
41 4z4p:A 161 155 0.1760 0.2919 0.3032 2.82e-11
42 7xpx:K 167 137 0.1760 0.2814 0.3431 7.38e-11 6boz:A, 6boz:B, 2bqz:A, 2bqz:E, 3f9w:B, 3f9w:A, 3f9w:C, 3f9w:D, 3f9x:B, 3f9x:A, 3f9x:C, 3f9x:D, 3f9y:A, 3f9y:B, 3f9z:B, 3f9z:A, 3f9z:C, 3f9z:D, 4ij8:A, 4ij8:B, 5t5g:A, 5teg:A, 5teg:B, 5th7:A, 5th7:B, 5w1y:A, 5w1y:B, 1zkk:A, 1zkk:B, 1zkk:C, 1zkk:D
43 8sr6:A 451 121 0.1236 0.0732 0.2727 0.047 5czy:A, 8swi:A
44 4o30:A 217 134 0.1573 0.1935 0.3134 0.10 4o30:B, 5va6:A, 5va6:B, 5vac:A, 5vah:A, 5vah:B, 5vbc:A, 5vbc:B
45 2g46:A 119 124 0.1273 0.2857 0.2742 0.22 2g46:B, 3kmt:A, 3kmt:B, 3kmt:C
46 5ex0:A 429 84 0.0974 0.0606 0.3095 2.5 7bj1:A, 5ccl:A, 5ccm:A, 5ex3:A, 5hi7:A, 5hq8:A, 5hq8:B, 6ijl:A, 3mek:A, 7o2a:A, 7o2b:A, 7o2c:A, 6o9o:A, 8owo:A, 3oxf:A, 3oxf:B, 3oxg:A, 3oxl:A, 6p6g:A, 6p6k:A, 6p7z:A, 6paf:A, 3pdn:A, 7qlb:A, 7qnr:A, 7qnu:A, 3qwp:A, 3ru0:A, 3ru0:B, 5v37:A, 5xxd:A, 5xxg:A, 5xxj:A, 5yjo:A, 6yuh:A, 6zrb:A
47 6c26:B 397 106 0.0974 0.0655 0.2453 3.0 8age:G, 6ezn:G, 7oci:G
48 5g09:D 473 85 0.0787 0.0444 0.2471 5.4 5g09:A, 5g09:B, 5g09:C, 5g0a:A, 5g0a:B, 5g0a:C, 5g0a:D, 5g2p:A, 5g2p:B, 5g2p:C, 5g2p:D, 5g2q:A, 5g2q:B, 5g2q:C, 5g2q:D, 5g2q:E, 5g2q:F, 5g2q:G, 5g2q:H, 5g2q:I, 5g2q:J, 5g2q:K, 5g2q:L
49 4au7:A 243 114 0.1161 0.1276 0.2719 5.9 4au7:B, 3rq4:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218